Một số đặc điểm dịch tễ học, lâm sàng và sinh học phân tử của vi rút dengue ở bệnh nhân sốt xuất huyết dengue tại bệnh viện đa khoa tỉnh Đắk Lắk, 2010 – 2016 (TT)

ĐẶT VẤN ĐỀ Sốt xuất huyết dengue (SXHD) là một trong những bệnh truyền nhiễm có tỷ lệ mắc và tử vong cao. VR dengue có 4 týp huyết thanh, tất cả các týp VR đều có khả năng gây bệnh nhưng týp 2 thường liên quan đến tình trạng lâm sàng nặng. Tại Việt Nam, số mắc và chết do SXHD gia tăng mạnh. Số liệu thống kê của Bộ Y tế những năm 2005-2013 cho thấy tỷ lệ mắc SXHD ở Tây Nguyên cao nhất nước, trong đó, Đắk Lắk có tỷ lệ mắc SXHD cao trong địa bàn Tây Nguyên. Xuất phát từ thực tế trên, chúng tôi tiến hành đề tài: “Một số đặc điểm dịch tễ học, lâm sàng và sinh học phân tử của vi rút dengue ở bệnh nhân sốt xuất huyết dengue tại Bệnh viện Đa khoa Tỉnh Đắk Lắk, 2010-2016” với 3 mục tiêu: 1. Mô tả một số đặc điểm dịch tễ học và yếu tố liên quan của sốt xuất huyết dengue ở tỉnh Đắk Lắk, 2010-2016. 2. Mô tả một số đặc điểm lâm sàng sốt xuất huyết dengue và sự liên quan với các týp vi rút dengue gây bệnh ở tỉnh Đắk Lắk, 2010-2016. 3. Xác định một số đặc điểm sinh học phân tử các týp vi rút dengue lưu hành ở tỉnh Đắk Lắk, 2010-2016. Những điểm mới về khoa học và giá trị thực tiễn của đề tài 1. Lần đầu tiên đưa ra được đặc điểm dịch tễ học và yếu tố liên quan của sốt xuất huyết dengue ở tỉnh Đắk Lắk trong suốt giai đoạn tương đối dài, từ 2010-2016, để có cái nhìn khái quát về dịch tễ học sốt xuất huyết dengue ở Đắk Lắk. 2. Lần đầu tiên đưa ra được mối liên quan giữa đặc điểm lâm sàng sốt xuất huyết dengue và týp vi rút gây bệnh. Nghiên cứu đã chỉ ra xuất huyết dưới da và xuất huyết lợi/răng/giác mạc gặp nhiều nhất ở nhóm bệnh nhân SXHD do DENV-3, ít gặp hơn ở nhóm bệnh nhân do DENV-4. Tỉ lệ giảm tiểu cầu cao nhất ở bệnh nhân do DENV-2, thấp nhất do DENV-4. 3. Đưa ra được 37 trình tự nucleotide một phần vùng gen C-PrM được cấp mã số trong Genbank.

BỘ GIÁO DỤC VÀ ĐÀO TẠO BỘ Y TẾ VIỆN VỆ SINH DỊCH TỄ TRUNG ƢƠNG - ĐOÀN HỮU THIỂN MỘT SỐ ĐẶC ĐIỂM DỊCH TỄ HỌC, LÂM SÀNG VÀ SINH HỌC PHÂN TỬ CỦA VI RÚT DENGUE Ở BỆNH NHÂN SỐT XUẤT HUYẾT DENGUE TẠI BỆNH VIỆN ĐA KHOA TỈNH ĐẮK LẮK, 2010 - 2016 Chuyên ngành: Dịch tễ học Mã số: 62.72.01.17 TÓM TẮT LUẬN ÁN TIẾN SĨ Y HỌC Hà Nội - 2017 ĐẶT VẤN ĐỀ Sốt xuất huyết dengue (SXHD) bệnh truyền nhiễm có tỷ lệ mắc tử vong cao VR dengue có týp huyết thanh, tất týp VR có khả gây bệnh týp thường liên quan đến tình trạng lâm sàng nặng Tại Việt Nam, số mắc chết SXHD gia tăng mạnh Số liệu thống kê Bộ Y tế năm 2005-2013 cho thấy tỷ lệ mắc SXHD Tây Nguyên cao nước, đó, Đắk Lắk có tỷ lệ mắc SXHD cao địa bàn Tây Nguyên Xuất phát từ thực tế trên, tiến hành đề tài: “Một số đặc điểm dịch tễ học, lâm sàng sinh học phân tử vi rút dengue bệnh nhân sốt xuất huyết dengue Bệnh viện Đa khoa Tỉnh Đắk Lắk, 2010-2016” với mục tiêu: Mô tả số đặc điểm dịch tễ học yếu tố liên quan sốt xuất huyết dengue tỉnh Đắk Lắk, 2010-2016 Mô tả số đặc điểm lâm sàng sốt xuất huyết dengue liên quan với týp vi rút dengue gây bệnh tỉnh Đắk Lắk, 2010-2016 Xác định số đặc điểm sinh học phân tử týp vi rút dengue lưu hành tỉnh Đắk Lắk, 2010-2016 Những điểm khoa học giá trị thực tiễn đề tài Lần đưa đặc điểm dịch tễ học yếu tố liên quan sốt xuất huyết dengue tỉnh Đắk Lắk suốt giai đoạn tương đối dài, từ 2010-2016, để có nhìn khái qt dịch tễ học sốt xuất huyết dengue Đắk Lắk Lần đưa mối liên quan đặc điểm lâm sàng sốt xuất huyết dengue týp vi rút gây bệnh Nghiên cứu xuất huyết da xuất huyết lợi/răng/giác mạc gặp nhiều nhóm bệnh nhân SXHD DENV-3, gặp nhóm bệnh nhân DENV-4 Tỉ lệ giảm tiểu cầu cao bệnh nhân DENV-2, thấp DENV-4 Đưa 37 trình tự nucleotide phần vùng gen C-PrM cấp mã số Genbank 2 Nghiên cứu xác định nhóm gồm chủng DENV- phân lập từ bệnh nhân Đắk Lắk cách biệt so với kiểu gen xác định, không thuộc genotyp cơng bố, genotyp/sub-genotyp Nghiên cứu xác định týp VR dengue lưu hành Đắk Lắk mà góp phần xác định nguồn gốc genotype týp VR dengue lưu hành tỉnh này, góp phần cung cấp thêm sở liệu dịch tễ sinh học phân tử VR dengue khu vực Tây Nguyên Việt Nam CẤU TRÚC CỦA LUẬN ÁN Luận án gồm 108 trang, 17 bảng, 27 hình Mở đầu trang Tổng quan 33 trang; đối tượng phương pháp nghiên cứu 16 trang; kết nghiên cứu 27 trang; bàn luận 27 trang; kết luận trang kiến nghị trang Chƣơng 1: TỔNG QUAN 1.1 Dịch tễ học sốt xuất huyết dengue 1.1.1 Tác nhân gây bệnh Sốt xuất huyết dengue (SXHD) VR dengue, thuộc chi Flavivirus, họ Flaviviridae, có týp huyết thanh, týp lại có nhiều geno týp khác Bệnh lây truyền qua muỗi Aedes aegypti Aedes albopictus 1.1.2 Đường lây SXHD lây truyền qua muỗi Aedes aegypti Aedes albopictus Aedes aegypti đóng vai trò chủ yếu 1.1.3 Khối cảm thụ Tất người, kể người mắc SXHD, nhiễm vi rút dengue tái mắc bệnh SXHD có tốc độ lây lan nhanh Đầu tiên, dịch xảy chủ yếu khu vực mật độ dân số cao, dần dần, dịch xuất vùng thưa người nông thôn, miền núi 3 1.3 Đặc điểm dịch tễ học sốt xuất huyết dengue Việt Nam 1.3.1 Tình hình sốt xuất huyết dengue Việt Nam Hình 1.1 Số mắc SXHD Việt Nam/100.000 dân Trước đây, SXHD lưu hành chủ yếu tỉnh miền Nam, miền Trung Những năm 2005-2013, tỷ lệ mắc SXHD Tây Nguyên cao nước, tỉnh Đắk Lắk có tỷ lệ mắc SXHD cao địa bàn Tây Nguyên 1.3.2 Khối cảm thụ SXHD ghi nhận lứa tuổi chủ yếu người lớn khu vực miền Bắc trẻ em khu vực miền Nam 1.3.3 Mùa dịch Miền Nam miền Trung bệnh xuất quanh năm, miền Bắc Tây Nguyên bệnh thường xảy từ tháng 4-11 Dịch lớn thường ghi nhận từ tháng 8-11, đỉnh dịch tháng 10 Hình 1.2 Số mắc sốt xuất huyết dengue theo tháng Việt Nam Gần đây, dịch SXHD diễn biến khác thường, số mắc cao ghi nhận vào tháng cuối năm Năm 2015, số mắc tăng 11,5% so với giai đoạn 2010-2014 chủ yếu vào tháng 10, 11 12 Năm 2015 đầu 2016, số ca mắc SXHD gia tăng nhiều nơi nước gần không theo quy luật bệnh dịch trước 1.3.4 Đặc điểm sốt xuất huyết dengue khu vực Tây Nguyên Từ năm 1983-2004, tỉnh Tây Nguyên, nhiều năm có dịch SXHD lớn, dịch lớn hàng năm SXHD xảy rải rác Hình 1.3 Tỷ lệ SXHD tỉnh Tây Nguyên, 2005-2014 Trong khoảng thời gian từ 2005 đến 2014, năm ghi nhận bệnh nhân SXHD địa bàn tỉnh Tây Nguyên Riêng năm 2010 2013 có dịch xảy với số mắc cao (297,67/100.000 dân 293,52/100.000 dân) Năm 2013, Đắk Lắk có tỷ lệ mắc cao Hình 1.4 Tỷ lệ mắc SXHD Đắk Lắk Tây Nguyên 1.4 Mối liên quan đặc điểm lâm sàng týp vi rút gây bệnh 1.4.1 Đặc điểm lâm sàng sốt xuất huyết dengue SXHD có biểu đặc trưng bao gồm sốt, xuất huyết thoát huyết tương Bệnh dẫn đến hậu sốc giảm thể tích tuần hồn, rối loạn đơng máu, suy tạng dẫn đến tử vong Biểu lâm sàng SXHD đa dạng, diễn biến nhanh chóng từ nhẹ đến nặng Tổ chức Y tế Thế giới phân loại SXHD theo mức độ: Sốt xuất huyết dengue, sốt xuất huyết dengue có dấu hiệu cảnh báo, sốt xuất huyết Dengue nặng 1.4.3 Tình trạng lâm sàng liên quan với týp vi rút gây bệnh Cả týp VR dengue có khả gây bệnh ca bệnh nặng/tử vong thường thuộc týp DENV-2 Có giả thuyết cho DENV-2 có độc lực có khả gây sốc mạnh týp vi rút dengue khác Các týp DENV-1 DENV-3 thường có biểu sốt đơn người lớn, đơi có xuất huyết nặng 1.5 Đặc điểm sinh học phân tử týp vi rút dengue Tất týp VR dengue lưu hành châu Á Thái Bình Dương, châu Phi châu Mỹ Hình 1.5 Lưu hành týp VR dengue Việt Nam, 1991-2012 Tại Việt Nam, trước 1970, giám sát VR học cho thấy, có đơn lẻ týp VR dengue gây dịch Những thập kỷ gần đây, vụ dịch SXHD có từ đến týp VR dengue lưu hành, trội týp VR dengue có khác 6 Chƣơng ĐỐI TƢỢNG VÀ PHƢƠNG PHÁP NGHIÊN CỨU 2.1 Đối tƣợng nghiên cứu 2.1.1 Đối tƣợng mục tiêu 1: Bệnh nhân có chẩn đốn lâm sàng SXHD bệnh viện Đa khoa tỉnh Đắk Lắk Tiêu chuẩn xác định ca bênh: Theo QĐ số 1499 ngày 17/5/2011 Bộ Y tế 2.1.2 Đối tƣợng mục tiêu 2: Bệnh án để điều tra số triệu chứng lâm sàng bệnh nhân SXHD theo týp vi rút: 2010-2016 2.1.3 Đối tƣợng mục tiêu 3: Một phần vùng gen C-PrM chủng vi rút dengue týp phân lập từ bệnh nhân SXHD tỉnh Đắk Lắk, 2010-2016 2.2 Thời gian địa điểm nghiên cứu - Thời gian địa điểm nghiên cứu: Nghiên cứu hồi cứu 2010–2014, nghiên cứu theo dõi 2015-2016; Bệnh viện Đa khoa tỉnh Đắk Lắk 2.3 Phƣơng pháp nghiên cứu Nghiên cứu mô tả cắt ngang (cross-sectional sudy), kết hợp hồi cứu (2010-2014) tiến cứu (2015-2016) Hình 2.1: Thiết kế nghiên cứu 2.3.1 Phương pháp nghiên cứu mục tiêu 2.3.1.1.Thiết kế nghiên cứu: Nghiên cứu dịch tễ học mơ tả Chọn bệnh nhân có chẩn đốn lâm sàng nghi ngờ SXHD bệnh viện Đa khoa tỉnh Đắk Lắk Cỡ mẫu nghiên cứu: 1675 bệnh nhân 2.3.1.2 Quy trình thu thập số liệu nghiên cứu a) Lựa chọn bệnh nhân có định lâm sàng nghi SXHD * Giai đoạn 2010-2014: Hồi cứu danh sách tất ca bệnh chẩn đoán lâm sàng SXHD ≥ tuổi; sống đến từ vùng có vi rút dengue lưu hành vòng 14 ngày, có biểu sốt cao đột ngột, sốt liên tục từ 2-7 ngày có số dấu hiệu: Xuất huyết nhiều mức độ khác nhau; nhức đầu, chán ăn, buồn nôn; da xung huyết, phát ban; đau cơ, đau khớp, nhức hai hố mắt; vật vã, li bì; đau vùng gan ấn đau vùng gan * Giai đoạn 2015-2016: Chọn tất ca bệnh chẩn đoán lâm sàng SXHD vào điều trị BV đa khoa tỉnh Đăk lắk - Lựa chọn bệnh nhân chẩn đoán xác định SXHD Chọn bệnh nhân chẩn đoán xác định SXHD kỹ thuật MAC-ELISA, RT-PCR phân lập vi rút: 694 trường hợp SXHD (107 ca hồi cứu giai đoạn 2010-2014 theo dõi phát 587 ca từ 2015-2016) - Thu thập số liệu đặc điểm dịch tễ tất ca bệnh dương tính SXHD Thu thập thông tin theo mẫu bệnh án nghiên cứu (Phụ lục 1-phiếu điều tra dịch tễ lâm sàng ca bệnh SXHD) 2.3.1.3 Lấy mẫu xét nghiệm: Giai đoạn 2010-2014, chọn 10% số bệnh nhân, bệnh nhân lấy máu lần 2015-2016, bệnh nhân lấy máu lần: Lần 1: Ngày nhập viện, lần 2: Trước viện sau 7-10 ngày mắc bệnh 2.3.1.4 Kỹ thuật xét nghiệm: MAC-ELISA Multiplex RT-PCR 2.3.2 Phương pháp nghiên cứu mục tiêu 2.3.2.1.Thiết kế nghiên cứu: Nghiên cứu mô tả cắt ngang, sử dụng số liệu hồi cứu (2010-2014) theo dõi tiếp diễn (2015-2016) 2.3.2.2 Cỡ mẫu: Toàn 276 mẫu thời gian 2010-2016 có kết định týp VR Chọn mẫu: Tất trường hợp có chẩn đốn xác định dương tính định týp VR kỹ thuật Multiplex RT-PCR 8 Bệnh nhân SXHD type 1, type 2, type type với số lượng tương ứng 63, 63, 50 100 Chọn bệnh án để điều tra triệu chứng lâm sàng để xác định mối liên quan tình trạng lâm sàng với type VRdengue gây bệnh 2.3.2.3.Kỹ thuật nghiên cứu - Điều tra đặc điểm lâm sàng yếu tố liên quan dựa vào biểu mẫu điều tra - Xác định týpVR kỹ thuật Multiplex RT-PCR 2.3.2.4 Công cụ thu thập số liệu Thu thập số liệu theo phụ lục (Phiếu điều tra hồi cứu lâm sàng) 2.3.3 Phương pháp nghiên cứu mục tiêu 2.3.3.1 Thiết kế nghiên cứu: Nghiên cứu mô tả 2.3.3.2 Cỡ mẫu nghiên cứu: 37 chủng vi rút dengue phân lập từ bệnh nhân Đắk Lắk (12 chủng DENV-1; chủng DENV-2; chủng DENV-3 13 chủng DENV-4) 2.3.3.3 Đối tượng nghiên cứu: Một phần vùng gen C-PrM 37 chủng VR dengue phân lập nghiên cứu So sánh với phần vùng gen C-PrM Genbank 43 chủng DENV-1; 51 chủng DENV-2; 62 chủng DENV-3 63 chủng DENV-4 19 chủng VR dengue loại số tỉnh khu vực Tây nguyên 2010-2016 2.3.3.4 Kỹ thuật thực Xác định týpVR dengue kỹ thuật Sequencing trực tiếp Sanger, giải trình tự gen 2.3.3.5 Xây dựng phát sinh lồi Trình tự nucleotide mẫu xếp đa trình tự phần mềm MUSCLE tích hợp MEGA6.06 Cây gia hệ xây dựng phương pháp Maximum Likelihood với độ lặp lại 1000 lần với mơ hình thích hợp (K2 + G: Kimura parameter phân bố Gamma) phần mềm tích hợp MEGA6.06 9 2.4 Các số nghiên cứu 2.4.1 Các số nghiên cứu mục tiêu 2.4.1.1 Đặc điểm dịch tễ học sốt xuất huyết dengue Đặc điểm dịch tễ học trường hợp sốt xuất huyết theo năm; đặc điểm phân bố dịch tễ học trường hợp sốt xuất huyết theo giới, theo nhóm tuổi, theo địa dư, theo mùa; tiền sử phơi nhiễm với SXHD 2.4.1.2 Yếu tố liên quan: Điều kiện sống, thực hành phòng muỗi đốt, thực hành diệt bọ gậy 2.4.2 Các số đặc điểm lâm sàng mối liên quan đến type vi rút gây bệnh - Xác định số đặc điểm lâm sàng SXHD trẻ em, người lớn liên quan đến týpVR dengue - Xác định số triệu chứng lâm sàng ngày nhập viện, số triệu chứng xuất huyết liên quan đến týpVR, số số xét nghiệm liên quan đến SXHD, mức độ lâm sàng theo týpVR, theo nhóm tuổi thời gian điều trị trung bình 2.4.3 Một số đặc điểm sinh học phân tử - Xác định genotype týp VR dengue phân lập kỹ thuật giải trình tự gen - Xây dựng phả hệ mô tả mối liên quan týp VR dengue phân lập Đắk Lắk, so sánh tương đồng trình tự nucleotid với chủng VR dengue số tỉnh khu vực Tây Nguyên, 20102016 - So sánh mối liên quan týp phân lập Đắk Lắk với số chủng VR dengue nước, giới 2.5 Các biện pháp hạn chế sai số Các biện pháp loại trừ sai số: - Thiết kế nghiên cứu chặt chẽ, biểu mẫu chuẩn bị đầy đủ, chi tiết Các kỹ thuật xét nghiệm thực theo thường quy phòng thí nghiệm chuẩn thức quốc gia khu vực Viện Vệ sinh dịch tễ Tây Nguyên, Viện Vệ sinh dịch tễ Trung ương - Sử dụng tối đa thuật toán thống kê để loại trừ sai số ngẫu nhiên 10 - Sử dụng phần mềm tin sinh học để so sánh/phân tích trình tự nucleotide chủng vi rút dengue phân lập Đắk Lắk với chủng vi rút dengue nước quốc tế - Chọn đội ngũ thu thập thông tin bác sỹ chun mơn sâu có kinh nghiệm lĩnh vực truyền nhiễm, tổ chức tập huấn thống phương pháp giám sát trường hợp bệnh; thường xuyên điều tra, giám sát - Cỡ mẫu đủ lớn 2.6 Phƣơng pháp xử lý số liệu: Nhập phân tích liệu phần mềm MS Excel, EpiInfo STATA; xử dụng phần mềm Meggas, Bioedit, để tạo phả hệ, xác định nguồn gốc giả định type VR dengue Đắk Lắk Chƣơng KẾT QUẢ NGHIÊN CỨU 3.1 Kết mô tả đặc điểm dịch tễ học yếu tố liên quan 3.1.1 Một số đặc điểm dịch tễ học 1675 trường hợp có chẩn đốn lâm sàng SXHD có 694 trường hợp xác định SXHD Bảng 3.1 Một số đặc điểm dịch tễ Đặc điểm Giới Nhóm tuổi Theo địa dư Nam Nữ < tuổi 1-4 tuổi 5-9 tuổi 10-14 tuổi ≥ 15 tuổi Thành phố Nông thôn Số ca SXHD lâm sàng n % 821 49,01 854 50,99 0,3 0,12 58 3,46 112 6,69 1498 89,43 551 32,90 1124 67,10 Số ca SXHD xác định (+) n % 332 47,84 362 52,16 0,29 0 0,58 15 2,16 673 96,97 278 40,06 416 59,94 11 Khơng có khác biệt nam nữ với p>0,05 Tỷ lệ SXHD nhóm trẻ 0,05 tuổi (8,06) (13,89) (3,16) (6,17) Tỷ lệ xuất huyết da xuất huyết lợi/răng/giác mạc gặp nhiều nhóm bệnh nhân DENV-3 (50% 33,33%) Tiểu máu, nơn máu gặp Các triệu chứng lâm sàng ngày nhập viện nhóm tuổi 82%) Nhóm bệnh nhân SXHD ngày (3,17) (1,59) (6,0) (6,0) viện Trung bình 4,25±1,75 3,56±1,19 4,18±1,67 4,41±1,63 63 (100,0) 62 (98,41) 49 (98,0) 97 (97,0) Kết Khỏi Không rõ (0,0) (1,59) (2,0) (3,0) Thời gian nằm viện trung bình xấp xỉ ngày, tỉ lệ nằm viện trên7 ngày thấp (6%) Tỷ lệ khỏi bệnh cao (>97%), trường hợp tử vong 3.3 Kết xác định đặc điểm dịch tễ sinh học phân tử týp vi rút dengue lƣu hành Đắk Lắk 2010-2016 Có 37 chủng VR dengue phân lập tỉnh Đắk Lắk, bao gồm: 12 chủng DENV-1; chủng DENV-2; chủng DENV- 13 chủng DENV-4 Tất 12 chủng vi rút DENV-1 thuộc genotýp I (GI) nhóm với chủng DENV-1 GI lưu hành Tây Nguyên Việt Nam Bảng 3.7 Độ tương đồng trình tự nucleotide chủng DENV-1 Đắk Lắk với chủng khác Độ đồng Tỷ lệ số Tỷ lệ số nucleotide nucleotide So sánh chủng trung bình thấp – (%) cao (%) Các chủng GI Đắk Lắk với Tây Nguyên 97,8 95,2 – 100 Các chủng GI Việt Nam 97,8 95,9 – 100 Các chủng Việt Nam – chủng GI nước 97,9 95,9 – 100 Các chủng GI Việt Nam – chủng thuộc GII 92,2 90,1 -93,3 Các chủng GI Việt Nam – chủng thuộc GIII 91,8 92,8 – 89,2 Các chủng GI Việt Nam – chủng thuộc GIV 92,1 90,1 – 93,3 Các chủng GI Việt Nam – chủng thuộc GV 91,6 89,9 – 93,6 Trình tự nucleotid chủng DENV-1 GI lưu hành Đắk Lắk 2010-2016 với chủng Tây Nguyên phân lập 17 thời điểm với chủng khác phân lập Việt Nam thời điểm khác trung bình 97,8% (95,9%–100%) Độ đồng trình tự nucleotide chủng Việt Nam với chủng GI lưu hành nước khu vực 97,9% (95,9-100%) với genotýp khác giao động khoảng 91,6%-92,2% DENV-2 có genotýp chủng phân lập nghiên cứu không thuộc kiểu gen số kiểu gen trên, nghiên cứu đặt Asian-III Bảng 3.8 Độ tương đồng trình tự nucleotide chủngDENV-2 Đắk Lắkvới chủng khác Độ đồng Tỷ lệ nucleotide Tỷ lệ nucleotide thấp So sánh chủng trung bình (%) – cao (%) Các chủng Tây Nguyên 99,1 98,3-100 Các chủng Tây Nguyên 99,1 98,1-99,8 chủng khác Việt Nam Các chủng Việt Nam – 99,3 98,6-99,8 chủng khác nhóm Các chủng Việt Nam – 96,0 95,3-96,6 chủng Asian-I Các chủng Việt Nam – 95,6 94,8-96,3 chủng Asian-II Các chủng Việt Nam – 91,6 91,0-92,7 chủng Asian-American Các chủng Việt Nam – 90,1 89,4-90,5 chủng American Các chủng Việt Nam – 91,0 89,4-92,2 chủng Cosmopolitan-I Các chủng Việt Nam – 92,4 91,9-92,7 chủng Cosmopolitan-II Các chủng Việt Nam – 91,4 90,5-92,6 chủng Cosmopolitan-III Các chủng DENV-2 phân lập Đắk Lắk, 2010-2016 cách biệt so với kiểu gen định danh với độ tương đồng mặt nucleotide nhóm kiểu gen khác từ 90,1%-96% số chủng DENV-2 Việt Nam lưu hành năm 2006 thuộc kiểu gen Cosmopolitan-III 18 Tất chủng DENV-3 phân lập tỉnh Đắk Lắk, thuộc genotýp II có mối quan hệ gần gũi mặt di truyền với chủng DENV-3 lưu hành Việt Nam DENV-4 chia thành kiểu gen (GI–GIII GS) kiểu gen GI chia thành hai phân nhóm nhỏ GI-A GI-B 13 chủng DENV-4 Đắk Lắk giai đoạn 2010–2016 thuộc kiểu GI-A Bảng 3.9 Độ tương đồng trình tự nucleotide chủng vi rút dengue týp Đắk Lắkvới chủng khác Độ đồng Tỷ lệ Tỷ lệ nucleotide nucleotide thấp – cao So sánh chủng trung bình (%) (%) Các chủng Đắk Lắk – 98,9 96,8-100 nhóm Các chủng Tây Nguyên – 94,7 93,7-95,3 nhóm nhóm Các chủng Tây Nguyên 99,2 99,0-99,5 nhóm – chủng khác nhóm Kết phân tích cho thấy chủng nhóm gen có độ tương đồng 98,9% (96,8-100%) Độ tương đồng hai nhóm gen 94,7%% (93,7-95,3%) Chƣơng BÀN LUẬN 4.1 Đặc điểm dịch tễ học yếu tố liên quan SXHD tỉnh Đắk Lắk, 2010-2016 Vụ dịch SXHD 2016 bùng phát Đắk Lắk với 13.234 trường hợp SXHD, so sánh với vụ dịch 2010 2013, khu vực Tây Nguyên số mắc có 13.000 trường hợp, cho thấy tỉnh Đắk Lắk điểm nóng SXHD khu vực Tây Nguyên Số mắc chủ yếu nhóm ≥15 tuổi (96,97%), số mắc nhóm trẻ