Bước vào giai đoạn mới, bên cạnh thời cơ, chúng ta phải đương đầu với những thách thức hết sức gay gắt liên quan đến sự tồn vong của Đảng và của chế độ. Trong bối cảnh đó, công tác xây dựng Đảng nói chung, việc xây dựng, củng cố tổ chức cơ sở đảng trong các doanh nghiệp nhà nước cổ phần hoá nói riêng càng có ý nghĩa quan trọng. Nghị quyết Đại hội tỉnh Đảng bộ Quảng Bình lần thứ XIV đã đề ra: "Tiếp tục phát triển, kiện toàn hệ thống tổ chức cơ sở đảng, đặc biệt là trong các doanh nghiệp ngoài quốc doanh, vùng sâu, vùng xa, vùng đồng bào có đạo, đồng bào dân tộc ít người" [32, tr.39].
Quá trình đổi mới, cổ phần hoá doanh nghiệp, nếu chỉ đơn thuần nghĩ đến việc chuyển đổi kinh tế, mà xem nhẹ công tác xây dựng và củng cố tổ chức Đảng trong doanh nghiệp sẽ dẫn đến sự suy yếu vai trò lãnh đạo của Đảng. Vì vậy, phương hướng xây dựng và củng cố tổ chức cơ cở đảng trong các doanh nghiệp đã cổ phần hoá ở Quảng Bình là:
- Nâng cao năng lực lãnh đạo của tổ chức cơ sở đảng trong từng doanh nghiệp cổ phần hoá, xây dựng tổ chức cơ sở đảng đủ sức lãnh đạo doanh nghiệp thực hiện tốt quá trình sản xuất kinh doanh, đem lại hiệu quả kinh tế cao.
- Quan tâm nâng cao chất lượng về chính trị và chuyên môn cho đội ngũ cán bộ, đảng viên thông qua đào tạo, đào tạo lại, kết hợp với thực tiễn phong phú đã được đúc kết rút kinh nghiệm. Đẩy mạnh công tác giáo dục chính trị, tư tưởng, nâng cao nhận thức cấp uỷ viên và đảng viên trong doanh nghiệp cổ phần hoá để khắc phục kịp thời các xu hướng lệch lạc trong nhận thức và hành động, nhất là chú trọng công tác sản xuất - kinh doanh mà xem nhẹ công tác xây dựng Đảng.
- Đổi mới hoàn thiện phương thức lãnh đạo của tổ chức cơ sở đảng trong doanh nghiệp nhà nước cổ phần hoá cho phù hợp, nâng cao sức chiến đấu của các tổ chức đảng, cấp uỷ Đảng và đảng viên.
- Xây dựng tổ chức đoàn thể vững mạnh, đoàn kết thống nhất, làm việc có hiệu quả, đặc biệt chú trọng là tổ chức công đoàn và đoàn thanh niên. Xây dựng cơ chế hữu hiệu để phát hiện, đào tạo, bồi dưỡng sử dụng nhân tài, không phân biệt đối xử người trong Đảng hay ngoài Đảng.