Thực hiện kế hoạch kiểm toán là quá trình sử dụng các phơng pháp kỹ thuật kiểm toán thích ứng với đối tợng kiểm toán cụ thể để thu thập bằng chứng kiểm toán. Đó là quá trình triển khai một cách chủ động và tích cực các kế hoạch, ch- ơng trình kiểm toán nhằm đa ra những ý kiến xác thực về mức độ trung thực và hợp lý của Báo cáo tài chính trên cơ sở những bằng chứng kiểm toán đầy đủ và tin cậy.
Nh vậy, thực hiện kế hoạch kiểm toán không chỉ là quá trình triển khai một cách máy móc kế hoạch đã vạch ra, cũng không phải là quá trình thu thập một cách thụ động các bằng chứng kiểm toán theo định hớng trong kế hoạch kiểm toán hoặc tràn lan theo diễn biến của thực tiễn. Trái lại đó là một quá trình chủ động
thực hiện các kế hoạch và chơng trình kiểm toán kết hợp với khả năng của kiểm toán viên để có đợc những kết luận xác đáng về mức độ trung thực và hợp lý của Báo cáo tài chính.
Trong giai đoạn thực hiện kiểm toán kiểm toán viên cần tiến hành các thử nghiệm kiểm soát và các thử nghiệm cơ bản đối với kiểm toán các khoản vay, nợ. Trong đó thử nghiệm kiểm soát là việc kiểm tra để thu thập bằng chứng kiểm toán về sự thiết kế phù hợp và sự vận hành hiện hữu của hệ thống kế toán và hệ thống kiểm soát nội bộ và thử nghiệm cơ bản là việc kiểm tra đợc thực hiện để thu thập bằng chứng kiểm toán liên quan tới Báo cáo tài chính nhằm phát hiện ra những sai sót trọng yếu trên Báo cáo tài chính.