- Genotype virus:
Những dự đốn chắc chắn về SVR ban đầu cĩ thể khác nhau gồm các yếu tố HCV genotype 2 hoặc 3, cĩ hay khơng sử dụng IFN dạng quy ước hoặc PegIFN trước đĩ, dùng đơn độc hoặc kết hợp cùng Ribavirin để điều trị
[45], [65], [74]. Dựa trên cơ sở sự khác nhau về trình tự các nucleotide của HCV, người ta phân ra 6 loại genotype (đánh số từ 1 – 6) và hơn 50 type phụ (subtype) (phân biệt bằng chữ cái nhỏ, ví dụ 1a và 1b) [5]. HCV genotype và các subtype (type phụ) cĩ đặc tính đặc trưng của chủng virus lây nhiễm và khơng thay đổi trong quá trình nhiễm trùng. Lý do tại sao HCV genotype 1 khĩ điều trị hơn các genotype khác vẫn chưa được biết đầy đủ. Một vài nghiên cứu đã chứng tỏ rằng tồn tại một sự khác biệt đặc trưng của các
genotype về mặt động học virus [126]. Do vậy những tế bào gan nhiễm HCV genotype 1 sẽ bình phục chậm hơn những tế bào gan nhiễm các genotype HCV khác sau khi sử dụng liệu pháp điều trị IFN lần đầu [128]. Điều này kéo theo HCV genotype 1 cĩ thể kháng liệu pháp diệt virus nhiều hơn.
Những khuyến cáo hiện tại [117] cho thấy, tỉ lệ SVR là 42 – 60 % đối với nhiễm HCV genotype 1 điều trị trong vịng 48 tuần bằng liệu pháp kết hợp giữa PegIFN – Ribavirin, so với 76 – 95% với nhiễm HCV genotype 2 hoặc 3 điều trị trong vịng 24 tuần [45], [74]. Đối với genotype 6, theo Lam và cộng sự SVR là 79% nếu điều trị 48 tuần và 70% nếu điều trị 24 tuần [69]. Phạm Thị Thu Thủy và cộng sự cho thấy SVR genotype 6 là 79 % nếu điều trị 48 tuần và 72% nếu điều trị 24 tuần [96]. Theo Antonio Ascione và cộng sự SVR genotype 1 là 54,8% khi dùng Peginterferon alfa 2a kết hợp Ribavirin, 39,8% khi dùng Peginterferon alfa 2b kết hợp Ribavirin [28]. Trong một nghiên cứu tại Medic, SVR genotype 1 là 55,55% nếu điều trị 48 tuần; 84,44% nếu điều trị 72 tuần [19]. Trong nghiên cứu chúng tơi SVR genotype 1, nhĩm I là 78,78%, nhĩm II là 80%. SVR genotype 2 và 6 thuộc nhĩm I là 88,23%, nhĩm II là 93,33%. Nếu tính chung hai nhĩm, tỉ lệ SVR của genotype 1 là 79,41%, genotype 2 là 100%, genotype 6 là 84,71%, cũng khơng cĩ sự khác biệt cĩ ý nghĩa thống kê (p>0,05). Trong nghiên cứu của chúng tơi khơng cĩ sự khác biệt về SVR giữa các genotype, cĩ thể do mẫu nghiên cứu cịn nhỏ. Ngồi ra trong kỹ thuật định genotype của chúng tơi trên đoạn 5’UT cĩ thể cĩ
lẫn genotype 6 vào genotype 1 [89] mà genotype 6 cĩ thể cho đáp ứng tốt hơn genotype 1. Do đĩ chúng tơi khơng thấy cĩ sự khác biệt hiệu quả điều trị giữa các genotype trong nghiên cứu này. Mợt trong những nhược điểm chính của việc xác định kiểu gen HCV dựa trên đoạn gen 5’ khơng mã hoá là bị phân loại nhầm kiểu gen 6 vào kiểu gen 1. Do đó hiện nay đã có thế hệ thứ 2 của sản phẩm thương mại LiPA ( Các đoạn dò vừa trên đoạn gen khơng mã hoá 5’ UT vừa trên đoạn gen lõi (Core)), hoặc trong mợt sớ trường hợp thực hiện nghiên cứu hoặc ở mức đợ phòng thí nghiệm người ta thực hiện giải trình tự trên đoạn gen lõi (Core) hay đoạn gen NS5B, từ đó mới xác định chính xác các kiểu gen của HCV, đặc biệt là kiểu gen 6.
Trong tương lai, nếu xác định genotype bằng kỹ thuật LiPa thế hệ 2 sẽ cho kết quả chính xác hơn.
- Lượng virus:
Lượng HCV RNA trước điều trị ít quan trọng hơn yếu tố genotype virus, là một yếu tố tiên đốn đáp ứng virus bền vững khi sử dụng liệu pháp điều trị IFN [72]. Khi lượng HCV RNA cao cho phép dự đốn tỉ lệ đáp ứng sẽ thấp. Lượng virus cao (giá trị giới hạn là 2.000.000 copies/mL hoặc
800.000 IU/mL) ảnh hưởng tới tỉ lệ đáp ứng của bệnh nhân nhiễm HCV genotype 1 (41% và 56%) nhưng khơng ảnh hưởng tới những bệnh nhân nhiễm HCV genotype 2 hoặc 3 (74% và 81%) [45]. Trong trường hợp đã xác định HCV genotype của bệnh nhân viêm gan C, xét nghiệm xác định lượng HCV RNA chỉ cĩ giá trị và được khuyến cáo sử dụng cho trường hợp nhiễm HCV genotype 1. Đối với những bệnh nhân nhiễm HCV genotype 2 hoặc 3, lượng virus ít cĩ giá trị [117].
Trong nghiên cứu của chúng tơi, ở nhĩm I, SVR ở nhĩm virus thấp là 72,72% và 84,61% ở nhĩm virus cao (p > 0,05). Ở nhĩm II, SVR ở nhĩm virus thấp 94,44% và 71,42% ở nhĩm virus cao (p > 0,05). Chúng tơi thấy cả 2 nhĩm đều khơng cĩ sự khác biệt về SVR đối với lượng virus. Những nghiên
cứu khác, lượng virus ảnh hưởng nhiều đối với genotype 1, trong nghiên cứu của chúng tơi khơng cĩ sự khác biệt này. Như giải thích ở trên cĩ thể là genotype 6 lẫn trong genotype 1 nên ít thấy cĩ sự khác biệt về SVR đối với lượng virus trong nghiên cứu này.