Nội dung Kiểm tra người nộp thuế tập trung vào những vấn đề chủ yếu sau:
2.1.3.1. Kiểm tra việc chấp hành những quy định vềđăng ký thuế
Khi NNT nộp hồ sơ đăng ký thuế trực tiếp cơ quan thuế tiếp nhận kiểm tra ngay hồ sơ đăng ký thuế của NNT. Trường hợp hồ sơ đăng ký thuế không đầy đủ, không đúng thủ tục quy định, bộ phận TTHT yêu cầu NNT lập hồ sơ đăng ký thuế thay thế hoặc chỉnh sửa, bổ sung các thông tin kê khai còn thiếu theo quy định tại Thông tư số 85/2007/TT-BTC ngày 18/07/2007 hướng dẫn thi hành Luật Quản lý thuế về việc đăng ký thuế (Sau đây gọi là Thông tư số 85/2007/TT-BTC).
Trường hợp hồ sơ đăng ký thuế do NNT chuyển đến cơ quan thuế qua đường bưu chính cơ quan thuế tiếp nhận hồ sơ. Sau khi nhận hồ sơ, bộ phận đăng ký thuế thực hiện kiểm tra tính đầy đủ, hợp lệ của các hồ sơ đăng ký
Học viện Nông nghiệp Việt Nam – Luận văn Thạc sỹ Khoa học Kinh tế Page 25 thuế theo quy định tại Thông tư số 85/2007/TT-BTC. Trường hợp hồ sơ đăng ký thuế của NNT không đầy đủ, không đúng thủ tục quy định, bộ phận đăng ký thuế phải lập và gửi cho NNT thông báo về việc hồ sơ đăng ký thuế chưa đúng thủ tục quy định (Theo mẫu ban hành kèm theo Quy trình Tuyên truyền và hỗ trợ NNT của Tổng cục Thuế) hoặc liên hệ qua điện thoại, thư điện tử để yêu cầu NNT lập hồ sơ đăng ký thuế thay thế hoặc bổ sung thêm các thông tin khai còn thiếu theo quy định tại Thông tư số 85/2007/TT-BTC.
2.1.3.2. Kiểm tra việc chấp hành chếđộ kế toán, hoá đơn, chứng từ
Là việc kiểm tra quyết toán thuế kết hợp kiểm tra việc thực hiện chế độ kế toán, hoá đơn, chứng từ đối chiếu với quy định, nếu sai phạm xử lý theo luật thuế TNCN hiện hành.
2.1.3.3. Kiểm tra việc thực hiện kê khai thuế, tính thuế và nộp thuế
Cơ quan thuế tiếp nhận hồ sơ khai thuế của NNT nộp và thực hiện: + Kiểm tra tính đầy đủ, hợp pháp, đúng thủ tục của hồ sơ khai thuế theo quy định của Luật Quản lý thuế và các văn bản hướng dẫn thi hành Luật
+ Hướng dẫn, cung cấp mẫu biểu cho NNT để bổ sung, điều chỉnh hồ sơ khai thuế nếu hồ sơ chưa đảm bảo tính đầy đủ, hợp pháp, đúng thủ tục quy định