Phương pháp PCR dùng chẩn ñ oán nấm sinh ñộ c tố Aflatoxin.

Một phần của tài liệu NGHIÊN cứu PHƯƠNG PHÁP CHẨN ĐOÁN nấm BỆNH aspergillus flavus SINH độc tố AFLATOXIN BẰNG KỸ THUẬT PCR (Trang 36 - 40)

để tiện lợi hoá việc phát hiện nấm Aspergillus spp. sinh ựộc tố Aflatoxin, gần ựây phương pháp dựa vào kỹ thuật PCR ựang ựược nghiên cứu áp dụng rộng rãi [40]. Ngoài tắnh tiện lợi và dễ sử dụng, phương pháp này còn có ưu

ựiểm là phát hiện nhanh, nhạy, chắnh xác nấm Aspergillus spp. sinh ựộc tố

Trường đại hc Nông nghip Hà Ni Ờ Lun văn thc s khoa hc Nông nghip ẦẦẦ26

quả nghiên cứu hệ gen nấm Aspergillus ssp. sinh ựộc tố Aflatoxin và con

ựường sinh tổng hợp Aflatoxin [15, 28]. Các nghiên cứu cho thấy, ắt nhất có 20 gen tham gia vào con ựường sinh tổng hợp Aflatoxin, trong ựó có 4 gen quan trọng là ver-1, omt-1, nor-1 apa-2 ựã ựược công bố trình tự

nucleotide và chức năng gen. Trình tự nucleotide của các gen này là cơ sở ựể

sinh tổng hợp các cặp mồi ựặc hiệu cho phản ứng PCR sử dụng sợi khuôn là ADN tổng số tách chiết từ sợi nấm hoặc các mẫu xét nghiệm.

Chất ựầu tiên tham gia vào con ựường sinh tổng hợp Aflatoxin có nguồn gốc từ một polyketide, ngưng tụ các chất acetate ựể tạo thành axit norsoloric, tiếp ựó là sự biến ựổi norsolorinic axit (NOR)→ averantin (AVN)→ averufanin → averufin (AVF) → hydroxyversicolorone →

versiconal hemiacetal acetate → versicolorin B → versicolorin A (VA)→

sterigmatocystin (ST) → O Ờ methylsterigmatocystin (OMST) → Aflatoxin B1. Trong mắt xắch cuối của con ựường sinh tổng hợp enzym O Ờ methyltransferase xúc tác cho quá trình chuyển hoá (ST) → (OMST) có liên quan tới sự sản sinh Aflatoxin. Gần ựây, chỉ mới một vài enzym trong con

ựường sinh tổng hợp này ựược phân lập [33, 53]. Cụ thể, ba gen cấu trúc trong con ựường sinh tổng hợp Aflatoxin của nấm A. paraciticus có liên quan

ựến sự biến ựổi của NOR và VA (nor-1ver-1), enzym O Ờ methyltransferase xúc tác cho quá trình chuyển hoá (ST) → (OMST) (omt -1) ;

và một gen ựiều hoà của nấm A. flavus (afl-2) ựã ựược nhân dòng. Các gen này ựược chọn làm gen ựắch cho phản ứng PCR. Gen afl -2 ựược biết ựến như

một như một enzym bảo tồn hoạt ựộng của các enzym khác trong con ựường sinh tổng hợp Aflatoxin. Trong một số nghiên cứu cũng ựưa ra, gen apa-2 của chủng nấm A. parasiticus trong quá trình sinh tổng hợp Aflatoxin, có mức ựộ

tương ựồng về ADN rất lớn với gen afl-2 của nấm A. flavus [33, 34].

Trường đại hc Nông nghip Hà Ni Ờ Lun văn thc s khoa hc Nông nghip ẦẦẦ27

trưởng và phát triển của nấm Aspergillus. điều này dẫn ựến hàm lượng và tỷ

lệ nhiễm Aflatoxin trên nông sản Việt Nam là ở mức cao trong khu vực và

ựây là một trong những nguyên nhân quan trọng dẫn ựến giá trị nông sản xuất khẩu của Việt nam rất thấp. Thực tế thì ựã có nhiều lô hàng nông sản xuất khẩu của nước ta như: lạc, ựậu tương... ựã bị trả lại do phát hiện ựộ nhiễm Aflatoxin cao quá mức cho phép. Vì vậy, việc nghiên cứu phát triển các phương pháp chẩn ựoán sớm nấm Aspergillus sinh ựộc tố Aflatoxin có ý nghĩa cực kỳ quan trọng trong việc hạn chế lây lan và giảm thiểu tác hại của nấm. Hiện tại, ở Việt nam chúng ta vẫn ựang sử dụng phương pháp truyền thống ựể chẩn ựoán nấm Aspergillus sinh ựộc tố Aflatoxin nên mới chỉ phát hiện ựược chủng nấm A. flavus.

Hình 2.8. Sơựồ minh ho con ựường sinh tng hp ựộc tAflatoxin B1 nm A. flavus

Trường đại hc Nông nghip Hà Ni Ờ Lun văn thc s khoa hc Nông nghip ẦẦẦ28

Việc phát hiện mầm bệnh nấm A. flavus sinh ựộc tố Aflatoxin bằng kỹ

thuật PCR chưa ựược nghiên cứu ở Việt nam. Từ năm 2007, Bộ môn Bệnh học Phân tử thực vật, Viện Di truyền Nông nghiệp ựã tiến hành thu thập và phân lập chủng nấm bệnh A. flavus trên một số nông sản (ngô, lạc, ựậu tương, gạo), nuôi cấy thu sinh khối và tối ưu hóa quy trình tách chiết ADN tổng số

của nấm A. flavus. đã xác ựịnh ựược các ựiều kiện cho phản ứng PCR ựặc hiệu sử dụng các cặp mồi riêng rẽnor-1, omt-1, ver -1, apa -2 (do gen afl Ờ 2

của nấm A. flavus có mức ựộ tương ựồng rất lớn với gen apa - 2 của nấm A. parasiticus), và phản ứng Multiplex PCR (dùng cả 4 cặp mồi), có thể nhận ra

ựược chủng nấm có mang gen mã hóa trong quá trình tổng hợp ựộc tố

Trường đại hc Nông nghip Hà Ni Ờ Lun văn thc s khoa hc Nông nghip ẦẦẦ29

Một phần của tài liệu NGHIÊN cứu PHƯƠNG PHÁP CHẨN ĐOÁN nấm BỆNH aspergillus flavus SINH độc tố AFLATOXIN BẰNG KỸ THUẬT PCR (Trang 36 - 40)