Cũng như các trường THPT khác mục tiêu cơ bản của GD trong nhà trường THPT Chuyên Hà Nội - Amsterdam trong giai đoạn hiện nay là: Tiếp tục thực hiện GD toàn diện, hoàn thành việc cung cấp cho HS học vấn phổ thông theo một chuẩn thống nhất, đồng thời tạo điều kiện cho sự phát huy năng lực và sở trường của HS ở một mức độ nhất định, như kết hợp nâng cao trình độ với rèn luyện kĩ năng thực hành, kĩ năng sống; tổ chức các hoạt động ngoài giờ lên lớp, GD thể chất, hướng nghiệp, ngoại khóa; bồi dưỡng HS có năng khiếu; giao lưu với học sinh trong và ngoài nước đáp ứng yêu cầu mới của giáo dục trong thế kỷ 21 “Học để biết - Học để làm người - Học để làm việc - Học để hoà nhập” sau này trở thành những người công dân có tri thức toàn diện, tự chủ và sáng tạo trong hội nhập quốc tế.
Mục tiêu của môn học tiếng Trung của trường THPT Chuyên Hà Nội - Amsterdam: Tiếng Trung là một trong các ngôn ngữ trên thế giới được nhiều người sử dụng nhất và cũng là một trong sáu thứ tiếng được tổ chức Liên Hợp Quốc sử dụng làm ngôn ngữ làm việc chính thức. Với tư cách là môn văn hóa cơ bản, bắt buộc trong chương trình giáo dục phổ thông. Dạy học môn tiếng Trung nhằm giúp HS sử dụng được tiếng Trung như một công cụ giao tiếp ở mức độ cơ bản dưới các dạng nghe, nói, đọc, viết có kiến thức cơ bản tương đối hệ thống và hoàn chỉnh về tiếng Trung phù hợp với trình độ, đặc điểm tâm lý lứa tuổi, có hiểu biết khái quát về đất nước, con người và nét đẹp văn hóa của một số nước nói tiếng Trung, từ đó sẽ
giúp các em thêm một ngôn ngữ, một phương tiện giao tiếp quan trọng và có thái độ, tình cảm tốt đẹp đối với đất nước, con người có nền văn hóa, ngôn ngữ của các nước nói tiếng Trung, biết tự hào, yêu quý và tôn trọng nền văn hóa và ngôn ngữ của dân tộc mình, thêm yêu quý Tổ quốc Việt Nam ngàn lần thương yêu.