Ngành sản xuất công nghiệp tiếp tục tăng trưởng với tốc độ cao nhờ khu KTM Chu Lai, các Khu công nghiệp và các mô hình cụm CN mới với những chính sách ưu đãi hấp dẫn đã thu hút được nhiều dự án công nghiệp, tăng nhanh khối lượng giá trị sản xuất, giải quyết việc làm và tạo sự chuyển dịch cơ cấu kinh tế tích cực. Nhiều sản phẩm công nghiệp mới như gạch men, ngói màu, mô tô, ô tô, giày thể thao, gỗ xuất
khẩu, bia, nước giải khát, thuỷ sản chế biến, tinh bột sắn, nước dứa cô đặc, thức ăn nuôi trồng thuỷ sản… đã được đưa ra thị trường trong và ngoài nước.
Trong năm 2006 do ảnh hưởng của bão số 6 quá mạnh nên gây thiệt hại lớn đối với ngành công nghiệp của. Có 124 doanh nghiệp bị thiệt hại với tổng giá trị thiệt hại ước tính 103,2 tỷ đồng, số lao động tạm ngưng làm việc khoảng 3.500 người, làm ảnh hưởng đến giá trị sản xuất của tháng 10 chỉ đạt 346,36 tỷ đồng, giảm 5,9% so tháng trước (tăng 22,1% so cùng kỳ), trong đó nhà nước Trung ương giảm 1,72%; nhà nước địa phương giảm 3,7% và ngoài nhà nước giảm 7,1%, một số địa phương có giá trị sản xuất công nghiệp giảm như: Đại Lộc giảm 28,8%, Quế Sơn giảm 28%, Hội An giảm 10,74%... Tính chung cả năm ước đạt 3.345,5 tỷ đồng, tăng 26,6% so cùng kỳ, đạt 81,9% so kế hoạch năm. Tốc độ tăng cao so cùng kỳ chủ yếu tập trung ở khu vực ngoài nhà nước tăng 34,75% và khu vực có vốn đầu tư nước ngoài tăng 64%. So với kế hoạch năm 2006 khu vực ngoài nhà nước đạt 88,55% KH với giá trị đạt 2.452,72 tỷ đồng; khu vực có vốn đầu tư nước ngoài đạt 206,2 tỷ đồng, bằng 73,64% KH. So với cùng kỳ công nghiệp QDTW tăng gần 14%; công nghiệp quốc doanh địa phương giảm 10,1% và mới đạt 61,7% kế hoạch năm do một số doanh nghiệp đã cổ phần hoá chuyển sang ngoài nhà nước. Ngành công nghiệp khai thác trong năm ước đạt 178,23 tỷ đồng, tăng 23,8% so cùng kỳ. Giá trị sản xuất ngành công nghiệp chế biến ước đạt 3.091,5 tỷ đồng, tăng 27,48% so cùng kỳ, trong đó: ngành chế biến thực phẩm, thức uống tăng 9,28%; dệt vải các loại tăng 39,9%; sản xuất trang phục tăng 34,15%; giày da tăng 64,74%; chế biến gỗ và sản phẩm từ gỗ tăng 17,42%; sản xuất gạch, bê tông tăng 43,38%. Ngành sản xuất và phân phối điện, nước, gas tăng 3,35% so cùng kỳ, đạt 75,76 tỷ đồng. Một số sản phẩm công nghiệp chủ yếu trong tỉnh tăng như: quần áo may sẵn, vải dệt các loại, gạch xây, gạch men cao cấp,…Tuy nhiên, một số sản phẩm khác giảm so với cùng kỳ như: thủy sản chế biến các loại ước 10 tháng giảm 4,1%, nguyên nhân do Cty XNK thủy sản trong những tháng đầu năm tập trung cổ phần hoá, bên
cạnh đó thời tiết trên biển không thuận nên nguyên liệu khan hiếm ...; ô tô lắp ráp do tiêu thụ chậm nên giảm 26,8%.