Giai đoạn trước năm 2000, bộ máy quản lý nhà nước về đất đai cấp huyện gọi là phòng Địa chính, thực hiện chức năng quản lý quản lý nhà nước về đất đai ở cấp huyện.
Từ năm 2000-2004, phòng Địa chính được sát nhập với phòng Nông nghiệp, gọi tên phòng Nông nghiệp. Trong đó có một bộ phận thực hiện chức năng quản lý nhà nước về đất đai, một bộ phận thực hiện chức năng quản lý về nông nghiệp, nông thôn.
Đến ngày 01/7/2004, thực hiện Luật đất đai năm 2003, phòng Nông nghiệp được tách ra là phòng Nông nghiệp và phát triển nông thôn và phòng Tài nguyên và Môi trường. Hai phòng này thực hiện chức năng độc lập.
Phòng Tài nguyên và Môi trường có 5 biên chế, gồm 1 trưởng phòng phụ trách chung, 01 phó trưởng phòng phụ trách công tác quản lý nhà nước về đất đai, 01 phó trưởng phòng phụ trách quản lý nhà nước về khoáng sản, môi trường, 02 cán bộ công chức phụ trách 28 xã, thị trấn trên địa bàn huyện. Khối lượng công việc nhiều, nguồn nhân lực mỏng cũng là một khó khăn trong công tác quản lý nhà nước về đất đai của huyện. Từ tháng 11/2011, UBND huyện Đoan Hùng có Quyết định số 2657/QĐ-UBND ngày 10/11/2011 về việc thành lập văn phòng đăng ký quyền sử dụng trực thuộc phòng Tài nguyên và Môi trường. Văn phòng đăng ký quyền sử dụng đất là đơn vị sự nghiệp công lập, thực hiện công tác cấp giấy chứng nhận lần đầu, thực hiện các quyền của người sử dụng đất, thống kê, kiểm kê đất đai, chỉnh lý biến động đất đai…..
Cơ cấu tổ chức của văn phòng đăng ký quyền sử dụng đất gồm: 01 giám đốc, 02 viên chức, và 08 cán bộ hợp đồng.
*Ở cấp xã:
Cán bộ quản lý nhà nước về đất đai ở cấp xã, thị trấn gọi là công chức địa chính, có trách nhiệm giúp UBND cấp xã trong việc quản lý đất đai ở địa phương.
Công chức địa chính xã thực hiện nhiều công việc địa chính, giao thông, thủy lợi và xây dựng, nông nghiệp. Nên trên địa bàn huyện Đoan Hùng mỗi xã có 02 công chức địa chính gồm 01 địa chính xây dựng và 01 địa chính nông nghiệp.