TÌNH HÌNH NHIỄM CANDIDA SPP xâm lấn ở BỆNH NHÂN điều TRỊ tại các KHOA hồi sức TÍCH cực

BỘ GIÁO DỤC VÀ ĐÀO TẠO BỘ Y TẾ TRƯỜNG ĐẠI HỌC Y HÀ NỘI *** VŨ THỊ NGÂN TÌNH HÌNH NHIỄM CANDIDA SPP XÂM LẤN Ở BỆNH NHÂN ĐIỀU TRỊ TẠI CÁC KHOA HỒI SỨC TÍCH CỰC KHĨA LUẬN TỐT NGHIỆP CỬ NHÂN Y KHOA KHÓA 2015 - 2019 HÀ NỘI-2019 BỘ GIÁO DỤC VÀ ĐÀO TẠO BỘ Y TẾ TRƯỜNG ĐẠI HỌC Y HÀ NỘI *** VŨ THỊ NGÂN TÌNH HÌNH NHIỄM CANDIDA SPP XÂM LẤN Ở BỆNH NHÂN ĐIỀU TRỊ TẠI CÁC KHOA HỒI SỨC TÍCH CỰC Nghành đào tạo: Cử Nhân Xét Nghiệm Y Học Mã ngành: 52720332 KHÓA LUẬN TỐT NGHIỆP CỬ NHÂN Y KHOA KHÓA 2015 – 2019 Người hướng dẫn khoa học: TS Nguyễn Thị Nga HÀ NỘI-2019 LỜI CẢM ƠN Trong trình học đại học, khóa luận tốt nghiệp dấu ấn quan trọng trình học tập nghiên cứu trường Thời gian tiến hành làm khóa luận tốt nghiệp khoa Kỹ Thuật Y học-Trường Đại học Y Hà Nội vừa qua giúp em học hỏi nhiều điều, từ chuyên môn kiến thức tác phong làm việc từ thầy cô, anh chị bạn bè khoa Trước tiên, em xin bày tỏ cảm ơn sâu sắc đến TS Nguyễn Thị Nga, giảng viên môn Vi Sinh – Ký Sinh Trùng lâm sàng trường Đại Học Y Hà Nội tận tình dạy cung cấp cho em kiến thức quý giá người hướng dẫn, tận tình giúp đỡ, ln đưa góp ý q báu, sửa chữa tỉ mỉ lời khuyên hữu ích, tạo điều kiện giúp em hồn thiện khóa luận tốt nghiệp Em xin cảm ơn Ban Giám Hiệu, Phòng Quản lý Đào tạo Đại học, Trường Đại học Y Hà Nội tạo điều kiện thuận lợi giúp em hồn thành khóa luận Thư viện trường Đại Học Y Hà Nội cung cấp cho em nhiều tư liệu hữu ích q trình học tập thực đề tài Đồng thời em xin trân trọng cảm ơn thầy cô Bộ Môn Vi Sinh – Ký Sinh Trùng lâm sàng trường Đại Học Y Hà Nội, thầy cô, anh chị khoa Kỹ Thuật Y học quan tâm, động viên em, tạo điều kiện thuận lợi cho em suốt trình học tập thực đề tài Cuối cùng, em xin gửi lời cảm ơn tới gia đình, bạn bè quan tâm, động viên, chia sẻ khó khăn với em suốt trình học tập Hà Nội, ngày 28 tháng 05 năm 2019 Sinh viên Vũ Thị Ngân Cộng hòa xã hội chủ nghĩa Việt Nam Độc lập – Tự – Hạnh phúc **** -LỜI CAM ĐOAN Kính gửi: Phịng Quản lý Đào tạo Đại học – Trường Đại học Y Hà Nội Hội đồng chấm khóa luận tốt nghiệp Tơi tên Vũ Thị Ngân, sinh viên tổ 32 lớp Y4I, chuyên ngành Cử nhân Xét Nghiệm Y Học, niên khóa 2015 – 2019, trường Đại Học Y Hà Nội Tôi xin cam đoan cơng trình nghiên cứu tơi với giúp đỡ thầy cô môn Vi Sinh _ Ký Sinh Trùng Lâm Sàng, Khoa Kỹ thuật Y Học Trường Đại Học y Hà Nội Hà Nội, ngày 28 tháng 05 năm 2019 Người viết khóa luận Vũ Thị Ngân DANH MỤC CHỮ VIẾT TẮT ICU: Intensive Care Unit IC: Invasive Candidiasis IFI: PCR: Invasive Fungal Infection Polymerase Chain Reaction DNA: PNA-FISH: Deoxyribonucleic Acid Peptide Nucleic Acid- Fluorescence In Situ MALDI-TOF: Hybridization matrix-assisted laser desorption/ionization time- SDA: of-flight Sabouraud Dextrose ATP: Adenosine triphosphat BDG: 1,3 -β- D -glucan C glabrata : Candida glabrata C tropicalis : C krusei : Candida tropicalis Candida krusei C albicans : Candida albicans C parapsilosis : Candida parapsilosis MỤC LỤ Danh mục chữ viết tắt Danh mục hình ảnh Danh mục bảng Danh mục sơ đồ ĐẶT VẤN ĐỀ CHƯƠNG I: TỔNG QUAN VỀ NẤM 1.1 Vài nét sơ lược vi nấm ký sinh 1.2 Giới thiệu Candida .3 1.2.1 Vài nét lịch sử .3 1.2.2 Đặc điểm 1.3 Khả gây bệnh Candida .5 CHƯƠNG II: ĐỐI TƯỢNG VÀ PHƯƠNG PHÁP NGHIÊN CỨU .10 2.1 Đối tượng nghiên cứu 10 2.2 Địa điểm nghiên cứu .10 2.3 Công cụ kỹ thuật thu thập thông tin số liệu 10 2.4 Thời gian nghiên cứu .10 CHƯƠNG III: CÁC KẾT QUẢ 11 3.1 Các yếu tố nguy dẫn đến nhiễm Candida xâm lấn thang điểm đánh giá 11 3.2 Chẩn đoán cận lâm sàng 15 3.2.1 Nhuộm soi 15 3.2.2 Nuôi cấy 16 3.2.3 Các phương pháp định danh thủ công 18 3.2.4 Nuôi cấy, định danh hệ thống máy tự động 22 3.2.5 Phương pháp định danh khối phổ 23 3.2.6 Xét nghiệm huyết 24 3.2.7 Kỹ thuật sinh học phân tử phát Candida xâm lấn 25 3.2.7.1 Kỹ thuật PCR multiplex- rt-PCR .25 3.2.7.2 PNA-FISH (Peptide Nucleic Acid- Fluorescence In Situ Hybridization) 26 3.2.8 Xét nghiệm mơ bệnh học chẩn đốn nhiễm Candida xâm lấn 27 3.3 Tình hình nhiễm Candida xâm lấn bệnh nhân điều trị khoa hồi sức tích cực .28 3.3.1 Nhiễm trùng huyết Candida .29 3.3.2 Các nhiễm trùng Candida xâm lấn khác (nhiễm trùng mô sâu ) 36 BÀN LUẬN 38 KẾT LUẬN 39 KIẾN NGHỊ 41 TÀI LIỆU THAM KHẢO DANH MỤC HÌNH ẢNH Hình 1.1 Candida A- Hình ảnh khuẩn lạc Candida mơi trường SDA; B- Hình ảnh nhuộm gram Candida soi vật kính dầu (100x) Hình 1.2 Hình ảnh Candida soi tươi Bệnh phẩm máu (hình bên trái) bệnh phảm phân (hình bên phải) .5 Hình 1.3.Candida sinh sợi giả (a) bào tử màng dày (b) Hình 1.4 Các đường xâm nhập gây nhiễm trùng Candida vào máu mô .9 Hình 3.1 Hình ảnh nhuộm Gram Candida soi vật kính dầu 100x 15 Hình 3.2 Màu sắc khuẩn lạc Candida nuôi cấy môi trường CHROMagarTM .16 Hình 3.3 Hình ảnh chai cấy máu Chai cấy máu thủ công-hai pha (A) chai cấy máu tự động (B) .18 Hình 3.4 Kết test mầm giá 19 Hình 3.5 Máy định danh tự động Vitek 2-compact, Phoenix tm 100, Phoenixtm m50 (theo thứ tự từ trái qua phải) 22 Hình 3.6 Hình ảnh mơ tả quy trình định danh khối phổ MALDI-TOF-MS cho loài Candida .23 Hình 3.7 Hình ảnh loài Candida phương pháp PNA-FISH (peptide nucleic acid- fluorescence in situ hybridization) 26 Hình 3.8 Hình ảnh mơ bệnh học nhuộm PAS có thấy tế bào nấm men sợi giả Candida 27 DANH MỤC BẢNG Bảng Các yếu tố nguy dẫn đến nhiễm Candida xâm lấn sử dụng thang điểm đánh giá khác bệnh nhân ICUs 12 Bảng Một số ví dụ dự đốn nhiễm Candida xâm lấn bệnh nhân có nguy theo thang điểm 14 Bảng 3 Bảng phân loại số loài Candida theo thử nghiệm Auxocolor 21 Bảng Một số nghiên cứu thử nghiệm miễn dịch phát kháng thể dùng chẩn đoán nhiễm Candida xâm lấn 25 Bảng Tỷ lệ nhiễm Candida xâm lấn ICUs theo số nghiên cứu 29 Bảng Đặc điểm dịch tễ lâm sàng liên quan đến loại Candida phổ biến gây nhiễm trùng huyết 30 Bảng Tỷ lệ phân bố loài Candida gây nhiễm trùng huyết bệnh nhân ICUs 31 DANH MỤC BIỂU ĐỒ Biểu đồ 3.1 Biểu đồ thể phân bố loài Candida thường gặp phân lập từ bệnh phẩm máu khoa ICUs 35 TÀI LIỆU THAM KHẢO Hankovszky, P Társy,D Öveges, N cộng (2015) “Invasive Candida Infections in the ICU: Diagnosis and Therapy”; J Crit Care Med (Targu Mures) 1(4):129-139 TS Lê Thị Anh Thư PGS TS Nguyễn Việt Hùng ThS Nguyễn Văn Hiếu ThS cộng (2012) “Tài liệu đào tạo phịng kiểm sốt nhiễm khuẩn” Pappas, P G Kauffman, C A Andes, D R., cộng (2016) "Executive Summary: Clinical Practice Guideline for the Management of Candidiasis: 2016 Update by the Infectious Diseases Society of America." Clin Infect Dis 62(4): 409-417 Quindos, G (2014) "Epidemiology of candidaemia and invasive candidiasis A changing face." Rev Iberoam Micol 31(1): 42-48 Ahmadi, A., Ardehali, S H Beigmohammadi, M T cộng (2014) "Invasive candidiasis in intensive care unit; consensus statement from an Iranian panel of experts, July 2013." JRSM Open 5(3): 2042533313517689 Karacaer, Z Oncul, O Turhan, V cộng (2014) "A surveillance of nosocomial candida infections: epidemiology and influences on mortalty in intensive care units." Pan Afr Med J 19: 398 Gangneux, J P Cornet, M Bailly, S cộng (2018) "Clinical Impact of Antifungal Susceptibility, Biofilm Formation and Mannoside Expression of Candida Yeasts on the Outcome of Invasive Candidiasis in ICU: An Ancillary Study on the Prospective AmarCAND2 Cohort." Front Microbiol 9: 2907 Vincent, J L Rello, J Marshall, J cộng (2009) "International study of the prevalence and outcomes of infection in intensive care units." Jama 302(21): 2323-2329 Horn DL, Neofytos D, Anaissie EJ, cộng “Epidemiology and outcomes of candidemia in 2019 patients: data from the prospective antifungal therapy alliance registry” Clin Infect Dis 2009;48(12): 16951703 10 Kucukates, E Gultekin, N N Alisan, Z, cộng (2016) "Identification of Candida species and susceptibility testing with Sensititre YeastOne microdilution panel to antifungal agents." Saudi Med J 37(7): 750-757 11 Bassetti M, Righi E, Ansaldi F, cộng “A multicenter study of septic shock due to candidemia: outcomes and predictors of mortality” Intensive Care Med 2014;40:839-45 12 Héctor M Mora-Montes Leila M Lopes-Bezerra “Current Progress in Medical Mycology” Springer International Publishing AG 2017 13 Garcia Garces H, Hrycyk MF, Giacobino cộng "Molecular identification and phylogenetical analysis of dermatophyte fungi from Latin America." Mycoses 59(12): 787-797 14 Lynch, D P (1994) “Oral candidiasis History, classification, and clinical presentation” ; Oral Surg Oral Med Oral Pathol 78(2): 189- 193 15 J.E.Mackinnon R.C.Artagaveytia-Allende (1945), “The So-Called Genus Candida Berkhout, 1923”, J Bacteriol, 49(4), tr 317-34 16 PGS.TS Phạm Văn Thân, PGS.TS Hồng Trí Tuệ, PGS Phạm Hoàng Thế Thực tập ký sinh trùng, Bộ y tế, Trường đại học y Hà Nội 17 Alam, M Z Alam, Q Jiman-Fatani, A cộng “(2014) "Candida identification: a journey from conventional to molecular methods in medical mycology." World J Microbiol Biotechnol 30(5): 1437-1451 18 PGSTS.Nguyễn Văn Đề, PGS.TS.Phạm Văn Thân (2012) “Ký sinh trùng y học-Giáo trình cho bác sĩ đa khoa”, trang 305-323 19 Hamid, M E Assiry, M M Joseph, M R cộng (2014) "Candida and other yeasts of clinical importance in Aseer region, southern Saudi Arabia Presentation of isolates from the routine laboratory setting." Saudi Med J 35(10): 1210-1214 20 Hồng Thị Hà (2016), “Tình hình nhiễm Candida spp bệnh nhân có hội chứng tiết dịch âm đạo đến khám Bệnh Biên Da Liễu Trung Ương”, Khoá luận tốt nghiệp cử nhân y khoa 21 Vasconcelos, Lopes, Alberto and cộng sự, (2018), “Candida Infections and Therapeutic Strategies: Mechanisms of Action for Traditional and Alternative Agents” Front Microbiol 9: 1351 22 Peter G Pappas, Michail S Lionakis, Maiken Cavling Arendrup, cộng sự, (2018), “Invasive candidiasis” Nature Reviews Disease Primers 4: 18026 23 McCarty, T P Pappas, P G “Invasive candidiasis” J Infect Dis Clin North Am 30, 103–124 (2016) 24 Pappas, P G et al “A prospective observational study of candidemia: epidemiology, therapy, and influences on mortality in hospitalized adult and pediatric patients” Clin Infect Dis 37 (5): 634–643 (2003) 25 Kullberg, B J Arendrup, M C “Invasive candidiasis” N Engl J Med 373, 1445–1456 (2015) 26 Wisplinghoff, H et al “Nosocomial bloodstream infections in US hospitals: analysis of 24,179 cases from a prospective nationwide surveillance study” Clin Infect Dis 39, 309–176 (2004) 27 Rodrigues, C F Rodrigues, M E Henriques, M (2019) "Candida sp Infections in Patients with Diabetes Mellitus." J Clin Med 8(1) 28 WHO 2009, “Laboratory manual for diagnosis of fungal opportunistic infections in HIV/AIDS patients” 29 Cleveland, A A et al “Declining incidence of candidemia and the shifting epidemiology of Candida resistance in two US metropolitan areas, 2008-2013: results from population-based surveillance” PLoS ONE 10, e0120452 (2015) 30 Strollo, S., Lionakis, M S., Adjemian, J., Steiner, C A Prevots, D R (2016) “Epidemiology of hospitalizations associated with invasive candidiasis, United States, 2002–2012” Emerg Infect Dis 23, 7–13 31 De Pauw cộng (2008), “Revised denfinitions of invasive fungal disease from the European oragnization for research and treatment of cancer/ invasive”, Clinical Infection Diseases, 46(12), 1813-1821 32 Nguyễn Nhị Hà (2017), “Nhận xét đặc điểm lâm sàng, cận lâm sàng kết điều trị bệnh nhân nhiễm Candida máu”, luận văn thạc sĩ y học 33 Badiee, P and Z Hashemizadeh (2014) “Opportunistic invasive fungal infections: diagnosis & clinical management”; Indian J Med Res 139(2): 195-204 34 Hà Tuấn Minh, Lê Hữu Doanh (2014), “Đặc điểm lâm sàng độ nhạy cảm với kháng sinh chống nấm số chủng Candida gây bệnh miệng”, luận văn thạc sĩ y học 35 Christine M Groth, Pharm.Elizabeth S Dodds-Ashley Và cộng (2016) “Fungal Infections in the ICU” Infection Critical Care 1-23 36 Pappas, P G Lionakis, M S Arendrup, M C cộng (2018) "Invasive candidiasis." Nat Rev Dis Primers 4: 18026 37 Luzzati, R Cavinato, S Giangreco, M cộng (2013) "Peripheral and total parenteral nutrition as the strongest risk factors for nosocomial candidemia in elderly patients: a matched case-control study." Mycoses 56(6): 664-671 38 Choi, Y J Lee, B Park, S A "Epidemiological Study on Candida Species in Patients with Cancer in the Intensive Care Unit." Osong Public Health Res Perspect 8(6): 384-388 39 Charsizadeh, A Mirhendi, H Nikmanesh, B cộng (2018) "Microbial epidemiology of candidaemia in neonatal and paediatric intensive care units at the Children's Medical Center, Tehran." Mycoses 61(1): 22-29 40 Matthaiou, D K Christodoulopoulou, T Dimopoulos, G (2015) "How to treat fungal infections in ICU patients." BMC Infect Dis 15: 205 41 Ahmed, A Azim, A Baronia, A K cộng (2014) (2014) "Risk prediction for invasive candidiasis." Indian J Crit Care Med 18(10): 682688 42 Dupont, H Bourichon, A Paugam-Burtz, C cộng (2003) "Can yeast isolation in peritoneal fluid be predicted in intensive care unit patients with peritonitis?" Crit Care Med 31(3): 752-757 43 Leon, C Ruiz-Santana, S Saavedra, P cộng (2006) "A bedside scoring system ("Candida score") for early antifungal treatment in nonneutropenic critically ill patients with Candida colonization." Crit Care Med 34(3): 730-737 44 Leroy, G Lambiotte, F Thevenin, D cộng (2011) "Evaluation of "Candida score" in critically ill patients: a prospective, multicenter, observational, cohort study." Ann Intensive Care 1(1): 50 45 Leon, C Ruiz-Santana, S Saavedra, P cộng (2009) "Usefulness of the "Candida score" for discriminating between Candida colonization and invasive candidiasis in non-neutropenic critically ill patients: a prospective multicenter study." Crit Care Med 37(5): 1624-1633 46 Ostrosky-Zeichner, L Sable, C Sobel, J cộng (2007) "Multicenter retrospective development and validation of a clinical prediction rule for nosocomial invasive candidiasis in the intensive care setting." Eur J Clin Microbiol Infect Dis 26(4): 271-276 47 Ostrosky-Zeichner, L Pappas, P G Shoham, S cộng (2011) "Improvement of a clinical prediction rule for clinical trials on prophylaxis for invasive candidiasis in the intensive care unit." Mycoses 54(1): 46-51 48 Guillamet, C V Vazquez, R Micek, S T cộng (2015) "Development and validation of a clinical prediction rule for candidemia in hospitalized patients with severe sepsis and septic shock." J Crit Care 30(4): 715-720 49 WHO (2013), “Laboratory diagnosis of sexually transmitted disease”, 89-91 50 Clancy, C J Nguyen, M H (2018) "Diagnosing Invasive Candidiasis." J Clin Microbiol 56(5) 51 Badiee, P Z Hashemizadeh (2014) "Opportunistic invasive fungal infections: diagnosis & clinical management." Indian J Med Res 139(2): 195-204 52 Pappas, P G Kauffman, C A Andes, D R cộng (2016) "Clinical Practice Guideline for the Management of Candidiasis: 2016 Update by the Infectious Diseases Society of America." Clin Infect Dis 62(4): e1-50 53.Hình ảnh nấm mơi trường chromagar hãng hóa chất http://www.chromagar.com/clinical-microbiology-chromagar-candidafocus-on-candida-species-22.html#.XOzyVx83uSQ 54 Payne, M S Cullinane, M Garland, S M cộng (2016) "Detection of Candida spp in the vagina of a cohort of nulliparous pregnant women by culture and molecular methods: Is there an association between maternal vaginal and infant oral colonisation?" Aust N Z J Obstet Gynaecol 56(2): 179-184 55 Fazeli, A Kordbacheh, P Nazari, A cộng (2019) "Candiduria in Hospitalized Patients and Identification of Isolated Candida Species by Morphological and Molecular Methods in Ilam, Iran." Iran J Public Health 48(1): 156-161 56 Stefaniuk, E Baraniak, A Fortuna, M cộng (2016) "Usefulness of CHROMagar Candida Medium, Biochemical Methods API ID32C and VITEK Compact and Two MALDI-TOF MS Systems for Candida spp Identification." Pol J Microbiol 65(1): 111-114 57 Horvath, L L Hospenthal, D R Murray, C K cộng (2003) "Direct isolation of Candida spp from blood cultures on the chromogenic medium CHROMagar Candida." J Clin Microbiol 41(6): 2629-2632 58 PGS.TS Nguyễn Vũ Trung, TS Lê Huy Chính, TS Lê Văn Hưng cộng sự, (2014) “vi sinh ký sinh trùng lâm sàng tập hai” dùng cho sinh viên hệ cử nhân kỹ thuật y học 25-36 59 Ibanez-Martinez, E Ruiz-Gaitan, A Peman-Garcia, J (2017) "Update on the diagnosis of invasive fungal infection." Rev Esp Quimioter 30 Suppl 1: 16-21 60 Arendrup, M C Andersen, J S Holten, M K cộng (2019) "Diagnostic Performance of T2Candida Among ICU Patients With Risk Factors for Invasive Candidiasis." Open Forum Infect Dis 6(5): ofz136 61 Chai cấy máu https://vietnamese.alibaba.com/product-detail/medicalmicrobes-analyzer-blood-culturing-bottle-62126844313.html 62 Matare, T Nziramasanga, P Gwanzura, L cộng (2017) "Experimental Germ Tube Induction in Candida albicans: An Evaluation of the Effect of Sodium Bicarbonate on Morphogenesis and Comparison with Pooled Human Serum." Biomed Res Int 2017: 1976273 63 Phan Anh Tuấn, Nguyễn Thanh Liêm, Cù Thị Kim Loan Trần Thị Lợi (2007) “Các loài candida spp gây viêm âm đạo nữ tái phát nhạy với thuốc kháng nấm” Tạp chí Y học TP Hồ Chí Minh Năm 2007 - Tập 11 Số 64 Trần Xuân Mai (2004) “Bệnh vi Candida-ký sinh trùng Y học”, nhà xuất Đà Nẵng, tr 438-449 65 Willemsen, M Breynaert, J Lauwers, S (1997) "Comparison of Auxacolor with API 20 C Aux in yeast identification." Clin Microbiol Infect 3(3): 369-375 66 BIO-RAD Auxacolortm 56513 20 tests colorimetric sugar assimilation test for identification of the main yeasts of medical interest (http://www.biorad.com/webroot/web/pdf/inserts/CDG/en/56513_880050_EN.pdf) 67.Ruiz de Alegria Puig, C Aguero-Balbin, J Fernandez-Mazarrasa, C cộng (2018) "Evaluation of the Vitek-MS system in the identification of Candida isolates from bloodstream infections." Rev Iberoam Micol 35(3): 130-133 68 Ksiazczyk, M Kuczkowski, M Dudek, B cộng (2016) "Application of Routine Diagnostic Procedure, VITEK Compact, MALDI-TOF MS, and PCR Assays in Identification Procedure of Bacterial Strain with Ambiguous Phenotype." Curr Microbiol 72(5): 570582 69 Lesur, D Duhirwe, G Kovensky, J "High resolution MALDI-TOF-MS and MS/MS: Application for the structural characterization of sulfated oligosaccharides." Eur J Mass Spectrom (Chichester): 1469066719851438 70 Turhan, O Ozhak-Baysan, B Zaragoza, O cộng (2017) "Evaluation of MALDI-TOF-MS for the Identification of Yeast Isolates Causing Bloodstream Infection." Clin Lab 63(4): 699-703 71 Singhal, N Kumar, M Kanaujia, P K Và cộng (2015) "MALDI-TOF mass spectrometry: an emerging technology for microbial identification and diagnosis." Front Microbiol 6: 791 72 Leon, C Ostrosky-Zeichner, L Schuster, M (2014) "What's new in the clinical and diagnostic management of invasive candidiasis in critically ill patients." Intensive Care Med 40(6): 808-819 73 Quindos, G Moragues, M D Ponton, J (2004) "Is there a role for antibody testing in the diagnosis of invasive candidiasis?" Rev Iberoam Micol 21(1): 10-14 74 Fortun, J Meije, Y Buitrago, M J cộng (2014) "Clinical validation of a multiplex real-time PCR assay for detection of invasive candidiasis in intensive care unit patients." J Antimicrob Chemother 69(11): 3134-3141 75 Aydemir, G Koc, A N Atalay, M A 2016) "[Evaluation of peptide nucleic acid fluorescent in situ hybridization (PNA FISH) method in the identifi cation of Candida species isolated from blood cultures]." Mikrobiyol Bul 50(2): 293-299 76 Radic, M Goic-Barisic, I Novak, A cộng (2016) "Evaluation of PNA FISH(R) Yeast Traffic Light in identification of Candida species from blood and non-blood culture specimens." Med Mycol 54(6): 654-658 77 Ibanez-Martinez, E Ruiz-Gaitan, A Peman-Garcia, J (2017) "Update on the diagnosis of invasive fungal infection." Rev Esp Quimioter 30 Suppl 1: 16-21 78 Hình ảnh kết PNA FISH loài Candida http://www.opgen.com/pathogenid/pna-fish-products/candida-pna-fish/ 79 Cao đẳng quân y, “Nấm y học” trang 499-543 80 Boo, T W O'Reilly, B O'Leary, J cộng (2005) "Candidaemia in an Irish tertiary referral hospital: epidemiology and prognostic factors." Mycoses 48(4): 251-259 81 Al-Dorzi, H M Sakkijha, H Khan, R cộng (2018) "Invasive Candidiasis in Critically Ill Patients: A Prospective Cohort Study in Two Tertiary Care Centers." J Intensive Care Med: 885066618767835 82 Hassan, E A Elsherbiny, N M Abd El-Rehim, A S cộng (2018) "Health care-associated infections in pre-transplant liver intensive care unit: Perspectives and challenges." J Infect Public Health 11(3): 398-404 83 Caggiano, G Lovero, G De Giglio, O cộng (2017) "Candidemia in the Neonatal Intensive Care Unit: A Retrospective, Observational Survey and Analysis of Literature Data." Biomed Res Int 2017: 7901763 84 Epelbaum, O and R Chasan (2017) "Candidemia in the Intensive Care Unit." Clin Chest Med 38(3): 493-509 85 Giri, S Kindo, A J Kalyani, J (2013) "Candidemia in intensive care unit patients: a one year study from a tertiary care center in South India." J Postgrad Med 59(3): 190-195 86 Eggimann, P Garbino, J Pittet, D (2003) "Epidemiology of Candida species infections in critically ill non-immunosuppressed patients." Lancet Infect Dis 3(11): 685-702 87 Pfaller MA, Diekema DJ (2007) “Epidemiology of invasive candidiasis: a persistent public health problem” Clin Microbiol Rev;20:133–63 88 Arendrup MC (2010) “Epidemiology of invasive candidiasis” Curr Opin Crit Care;16:445–52 89 Silva S, Negri M, Henriques M, et al (2012); “Candida glabrata, Candida parapsilosis and Candida tropicalis: biology, epidemiology, pathogenicity and antifungal resistance” FEMS Microbiol Rev 36: 288–305 90 Pfaller MA, Diekema DJ, Gibbs DL, et al (2008); “Candida krusei, a multidrug-resistant opportunistic fungal pathogen: geographic and temporal trends from the ARTEMIS DISK antifungal surveillance program, 2001 to 2005” J Clin Microbiol 46: 515–21 91 Shetty SS, Harrison LH, Hajjeh RA, Taylor T, Mirza SA, Schmidt AB, et al (2005); “Determining risk factors for candidemia among newborn infants from population-based surveillance: Baltimore, Maryland, 1998– 2000” Pediatr Infect Dis J 24:601–4 92 Giusiano, G E Mangiaterra, M Rojas, F Gomez, V (2004) "Yeasts species distribution in Neonatal Intensive Care Units in northeast Argentina." Mycoses 47(7): 300-303 93 Rodriguez D, Almirante B, Park BJ, Cuenca-Estrella M, Planes AM, Sanchez F, et al (2006); “Candidemia in neonatal intensive care units: Barcelona, Spain” Pediatr Infect Dis J 25:224–9 94 Comert F, Kulah C, Aktas E, Eroglu O, Ozlu N (2007); “Identification of Candida species isolated from patients in intensive care unit and in vitro susceptibility to fluconazole for a 3-year period.” Mycoses 50:52–7 95 Bassetti M, Righi E, Costa A, Fasce R, Molinari MP, Rosso R, et al (2006); “Epidemiological trends in nosocomial candidemia in intensive care” BMC Infect Dis 6:21 96 Lagrou K, Verhaegen J, Peetermans WE, De Rijdt T, Maertens J, Van Wijngaerden E (2007); “Fungemia at a tertiary care hospital: incidence, therapy, and distribution and antifungal susceptibility of causative species.” Eur J Clin Microbiol Infect Dis 26:541–7 97 Costa-de-Oliveira S, Pina-Vaz C, Mendonca D, Goncalves Rodrigues A (2008); “A first Portuguese epidemiological survey of fungaemia in a university hospital” Eur J Clin Microbiol Infect Dis 27:365–74 98 Dimopoulos G, Karabinis A, Samonis G, Falagas ME (2007); “Candidemia in immunocompromised and immunocompetent critically ill patients: a prospective comparative study” Eur J Clin Microbiol Infect Dis 26:377–84 99 Bougnoux ME, Kac G, Aegerter P, d’Enfert C, Fagon JY (2008); “Candidemia and candiduria in critically ill patients admitted to intensive care units in France: incidence, molecular diversity, management and outcome” Intensive Care Med 34:292–9 100 Fridkin SK, Kaufman D, Edwards JR, Shetty S, Horan T (2006); “Changing incidence of Candida bloodstream infections among NICU patients in the United States: 1995-2004” Pediatrics 117:1680–7 101 Playford EG, Marriott D, Nguyen Q, Chen S, Ellis D, Slavin M, Sorrell TC (2008); “Candidemia in nonneutropenic critically ill patients: risk factors for nonalbicans Candida spp” Crit Care Med 36:2034–9 102 Chow JK, Golan Y, Ruthazer R, Karchmer AW, Carmeli Y, Lichtenberg D, et al (2008); “Factors associated with candidemia caused by nonalbicans Candida species versus Candida albicans in the intensive care unit” Clin Infect Dis 46:1206– 13 103 Vardakas KZ, Michalopoulos A, Kiriakidou KG, Siampli EP, Samonis G, Falagas ME (2009); “Candidaemia: incidence, risk factors, characteristics and outcomes in immunocompetent critically ill patients” Clin Microbiol Infect 15: 289–92 104 Malek, M Paluchowska, P Bogusz, B cộng (2017) "Molecular characterization of Candida isolates from intensive care unit patients, Krakow, Poland." Rev Iberoam Micol 34(1): 10-16 105 Gokahmetoglu, G Mutlu Sariguzel, F Koc, A N cộng (2016) "Determination of Candida colonization and Candida score in patients in anesthesia intensive care unit." Mikrobiyol Bul 50(3): 438-448 106 Motoa, G Munoz, J S Onate, J cộng (2017) "Epidemiology of Candida isolates from Intensive Care Units in Colombia from 2010 to 2013." Rev Iberoam Micol 34(1): 17-22 107 Chakrabarti, A Sood, P Rudramurthy, S M cộng (2015) "Incidence, characteristics and outcome of ICU-acquired candidemia in India." Intensive Care Med 41(2): 285-295 108 Puig-Asensio, M Peman, J Zaragoza, R cộng (2014) "Impact of therapeutic strategies on the prognosis of candidemia in the ICU." Crit Care Med 42(6): 1423-1432 109 N Brusselaers, S Blot, D Vogelaers (2011); “Deep-seated Candida infections in the Intensive Care Unit” neth j crit care 15(4) 110 Darouiche RO.(2009) “Candida in the ICU” Clin Chest Med 2009; 30:287-293, vi-vii 111 Bouza E, Munoz P (2008); “Epidemiology of candidemia in intensive care units” Int J Antimicrob Agents 32 Suppl 2:S87-9 112 Peman J, Zaragoza R (2009) “Current diagnostic approaches to invasive candidiasis in critical care settings” Mycoses 113 De Rosa FG, Garazzino S, Pasero D, Di Perri G, Ranieri VM (2009); “Invasive candidiasis and candidemia: new guidelines.” Minerva Anestesiol 75:453-458 114 Guery BP, Arendrup MC, Auzinger G et al (2009); “Management of invasive candidiasis and candidemia in adult non-neutropenic intensive care unit patients: Part I Epidemiology and diagnosis” Intensive Care Med 35:55-62 115 Dimopoulos G, Karabinis A, Samonis G, Falagas ME (2007); “Candidemia in immunocompromised and immunocompetent critically ill patients: a prospective comparative study” Eur J Clin Microbiol Infect Dis 26:377-384 116 Slotman GJ, Shapiro E, Moffa SM (1994); “Fungal sepsis: multisite colonization versus fungemia” Am Surg 60:107-113 26 117 Pittet D, Monod M, Suter PM, Frenk E, Auckenthaler R (1994); “Candida colonization and subsequent infections in critically ill surgical patients” Ann Surg 220:751-758 118 Nucci M, Colombo AL (2002); “Risk factors for breakthrough candidemia” Eur J Clin Microbiol Infect Dis 21:209-211 119 Chellan, G Shivaprakash, S Karimassery Ramaiyar, S cộng (2010) "Spectrum and prevalence of fungi infecting deep tissues of lowerlimb wounds in patients with type diabetes." J Clin Microbiol 48(6): 2097-2102 120 Kollef, M Micek, S Hampton, N cộng (2012) "Septic shock attributed to Candida infection: importance of empiric therapy and source control." Clin Infect Dis 54(12): 1739-1746 121 Schmiedel, Y and S Zimmerli (2016) "Common invasive fungal diseases: an overview of invasive candidiasis, aspergillosis, cryptococcosis, and Pneumocystis pneumonia." Swiss Med Wkly 146: w14281 ... đốn nhiễm Candida xâm lấn 27 3.3 Tình hình nhiễm Candida xâm lấn bệnh nhân điều trị khoa hồi sức tích cực .28 3.3.1 Nhiễm trùng huyết Candida .29 3.3.2 Các nhiễm trùng Candida xâm. .. THỊ NGÂN TÌNH HÌNH NHIỄM CANDIDA SPP XÂM LẤN Ở BỆNH NHÂN ĐIỀU TRỊ TẠI CÁC KHOA HỒI SỨC TÍCH CỰC Nghành đào tạo: Cử Nhân Xét Nghiệm Y Học Mã ngành: 52720332 KHÓA LUẬN TỐT NGHIỆP CỬ NHÂN Y KHOA KHÓA... nghiên cứu tổng quan ? ?Tình hình nhiễm Candida xâm lấn bệnh nhân điều trị khoa hồi sức tích cực? ?? với mục tiêu sau: Xác định yếu tố nguy dẫn đến nhiễm Candida xâm lấn bệnh nhân ICUs Tìm hiểu phương