Điều 31 Luật Biên giới quốc gia quy định: “Xây dựng, quản lý, bảo vệ biên giới quốc gia, khu vực biên giới là nhiệm vụ của nhà nước và của toàn dân, trước hết là của chính quyền, nhân dân khu vực biên giới và các lực lượng vũ trang nhân dân”.
Như vậy, tất cả các cơ quan nhà nước đều thực hiện chức n ng quản lý nhà nước về biên giới quốc gia theo nhiệm vụ, quyền hạn của từng ngành, từng lĩnh vực do pháp luật quy định. Quản lý nhà nước về biên giới quốc gia là một dạng quản lý nhà nước chuyên ngành, do đó các chủ thể tham gia quản lý ở các mức độ khác nhau, trong đó do cơ quan hành chính nhà nước thực hiện trực tiếp và chủ yếu bao gồm:
Chính phủ: Chính phủ thống nhất quản lý nhà nước về biên giới quốc gia,
quy định nhiệm vụ, quyền hạn, phạm vi trách nhiệm phối hợp giữa các bộ, cơ quan ngang bộ, uỷ ban nhân dân tỉnh, thành phố trực thuộc trung ương nơi có biên giới quốc gia thực hiện quản lý nhà nước về biên giới quốc gia.
- Bộ Quốc phòng: Chủ trì, phối hợp với Bộ Ngoại giao, Bộ Công an chịu
trách nhiệm trước Chính phủ thực hiện quản lý nhà nước về biên giới quốc gia (Điều 36 Luật Biên giới quốc gia).
- Các bộ, cơ quan ngang bộ: Trong phạm vi nhiệm vụ, quyền hạn của mình
có trách nhiệm thực hiện quản lý nhà nước về biên giới quốc gia (Điều 36 Luật Biên giới quốc gia).
- Uỷ ban nhân dân các cấp nơi có biên giới quốc gia: Thực hiện quản lý nhà nước về biên giới quốc gia theo quy định của Chính phủ (Điều 37 Luật Biên giới quốc gia).