... 1- Xâydựngphươngpháp nhận diện 21 dòng cacao dựa cặp primer microsatellite: mTcCIR7, mTcCIR8, mTcCIR11, mTcCIR15 mTcCIR18 2- Tối ưu hóa phươngpháp 3- Kiểm tra độ xác tính ổn định phươngpháp ... tính đa dạng di truyền 21 dòng cacao 2.2.Yêu cầu - Ly trích DNA từ mẫu với độ tinh khiết cao - Xâydựng qui trình PCR ổn định - Đánh giá khác biệt di truyền giống cacao khảo sát qua việc phân tích ... hóa phần mềm Cervus - Mô tả quan hệ di truyền gần xa giống cacao khảo sát phần mềm Genetix - Xâydựng qui trình cho phản ứng multiplex PCR ...
... cho thay đổi tiến hóa 2.5.5 Các phươngpháp phát microsatellite Có phươngpháp để phát microsatllite: phươngpháp lai phươngpháp PCR 2.5.5.1 .Phương pháp lai Phươngpháp lai ghép phân tử cho phép ... dài chúng bị hạn chế Trong phươngpháp lai có hai cách: phươngpháp phát nhờ đồng vị phóng xạ phươngpháp nhuộm bạc • Phươngpháp phát nhờ đồng vị phóng xạ Phươngpháp hiệu dùng đồng vị phóng ... microsatellite công cụ chủ yếu thay phươngpháp RFLP nghiên cứu lập đồ di truyền thực vật Ngoài ra, kết hợp phươngpháp microsatellite phươngpháp AFLP giúp cho việc xâydựng đồ di truyền cách chi tiết...
... gồm giai đoạn sau: • Giai đoạn 1: Xâydựngphươngpháp nhận diện 21 dòng cacao dựa cặp primer microsatellite mTcCIR7, mTcCIR8, mTcCIR11, mTcCIR15 mTcCIR18 Phươngpháp nhận diện gồm bước: 1- Lấy ... mềm Gene Mapper để đọc kết phân tích đoạn microsatellite dòng Ghi nhận liệu microsatellite 21 dòng cacao với primer • Giai đoạn 2: Kiểm tra độ xác tính ổn định phươngpháp nhận diện.qua bước: ... DNA tiếp tục tinh 3.2.4.Kiểm tra định lượng định tính DNA 3.2.4.1 Định tính DNA phươngphápđiện di Để kiểm tra kết li trích có thu DNA hay không, tiến hành điện di mẫu DNA li trích gel agarose...
... cacao giới ICGD không giống nhau, nguồn gốc lai tạo khác Tuy nhiên, kết cho thấy phươngpháp kỹ thuật phân tích chúng tơi với phươngpháp phân tích microsatellite ngân hàng cacao giới Điều hỗ trợ ... mTcCIR8 mTcCIR7 mTcCIR15 mTcCIR11 Hình 4.7 :Kết phân tích mẫu CT3 phươngphápkết hợp sản phẩm PCR riêng biệt với primer mTcCIR7, mTcCIR15 mTcCIR11 4.7 Kết phân tích tính đa dạng di truyền Với liệu ... mẫu đem phân tích trình tự kết tương tự thực phản ứng multiplex PCR Ưu điểm cách làm so với multiplex PCR kết hợp phân tích lúc primer có nhiệt độ lai khác (trong phươngpháp multiplex PCR đòi hỏi...
... 3.2.7 .Phương pháp phân tích trình tự máy giải trình tự DNA 45 3.2.8 .Phương pháp nhận diện phần mềm Cervus 46 3.2.9 .Phương pháp phân tích tính đa dạng di truyền phần mềm Genetix KẾT QUẢ ... Bảng 4.3: Kết nhận diện mẫu mã hóa 56 Bảng 4.4: Kết nhận diện mẫu mã hóa 57 Bảng 4.5: Kết so sánh giống NA33 58 Bảng 4.6: Kết so sánh giống AMAZ15/15 .58 Bảng 4.7: Kết so ... PA107 59 DANH SÁCH CÁC BIỂU ĐỒ BIỂU ĐỒ TRANG Biểu đồ 3.1: quần thể với số lượng cá thể tương ứng 49 Biểu đồ 3.2: primer với số lượng al tương ứng 49 Biểu đồ 4.1: Sự đa dạng di...
... Thành Phố Hồ Chí Minh, 278 trang Hồng Thị Liễu- 2004 - Phân tích mức độ đa dạng di truyền xâydựngphươngpháp nhận diện số giống cacao sở kỹ thật PCR Luận văn tốt nghiệp Kỹ sư Nông học, Trường ... cho công tác lai tạo giống - Mỗi lần cài đặt lại bin set phần mềm Gene Mapper, kết bị biến đổi, cần phải kiểm tra lại kết phân tích cũ trước muốn tiến hành so sánh với liệu - Trong trình lai tạo...
... cacao giới ICGD khơng giống nhau, nguồn gốc lai tạo khác Tuy nhiên, kết cho thấy phươngpháp kỹ thuật phân tích chúng tơi với phươngpháp phân tích microsatellite ngân hàng cacao giới Điều hỗ trợ ... mTcCIR7 mTcCIR15 mTcCIR11 mTcCIR8 Hình 4.7 :Kết phân tích mẫu CT3 phươngphápkết hợp sản phẩm PCR riêng biệt với primer mTcCIR7, mTcCIR15 mTcCIR11 4.7 Kết phân tích tính đa dạng di truyền Với liệu ... mẫu đem phân tích trình tự kết tương tự thực phản ứng multiplex PCR Ưu điểm cách làm so với multiplex PCR kết hợp phân tích lúc primer có nhiệt độ lai khác (trong phươngpháp multiplex PCR đòi hỏi...
... sai khác cho phép Chúng dựa kết kiểm tra nhận diện cặp cá thể có đồng di truyền Cevus phân tích để định danh mẫu mã hóa Do việc định danh xác khách quan 3.2.9 .Phương pháp phân tích tính đa dạng ... phân ly q trình di truyền giúp cấu trúc quần thể quần thể Bảng 3.8: Dữ liệu microsatellite đưa vào phân tích Genetix 106 Biểu đồ 3.1: quần thể với số lượng cá Biểu đồ 3.2:5 primer với số lượng ... nhận kết phân tích microsatellite (No data), chúng tơi tiến hành hồn thiện phản ứng cách nâng lượng mẫu phản ứng PCR lên gấp đơi (4µl thay 2µl) Do chúng tơi thu kết phân tích tất mẫu với primer Kết...
... microsatellite công cụ chủ yếu thay phươngpháp RFLP nghiên cứu lập đồ di truyền thực vật Ngoài ra, kết hợp phươngpháp microsatellite phươngpháp AFLP giúp cho việc xâydựng đồ di truyền cách chi tiết ... đưa vào phân tích trình 84 tự 2.5.7.Ưu, khuyết điểm phươngpháp microsatellite so với phươngpháp khác - Phươngpháp microsatellite hiệu phươngpháp RFLP chỗ đòi hỏi lượng DNA phân tích hơn, mức ... áp dụng từ loài sang loài khác phươngpháp AFLP - Phươngpháp microsatellite cho kết phân tích tính đa hình xác hơn, với mức độ đa hình cao gấp lần so với phươngpháp RAPD (Kraic ctv., 1998) -...
... cho thay đổi tiến hóa 2.5.5 Các phươngpháp phát microsatellite Có phươngpháp để phát microsatllite: phươngpháp lai phươngpháp PCR 2.5.5.1 .Phương pháp lai Phươngpháp lai ghép phân tử cho phép ... dài chúng bị hạn chế Trong phươngpháp lai có hai cách: phươngpháp phát nhờ đồng vị phóng xạ phươngpháp nhuộm bạc Phươngpháp phát nhờ đồng vị phóng xạ Phươngpháp hiệu dùng đồng vị phóng ... rắc rối nhuộm 2.5.5.2 .Phương pháp PCR Phươngpháp PCR sử dụng màu huỳnh quang để đánh dấu primer forward sử dụng máy giải trình tự tự động Đây phươngpháp áp dụngPhươngpháp phát triển với phát...
... phân tích định tính định lượng DNA quang phổ kế Phươngpháp cho phép ước lượng tương đối nồng độ nucleic acid có mẫu sau ly trích Ngun tắc phươngpháp dựa vào hấp thụ mạnh ánh sáng tử ngoại bước ... trong việc tạo dòng (TA- cloning) bị loại thải gắn kếtxảy đầu tận đầu (blunt end ligation) Ngồi làm gia tăng hoạt tính Taq polymerase cách sử dụngkết hợp với số enzyme khác: Tli Pfu Use Tli, Pfu ... Primer tiêu quan trọng để đạt khuếch đại đặc trưng có hiệu cao Việc chọn primer giai đoạn định phươngpháp PCR, việc thiết kế primer phải tuân thủ số tiêu sau (Vincent R Prezioso, 2004): 1- Chiều...
... Microsatellite cở sở phươngpháp PCR phân tích trình tự tự động để xâydựngphươngpháp nhận diện hiệu phân tích tính đa dạng di truyền số dòng cacao Mục đích nghiên cứu: - Xâydựngphươngpháp nhận diện ... 1- Xâydựngphươngpháp nhận diện 21 dòng cacao dựa cặp primer microsatellite: mTcCIR7, mTcCIR8, mTcCIR11, mTcCIR15 mTcCIR18 2- Tối ưu hóa phươngpháp 3- Kiểm tra độ xác tính ổn định phươngpháp ... tích tính đa dạng di truyền 21 dòng cacao khảo sát Kết quả: - Phươngpháp kỹ thuật định danh ổn định, có độ xác cao - Tối ưu hóa phươngpháp nhờ thực thành cơng qui trình phản ứng multiplex...
... Ngồi phươngphápphươngpháp khác phươngpháp Newton, phươngphápdùng hàm phạt, phươngpháp hàm rào chắn, thuật toán di truyền v v… Các phươngpháp thường áp dụng toán thiết kế tối ưu kếtcấu ... (phương pháp lực) - Thay kếtcấu liên kết với kếtcấu xét liên kết động học sở điều kiện liên tục chuyển vị (phương pháp chuyển vị) Khi tính độ bền cục theo phươngpháp lực hay theo phươngpháp ... với phươngpháp khác, phươngpháp tìm kiếm trực tiếp có nhiều ưu tốn tính tối ưu kếtcấu nói chung kếtcấu khung sườn tàu nói riêng Thuộc nhóm có phươngpháp sau : - Phươngpháp Hooke-Jeeves - Phương...