Đường lối đổi mới mọi mặt về đời sống xã hội do Đại hội lần thứ VI của Đảng Cộng sản Việt Nam khởi xướng đã tạo tiền đề cho việc nghiên cứu,xây dựng Hiến pháp năm 1992. Trước những yêu cầu thực hiện công cuộc đổi mới, mô hình tổ chức Tòa án nhân dân theo Hiến pháp 1980 dựa trên cơ chế quản lý nhà nước theo cơ chế kế hoạch hóa tập trung và bao cấp không còn phù hợp. Vì vậy, kế thừa các quy định của Hiến pháp 1980, Hiến pháp 1992 đã có những quy định thể hiện sự đổi mới trong tổ chức và hoạt động của Tòa án nhân dân.
Trên cơ sở Hiến pháp 1992, Quốc hội đã thông qua Luật tổ chức Tòa án nhân dân ngày 06/10/1992 và được sửa đổi, bổ sung theo các Luật sửa đổi, bổsung một số điều của Luật tổ chức Tòa án nhân dân, được Quốc hội thông qua ngày 28/12/1993 và ngày 28/10/1995. Uỷ ban thường vụ Quốc hội đã thông qua Pháp lệnh Tổ chức Tòa án quân sự ngày 19/4/1993 và Pháp lệnh về
Thẩm phán và Hội thẩm Tòa án nhân dân ngày 14/5/1993. Theo các văn bản pháp luật này thì tổ chức và hoạt động của Tòa án nhân dân đã được kiện toàn và đổi mới một bước cơ bản. Nhìn chung nhiều quy định của Hiến pháp năm 1992 về tổ chức và hoạt động của Tòa án nhân dân được kế thừa các quy định của Hiến pháp năm 1980, tuy nhiên một số quy định của Hiến pháp năm 1992 về tổ chức và hoạt động của các cơ quan tư pháp nói chung và của Tòa án nhân dân nói riêng đã thể hiện rõ nét đổi mới các nguyên tắc tổ chức và hoạt động của các cơ quan này.
Trên địa bàn tỉnh Quảng Bình cũng như tình hình chung cả nước, Ngành Tòa án có sự thay đổi đó là năm 1993 công tác Thi hành án dân sự được chuyển sang Chính Phủ, nên hoạt động của ngành Tòa án nhân dân đi vào chuyên sâu công tác xét xử và thi hành án phạt tù, vì thế công tác tổ chức cán bộ có một số điều chỉnh. Biên chế cán bộ khi chưa chia tách là 84 cán bộ, sau khi bàn giao cán bộ sang làm công tác Thi hành án dân sự 17 cán bộ, còn lại 67 cán bộ (tỉnh 26 cán bộ, huyện thị 41 cán bộ).
Tháng 4/1994 (năm triển khai thực hiện Luật tổ chức Tòa án nhân dân sửa đổi: chế độ Thẩm phán bầu thay đổi bằng chế độ do Chủ tịch nước bổ nhiệm) Chủ tịch nước cộng hòa xã hội chủ nghĩa Việt Nam đã bổ nhiệm 12 Thẩm phán Tòa án nhân dân tỉnh, 24 Thẩm phán cho 7 Tòa án nhân dân cấp huyện, thị. Việc bổ nhiệm kịp thời này đã triển khai kịp thời, các nhiệm vụ công tác của Tòa án. Công tác xét xử các loại án có những chuyển biến tích cực hơn, tốc độ giải quyết nhanh và kịp thời, có nhiều đơn vị cấp huyện giải quyết đạt 100% chỉ tiêu.
Trong việc quản lý tổ chức và cán bộ đối với các đơn vị Tòa án cấp huyện, sự phối hợp giữa lãnh đạo hai ngành Tòa án nhân dân tỉnh Quảng Bình và Sở Tư pháp ngày càng chặt chẽ. Các khâu phân bổ biên chế, tuyển dụng, sắp xếp bố trí thuyên chuyển công tác, đề bạt, nâng lương, cử đi đào tạo đều
có sự bàn bạc, thống nhất. Đối với những đơn vị yếu hoặc thiếu Thẩm phán, lãnh đạo hai ngành đã có biện pháp hỗ trợ chuyên môn nhằm giúp đỡ đơn vị hoàn thành nhiệm vụ.
Năm 1996, thực hiện Luật bổ sung sửa đổi một số điều của Luật tổ chức Tòa án nhân dân, ngành đã cử 17 cán bộ, trong đó có 5 cán bộ cấp huyện theo học các lớp bồi dưỡng, tập huấn chuyên đề về nghiệp vụ hành chính, lao động do Bộ Tư pháp, Tòa án nhân dân Tối cao triệu tập. Về công tác cán bộ, trong năm, cấp huyện có 18/22 cán bộ có bằng Đại học, Cao đẳng pháp lý. Các Hội thẩm nhân dân cấp huyện đã được bồi dưỡng, tập huấn về nghiệp vụ và các chuyên đề cần thiết.
Với diễn biến phức tạp của tình hình tội phạm cuối năm 1999 đầu năm 2000, các Tòa án đã bám sát nhiệm vụ chính trị địa phương và phương hướng hoạt động của ngành đã được Hội nghị triển khai công tác ngành Tòa án tỉnh Quảng Bình năm 2000 đề ra đầu năm, chủ động tích cực đẩy mạnh các hoạt động xét xử, vì vậy đã đạt được những kết quả tích cực như Tòa án nhân dân huyện Lệ Thủy là 95%, Tòa án nhân dân thị xã Đồng Hới là 85%. Chất lượng xét xử nhìn chung là đảm bảo. Giữa năm 2000 công tác bổ nhiệm Thẩm phán về cơ bản đã hoàn thành, Tòa án nhân dân tỉnh phối hợp với Sở Tư pháp và các cấp Đảng ủy tiếp tục kiện toàn về tổ chức bộ máy trong toàn ngành theo tinh thần Nghị quyết Trung ương 6 lần 2, trung ương 7 (khóa VIII) nhằm nâng cao hiệu quả công tác và tiếp tục rà soát, có kế hoạch tuyển chọn bổ sung thẩm phán cho các tòa án còn thiếu Thẩm phán [43].