MỘT số đặc điểm DỊCH tễ học, lâm SÀNG và SINH học PHÂN tử của VI rút DENGUE ở BỆNH NHÂN tại BỆNH VIỆN đa KHOA TỈNH đắk lắk, 2010 2016

BỘ GIÁO DỤC VÀ ĐÀO TẠO BỘ Y TẾ VIỆN VỆ SINH DỊCH TỄ TRUNG ƯƠNG -* - ĐOÀN HỮU THIỂN MỘT SỐ ĐẶC ĐIỂM DỊCH TỄ HỌC, LÂM SÀNG VÀ SINH HỌC PHÂN TỬ CỦA VI RÚT DENGUE Ở BỆNH NHÂN TẠI BỆNH VIỆN ĐA KHOA TỈNH ĐẮK LẮK, 2010 - 2016 Chuyên ngành : Dịch tễ học Mã số : 62.72.01.17 LUẬN ÁN TIẾN SỸ Y HỌC HÀ NỘI – 2017 i BỘ GIÁO DỤC VÀ ĐÀO TẠO BỘ Y TẾ VIỆN VỆ SINH DỊCH TỄ TRUNG ƯƠNG -* - ĐOÀN HỮU THIỂN MỘT SỐ ĐẶC ĐIỂM DỊCH TỄ HỌC, LÂM SÀNG VÀ SINH HỌC PHÂN TỬ CỦA VI RÚT DENGUE Ở BỆNH NHÂN TẠI BỆNH VIỆN ĐA KHOA TỈNH ĐẮK LẮK, 2010 - 2016 Chuyên ngành : Dịch tễ học Mã số : 62.72.01.17 LUẬN ÁN TIẾN SỸ Y HỌC Người hướng dẫn khoa học: GS TS PHAN THỊ NGÀ GS TS ĐẶNG TUẤN ĐẠT HÀ NỘI – 2017 ii LỜI CAM ĐOAN Tơi xin cam đoan cơng trình nghiên cứu với hợp tác đồng nghiệp đồng ý cho công bố luận án Kết nêu luận án trung thực chưa công bố cơng trình khác Tơi xin chịu hồn tồn trách nhiệm lời cam đoan Tác giả NCS Đồn Hữu Thiển iii LỜI CẢM ƠN Tơi xin gửi lời cảm ơn chân thành tới Ban Lãnh đạo Viện Vệ sinh dịch tễ Trung ương; Ban Lãnh đạo Viện Vệ sinh dịch tễ Tây Nguyên; Ban Lãnh đạo bệnh viện Đa Khoa tỉnh Đắk Lắk; Ban Lãnh đạo Viện Kiểm định Quốc gia Vắc xin Sinh phẩm Y tế; Khoa VR, Khoa Đào tạo Quản lý khoa học thầy cô giáo tạo điều kiện thuận lợi, giúp đỡ suốt q trình học tập hồn thiện luận án Tơi xin bày tỏ lòng biết ơn sâu sắc tới GS.TS Phan Thị Ngà GS.TS Đặng Tuấn Đạt, thầy cô trực tiếp hướng dẫn, động viên khích lệ, tận tình giúp đỡ định hướng tơi suốt thời gian học tập, nghiên cứu thực luận án Tôi xin gửi lời cảm ơn chân thành tới GS.TS Phạm Ngọc Đính, nguyên Bí thư Đảng ủy, Phó Viện trưởng Viện Vệ sinh dịch tễ Trung ương, ngun Phó Tổng biên tập Tạp chí Y học dự phòng đóng góp ý kiến q báu để tơi hồn thành luận án Tơi xin gửi lời cảm ơn chân thành tới bệnh nhân thân nhân gia đình bệnh nhân điều trị Bệnh viện Đa khoa Tỉnh Đắk Lắk ủng hộ tơi suốt q trình nghiên cứu, để có số liệu giá trị trung thực luận án Cuối tơi xin cảm tạ tình cảm vơ bờ bến gia đình lớn nhỏ thân yêu, bạn bè, đồng nghiệp giúp đỡ động viên ngày tháng học tập nghiên cứu Hà Nội, ngày tháng năm 2017 iv MỤC LỤC TRANG PHỤ BIA .i LỜI CAM ĐOAN .ii LỜI CẢM ƠN iii MỤC LỤC iv DANH MỤC CÁC CHỮ VIẾT TẮT viii DANH MỤC HÌNH x DANH MỤC BẢNG xii ĐẶT VẤN ĐỀ Chương 1: TỔNG QUAN 1.1 Dịch tễ học sốt xuât huyết dengue 1.1.1 Tác nhân gây bệnh 1.1.2, Ổ chứa VR tự nhiên, nguồn truyền nhiễm .4 1.1.3 Đường lây 1.1.4 Khối cảm thụ 1.1.5 Yếu tố liên quan .6 1.1.6 Véc tơ truyền bệnh 1.1.7 Phòng bệnh 1.2 Đặc điểm dịch tễ học sốt xuất huyết dengue giới 1.2.1 Lịch sử xuất lan truyền sốt xuất huyết dengue 1.2.2 Khối cảm thụ 13 1.2.3 Mùa dịch, yếu tố liên quan 13 1.2.4 Véc tơ truyền bệnh 13 1.2.5 Dự phòng bệnh 14 v 1.3 Đặc điểm dịch tễ học sốt xuất huyết dengue Việt Nam .14 1.3.1 Tác nhân gây bệnh 14 1.3.2 Tình hình sốt xuất huyết dengue Việt Nam 15 1.3.3 Khối cảm thụ 17 1.3.4 Mùa dịch 17 1.3.5 Véc tơ truyền bệnh 19 1.3.6 Phòng bệnh 19 1.3.7 Một số đặc điểm sốt xuất huyết dengue khu vực Tây Nguyên20 1.4 Mối liên quan đặc điểm lâm sàng týp VR gây bệnh 23 1.4.1 Đặc điểm lâm sàng cận lâm sàng SXHD 23 1.4.2 Chẩn đoán xác định .27 1.4.3 Tình trạng lâm sàng liên quan với týp VR dengue gây bệnh 30 1.5 Đặc điểm dịch tễ học phân tử týp VR dengue 31 1.5.1 Đặc điểm dịch tễ học phân tử týp VR dengue giới 31 1.5.2 Đặc điểm dịch tễ học phân tử týp VR dengue Viêt Nam 35 Chương 2: ĐỐI TƯỢNG VÀ PHƯƠNG PHÁP NGHIÊN CỨU 36 2.1 Đối tượng nghiên cứu: 36 2.1.1 Đối tượng mục tiêu 36 2.1.2 Đối tượng mục tiêu 36 2.1.3 Đối tượng mục tiêu 36 2.1.4 Tiêu chuẩn lựa chọn loại trừ đối tượng nghiên cứu 36 2.2 Thời gian nghiên cứu: 2015-2016 38 2.3 Thiết kế nghiên cứu 38 2.3.1 Phương pháp nghiên cứu mục tiêu .38 2.3.2 Phương pháp nghiên cứu mục tiêu .44 2.3.3 Cỡ mẫu 44 2.3.4 Cách chọn mẫu 45 vi 2.3.5 Phương pháp nghiên cứu mục tiêu 46 2.4 Tóm tắt sơ đồ nghiên cứu .48 2.5 Các số nghiên cứu .49 2.5.1 Các số nghiên cứu mục tiêu 49 2.5.2 Các số đặc điểm lâm sàng mối liên quan đến lưu hành týp VR dengue nghiên cứu mô tả 2010 - 2016 49 2.5.3 Một số đặc điểm phân tử genotýp týp VR dengue Đắk Lắk, 2010 - 2016 .50 2.6 Các biện pháp hạn chế sai số 50 2.7 Phương pháp xử lý số liệu 51 2.8 Đạo đức nghiên cứu 51 2.9 Hạn chế nghiên cứu .52 2.9.1 Thiết kế nghiên cứu .52 2.9.2 Tính đồng nhất, loại bỏ mẫu phân tích .53 Chương 3: KẾT QUẢ NGHIÊN CỨU .54 3.1 Kết mô tả đặc điểm dịch tễ học yếu tố liên quan SXHD tỉnh Đắk Lắk, 2010-2016 54 3.1.1 Một số đặc điểm dịch tễ học 54 3.1.2 Một số yếu tố liên quan 58 3.2 Kết xác định số đặc điểm lâm sàng sốt xuất huyết dengue liên quan với týp VR gây bệnh tỉnh Đắk Lắk, 2010-2016 61 3.3 Kết xác định số đặc điểm dịch tễ sinh học phân tử týp VR dengue lưu hành Đắk Lắk, Tây Nguyên 2010-2016 69 vii Chương 4: BÀN LUẬN 81 4.1 Một số đặc điểm dịch tễ học yếu tố liên quan SXHD tỉnh Đắk Lắk, 2010-2016 81 4.2 Một số đặc điểm lâm sàng SXHD liên quan với týp VR dengue gây bệnh tỉnh Đắk Lắk, 2010-2016 90 4.3 Một số đặc điểm sinh học phân tử týp VR dengue lưu hành Đắk Lắk, Tây Nguyên 2010-2016 .101 4.4 Hạn chế nghiên cứu .109 KẾT LUẬN 110 KIẾN NGHỊ 112 CÁC CƠNG TRÌNH CƠNG BỐ LIÊN QUAN ĐẾN LUẬN ÁN TÀI LIỆU THAM KHẢO PHỤ LỤC Phụ lục Phiếu điều tra dịch tễ yếu tố liên quan sốt xuất huyết dengue Phụ lục Phiếu điều tra hồi cứu ca bệnh sốt xuất huyết dengue Phụ lục Danh sách chủng vi rút dengue phân lập từ bệnh nhân bệnh viện Đa khoa tỉnh Đắk Lắk, 2010-2016 Phụ lục Mã số Genbank phần vùng gen C-PrM chủng vi rút dengue phân lập từ bệnh nhân Đắk Lắk, Tây Nguyên, 2010-2016 Phụ lục Danh sách chủng vi rút dengue tham khảo sử dụng để xây dựng phát sinh loài viii DANH MỤC CÁC CHỮ VIẾT TẮT TỪ VIẾT TẮT Arbo ADN ARN BSA cDNA DENV-1 DENV-2 DENV-3 DENV-4 dNTP ddNTP ELISA FBS GAC-ELISA HCSD HRPO HT KN KT MAC-ELISA MEM OD ỎR PBS P RT-PCR SD SD/DF SXHD/DHF SOP TAE VVSDTTƯ TỪ TIẾNG ANH Arthropodborne Desoxyribonucleic Ribonucleic acid Bovine Serum Albubumin Complement DNA Dengue virus type Dengue virus type Dengue virus type Dengue virus type Deoxynucleotide triphosphate Dideoxynucleotide triphosphate Enzyme Linked Immunorbent assay Fetal bovine serum IgG antibody capture ELISA TỪ- NGHĨA TIẾNG VIỆT Mang côn trùng tiết túc Axit Đêzơxiribonuclêic Axit ribonucleic Albumin bò ADN bổ sung VR dengue type VR dengue type VR dengue type VR dengue type Thử nghiệm miễn dịch gắn enzyme huyết bê bào thai Kỹ thuật ELISA tóm bắt IgG Hội chứng sốc dengue Horseradis Peroxidase Huyết Kháng nguyên Kháng thể IgM Antibody Capture ELISA Kỹ thuật ELISA tóm bắt IgM Minium Essential Medium Mơi trường thiết yếu Opital density Mật độ quang học Odd ratio Tỉ số chênh Phosphate Buffer Saline Đệm muối phốt phát Probability Xác suất Reverse transcriptaze polymerase chain Phản ứng chuỗi phiên mã ngược reaction Standard Deviation Dengue fever Dengue heamrrhagic fever Standard operation procedure Tris- Acetate – EDTA Độ lệch chuẩn Sốt dengue Sốt xuất huyết dengue Quy trình chuẩn Viện Vệ sinh Dich tễ Trung ương ix VR YF WHO-TCYTTG Yellow fever World Health Organization VR Sốt vàng Tổ chức Y tế Thế giới VII Triệu chứng lâm sàng sau nhập viện (khoanh tròn vào số thích hợp): Nhiệt độ thể: …… oC Các triệu chứng lâm sàng tồn Đau đầu Đau bắp thịt Đau xương khớp Dấu hiệu dây thắt Nhịp mạch (lần/ phút) ……… Huyết áp tối đa/tối thiểu: ………./ ………… Các triệu chứng hội chứng sốt xuất huyết tồn (khoanh tròn vào số thích hợp): Nổi ban Xuất huyết da Chấm xuất huyết Xuất huyết cục Mảng xuất huyết Nôn máu Đi máu Đi tiểu máu 10 Hành kinh kéo dài 11 Xuất huyết nơi khác 13 Gan bờ sườn 14 Sưng hạch bạch huyết Xuất huyết lợi/răng 12 Đau vùng gan VIII Kết xét nghiệm bệnh nhân hồi phục, viên: Xét nghiệm huyết học: Hematocrit: Tiểu cầu: Hồng cầu: Bạch cầu: IX Phân độ lâm sàng SD/SXHD theo độ (SXHD, SXHD có dấu hiệu cảnh báo, SXHD nặng): ………… Số ngày điều trị: ………………………………………………………… Kết điều trị: Khỏi Tử vong Chuyển Viện Không theo dõi Ngày Người điều tra Phụ trách đơn vị tháng năm PHỤ LỤC Danh sách chủng VR dengue phân lập từ bệnh nhân bệnh viện Đa khoa tỉnh Đắk Lắk, 2010-2016 STT Ký hiệu chủng 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22 23 24 25 26 27 28 29 30 31 32 D87DL/10 D7DL/11 D229DL/13 D283N/15 D163N/15 D346N/15 D347N/15 D177N/15 D279N/15 D031N/16 D017N/16 D797N/16 D72DL/10 D22DL/14 D686N/16 D678N/16 D677N/16 D168DL/13 D11DL/14 D15DL/14 D16DL/14 D23DL/14 D25DL/14 D26DL/14 D178P/15 D425N/15 D676N/16 D140N/15 D419N/15 D005N/16 D026N/16 D027N/16 Năm Týp Ðịnh týp VR phân lập 2010 2011 2013 2015 2015 2015 2015 2015 2015 2016 2016 2016 2010 2014 2016 2016 2016 2013 2014 2014 2014 2014 2014 2014 2015 2015 2016 2015 2015 2016 2016 2016 VR 1 1 1 1 1 1 2 2 3 3 3 4 4 4 4 Multiplex RT-PCR Dương tính Dương tính Dương tính Dương tính Dương tính Dương tính Dương tính Dương tính Dương tính Dương tính Dương tính Dương tính Dương tính Dương tính Dương tính Dương tính Dương tính Dương tính Dương tính Dương tính Dương tính Dương tính Dương tính Dương tính Dương tính Dương tính Dương tính Dương tính Dương tính Dương tính Dương tính Dương tính STT Ký hiệu chủng 33 34 35 36 37 D015N/16 D022N/16 D158N/16 D674N/16 D028N/16 Năm Týp Ðịnh týp VR phân lập 2016 2016 2016 2016 2016 VR 4 4 Multiplex RT-PCR Dương tính Dương tính Dương tính Dương tính Dương tính PHỤ LỤC Mã số Genbank phần vùng gen C-PrM chủng VR dengue phân lập từ bệnh nhân Đắk Lắk, Tây Nguyên, 2010-2016 STT 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22 23 24 25 26 27 28 29 30 31 Ký hiệu chủng D3KT/10 D87DL/10 D7DL/11 D72GL/12 D229DL/13 D99DN/13 D283N/15 D163N/15 D346N/15 D347N/15 D177N/15 D279N/15 D031N/16 D017N/16 D797N/16 D72DL/10 D69GL/10 D30DN/11 D28GL/12 D9GL/12 D73GL/13 D07KT/14 D22DL/14 D686N/16 D678N/16 D677N/16 D26GL/10 D168DL/13 D1DN/13 D03KT/14 D07DN/14 Năm phân lập 2010 2010 2011 2012 2013 2013 2015 2015 2015 2015 2015 2015 2016 2016 2016 2010 2010 2011 2012 2012 2013 2014 2014 2016 2016 2016 2010 2013 2013 2014 2014 Tỉnh Type Kon Tum Đắk Lắk Đắk Lắk Gia Lai Đắk Lắk Đắk Nông Đắk Lắk Đắk Lắk Đắk Lắk Đắk Lắk Đắk Lắk Đắk Lắk Đắk Lắk Đắk Lắk Đắk Lắk Đắk Lắk Gia Lai Đắk Nông Gia Lai Gia Lai Gia Lai Kon Tum Đắk Lắk Đắk Lắk Đắk Lắk Đắk Lắk Gia Lai Đắk Lắk Đắk Nông Kon Tum Đắk Nông 1 1 1 1 1 1 1 2 2 2 2 2 3 3 Số đăng ký ngân hàng gen LC311794 LC311795 LC311796 LC311797 LC311798 LC311799 LC311800 LC311801 LC311802 LC311803 LC311804 LC311805 LC311806 LC311807 LC311808 LC311809 LC311810 LC311811 LC311812 LC311813 LC311814 LC311815 LC311816 LC311817 LC311818 LC311819 LC311820 LC311821 LC311822 LC311823 LC311824 STT 32 33 34 35 36 37 38 39 40 41 42 43 44 45 46 47 48 49 50 51 52 53 54 55 56 Ký hiệu chủng D08KT/14 D09KT/14 D11DL/14 D15DL/14 D16DL/14 D23DL/14 D25DL/14 D26DL/14 D65DN/14 D67DN/14 D178P/15 DL16GL/10 D425N/15 D676N/16 D140N/15 D419N/15 D005N/16 D026N/16 D027N/16 D16GL/13 D015N/16 D022N/16 D158N/16 D674N/16 D028N/16 Năm phân lập 2014 2014 2014 2014 2014 2014 2014 2014 2014 2014 2015 2010 2015 2016 2015 2015 2016 2016 2016 2013 2016 2016 2016 2016 2016 Tỉnh Type Kon Tum Kon Tum Đắk Lắk Đắk Lắk Đắk Lắk Đắk Lắk Đắk Lắk Đắk Lắk Đắk Nông Đăk Nông Đắk Lắk Gia Lai Đắk Lắk Đắk Lắk Đắk Lắk Đắk Lắk Đắk Lắk Đắk Lắk Đắk Lắk Gia Lai Đắk Lắk Đắk Lắk Đắk Lắk Đắk Lắk Đắk Lắk 3 3 3 3 3 4 4 4 4 4 4 4 Số đăng ký ngân hàng gen LC311825 LC311826 LC311827 LC311828 LC311829 LC311830 LC311831 LC311832 LC311833 LC311834 LC311835 LC311836 LC311837 LC311838 LC311839 LC311840 LC311841 LC311842 LC311843 LC311844 LC311845 LC311846 LC311847 LC311848 LC311849 PHỤ LỤC Danh sách chủng VR dengue tham khảo sử dụng để xây dựng phát sinh loài VR dengue týp STT Ký hiệu chủng DENV-1/VN/BID- Mã số Năm Địa điểm Vật chủ 2007 Miền Người Genbank FJ024459 V1689/2007 DENV-1/VN/BID- Nam-VN EU677175 2007 V1553/2007 DENV-1/VN/BIDDENV-1/VN/BID- FJ182032 2007 DENV-1/VN/BID- FJ410207 2007 DENV-1/VN/BID- FJ410240 2008 DENV-1/VN/BID- FJ432730 2007 DENV-1/VN/BID- FJ882517 2006 DENV-1/VN/BID- FJ882558 2007 DENV-1/VN/BID- FJ898418 2006 DENV-1/VN/BID- FJ898422 2006 DENV-1/VN/BID- FJ906964 2007 DENV-1/VN/BIDV2875/2006 Miền Người Miền Người Miền Người Miền Người Miền Người Nam-VN FJ906965 2007 V2737/2007 13 Người Nam-VN V2736/2007 12 Miền Nam-VN V2907/2006 11 Người Nam-VN V2903/2006 10 Miền Nam-VN V2814/2007 Người Nam-VN V2686/2006 Miền Nam-VN V1785/2007 Người Nam-VN V1904/2008 Miền Nam-VN V1664/2007 Người Nam-VN V1664/2007 Miền Miền Người Nam-VN GQ199842 2006 Miền Nam-VN Người 14 DENV-1/VN/BID- GQ868606 2006 V2713/2006 15 DENV-1/VN/BIDDENV-1/VN/BID- GQ868613 2006 DENV-1/VN/BID- GU131687 2008 DENV-1/KHM/2001 L110 Người Miền Người Nam-VN EU677162 2007 V1535/2007 18 Miền Nam-VN V3851/2008 17 Người Nam-VN V2909/2006 16 Miền Miền Người Nam-VN AF538031 2001 Campuchia Người AF538026 2001 Campuchia Người HM469968 2007 Thái Lan Người 8177 19 DENV-1/KHM/2001 L1117016 20 DENV1/Laos/SV2951/2007 21 DENV-1/Laos/SV36/2008 KC172833 2008 Lào Người 22 D1/SG/05K4820DK1/2005 EU081279 2005 Singapore / 22 D1/SG/05K4632DK1/2005 EU081278 2005 Singapore / 23 D1/SG/06K2236DK1/2006 EU081280 2006 Singapore / 24 D1/SG/06K2290DK1/2006 EU081281 2006 Singapore / 25 DENV- KR919821 2008 Australia Người KC762644 2008 Indonesia Người KC762643 2008 Indonesia Người KC762637 2007 Indonesia Người 29 D1/SG/05K4621DK1/2005 EU081276 2005 Singapore / 30 DENV- KC172835 2008 Lào Người FJ196842 2003 Trung Muỗi 1/AUS/TSV08/2008 26 DENV-1/IDN/MKS2094/2008 DENV-1/IDN/MKS- 27 0398/2008 28 DENV-1/IDN/MKS0352/2007 1/Laos/UI13412/2008 31 D1/CHN/GD66/03/2003 Quốc 32 D1/IND/98901530-DF/ AB189121 1998 Indonesia Người 33 D1/MAL/P72-1244/1972/ EF457905 1972 Malaysia / 34 D1.Myanmar.40553/71 AY713473 1971 Myanmar / 35 D1.Myanmar.40568/76 AY722801 1976 Myanmar / 36 D1/VG/BID-V2937/1985 GQ868601 1985 Tortola Người 37 D1/BR/BID-V2389/2004 FJ850081 2004 Brazil Người 38 D1/Reunion/191/04/2004 DQ285559 2004 Reunion Người 39 D1/Venezela/BID- FJ639741 1998 Venezuela Người FJ562105 1993 Puerto Người V2169/1998 40 D1/US/BID-V2096/1993 Rico 41 D1/BR/97-111 /1997 AF311956 / Brazil Người VR dengue týp STT Ký hiệu chủng Mã số Genbank FJ639708 Năm Địa điểm Vật chủ 2005 Campuchia Người FJ639707 2004 Campuchia Người FJ898452 2003 Thái Lan Người GU131886 2001 Thái Lan Người KY586625 KY586690 FM210214 2010 1999 2004 Thái Lan Thái Lan Miền Nam-VN Miền Nam-VN Miền Nam-VN Miền Nam-VN Thái Lan Campuchia Người Người / Miền Nam-VN Miền Nam-VN Miền Nam-VN Miền Nam-VN Miền Nam-VN Miền Nam-VN Miền Nam-VN Miền Nam-VN Người DENV-2/KH/BIDV2042/2005 DENV-2/KH/BIDV2041/2004 DENV-2/TH/BIDV2957/2003 DENV-2/TH/BIDV4325/2001 DENV-2/TH/Seq35 DENV-2/TH/Seq49 DENV-2/VN/CSF63/2004 DENV-2/VN/DF907/2003 FM210211 2003 EU482775 2004 FJ410215 2008 KY586597 FJ639718 2009 2008 FJ410208 2007 14 DENV-2/VN/BIDV753/2004 DENV-2/VN/BIDV1844/2008 DENV-2/TH/Seq30 DENV-2/KH/BIDV2068/2008 DENV-2/VN/BIDV1818/2007 DENV-2/VN/MD1618/2005 FM210246 2005 15 DENV-2/VN/MD1619/2005 FM210207 2005 16 FJ410241 2008 17 DENV-2/VN/BIDV1905/2008 DENV-2/VN/MD1520/2005 FM210245 2005 18 DENV-2/VN/MD1533/2005 FM210205 2005 19 DENV-2/VN/BIDV1858/2007 DENV-2/VN/BIDV921/2006 FJ461314 2007 EU482467 2006 10 11 12 13 20 / Người Người Người Người Người Người Người Người Người Người Người Mã số Genbank GU131899 Năm Địa điểm Vật chủ 2008 Campuchia Người FJ873811 2006 Người GQ868591 1964 Miền Nam-VN Thái Lan KC294221 KC294223 HQ999999 2010 2010 2009 Peru Peru Guatemala Người Người Người AF11966 1985 Người DENV-2/ID/1022DN/1975 DENV-2/NewGuineaC/1944 GQ398268 KM204118 1975 1944 30 DENV-2/CHN/43 AF204178 1987 31 DENV-2/US/BIDV5412/2007 DENV-2/US/BIDV5055/2008 DENV-2/TW/BIDV5056/2008 D2/Pakistan/2011-23/2011 D2/Pakistan/2011-4/2011 D2/Pakistan/2011-3/2011 DENV-2/IND/Od2112/2009 DENV-2/IN/BIDV2961/2006 DENV-2/ID/1016DN/1975 DENV-2/ID/1017DN/1976 DEV-2/Taiwan/1222-DF06/24/2002 DEV2/Brunei/DS31/291005/2005 DENV-2/GU/BIDV2950/2001 DENV-2/SG/D2Y98P- JF730050 2007 Trung Quốc Indonesia New Guinea Trung Quốc Mỹ JN796245 2008 Mỹ HQ891024 2008 Đài Loan KF041232 KF041234 KF041233 JQ955624 FJ898454 2011 2011 2011 2011 2006 Pakistan Pakistan Pakistan Ấn Độ Ấn Độ Chuột Mus musculus Chuột Mus musculus Người Người Người Người Người GQ398258 GQ398259 DQ645546 1975 1976 2002 Indonesia Indonesia Đài Loan Người Người Người EU031572 2005 Brunei / HM488257 2001 Guam Người JF327392 2009 Singapore Người STT Ký hiệu chủng 21 27 DENV-2/IPC/BIDV3796/2008 DENV-2/VN/BIDV922/2006 DENV-2/TH/BIDV3357/1964 DENV-2/PE/IQA 2080/2010 DENV-2/PE/NFI1159/2010 DENV-2/GU/FDAGUA09/2009 DENV-2/CHN/04/1985 28 29 22 23 24 25 26 32 33 34 35 36 37 38 39 40 41 42 43 44 Người Người Người Người Người STT 45 46 47 48 49 50 51 Ký hiệu chủng PP1/2009 DENV-2/VN/BIDV735/2006 DENV-2/Brunei/DS09280106/2006 DENV2/IDN/98900663/1998 D2/SG/05K3295DK1/2005 DENV2/CHN/GD01/03/2003 DENV-2/AUS/TSV01/1993 DENV-2/IDN/BA05i/2004 Mã số Genbank Năm Địa điểm Vật chủ EU482672 2006 Người EU179859 2006 Miền Nam-Vn Brunei AB189122 1998 Indonesia Người EU081177 FJ196853 2005 2003 / Muỗi AY037116 AY858035 1993 2004 Singapore Trung Quốc Australia Indonesia / Người Người VR dengue týp ST Mã số Ký hiệu chủng T 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22 23 24 25 26 27 28 29 30 31 32 33 34 35 36 37 38 39 DENV-3/VN/BID-V1783/2007 DENV-3/VN/BID-V1327/2006 DENV-3/VN/BID-V1786/2007 DENV-3/VN/BID-V1933/2008 DENV-3/VN/BID-V1957/2008 DENV-3/VN/BID-V1330/2006 DENV-3/VN/BID-V1018/2007 DENV-3/VN/BID-V1009/2006 DENV-3/KH/BID-V2084/2005 DENV-3/KH/BID-V2092/2007 DENV-3/KH/BID-V3823/2006 DENV-3/IPC/BID-V4306/2007 DENV-3/IPC/BID-V3825/2006 DENV-3/IPC/BID-V3809/2003 DENV-3/IPC/BID-V3819/2006 DENV-3/KH/BID-V2082/2003 DENV-3/KH/BID-V4315/2008 DENV-3/IPC/BID-V3808/2008 DENV-3/KH/BID-V2089/2006 DENV-3/IPC/BID-V4294/2007 DENV-3/IPC/BID-V3807/2003 DENV-3/KH/BID-V20070/1999 DENV-3/TH/Seq54 DENV-3/BLD/BDH02-03/2002 DENV-3/BLD/BDH02-04/2002 DENV-3/BD/BDH02-07/2002 DENV-3/BLD/BDH02-01/xxx DENV-3/TW/98TW503/1998 DENV-3/TW/98TW388/1999 DENV-3/TH/Seq40 DENV-3/TH/Seq38 DENV-3/TH/Seq14 DENV-3/TH/Seq33 DENV-3/TH/Seq9 DENV-3/AUS/C0360/1994 DENV-3/TH/ThD3 1283/1998 DENV-3/TH/Seq8 DENV-3/TH/Seq6 DENV-3/TWN/Taiwan- 40 739079A DENV-3/IDN/98902890 Genbank FJ432728 EU660408 FJ432731 KF955460 FJ562103 EU660410 EU482462 EU482453 KF955333 FJ639731 HM181934 GU131944 GU131911 GU131906 GQ868634 FJ639725 HM631854 GU131905 FJ639729 GU131939 GU131904 KF955461 KY586772 DQ401691 DQ401692 DQ401693 DQ401689 DQ675531 DQ675526 KY586822 KY586820 KY586749 KY586811 KY586734 KJ737429 AY676349 KY586733 KY586716 AY776329 DF AB189128 Năm Địa điểm Vật chủ 2007 2006 2007 2008 2008 2006 2007 2006 2005 2007 2006 2007 2006 2003 2006 2003 2008 2008 2006 2007 2005 1999 1998 2002 2002 2002 / 1998 1998 2009 2008 2003 2009 2001 1994 1998 2000 2002 / Miền Nam-VN Miền Nam-VN Miền Nam-VN Miền Nam-VN Miền Nam-VN Miền Nam-VN Miền Nam-VN Miền Nam-VN Campuchia Campuchia Campuchia Campuchia Campuchia Campuchia Campuchia Campuchia Campuchia Campuchia Campuchia Campuchia Campuchia Campuchia Thái Lan Bangladesh Bangladesh Bangladesh Bangladesh Đài Loan Đài Loan Thái Lan Thái Lan Thái Lan Thái Lan Thái Lan Thái Lan Thái Lan Thái Lan Thái Lan Đài Loan Người Người Người Người Người Người Người Người Người Người Người Người Người Người Người Người Người Người Người Người Người Người Người / / / / Người Người Người Người Người Người Người Người / Người Người / 1998 Indonesia Người ST T Ký hiệu chủng Mã số Genbank Năm Địa điểm Vật chủ 41 42 43 44 45 46 DV-3/1998 DENV-3/IDN/PI64/2004 D3/SG/05K4477DK1/2005 DENV-3/IDN/TB16/2004 DENV-3/IDN/KJ46/2004 DENV-3/IDN/FW06/2004 DENV-3/THA/Hu/TL AY858046 EU081223 AY858047 AY858043 AY858041 AB214882 2004 2005 2004 2004 2004 2005 Indonesia Singapore Indonesia Indonesia Indonesia Timor Leste Người / Người Người Người Người 47 129NIID/2005 DENV-3/THA/Hu/TL AB214880 2005 Timor Leste Người 48 49 50 51 52 029NIID/2006 D3/Hu/TL129NIID/2005 DENV-3/TWN/99TW628/1999 D3/H/IMTSSA-SRI/2000/1266 D3/SG/05K3928DK1/2005 DENV- AB214882 DQ675533 AY099336 EU081213 AY679147 2005 1999 / 2005 / Timor Leste Đài Loan Sri Lanka Singapore Brazil Người Người / / / 53 54 55 56 57 58 59 60 61 62 3/BRZ/BR74886/02/2002 DENV-3/CO/BID-V3405/2007 DENV-3/US/BID-V2118/2001 DENV-3/PE/BID-V7088/2005 DENV-3/PE/BID-V7087/2008 DENV-3/PE/BID-V7086/2006 DENV-3/US/BID-V2111/2000 D3/H/IMTSSA-SRI/1999/1243 DENV-3/VE/BID-V2969/2003 DENV-3/US/BID-V2099/1998 DENV-3/US/BID-V1737/1999 GQ868578 FJ547082 KJ189299 KJ189298 KJ189297 FJ547076 NC_001475 FJ898472 FJ547070 FJ390377 2007 2001 2005 2008 2006 2000 / 2003 1998 1999 Colombia Puerto Rico Peru Peru Peru Puerto Rico Sri Lanka Venezela Puerto Rico Puerto Rico Người Người Người Người Người Người / Người Người Người VR dengue týp STT Ký hiệu chủng 10 DENV-4/TH/Seq23 DENV-4/TH/BID-V4331/2006 DENV-4/TH/Seq24 DENV-4/TH/Seq41 DENV-4/TH/Seq15 DENV-4/TH/Seq16 DENV-4/TH/Seq21 DENV-4/TH/Seq22 DENV-4/TH/Seq14 DENV-4/TH/Seq29 Mã số Năm Địa điểm Vật chủ Genbank KY586880 KF955522 KY586881 KY586926 KY586865 KY586866 KY586877 KY586879 KY586862 KY586891 2005 2006 2004 2002 2005 2004 2003 2004 2004 2005 Thái Lan Thái Lan Thái Lan Thái Lan Thái Lan Thái Lan Thái Lan Thái Lan Thái Lan Thái Lan Người Người / Người Người Người Người Người Người Người STT Ký hiệu chủng Mã số Năm Địa điểm Vật chủ 2003 2003 2002 2002 2002 2002 2007 2007 2002 2004 2011 / 2011 2011 2006 2011 2002 2006 2010 2007 2005 2001 2008 2008 2007 2008 2002 2001 2001 2002 Thái Lan Thái Lan Thái Lan Thái Lan Thái Lan Thái Lan Thái Lan Thái Lan Thái Lan Thái Lan Thái Lan Thái Lan Thái Lan Thái Lan Thái Lan Campuchia Thái Lan Thái Lan Campuchia Campuchia Thái Lan Campuchia Campuchia Campuchia Campuchia Campuchia Thái Lan Thái Lan Thái Lan Thái Lan Người Người Người Người Người Người Người Người Người Người Người Người Người Người Người Người Người Người Người Người Người Người Người Người Người Người Người Người Người Người 1998 2000 1991 2011 2009 1979 1961 1997 1997 1995 2011 2011 2004 Thái Lan Thái Lan Thái Lan Singapore Ấn Độ Ấn Độ Ấn Độ Thái Lan Thái Lan Venezuela Brazil Brazil Colombia Người Người / Người Người Người Người / / Người Người Người Người 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22 23 24 25 26 27 28 29 30 31 32 33 34 35 36 37 38 39 40 DENV-4/TH/Seq40 DENV-4/TH/Seq27 DENV-4/TH/Seq42 DENV-4/TH/Seq30 DENV-4/TH/Seq31 DENV-4/TH/Seq32 DENV-4/TH/Seq20 DENV-4/TH/Seq13 DENV-4/TH/Seq43 DENV-4/TH/Seq26 DENV-4/TH11/1404 DENV-4/TH11/1666 DENV-4/TH11/1373 DENV-4/TH11/1194 DENV-4/TH/BID-V4332/2006 DENV-4/IPC/DF patient/2008 DENV-4/TH/Seq67 DENV-4/TH/Seq65 DENV-4/TH/Seq64 DENV-4/TH/Seq63 Genbank KY586924 KY586889 KY586893 KY586895 KY586896 KY586897 KY586874 KY586858 KY586894 KY586888 KT026310 / KT026309 KT026308 KF955531 KF543273 KY586887 KF955533 KF543272 KF955528 KF955520 KF955514 KF955513 JN638572 JN638571 JN638570 KY586930 KY586928 KY586927 KY586925 41 42 43 44 45 46 47 48 49 50 51 52 53 DENV-4/TH/Seq62 DENV-4/TH/Seq52 DENV-4/THA/ThD4 0348 91/1991 DEV-4/SG(EHI)D4/25178Y11/2011 DENV-4/IND/0952326/2009 DENV-4/IND/793679/1979 DENV-4/IND/G11337/1961 DENV-4/THA/ThD4 0017 97/1997 DENV-4/THA/ThD4 0476 97/1997 DENV-4/VEN/INH6412/1995 DENV-4/BRA/H780571/2011 DENV-4/BRZ/H778887/2011 DENV-4/CO/BID-V3410/2004 KY586922 KY586912 AY618990 KP792537 JQ922560 JQ922559 JF262783 AY618989 AY618988 JF262781 JQ513344 JQ513337 GQ868583 DENV-4/CAM/V0624301/2011 DENV-4/TH/Seq25 DENV-4/TH/BID-V4334/2006 DENV-4/CAM/U0811386/2010 DENV-4/KH/BID-V3836/2007 DENV-4/TH/BID-V4329/2005 DENV-4/KH/BID-V3814/2001 DENV-4/KH/BID-V2058/2008 DENV-4/IPC/DSS patient/2008 DENV-4/IPC/DHF patient/2008 STT Ký hiệu chủng Mã số Năm Địa điểm Vật chủ 2006 1999 1978 2009 2012 2010 2008 Venezuela Puerto Rico Trung Quốc Polynesia Trung Quốc Singapore New Người Người Chuột Người Người Người Người 1973 / 1975 Caledonia Malaysia Malaysia Malaysia Khỉ / / 54 55 56 57 58 59 60 DENV-4/VE/BID-V2607/2006 DENV-4/US/BID-V2448/1999 DENV-4/CHN/GD07/78/1978 DENV-4/FP/PF09/290109-69/2009 DENV-4/CHN/GZ/9809/2012 DENV-4/SIN/EHI310A129SY10/2010 DENV-4/NC/NC08/200208-409/2008 Genbank JN819406 FJ882601 FJ196849 JQ915081 KC333651 JX024758 JQ915085 61 62 63 DENV-4/MAL/P73-1120/1973 DENV-4/MAL/P75-514/1975 DENV-4/MAL/P75-215/1975 JF262780 AF231723 EF457906 3,4,9-12,14,17,18,21-23,31,32,44,56,63,65 1-2,5-8,13,15,16,19,20,24-30,33-43,45-55,57-62,64,66- ... nghiên cứu: Một số đặc điểm dịch tễ học, lâm sàng sinh học phân tử VR dengue bệnh nhân Bệnh vi n Đa khoa Tỉnh Đắk Lắk, 2010 2016 MỤC TIÊU NGHIÊN CỨU CỦA ĐỀ TÀI: Mô tả số đặc điểm dịch tễ học yếu... DỤC VÀ ĐÀO TẠO BỘ Y TẾ VI N VỆ SINH DỊCH TỄ TRUNG ƯƠNG -* - ĐOÀN HỮU THIỂN MỘT SỐ ĐẶC ĐIỂM DỊCH TỄ HỌC, LÂM SÀNG VÀ SINH HỌC PHÂN TỬ CỦA VI RÚT DENGUE Ở BỆNH NHÂN TẠI BỆNH VI N ĐA. .. 4.2 Một số đặc điểm lâm sàng SXHD liên quan với týp VR dengue gây bệnh tỉnh Đắk Lắk, 2010- 2016 90 4.3 Một số đặc điểm sinh học phân tử týp VR dengue lưu hành Đắk Lắk, Tây Nguyên 2010- 2016