nước nhập khẩu biết để phối hợp kiểm tra.
Sau khi thực hiện xong bước tiếp nhận, đăng ký tờ khai, quyết định hình thức, mức độ kiểm tra thực tế hải quan nước nhập khẩu phối hợp với hải quan nước xuất khẩu thực hiện kiểm tra thực tế hàng hoá, phương tiện vận tải.
Hình thức và mức độ kiểm tra thực tế hàng hoá sẽ do hải quan mỗi nước quyết định nếu hình thức và mức độ kiểm tra của hải quan hai nước có sự khác biệt thì hải quan mỗi nước kiểm tra theo hình thức và mức độ mà hải quan nước đó quyết định.
2.2.2. Hoạt động của các cơ quan chức năng khác liên quan đến hoạt động xuất nhập khẩu nhập khẩu
Tại Việt Nam, việc quản lý và giám sát hoạt động xuất khẩu, nhập khẩu, quá cảnh hàng hoá, phương tiện vận tải thuộc trách nhiệm của 12 cơ quan quản lý của nhà nước là: Bộ Công thương, Bộ GTVT, Bộ NN&PTNT, Bộ Y tế, Bộ Tài nguyên và Môi trường, Bộ Văn hoá thể thao & Du lịch, Bộ Công An, Bộ Quốc phòng, Ngân hàng nhà nước Việt Nam, Bộ Thông tin và truyền thông, Bộ Khoa học và Công nghệ, Bộ Tài chính (Tổng cục Hải quan).
Trên thực tế, các Bộ, Ngành và các cơ quan chính phủ nêu trên cấp khoảng 65 loại giấy phép/ chứng từ trong bộ hồ sơ dùng để thông quan cũng như chịu trách nhiệm quản lý hàng hoá, phương tiện vận tải xuất khẩu, nhập khẩu, xuất cảnh, nhập cảnh, quá cảnh. Theo quy định của pháp luật, để thông quan hàng hoá thì tuỳ từng trường hợp cụ thể, doanh nghiệp phải nộp hồ sơ hải quan bao gồm các loại giấy phép, giấy tờ quản lý chuyên ngành của 12 Bộ, Ngành liên quan gồm: giấy phép xuất khẩu, giấy phép nhập khẩu, giấy chứng nhận xuất xứ hàng hoá, giấy kiểm tra, hoặc thông báo miễn kiểm tra của cơ quan kiểm tra vệ sinh an toàn thực phẩm, cơ quan kiểm dịch đối với hàng hoá xuất khẩu, nhập khẩu thuộc danh mục sản phẩm, hàng hoá phải kiểm tra về chất lượng, vệ sinh an toàn thực phẩm, về kiểm dịch
động vật và thực vật, giấy xác nhận hàng hoá nhập khẩu phục vụ trực tiếp cho quốc phòng hoặc phục vụ trực tiếp cho an ninh.
Để thực hiện chức năng quản lý chuyên ngành, tại cửa khẩu quốc tế đường bộ với Lào và Campuchia, một số Bộ, Ngành liên quan trực tiếp đến các hoạt động xuất nhập khẩu, xuất nhập cảnh, quá cảnh đều có cơ quan đại diện tại biên giới. Cụ thể, Bộ NN&PTNT có bộ phận thực hiện chức năng kiểm dịch động vật, thực vật đối với hàng hoá, phương tiện vận tải xuất khẩu, nhập khẩu, quá cảnh. Bộ Y tế có cơ quan đại diện tại biên giới để thực hiện các chức năng về phòng dịch. Bộ Quốc phòng có Bộ đội biên phòng thực hiện các thủ tục kiểm tra, kiểm soát người (hộ chiếu, thị thực, bằng lái xe…) Bộ GTVT thực hiện kiểm tra xe vận tải (đăng ký xe, giấy chứng nhận đăng kiểm xe, giấy chứng nhận bảo hiểm).
Theo quy định tài điều 4 phần II – Tạo thuận lợi đối với thủ tục hải quan qua lại biên giới của hiệp định GMS, khi tiến hành kiểm tra Một cửa các thủ tục kiểm tra, kiểm soát người (hộ chiếu, thị thực, bằng lái xe, ngoại tệ, hải quan, y tế, phòng dịch), xe vận tải (đăng ký xe, giấy chứng nhận đăng kiểm xe, giấy chứng nhận bảo hiểm) và hàng hoá (hải quan, chất lượng, kiểm dịch động thực vật thú y) sẽ tiến hành kiểm tra tại địa điểm kiểm tra chung và đồng thời. Tuy nhiên, trên thực tế các địa điểm kiểm tra chung tại các cặp cửa khẩu triển khai kiểm tra một điểm dừng chưa hoàn thành. Tại cặp cửa khẩu Mộc Bài – Ba Vét, địa điểm kiểm tra chung đang trong giai đoạn triển khai lập dự án đầu tư với diện tích về phía Việt Nam là 7.000 m2 ;cặp cửa khẩu Lao Bảo – Densavan đang xây dựng địa điểm kiểm tra chung. Do vậy, việc phối hợp thực hiện giữa các cơ quan chức năng có liên quan với cơ quan hải quan Việt Nam và với nước bạn còn nhiều hạn chế, chưa thực hiện được đầy đủ yêu cầu của kiểm tra một lần, một điểm dừng. Ngoài ra do bất đồng về ngôn ngữ, quy trình thủ tục kiểm tra giữa các cơ quan chức năng có liên quan của Việt Nam và nước bạn có nhiều điểm khác biệt dẫn đến việc thực hiện các thủ tục kiểm tra chung chưa thực hiện được.