Các enzyme thường cĩ trong các tế bào động thực vật và vi sinh vật và một số enzyme ngoại bào sẽ cĩ trong mơi trường nuơi cấy vi sinh vật.để tách chiết chúng ra cĩ các cách như sau:
Nghiền tế bào (phá vỡ tế bào): cĩ thể dùng phương pháp vật lý, hĩa học hoặc sinh học.
Phương pháp vật lý: các phương pháp xay nghiền ở nhiệtđộ thấp hay dùng Nitơ lỏng. Khiđĩ nước trong tế bào bị kết tinh và tăng lực ma sát khi xay nghiền phá vỡ màng tế bào.
Phương pháp hĩa học: xử lý tế bào bằng các dung mơi cĩ khả năng hịa tan màng tế bào. Phần lớn người ta cĩ thể chọn các dung mơi hữu cơ hịa tanđược chất béo hoặc xử lý kiềm.
Phương pháp sinh học: hay cịn gọi là phương pháp tự phân (autolyse). Sử dụng lyxosom trong tế bàođể giải phĩng các enzyme phá hủy tế bào hoặc bổ sung các chế phẩm enzyme phá vỡ màng tế bào.
Trích ly enzyme:
Tùy loại enzyme người ta sẽ chọn dung mơi thích hợp để trích ly. Phần lớn dung mơi là các muối lỗng hay là dung dịchđệm cĩ pH xácđịnh.
Kết tủa enzyme:
Sử dụng các dung mơi khác nhau để kết tủa enzyme. Các tác nhân này phải là các tác nhân biến tính thuận nghịch proteinđể sau khi kết tủa cĩ thể hịa tan lạiđược. Bao gồm:
Muối trung tính: từng loại protein cĩ thể kết tủa bởi các nồngđộ muối khác nhau. Các muối trung tính thườngđược chọn là (NH4)2SO4, Na2SO4, MgSO4, MgCl2, NaCl. Phương pháp này cịn gọi là phương pháp diêm tích.
Sauđĩ ly tâm, thu kết tủa enzyme và sấy ở nhiệtđộ khơng quá 40oC. Loại tạp chất cĩ phân tử lượng nhỏ:
Bằng phương pháp thẩm tích, dùng các màng bán thấm bằng vật liệu cĩ kích thước lỗ màng nhỏ cĩ thể cho các chất cĩ phân tử lượng nhỏđi qua do chênh lệch áp suất và giữ lại các chất cĩ phân tử lượng lớn.
Loại protein tạp:
Dùng phương pháp sắc ký, gồm sắc ký hấp phụ hoặc sắc ký traođổi ion, sắc ký lọc gel. Hoặc dùng phương phápđiện di: dùngđiện trườngđể tách các protein tíchđiện khác nhau. Làmđặc – tiêu chuẩn hĩa sản phẩm:
Dùng sấy thăng hoa hoặc các chế phẩm lỏng được siêu lọc và phải tiêu chuẩn hĩa sản phẩm: chế phẩm phải cĩ hoạt tính riêng nhấtđịnh.