5. BIẾN NẠP, TÁCH DÒNG VÀ GIẢI TRÌNH TỰ ĐOẠN GEN β-
5.2 Giải trình tự đoạn gen β-globin có đột biến Cd17
Kết quả giải trình tự trình tự đoạn gen β-globin của mẫu T57 đƣợc trình bày ở Phụ lục 4. So sánh trình tự nucleotide đoạn gen β-globin của mẫu T57 với ngân hàng dữ liệu NCBI (Hình 3.10) cho kết quả tƣơng đồng 99% với trình tự tham chiếu gen β-globin của ngƣời. Có 4 vị trí sai khác của mẫu T57 với trình tự gen β-globin (khoanh đỏ trên hình). Trong đó có đột biến thay thế nucleotide A thành nucleotide T tại vị trí Cd 17 làm thay đổi bộ ba mã hóa axit amin Lysin (AAG) thành bộ ba kết thúc (TAG). Đây cũng chính là đột biến trên mẫu T57 chúng tôi phát hiện đƣợc bằng kỹ thuật ARMS-PCR.
62
Hình 3.10. Kết quả so sánh trình tự đoạn gen β-globin của mẫu T57 với ngân hàng dữ liệu NCBI. Query: trình tự đoạn gen β-globin của mẫu T57; Sbjct: trình tự đoạn gen β-globin của ngƣời; Identities: độ tƣơng đồng tính theo tỷ lệ % các nucleotide giống nhau trên tổng số nucleotide đƣợc so sánh.
Ngoài ra còn có 3 vị trí sai khác của trình đoạn gen β-globin của mẫu T57 với trình tự gen β-globin: thay thế nucleotide T thành nucleotide C tại vị trí 116 của intron 1, thêm nucleotide T tại vị trí 98 của intron 2, thay thế nucleotide C thành nucleotide T tại vị trí Cd 80 làm thay đổi bộ ba AAC thành AAT nhƣng vẫn mã hóa cho axit amin asparagin. Các biến đổi tại các vị trí intron không nằm trong trình tự cắt nối intron-exon; đồng thời, chúng tôi cũng không tìm thấy có tài liệu nào nói về biến đổi tại vị trí này có ảnh hƣởng tới quá trình tổng hợp chuỗi β-globin.