nghiên cứu quy trình sản xuất mẫu bệnh phẩm giả định dùng trong ngoại kiểm vi sinh

BỘ Y TẾ ĐẠI HỌC Y DƯỢC THÀNH PHỐ HỒ CHÍ MINH BÁO CÁO TỔNG KẾT ĐỀ TÀI KHOA HỌC VÀ CƠNG NGHỆ CẤP TRƯỜNG NGHIÊN CỨU QUY TRÌNH SẢN XUẤT MẪU BỆNH PHẨM GIẢ ĐỊNH DÙNG TRONG NGOẠI KIỂM VI SINH Mã số : 217/2016/ HĐ - NCKH Chủ nhiệm đề tài: ThS Nguyễn Tuấn Anh Tp Hồ Chí Minh, tháng 04 năm 2018 BỘ Y TẾ ĐẠI HỌC Y DƯỢC THÀNH PHỐ HỒ CHÍ MINH BÁO CÁO TỔNG KẾT ĐỀ TÀI KHOA HỌC VÀ CÔNG NGHỆ CẤP TRƯỜNG NGHIÊN CỨU QUY TRÌNH SẢN XUẤT MẪU BỆNH PHẨM GIẢ ĐỊNH DÙNG TRONG NGOẠI KIỂM VI SINH Mã số : 217/2016/ HĐ - NCKH Chủ nhiệm đề tài (Ký, họ tên) ThS Nguyễn Tuấn Anh Tp Hồ Chí Minh, tháng năm 2018 i Danh sách thành viên tham gia nghiên cứu đề tài đơn vị phối hợp Chủ nhiệm đề tài : ThS Nguyễn Tuấn Anh(2), PGS.TS Vũ Quang Huy(1), (2) Cs Lê Ngọc Minh Trân, Trần Thái(1), Phạm Hồng Thụy, Lâm Quốc Cường(1), Bùi Quang Sang (1), Lê Hoàng Anh (1), Nguyễn Văn Hoàng Sơn (1), Trần Hà Tiểu Linh (1) (1) Trung tâm Kiểm chuẩn chất lượng xét nghiệm y học- Đại Học Y Dược TP HCM (2) Bộ môn Xét nghiệm,Khoa Điều dưỡng Kỹ thuật Y học-Đại Học Y Dược TP HCM MỤC LỤC Trang LỜI CAM ĐOAN ERROR! BOOKMARK NOT DEFINED MỤC LỤC I DANH MỤC CÁC CHỮ VIẾT TẮT III DANH MỤC BẢNG V DANH MỤC BIỂU ĐỒ VI DANH MỤC HÌNH VIII ĐẶT VẤN ĐỀ CHƯƠNG 1: TỔNG QUAN TÀI LIỆU 1.1 ĐẠI CƯƠNG VỀ VI KHUẨN 1.2 CÁC KỸ THUẬT VI SINH LÂM SÀNG 1.3 QUẢN LÝ CHẤT LƯỢNG XÉT NGHIỆM VI SINH LÂM SÀNG 18 CHƯƠNG 2: ĐỐI TƯỢNG - PHƯƠNG PHÁP NGHIÊN CỨU 22 2.1 THIẾT KẾ NGHIÊN CỨU 22 2.2 ĐỐI TƯỢNG NGHIÊN CỨU 23 2.3 AN TOÀN VÀ THỰC HÀNH TRONG NGHIÊN CỨU 23 ii 2.4 VẬT LIỆU NGHIÊN CỨU 24 2.5 PHƯƠNG PHÁP NGHIÊN CỨU 26 2.6 THỬ NGHIỆM ĐÁNH GIÁ ĐỘ ĐỒNG NHẤT VÀ ỔN ĐỊNH CỦA CÁC MẪU BỆNH PHẨM GIẢ ĐỊNH 32 CHƯƠNG 3: KẾT QUẢ NGHIÊN CỨU 35 3.1 KẾT QUẢ NỘI KIỂM TRA 35 3.2 KẾT QUẢ ĐÁNH GIÁ MẪU TIÊU BẢN 37 3.3 KẾT QUẢ ĐÁNH GIÁ MẪU PHÂN GIẢ ĐỊNH 41 3.4 KẾT QUẢ ĐÁNH GIẢ MẪU MỦ GIẢ ĐỊNH 51 CHƯƠNG 4: BÀN LUẬN 62 4.1 QUY TRÌNH SẢN XUẤT THỬ NGHIỆM 62 4.2 MẪU TIÊU BẢN VI KHUẨN 72 4.3 MẪU PHÂN GIẢ ĐỊNH 73 4.4 MẪU MỦ GIẢ ĐỊNH 77 KẾT LUẬN 83 KIẾN NGHỊ 84 TÀI LIỆU THAM KHẢO I PHỤ LỤC 1: KẾT QUẢ PHÂN TÍCH ANOVA CỦA MẪU PHÂN GIẢ ĐỊNH XI PHỤ LỤC 2: KẾT QUẢ PHÂN TÍCH ANOVA CỦA MẪU MỦ GIẢ ĐỊNH XVII iii DANH MỤC CÁC CHỮ VIẾT TẮT Từ tiếng Việt ATSH An toàn sinh học C Cầu khuẩn gram dương CSVC Cơ sở vật chất Đ Độ tiêu ĐHYD Đại Học Y Dược Thành phố hồ Chí Minh KS Kháng sinh KST Ký sinh trùng M Màu sắc nhuộm tiêu NK Ngoại kiểm PXN Phịng xét nghiệm y học QT Quy trình T Trực khuẩn gram âm TTKC Trung tâm kiểm chuẩn chất lượng xét nghiệm y học VK Vi khuẩn iv Từ nước AMP Ampicillin API Analytical profile index ATCC American Type Culture Collection ATM Aztreonam AUG Amoxicillin/Clavulanic BA Blood Argar BHI Brain heart infusion CAZ Ceftazidime CFU Colony-forming unit CIP Ciprofloxacin CLSI Clinical Laboratory Standard Institute CRO Ceftriaxone CTX Cefotaxime E coli Escherichia coli EQA External Quality Assessment HCAI Health Care-Associated Infection K pneumoniae Klebsiella pneumoniae MC MacConkey MHA Mueller Hinton Agar PEF Cefepime S aureus Staphylococcus aureus S flexneri Shigella flexeneri SS Salmonella – Shigella SXT Trimethoprim-sulfamethoxazole WHO World health organization v DANH MỤC BẢNG Trang Bảng 2.1 Các chủng thương mại dành cho nghiên cứu 23 Bảng 2.2 Danh sách trang thiết bị thực nghiên cứu 24 Bảng 2.3 Sinh phẩm - hóa chất dùng nghiên cứu 25 Bảng 2.4 Tiêu chí đánh giá tiêu [82] 32 Bảng 3.1 Kết tiêu E.coli ngày vận chuyển 39 Bảng 3.2 Kết tiêu S aureus ngày vận chuyển 40 Bảng 3.3 Kết đánh giá độ đồng S flexneri mẫu phân 41 Bảng 3.4 Kết đánh giá độ ổn định S flexneri bảo quản mẫu phân 44 Bảng 3.5 Kết đánh giá độ ổn định S flexneri vận chuyển mẫu phân 47 Bảng 3.6 Kết đánh giá độ đồng K pneumoniae mẫu mủ 51 Bảng 3.7 Kết đánh giá độ ổn định K pneumoniae bảo quản mẫu mủ 55 Bảng 3.8 Kết đánh giá độ ổn định K pneumoniae vận chuyển mẫu mủ 58 vi DANH MỤC BIỂU ĐỒ Trang Biểu đồ 1.1 Biểu đồ Shewhart dạng tỉ số z (z-socre) 21 Biểu đồ 3.1 Kết đánh giá độ đồng tiêu E coli S aureus 37 Biểu đồ 3.2 Kết tiêu S aureus đạt tiêu chí điều kiện bảo quản tuần 38 Biểu đồ 3.3 Biểu diễn z-score nồng độ S flexneri gram mẫu phân giả định 42 Biểu đồ 3.4 Biểu diễn z-score đường kính nhạy Ampicillin (A), Ciprofloxacin (B), SXT (C) S flexneri đánh giá đồng 43 Biểu đồ 3.5 Biểu diễn thay đổi nồng độ S flexneri gram phân qua tuần bảo quản 45 Biểu đồ 3.6 Biểu diễn độ nhạy với Ampicillin (AMP), Ciprofloxacin (CIP), SXT S flexneri điều kiện bảo quản 14 ngày 46 Biểu đồ 3.7 Nồng độ S flexneri vận chuyển tuần 49 Biểu đồ 3.8 Biểu diễn độ nhạy với Ampicillin (A), Ciprofloxacin (B), SXT (C) S flexneri điều kiện vận chuyển tuần 50 Biểu đồ 3.9 Kết đánh giá độ đồng K pneumoniae tính sinh hóa định danh 52 Biểu đồ 3.10 Tỉ số z-score nồng độ K pneumoniae đánh giá đồng 53 Biểu đồ 3.11 Biểu diễn tỉ số z-score đường kính nhạy Amoxicillin/Clavulanic acid (A), Cefotaxime (B), Ceftriaxone (C), Ceftazidime (D), Cefepime (E), Aztreonam (F) K pneumoniae đánh giá đồng 54 vii Biểu đồ 3.12 Đường biểu diễn nồng độ K pneumoniae mẫu mủ giả định theo thời gian 56 Biểu đồ 3.13 Biểu diễn độ nhạy với Amoxicillin/Clavulanic acid (A), Cefotaxime(B), Ceftriaxone (C), Ceftazidime (D), Cefepime (E), Aztreonam (F) K pneumoniae tuần bảo quản 57 Biểu đồ 3.14 Biểu diễn thay đổi nồng độ K pneumoniae vận chuyển 59 Biểu đồ 3.15 Biểu đồ biểu diễn đường kính nhạy với Amoxicillin/Clavulanic acid (A), Cefotaxime(B), Ceftriaxone (C), Ceftazidime (D), Cefepime (E), Aztreonam (F) K pneumoniae vận chuyển 60 viii DANH MỤC HÌNH Trang Hình 1.1 Cấu tạo vách vi khuẩn gram dương (A), gram âm (B) Hình 1.2 A: Kết thử nghiệm Oxidase dương với Pseudomonas aeruginosa B: âm tính với Escherichia coli (E), Shigella flexneri mẫu phân (SP), Klebsiella pneumoniae mẫu mủ (PK) Hình 1.3 Trực khuẩn Shigella spp gây lỵ trực trùng (Nguồn CDC [17]) Hình 1.4 Trực khuẩn K pneumoniae [59] Hình 1.5 Quy trình nhuộm gram với vi khuẩn bắt màu nhuộm theo bước Hình 1.6 Minh họa q trình pha lỗng, cấy đếm khúm khuẩn 10 Hình 1.7 Minh họa S flexneri mọc môi trường phân lập SS nồng độ pha loãng 10 Hình 1.8 Mơ tả kỹ thuật cấy ria 11 Hình 1.9 Minh họa kết cấy phân lập S aureus đĩa thạch máu (BA) E coli thạch nâu (CA) 11 Hình 1.10 Bảng so màu định danh API 20E với kết âm (trên) dương (dưới) 13 Hình 1.11 Giao diện nhập kết phần mềm 13 Hình 1.12 Minh họa kết định danh từ phần mềm 14 Hình 1.13 Minh họa kết dương thử nghiệm kháng huyết S flexneri 15 Hình 1.14 Ủ đĩa kháng sinh đồ thẻ API tủ ủ 36oC 17 Hình 2.1 Thực cố định tiêu 27 Hình 2.2 Các mẫu tiêu giữ hộp sau sản xuất 27 Hình 3.1 Hai tiêu sản xuất theo mục 4.1 quy trình (*) 37 Hình 3.2 Sự tương đồng kích thước, độ đều, màu sắc tiêu E coli nhuộm gram lô ngày thứ (B5) bảo quản 38 XI PHỤ LỤC 1: KẾT QUẢ PHÂN TÍCH ANOVA CỦA MẪU PHÂN GIẢ ĐỊNH Bảng PL1.1: Nồng độ S flexneri gram mẫu Anova: Single Factor Groups Lô Lô Source of Variation Between Groups Within Groups Total Count 10 10 SS 0,00072 0,01016 0,01088 Sum Average Variance 77,78 77,9 7,778 7,79 0,000462 0,000667 MS 0,00072 0,000564 F 1,275591 df 18 19 P-value 0,273548 F crit 4,413873 Bảng PL1.2: Tỉ lệ định danh S flexneri Anova: Single Factor Groups Count Sum Average Variance Lô 11 898,5 81,68182 835,8596 Lô 11 872,4 79,30909 829,6409 Source of Variation SS df MS F P-value F crit Between Groups 30,96409 30,96409 0,037183 0,849038 4,351243 Within Groups 16655,01 20 832,7503 Total 16685,97 21 Bảng PL2.3: Đường kính nhạy cảm với kháng sinh Ampicillin S flexneri Anova: Single Factor Groups Count Sum Average Variance Lô 10 220 22 0,444444 Lô 10 220 22 0,666667 Source of Variation SS df MS F Between Groups 0 Within Groups 10 18 0,555556 Total 10 19 P-value F crit 4,413873 XII Bảng PL1.4: Đường kính nhạy cảm với kháng sinh Ciprofloxacin S flexneri Anova: Single Factor Groups Count Sum Average Variance Lô 10 378 37,8 0,4 Lô 10 379 37,9 0,544444 Source of Variation SS df MS F P-value F crit Between Groups 0,05 0,05 0,105882 0,748634 4,413873 Within Groups 8,5 18 0,472222 Total 8,55 19 Bảng PL1.5: Đường kính nhạy cảm với kháng sinh Trimethoprimsulfamethoxazole S flexneri Anova: Single Factor Groups Count Sum Lô 10 336 Lô 10 339 Source of Variation SS df Between Groups 0,45 Within Groups 9,3 18 Total 9,75 19 Average 33,6 33,9 Variance 0,488889 0,544444 MS 0,45 0,516667 F 0,870968 P-value 0,363038 F crit 4,413873 Bảng PL1.6: Kết nồng độ S flexneri trình bảo quản Anova: Two-Factor With Replication Total Count Sum Average Variance ANOVA Source of Variation Sample Columns Interaction Within Total 18 18 139,8067414 139,9102 7,76704119 7,772789 0,001305568 0,000795 SS 0,008798081 0,000297297 0,001764352 0,025155 0,03601473 df 5 24 35 MS F P-value F crit 0,00176 1,678823 0,178056 2,620654 0,000297 0,283646 0,599218 4,259677 0,000353 0,336668 0,885645 2,620654 0,001048 XIII Bảng PL1.7: Kết định danh S flexneri trình bảo quản Anova: Two-Factor With Replication Total Count Sum Average Variance ANOVA Source of Variation Sample Columns Interaction Within 18 1632,3 90,68333333 98,64852941 18 1606,4 89,24444 122,7626 SS 93,16805556 18,63361111 540,3747222 3130,446667 df 5 24 Total 3782,623056 35 Total 2888,209722 35 MS 18,63361 18,63361 108,0749 130,4353 F 0,142857 0,142857 0,828571 P-value 0,980305 0,708779 0,541957 F crit 2,620654 4,259677 2,620654 Bảng PL1.8: Kết nhạy Ampicillin S flexneri trình bảo quản Anova: Two-Factor With Replication Total Count Sum Average Variance ANOVA Source of Variation Sample Columns Interaction Within Total 18 18 382 385 21,22222222 21,38889 0,418300654 0,369281 SS 4,472222222 0,25 0,25 8,666666667 13,63888889 df 5 24 MS F P-value F crit 0,894444 2,476923 0,060501 2,620654 0,25 0,692308 0,413583 4,259677 0,05 0,138462 0,98162 2,620654 0,361111 35 Bảng PL1.9: Kết nhạy Ciprofloxacin S flexneri trình bảo quản Anova: Two-Factor With Replication ANOVA Source of Variation SS df MS Sample 5,805555556 1,161111 F P-value F crit 1,045 0,414522 2,620654 XIV Columns Interaction Within 0,027777778 0,472222222 26,66666667 0,027778 0,094444 24 1,111111 Total 32,97222222 35 0,025 0,87569 4,259677 0,085 0,993937 2,620654 Bảng PL1.10: Kết nhạy Trimethoprim-sulfamethoxazole S flexneri trình bảo quản Anova: Two-Factor With Replication Total Count Sum Average Variance ANOVA Source of Variation Sample Columns Interaction Within Total 18 604 33,55555556 1,202614379 18 607 33,72222 0,565359 SS 9,805555556 0,25 1,583333333 18,66666667 df 5 24 30,30555556 MS 1,961111 0,25 0,316667 0,777778 F 2,521429 0,321429 0,407143 P-value 0,057023 0,576015 0,83903 F crit 2,620654 4,259677 2,620654 35 Bảng PL1.11: Kết mật độ S flexneri trình vận chuyển Anova: Two-Factor With Replication Total Count 12 12 Sum 92,9620080393,04117 Average 7,7468340027,753431 Variance 0,0009044870,000744 Source of Variation SS df MS F P-value F crit Sample 0,003928913 Columns 0,000261129 0,000261 0,309287 0,585812 4,493998 Interaction 0,000694984 0,000232 0,274385 0,842993 3,238872 Within 0,013508687 16 0,000844 Total 0,018393712 23 0,00131 1,551165 0,240017 3,238872 XV Bảng PL1.12: Kết định danh S flexneri trình vận chuyển Anova: Two-Factor With Replication Total Count Sum Average Variance Source of Variation Sample Columns Interaction Within Total 12 12 1088,2 1114,1 90,68333333 92,84167 101,6378788 55,90083 SS 307,4545833 27,95041667 83,85125 1341,62 1760,87625 df 3 16 23 MS F P-value F crit 102,4849 1,222222 0,333941 3,238872 27,95042 0,333333 0,571738 4,493998 27,95042 0,333333 0,8014 3,238872 83,85125 Bảng PL1.13: Kết độ nhạy Ampicillin S flexneri vận chuyển Anova: Two-Factor With Replication Total Count Sum Average Variance Source of Variation Sample Columns Interaction Within Total 12 12 263 260 21,91666667 21,66667 0,810606061 0,969697 SS 5,791666667 0,375 1,125 12,66666667 19,95833333 df 3 16 23 MS F P-value F crit 1,930556 2,438596 0,102172 3,238872 0,375 0,473684 0,501155 4,493998 0,375 0,473684 0,70492 3,238872 0,791667 XVI Bảng PL1.14: Kết độ nhạy Ciprofloxacin S flexneri vận chuyển Anova: Two-Factor With Replication Total Count Sum Average Variance Source of Variation Sample Columns Interaction Within Total 12 453 37,75 1,295454545 12 450 37,5 0,636364 SS 0,458333333 0,375 0,125 20,66666667 df 3 16 21,625 MS 0,152778 0,375 0,041667 1,291667 F 0,11828 0,290323 0,032258 P-value 0,948049 0,597432 0,991907 F crit 3,238872 4,493998 3,238872 23 Bảng PL1.15: Kết độ nhạy Trimethoprim-sulfamethoxazole S flexneri trình vận chuyển Anova: Two-Factor With Replication Total Count Sum Average Variance Source of Variation Sample Columns Interaction Within Total 12 12 404 402 33,66666667 33,5 0,424242424 0,818182 SS 4,166666667 0,166666667 0,833333333 8,666666667 13,83333333 df 3 16 23 MS F P-value F crit 1,388889 2,564103 0,091016 3,238872 0,166667 0,307692 0,586771 4,493998 0,277778 0,512821 0,679201 3,238872 0,541667 XVII PHỤ LỤC 2: KẾT QUẢ PHÂN TÍCH ANOVA CỦA MẪU MỦ GIẢ ĐỊNH Bảng PL2.1: Mật độ K pneumoniae Anova: Single Factor Groups Count Sum Lô 10 61,53 Lô 10 61,42 Source of Variation SS df Between Groups 0,000605 Within Groups 0,04077 18 Total 0,041375 19 Average 6,153 6,142 Variance 0,001423333 0,003106667 MS 0,000605 0,002265 F 0,267108168 P-value F crit 0,61157 4,413873 Bảng PL2.2: Tỉ lệ định danh K pneumoniae Anova: Single Factor Groups Count Sum API 20E Lô 10 979,9 API 20E Lô 10 982 Source of Variation SS df Between Groups 0,2205 Within Groups 23,409 18 Total 23,6295 19 Average 97,99 98,2 MS 0,2205 1,3005 Variance 1,241 1,36 F 0,169550173 P-value 0,685374 F crit 4,413873 Bảng PL2.3: Đường kính nhạy cảm với kháng sinh Amoxicillin/Clavulanic acid K pneumoniae Anova: Single Factor Groups Count Sum Lô 10 197 Lô 10 199 Source of Variation SS df Between Groups 0,2 Within Groups 17 18 Total 17,2 19 Average Variance 19,7 19,9 MS 0,2 0,944444444 0,9 0,988888889 F P-value F crit 0,211764706 0,650898 4,413873 XVIII Bảng PL2.4: Đường kính nhạy cảm với kháng sinh Cefotaxime K pneumoniae Anova: Single Factor Groups Count Sum Lô 10 234 Lô 10 238 Source of Variation SS df Between Groups 0,8 Within Groups 12 18 Total 12,8 19 Average 23,4 23,8 MS Variance 0,488888889 0,844444444 F 0,8 0,666666667 P-value F crit 1,2 0,287763 4,413873 Bảng PL2.5: Đường kính nhạy cảm với kháng sinh Ceftriaxone K pneumoniae Anova: Single Factor Groups Count Sum Lô 10 203 Lô 10 204 Source of Variation SS df Between Groups 0,05 Within Groups 4,5 18 Total 4,55 19 Average 20,3 20,4 MS Variance 0,233333333 0,266666667 F 0,05 0,25 P-value F crit 0,2 0,660056 4,413873 Bảng PL2.6: Đường kính nhạy cảm với kháng sinh Ceftazidime K pneumoniae Anova: Single Factor Groups Count Sum 16 131 15 135 Source of Variation SS df Between Groups 0,888889 Within Groups 6,222222 16 Total 7,111111 17 Average Variance 14,55555556 0,277778 15 0,5 MS F P-value 0,888888889 2,285714 0,150069 0,388888889 F crit 4,493998418 Bảng PL2.7: Đường kính nhạy cảm với kháng sinh Cefepime củaK pneumoniae Anova: Single Factor Groups Count Sum Lô 10 268 Lô 10 269 Source of Variation SS df Between Groups 0,05 Within Groups 8,5 18 Total 8,55 19 Average Variance 26,8 26,9 MS 0,05 0,472222222 0,4 0,544444444 F P-value F crit 0,105882353 0,748634 4,413873 XIX Bảng PL2.8: Đường kính nhạy cảm với kháng sinh Atreonam K pneumoniae Anova: Single Factor Groups Count Sum Lô 10 133 Lô 10 132 Source of Variation SS df Between Groups 0,05 Within Groups 3,7 18 Total 3,75 19 Average 13,3 13,2 MS 0,05 0,205555556 Variance 0,233333333 0,177777778 F 0,243243243 P-value 0,627837 F crit 4,413873 Bảng PL2.9: Nồng độ K pneumoniae điều kiện bảo quản Anova: Two-Factor With Replication Total Count 18 18 Sum 110,5293985 110,4778 Average 6,140522139 6,137658 Variance 0,001189953 0,001265 Source of Variation SS df Sample 0,013739374 Columns 7,38268E-05 Interaction 0,001323676 Within 0,026679023 24 MS 0,002747875 7,38268E-05 0,000264735 0,001111626 P-value 0,060904 0,798829 0,941689 P-value 0,060904 0,798829 0,941689 F crit 2,62065415 4,25967721 2,62065415 Bảng PL2.10: Tỉ lệ định danh K pneumoniae điều kiện bảo quản Anova: Two-Factor With Replication Total Count Sum Average Variance Source of Variation Sample Columns Interaction Within Total 18 18 1762,5 1766,7 97,91666667 98,15 1,053235294 1,209706 SS 3,44 0,49 5,39 29,64 38,96 df 5 24 35 MS F P-value 0,688 0,557085 0,731597 0,49 0,396761 0,534718 1,078 0,872874 0,513829 1,235 F crit 2,620654147 4,259677214 2,620654147 Bảng PL2.11: Độ nhạy với AUG K pneumoniae bảo quản XX Anova: Two-Factor With Replication Total Count Sum Average Variance Source of Variation Sample Columns Interaction Within Total 18 18 352 351 19,55555556 19,5 0,967320261 0,382353 SS 3,805555556 0,027777778 0,472222222 18,66666667 22,97222222 df 5 24 35 MS F P-value 0,761111 0,978571 0,450919 0,027778 0,035714 0,851696 0,094444 0,121429 0,986289 0,777778 F crit 2,620654147 4,259677214 2,620654147 Bảng PL2.12: Độ nhạy với Cefotaxime K pneumoniae bảo quản Anova: Two-Factor With Replication Total Count Sum Average Variance Source of Variation Sample Columns Interaction Within Total 18 431 23,94444444 0,526143791 18 431 23,94444 0,643791 SS 5,222222222 0,666666667 14 19,88888889 df 5 24 35 MS 1,044444 0,133333 0,583333 F 1,790476 0,228571 P-value 0,152942 0,946366 F crit 2,620654147 4,259677214 2,620654147 Bảng PL2.13: Độ nhạy với Ceftriaxone K pneumoniae bảo quản Anova: Two-Factor With Replication Total Count Sum Average Variance Source of Variation Sample Columns Interaction Within Total 18 358 19,88888889 0,575163399 18 361 20,05556 0,526144 SS 6,138888889 0,25 0,583333333 12 18,97222222 df 5 24 35 MS 1,227778 0,25 0,116667 0,5 F 2,455556 0,5 0,233333 P-value 0,062248 0,48631 0,944061 F crit 2,620654147 4,259677214 2,620654147 Bảng PL2.14: Độ nhạy với Ceftazidime K pneumoniae bảo quản XXI Anova: Two-Factor With Replication Total Count Sum Average Variance Source of Variation Sample Columns Interaction Within Total 18 266 14,77777778 0,300653595 18 267 14,83333 0,382353 SS 1,805555556 0,027777778 0,472222222 9,333333333 df 5 24 11,63888889 MS 0,361111 0,027778 0,094444 0,388889 F 0,928571 0,071429 0,242857 P-value 0,479923 0,791551 0,939333 F crit 2,620654147 4,259677214 2,620654147 35 Bảng PL2.15: Độ nhạy với K pneumoniae bảo quản Anova: Two-Factor With Replication Total Count Sum Average Variance Source of Variation Sample Columns Interaction Within Total 18 463 25,72222222 0,447712418 SS 4,888888889 0,444444444 0,555555556 10,66666667 16,55555556 18 459 25,5 0,5 df 5 24 35 MS 0,977778 0,444444 0,111111 0,444444 F P-value 2,2 0,087712 0,327287 0,25 0,935688 F crit 2,620654147 4,259677214 2,620654147 XXII Bảng PL2.16: Độ nhạy với Aztreonam K pneumoniae bảo quản Anova: Two-Factor With Replication Total Count Sum Average Variance Source of Variation Sample Columns Interaction Within Total 18 18 233 232 12,94444444 12,88889 0,290849673 0,575163 SS 4,916666667 0,027777778 0,472222222 9,333333333 14,75 df 5 24 MS F P-value 0,983333 2,528571 0,056485 0,027778 0,071429 0,791551 0,094444 0,242857 0,939333 0,388889 F crit 2,620654147 4,259677214 2,620654147 35 Bảng PL2.17: Nồng độ K pneumoniae vận chuyển Anova: Two-Factor With Replication Total Count 12 12 Sum 72,82 72,61 Average 6,068333333 6,050833 Variance 0,001178788 0,001281 Source of Variation SS df MS Sample 0,0043125 0,0014375 Columns 0,0018375 0,0018375 Interaction Within 0,007145833 0,0156 16 0,002381944 0,000975 Total 0,028895833 23 F 1,4743 59 1,8846 15 2,4430 P-value 0,25912 0,18874 0,10175 F crit 3,2388715 4,4939984 3,2388715 Bảng PL2.18: Tỉ lệ định danh K pneumoniae vận chuyển Anova: Two-Factor With Replication Total Count Sum Average Variance Source of 12 12 1176,6 1172,1 98,05 97,675 1,235454545 0,771136 SS df MS F P-value F crit XXIII Variation Sample Columns Interaction Within Total 1,09125 0,84375 0,64125 20,34 22,91625 3 16 23 0,36375 0,286136 0,8347 3,23887152 0,84375 0,663717 0,427211 4,49399842 0,21375 0,168142 0,916308 3,23887152 1,27125 Bảng PL2.19: Độ nhạy với Aztreonam K pneumoniae vận chuyển Anova: Two-Factor With Replication Total Count Sum 12 234 Average 19,5 Variance Source of Variatio n Sample Columns Interaction Within Total SS 10,3333333 0,66666666 2,33333333 20 33,3333333 12 230 19,1666 1,96969 df 3 16 MS 3,44444444 0,66666666 0,77777777 1,25 F 2,75555 0,53333 0,62222 P-value F crit 0,07649 3,23887152 0,47576 4,49399841 0,61084 3,238871522 23 Bảng PL2.20: Độ nhạy với Cefotaxime K pneumoniae vận chuyển Anova: Two-Factor With Replication Total Count Sum Average Variance Source of Variation Sample 12 283 23,5833333 0,26515151 12 284 23,6666 0,78787 SS df Columns 3,125 0,04166666 Interaction Within Total 1,125 7,33333333 11,625 16 23 MS 1,04166666 0,04166666 0,375 0,45833333 F 2,27272 0,09090 0,81818 P-value 0,11928 0,76690 0,50258 F crit 3,23887152 4,49399841 3,23887152 XXIV Bảng PL2.21: Độ nhạy với Ceftriaxone K pneumoniae vận chuyển Anova: Two-Factor With Replication Total Count Sum Average Variance Source of Variation Sample Columns Interaction Within Total 12 243 20,25 0,56818181 12 240 20 0,54545 SS 2,45833333 df 0,375 0,45833333 9,33333333 12,625 16 23 MS 0,81944444 0,375 0,15277777 0,58333333 F 1,40476 0,64285 0,26190 P-value 0,27783 0,43442 0,85178 F crit 3,23887152 4,49399841 3,23887152 Bảng PL2.22: Độ nhạy với Ceftazidime K pneumoniae vận chuyển Anova: Two-Factor With Replication Total Count Sum Average Variance Source of Variation Sample Columns Interaction Within Total 12 178 14,8333333 0,33333333 12 179 14,9166 SS 2,45833333 0,04166666 0,79166666 5,33333333 8,625 df 0,44697 3 16 23 MS 0,81944444 0,04166666 0,26388888 0,33333333 F 2,45833 0,125 0,79166 P-value 0,10032 0,72828 0,51615 F crit 3,23887152 4,49399841 3,23887152 XXV Bảng PL2.23: Độ nhạy với Cefepime K pneumoniae vận chuyển Anova: Two-Factor With Replication Total Count Sum Average Variance Source of Variation Sample Columns Interaction Within Total 12 307 25,5833333 1,17424242 SS 1,83333333 0,66666666 0,66666666 14,6666666 17,8333333 12 303 25,25 0,38636 df 3 16 MS 0,61111111 0,66666666 0,22222222 0,91666666 F 0,66666 0,72727 0,24242 P-value 0,58466 0,40635 0,86546 F crit 3,23887152 4,49399841 3,23887152 23 Bảng PL2.24: Độ nhạy với Aztreonam K pneumoniae vận chuyển Anova: Two-Factor With Replication Total Count Sum Average Variance Source of Variation Sample Columns Interaction Within Total 12 151 12,5833333 0,26515151 12 155 12,9166 0,62878 SS df 0,5 0,66666666 0,66666666 8,66666666 10,5 3 16 23 MS 0,16666666 0,66666666 0,22222222 0,54166666 F 0,30769 1,23076 0,41025 P-value 0,81947 0,28365 0,74782 F crit 3,23887152 4,49399841 3,23887152 ... ĐỐI TƯỢNG NGHIÊN CỨU 2.2 Đối tượng nghiên cứu quy trình sản xuất mẫu bệnh phẩm giả định gồm tiêu vi khuẩn, mẫu phân, mẫu mủ Các mẫu nghiên cứu với chủng vi khuẩn Bộ chủng chuẩn vi sinh vật Mỹ... khai tiếp chương trình ngoại kiểm vi sinh với mẫu ngoại kiểm gởi dạng mẫu bệnh phẩm giả định có chứa vi khuẩn gây bệnh [46] Đến năm 1985, có ghi nhận chương trình ngoại kiểm vi sinh Châu Âu Anh... BÁO CÁO TỔNG KẾT ĐỀ TÀI KHOA HỌC VÀ CƠNG NGHỆ CẤP TRƯỜNG NGHIÊN CỨU QUY TRÌNH SẢN XUẤT MẪU BỆNH PHẨM GIẢ ĐỊNH DÙNG TRONG NGOẠI KIỂM VI SINH Mã số : 217/2016/ HĐ - NCKH Chủ nhiệm đề tài (Ký, họ