Rất nhiều vấn đề nảy sinh từ cỏc hệ thống cú thể giải quyết bằng cỏc phương phỏp khoa học, cú thể là cỏc biện phỏp khoa học trong quản lý điều hành với cỏc cụng nghệ khoa học cú logic và cú cấu trỳc của nú. Phương phỏp giải quyết khoa học đú gọi là phương phỏp phõn tớch hệ thống.
Cú rất nhiều phương phỏp phõn tớch, cú khi là hỡnh thức nhưng cũng cú khi là phi hỡnh thức như:
a. Phương phỏp tối ưu húa
Tối ưu húa là phương phỏp mà lời giải được cho là tối ưu, được xỏc định và thực hiện bởi cỏc hàm mục tiờu khai thỏc hệ thống. Hay mục tiờu khai thỏc hệ thống đó được lượng húa bằng cỏc hàm mục tiờu.
b. Phương phỏp mụ phong
Phương phỏp mụ phỏng là sử dụng mụ hỡnh mụ phỏng để tỡm phương ỏn cú lợi hay phương ỏn tiệm cận với tối ưu.
Đú là việc sử dụng mụ hỡnh tối ưu để tỡm được nghiệm tốt nhất cho một phương ỏn quản lý nào đú. Chẳng hạn, trong quy hoạch tài nguyờn nước người ta đó xõy dựng một số phương ỏn khai thỏc thủy lợi trờn một lưu vực sụng hoặc trờn một địa giới hành chớnh nào đú rồi từ đú, qua phõn tớch để lựa chọn phương ỏn tốt nhất.
Việc sử dụng mụ hỡnh tối ưu thường xẩy ra cỏc trường hợp sau:
- Do một số điều kiện nào đấy mà khụng phải tất cả cỏc bài toỏn phõn tớch hệ thống đều cú mụ hỡnh mụ tả tối ưu .
- Khi khụng thể mụ tả được bằng mụ hỡnh tối ưu do nhiều hạn chế khỏc nhau, cũng cú thể do phương phỏp mụ tả (bằng toỏn học chẳng hạn).
- Lời giải tối ưu được giải cú khi chỉ là nghiệm cục bộ nờn phương ỏn được chọn khụng hẳn là phương ỏn tốt nhất hay ta đó bỏ sút phương ỏn tốt nhất.
Do những hạn chế trờn, nờn người ta đó sử dụng phương phỏp mụ phỏng để phõn tớch hiệu quả của từng phương ỏn nhằm tỡm phương ỏn tốt nhất.
Việc tỡm phương ỏn tốt nhất bằng mụ phỏng bằng việc thiết lập một số kịnh bản để lựa chọn lại là một nhược điểm của phương phỏp mụ phỏng. Bởi vỡ người mụ phỏng cũng khụng thể khẳng định rằng phương ỏn được chọn là phương ỏn tối ưu, trong khi ta chỉ chỉ xõy dựng được một số phương ỏn để phõn tớch mà khụng phải tất cả. Núi đỳng hơn, cú thể ta đó bỏ sút phương ỏn tốt nhất ngoài cỏc kịch bản được đưa ra để lựa chọn.
Sự khỏc biệt giữa hai phương phỏp tối ưu húa và mụ phỏng được thể hiện ở chỗ:
- Phương phỏp mụ phỏng khụng giải bài toỏn tối ưu mà chỉ tỡm giỏ trị tốt nhất trong cỏc kịch bản được trỡnh bày.
- Nghiệm tối ưu trong phương phỏp tối ưu là nghiệm chấp nhận do lời giải đưa ra do đó được giản húa trong mụ phỏng.
Nhằm khắc phục những tồn tại trờn, người ta thường sử dụng kết hợp cả hai phương phỏp để phõn tớch hệ thống.