Ngoài nguồn vốn huy động thì vốn điều hòa từ NH cấp trên là rất cần thiết, góp phần giúp cho hoạt động của NH ổn định. Nguồn vốn điều hòa là nguồn vốn từ NH hội sở chuyển xuống với chi phí cao hơn chi phí huy động tại chỗ do nguồn này được hình thành khi các chi nhánh huy động dư thừa chuyển về hội sở để cho các chi nhánh huy động thiếu vay lại. Nhìn chung thì nguồn vốn điều hòa giảm dần qua các năm cụ thể năm 2012 vốn điều chuyển giảm 46.931 triệu đồng giảm 18,43%. Tỷ trọng sử dụng vốn NHNo cấp trên đã giảm nhiều, nhất là vào cuối năm đã tạo thuận lợi cho NHNo Cai Lậy chủ động nguồn vốn để tăng trưởng mạnh dư nợ phục vụ phát triển kinh tế huyện nhà. Sang năm 2013 vốn điều chuyển tiếp tục giảm 46.911 triệu đồng giảm 15,24% điều đó cho thấy chính sách huy động của ngân hàng ngày càng có hiệu quả hơn, tận dụng được nguồn vốn tại chỗ với chi phí thấp, NH không còn phụ thuộc nhiều vào sự hỗ trợ của ngân hàng cấp trên. Hơn nữa, nguồn vốn điều hòa từ cấp trên có chi phí sử dụng cao nên NH phải giảm dần để giảm chi phí hoạt động nâng cao lợi nhuận cho NH. Việc sử dụng nguồn vốn điều hòa từ cấp trên sẽ không tốt cho NH vì chi phí cho việc sử dụng vốn này cao hơn vốn huy động tại chỗ và phụ thuộc vào NH hội sở, tính linh hoạt của NH sẽ bị hạn chế. Có thể thấy nguồn vốn này giảm qua các năm đây là một tín hiệu đáng mừng đối với NHNo Cai Lậy, cho thấy NH dần dần chủ động trong công tác huy động vốn tại chỗ của mình.