Đánh giá hiệu quả nhân bản của các cặp mồ

Một phần của tài liệu Định danh các type gen của Helicobacter pylori và ý nghĩa bệnh học trong ung thư dạ dày ( Bệnh viện Đại học Y Dược Tp.HCM chủ nhiệm đê tài PGS.TS. Trần Thiện Trung ) (Trang 28 - 30)

KẾT QUẢ NGHIÊN CỨU

3.1.3.1. Đánh giá hiệu quả nhân bản của các cặp mồ

Chúng tôi so sánh hiệu quả nhân bản của 2 cặp mồi cho mỗi gene. Tiêu chí để chọn cặp mồi phù hợp là cho sản phẩm nhân bản đặc hiệu có hàm lượng cao, không có sản phẩm ký sinh.

Các mẫu dùng cho khảo sát này là DNA từ 2 chủng H. pylori J99 (ATCC

700824) có kiểu gene cagA (+), vacA s1m1; urease (+), và chủng Tx30a (ATCC 51932) có kiểu gene cagA (-), vacA s2m2; urease (+) ; và DNA từ 2 chủng lâm sàng đã được

giải trình tự, có kiểu gene là cagA (+), vacA s1m1, urease (+); và cagA (+), vacA s1m2,

urease (+). Hai cặp mồi nhân bản hai gene chứng nội cũng được so sánh.

Hình 3.6. Điện di sản phẩm PCR trên 2 chủng H. pylori ATCC với từng cặp mồi.

Hình 3.6A. Sản phẩm PCR với 2 cặp mồi đặc hiệu cho vacA s1/s2, HP2-F/R và HP7-

F/R. Hình 3.6 B. Sản phẩm PCR với 2 cặp mồi đặc hiệu cho vacA m1/m2, HP3-F/R và HP8-F/R. Hình 3.6 C. Sản phẩm PCR với 2 cặp mồi đặc hiệu cho gene urease, HP-4F/R và HP9-F/R. Hình 3.6 D. Sản phẩm PCR với 2 cặp mồi đặc hiệu cho cagA, HP1-F/R và HP6-F/R. Hình 3.6 E. Sản phẩm PCR với 2 cặp mồi đặc hiệu cho 2 gene chứng nội h- GST và smad4, HP5-F/R và HP10-F/R.

Đối với vùng gene cagA và vacA s1/s2 và m1/m2 thì các cặp mồi HP1-F/R, HP2- F/R, HP3-F/R cho kết quả đúng theo tiêu chí chọn lựa. Đối với gene urease và 2 gene

chứng nội các cặp mồi khảo sát cho hiệu quả nhân bản như nhau.

Chúng tôi chọn các cặp mồi sau cho các nội dung tiếp theo: HP1-F/R, HP2-F/R, HP3-F/R, HP4-F/R, HP5-F/R.

A B

C D

Một phần của tài liệu Định danh các type gen của Helicobacter pylori và ý nghĩa bệnh học trong ung thư dạ dày ( Bệnh viện Đại học Y Dược Tp.HCM chủ nhiệm đê tài PGS.TS. Trần Thiện Trung ) (Trang 28 - 30)