- Đối với phương phỏp xỏc định định mức chi theo học sinh cú ưu điểm đảm bảo đủ ngõn sỏch chi thường xuyờn cho cỏc trường; Đối với khu vực giỏo dục đào tạo đó
2.3.1. Những hạn chế
Một: Chưa thống nhất quản lý ngõn sỏch giỏo dục theo toàn ngành, mặc dự nhiều địa phương đó chỉ đạo và thực hiện quản lý ngõn sỏch theo ngành nhưng quỏ trỡnh thực hiện vẫn cũn chắp vỏ, chưa đồng bộ hoặc chưa cú sự thống nhất từ trung ương xuống, điều này gõy khú khăn cho cụng tỏc chỉ đạo của Bộ chủ quản và cỏc cơ quan tổng hợp của Nhà nước. Bộ Giỏo dục và Đào tạo hoặc Bộ Tài chớnh cũng khú cú thể tổng hợp một cỏch kịp thời và chớnh xỏc về tỡnh hỡnh thực hiện ngõn sỏch giỏo dục - đào tạo của cỏc địa phương, cỏc Bộ, cỏc ngành. Để thực hiện được những yờu cầu của giai đoạn phỏt triển mới đũi hỏi phải thống nhất quản lý ngõn sỏch giỏo dục - đào tạo theo ngành đi đụi với cụng tỏc quản lý giỏo dục - đào tạo toàn ngành.
Hai: Việc xõy dựng kế hoạch ngõn sỏch, điều hành ngõn sỏch giỏo dục - đào tạo cũn chưa gắn với mục tiờu, định hướng phỏt triển giỏo dục ngắn hạn và dài hạn (chưa gắn với kết quả đầu ra). Đầu tư xõy dựng cơ sở vật chất trường sở cũn dàn trải, thiếu đồng bộ, khụng trọng tõm trọng điểm, nhất là đối với khối đào tạo.
Ba: Sự phối hợp và phõn định trỏch nhiệm của cỏc cơ quan Giỏo dục - Đào tạo, Tài chớnh Vật giỏ và Kế hoạch Đầu tư trong quản lý và điều hành ngõn sỏch giỏo dục - đào tạo chưa rừ ràng, do vậy cơ chế phõn bổ và điều hành ngõn sỏch giỏo dục - đào tạo ở cỏc địa phương thiếu thống nhất, rất khỏc nhau giữa cỏc địa phương. Trỡnh độ tổ chức cụng tỏc kế toỏn ở cỏc trường học phổ thụng hiện nay cũn yếu đặc biệt đối với khối mầm non, tiểu học và THCS. ở nhiều trường cụng tỏc kế toỏn cũn rất thụ sơ, cỏn bộ kế toỏn
khụng qua đào tạo, sử dụng cả giỏo viờn kiờm nhiệm chưa đỏp ứng được yờu cầu của cụng tỏc quản lý tài chớnh trong trường học.
Bốn: Chưa tạo quyền chủ động sử dụng ngõn sỏch cho cỏc cơ sở giỏo dục - đào tạo. Phõn bổ ngõn sỏch giỏo dục - đào tạo cũn chưa cụng bằng dẫn đến tỡnh trạng khú kiểm tra đỏnh giỏ hiệu quả sử dụng ngõn sỏch giỏo dục - đào tạo.
Năm: Nguồn thu ngoài ngõn sỏch trong ngành giỏo dục - đào tạo hiện nay là rất lớn nhưng chưa được cõn đối đầy đủ trong ngõn sỏch nhà nước, đặc biệt là cỏc khoản đúng gúp của gia đỡnh học sinh và người học. Nguồn thu về hợp tỏc quốc tế thụng qua cỏc dự ỏn viện trợ khụng hoàn lại, cỏc dự ỏn vay nợ ưu đói...chưa được quản lý tập trung và hạch toỏn đầy đủ do vậy rất khú cú thể thống kờ được số kinh phớ này hàng năm bổ sung cho ngõn sỏch giỏo dục là bao nhiờu.