Ngân hàng Nông nghiệp và Phát triển Nông thôn Việt Nam (Agribank) - Chi nhánh Sài Gòn được thành lập vào ngày 01/04/1991 với tên gọi ban đầu là Sở giao dịch Ngân hàng Nông nghiệp và Phát triển Nông thôn II theo quyết định số 61/NHNN-QĐ của Thống đốc NHNN Việt Nam. Chính thức được đổi tên như hiện nay vào ngày 25/02/2002 theo quyết định số 41/QĐ-HĐQT-TCCB của Chủ tịch Hội đồng quản trị. Agribank chi nhánh Sài Gòn là đơn vị được xếp hạng doanh nghiệp Nhà nước hạng I và trực thuộc trực tiếp Ngân hàng Nông nghiệp và Phát triển Nông thôn Việt Nam. Tính đến thời điểm hiện tại, Agribank chi nhánh Sài Gòn có tổng dư nợ tín dụng đạt gần 4.500 tỷ đồng, doanh số thanh toán quốc tế chiếm khoảng 33% thị phần so với địa bàn thành phố, tổng lợi nhuận chiếm khoảng 25% trên toàn địa bàn, những chỉ tiêu này phần nào phản ánh được thành quả lớn cho quá trình hoạt động 25 năm của Chi nhánh.
Tính đến thời điểm cuối năm 2015, về mạng lưới, Agribank chi nhánh Sài Gòn có 1 trụ sở chính, 1 chi nhánh loại 3 (Agribank chi nhánh Huyện Côn Đảo) và 04 phòng giao dịch, về số lượng khách hàng, chi nhánh có trên 200.000 khách hàng có quan hệ giao dịch tiền gửi, thanh toán; trong đó có trên 19.000 khách hàng sử dụng dịch vụ thẻ và 1.000 khách hàng có quan hệ tín dụng.
Ban lãnh đạo gồm: 1 giám đốc chi nhánh và 3 phó giám đốc.
Chi nhánh có 8 phòng nghiệp vụ bao gồm: Phòng Kinh doanh ngoại hối, Phòng Tín dụng, Phòng Kế hoạch Tổng hợp, Phòng Kế toán Ngân quỹ, Phòng Hành chính Nhân sự, Phòng Kiểm tra kiểm soát nội bộ, Phòng Dịch vụ & Marketing, Phòng Điện toán và các phòng giao dịch trực thuộc.