+ Trong giai đoạn chuẩn bị đầu t:
Thanh tra các bớc tiến hành chuẩn bị đầu t, phát hiện những sai phạm về bỏ qua các bớc trong giai đoạn chuẩn bị đầu t hoặc thực hiện không đúng trình tự dẫn đến sự lãng phí, kém hiệu quả của dự án đầu t.
Xem xét những căn cứ để xác định hiệu quả kinh tế của dự án và phơng án huy động vốn đầu t do chủ đầu t lập thể hiện ở báo cáo nghiên cứu khả thi với nội dung các văn bản và thông tin của các ngành liên quan, để đánh giá việc xây dựng dự án cha dựa vào số liệu tình hình thực tế, các số liệu thông tin không do các cơ quan chức năng cung cấp, việc xây dựng phơng án huy động, sử dụng vốn không phù hợp với khả năng của đơn vị.
Thanh tra việc chấp hành thời gian và thẩm quyền phê duyệt các văn bản chuẩn bị đầu t, xem xét tính chất pháp lý của các hồ sơ để phát hiện trờng hợp thẩm định dự án đầu t, quyết định đầu t không đúng thẩm quyền, không đúng
thời gian quy định, những bổ sung, sửa đổi phơng án đầu t không đúng trình tự, thẩm quyền.
+ Trong giai đoạn thực hiện đầu t:
Xem xét tính đầy đủ và trình tự thực hiện những công việc trong giai đoạn đầu t nh: xin giao đất hoặc thuê đất theo quy định của Nhà nớc; chuẩn bị mặt bằng xây dựng, tổ chức tuyển chọn t vấn khảo sát, thiết kế, giám định kỹ thuật và chất lợng công trình; thẩm định thiết kế công trình; tổ chức đấu thầu mua sắm thiết bị, thi công xây lắp; xin giấy phép xây dựng và giấy phép khai thác tài nguyên; ký kết với nhà thầu để thực hiện dự án; thi công xây lắp công trình; theo dõi, kiểm tra việc thực hiện hợp đồng để phát hiện việc thực hiện không đầy đủ nội dung, không đúng trình tự trong giai đoạn đầu t.
Thanh tra thẩm quyền phê duyệt tổng dự toán và thiết kế kỹ thuật để phát hiện việc phê duyệt tổng dự toán và thiết kế kỹ thuật để phát hiện việc phê duyệt tổng dự toán và thiết kế kỹ thuật sai thẩm quyền.
Xem xét định mức và đơn giá trong xây dựng tổng dự toán để phát hiện việc xây dựng tổng dự toán sai do áp dụng sai đơn giá, định mức.
Thanh tra việc tổ chức đấu thầu dự án, phát hiện dự án không tổ chức đấu thầu, đấu thầu mang tính hình thức, thang điểm để xét thầu và xét thầu không đúng chế độ, phê duyệt kết quả trúng thầu không đúng thẩm quyền.
Thanh tra việc thực hiện thủ tục đền bù giải phóng mặt bằng, điều kiện đ- ợc đền bù và mức đền bù giải phóng mặt bằng để phát hiện việc đền bù cha đủ hồ sơ, không đủ điều kiện, mức đền bù sai với quy định dẫn đến thất thoát trong khâu đền bù.
Thanh tra việc thực hiện những thủ tục trong nghiệm thu thanh quyết toán khối lợng XDCB hoàn thành.
+ Giai đoạn kết thúc xây dựng dự án đa vào sử dụng:
Kiểm tra quyết toán vốn đầu t, phát hiện những dự án không quyết toán vốn đầu t, thời gian lập báo cáo quyết toán vốn đầu t chậm so với quy định, báo cáo quyết toán vốn đầu t không chính xác, việc quy đổi vốn đầu t đã thực hiện
về mặt bằng giá trị tại thời điểm bàn giao sai dẫn đến xác định giá trị TSCĐ tăng không đúng.
Thanh tra việc thẩm định và phê duyệt quyết toán vốn đầu t, phát hiện các sai phạm: không thẩm tra quyết toán, thẩm tra không hết các nội dung của quyết toán và việc phê duyệt quyết toán vốn đầu t sai thẩm quyền.