Ảnh hưởng mặn đến việc sản sinh ra proline được báo cáo ở một số giống lúa. Pokkali tích lũy proline trong chồi gấp 13 lần khi bị nhiễm mặn hơn so với điều kiện bình thường (IRRI, 1978; 1979) [114, 117]. Tuy nhiên, nhiều báo cáo cho thấy mối tương quan nghịch giữa tích lũy proline và khả năng chịu mặn (Handa et al., 1986) [93].
Proline tăng cường xuất hiện trong tiến trình sinh lý của giống (Bhattacharya, 1991) [56] và đã được liên hệ đến một sự thay đổi trong hoạt động của các enzym quy định proline như pyproline-5-carboxylate reductase và dehydrogenase L-proline (Roy et al., 1992) [209]. Các hoạt động của
enzyme trước đây được kích thích bởi giống chống chịu mặn trong điều kiện nhiễm mặn. Do đó, đã có đề xuất rằng hàm lượng proline (Prakash và Padayatty, 1989) [197] hoặc hoạt động của pyrroline-5-carboxylate reductase (Roy et al., 1992) [209] có thể được sử dụng như điểm đánh dấu sinh học để thanh lọc các giống cây trồng nhạy cảm và chống chịu trong giai đoạn nảy mầm sớm.
Các phản ứng hình thái và sinh hóa của mô sẹo và cây giống của các giống lúa khác nhau được so sánh trong điều kiện mặn. Mô sẹo của giống chống chịu và nhạy cảm cho thấy triệu chứng stress nghiêm trọng như có màu nâu và hoại tử, tuy nhiên giống Pokkali không biểu hiện. Giai đoạn mạ của Pokkali cho thấy các triệu chứng stress như quăn và già yếu của các lá già trong độ mặn cao hơn. Mặc dù thực vật có thể hồi phục lại sau stress, cây con của các giống cây trồng khác cho thấy các triệu chứng stress nghiêm trọng ngay cả ở độ mặn thấp và cây chết ở độ mặn cao hơn. Stress mặn gây ra sự tích tụ của proline trong mô sẹo và cây giống của tất cả các giống. Proline tích lũy cao trong các giống nhạy cảm hơn trong Pokkali. Những kết quả này cho thấy rằng tích lũy proline không liên quan trực tiếp đến khả năng chống chịu mặn của lúa (Renuka et al., 1997) [204].