Công tác lập kế hoạch đấu thầu cho một số gói thầu còn chưa đúng quy trình, việc tính toán chi phí chưa đầy đủ khiến giá gói thầu chưa thật sự chính xác. Nhiều trường hợp do không tính toán đến lượng hàng hóa cần bổ sung, mua mới và nâng cấp nên dẫn đến hiện tượng thiếu sót cũng như vượt quá nhu cầu thực tế, gây lãng phí nguồn vốn kinh doanh và chất lượng của gói thầu. Có trường hợp phải tiến hành đấu thầu lại do không có nhà thầu nào trúng thầu và đến lần đấu thầu thứ hai đã phải tiến hành điều chỉnh tổng dự toán, gây ra tổn thất về thời gian.
Ví dụ: trong gói thầu “Mua sắm cột bê tông” thuộc dự án “ Đầu tư cáp ngọn và cáp trung gian cho các trạm truy nhập huyện Bắc Sơn - VTLS năm 2008”, sau khi lựa chọn được nhà thầu trúng thầu, hai bên đã tiến hành kí kết hợp đồng. Tuy nhiên, đến thời điểm giao hàng, tức là ngày 11/11/2008, do lúc này giá cả thị trường của cột bê tông đã tăng giá nên nhà thầu trúng thầu đã không thực hiện trách nhiệm giao hàng mà đem cột bê tông để bán ra thị trường. Nhà thầu đó đã chấp nhận mức phạt do không thực hiện hợp đồng là 30 triệu đồng vì nếu bán ra thị trường thì họ sẽ được lợi hơn. Điều này đã gây ra thiệt hại lớn cho Viễn Thông Lạng Sơn. Do trong khi lập kế hoạch đấu thầu đã không tính toán được đầy đủ mức biến động của thị trường có thể tác động đến giá của gói thầu. Tuy nhận được 30 triệu tiền phạt nhưng sau đó VTLS đã phải mất thời gian lập lại kế hoạch đấu thầu và phải tổ chức lại đấu thầu, gậy thiệt hại về chi phí và thời gian cũng như tiến độ tiến hành dự án.