Xây dựng phương pháp nhận diện và phân tích tính đa dạng di truyền của 21 dòng cacao băng kỹ thuật Microsatellite 1
Trang 1Microsatellite là một công cụ đắc lực để giải quyết vấn đề như định danh vàphát hiện những cây bị mất lai lịch đồng thời cũng đánh giá mức độ đa dạng ditruyền của cây Mức độ đa dạng di truyền là một chỉ tiêu quan trọng trong quá trìnhchọn tạo giống vì khi các cặp cha mẹ có độ đồng nhất di truyền cao sẽ làm mất tínhưu thế lai Sự phối hợp các primer microsatellite được đánh dấu huỳnh quang trongphản ứng PCR và tiến hành phân tích microsatellite bằng máy giải trình tự sẽ cungcấp dữ liệu giúp cho việc nhận diện chính xác các giống cacao bằng đặc trưng phântử
Trên cơ sở đó chúng tôi tiến hành thực hiện đề tài:
“Xây dựng phương pháp nhận diện và phân tích tính đa dạng di truyền
của 21 dòng cacao (Theobroma cacao L.) bằng kỹ thuật Microsatellite”
Đề tài được thực hiện dưới sự hướng dẫn của TS Bùi Minh Trí,TS Phạm Hồng Đức Phước và TS Juan Carlos Motamayor, chuyên gia vềMicrosatellite trên cây cacao của tổ chức USDA-Bộ Nông Nghiệp Mỹ và Công tyMaster Food, Miami, Mỹ Đối tượng nghiên cứu của đề tài là các giống cacao trongtập đoàn cacao của trường Đại Học Nông Lâm TP Hồ Chí Minh.
1
Trang 22.Mục đích yêu cầu
2.1.Mục đích nghiên cứu
1- Xây dựng phương pháp nhận diện 21 dòng cacao dựa trên 5 cặp primermicrosatellite: mTcCIR7, mTcCIR8, mTcCIR11, mTcCIR15 và mTcCIR18.
2- Tối ưu hóa phương pháp.
3- Kiểm tra độ chính xác và tính ổn định của phương pháp nhận diện.4- Phân tích tính đa dạng di truyền của 21 dòng cacao.
- Định danh chính xác các dòng mã hóa bằng phần mềm Cervus.
- Mô tả được quan hệ di truyền gần hoặc xa giữa các giống cacao khảo sátbằng phần mềm Genetix
- Xây dựng được qui trình cho phản ứng multiplex PCR.
2