Danh mục dụng cụ, trang thiết bị PTN

Phòng thí nghiệm sinh học phân tử – cách xây dựng phòng Lab chuẩn Phòng thí nghiệm sinh học phân tử (phòng thí nghiệm PCR) nên chia thành khu vực riêng biệt: cho bước chuẩn bị mẫu trước PCR, cho bước phân tích sau chạy PCR Hai khu vực tốt nên nằm tách rời phòng riêng biệt Trong trường hợp không gian bị giới hạn, cần tách tủ an toàn sinh học dùng cho PCR phòng riêng Tất trang thiết bị vật dụng phải dùng riêng cho khu vực, không mang qua lại từ khu sang khu khác Phòng thí nghiệm sinh học phân tử Phòng thí nghiệm thực phản ứng PCR: Phòng thí nghiệm thực PCR dùng chẩn đoán mẫu bệnh phẩm nên tách thành khu vực phòng riêng biệt: Chuẩn bị hóa chất (duy trì áp suất phòng cao áp suất mơi trường bên ngồi để tránh bị tạp nhiễm từ nguồn bên ngồi phòng) Chuẩn bị mẫu (duy trì áp suất phòng thấp áp suất mơi trường bên ngồi để giữ DNA template bên phòng) Khuếch đại phát sản phẩm (duy trì áp suất phòng thấp mơi trường bên ngồi để giữ nucleic acids khuếch đại bên phòng) Làm việc phòng thí nghiệm PCR: Nên tn thủ theo quy trình làm việc chiều (bên dưới) để giảm thiểu tối đa khả tạp nhiễm Phòng chuẩn bị hóa chất Chuẩn bị PCR master mix, chia nhỏ master mix ↓ Phòng chuẩn bị mẫu (a) Sơ chế mẫu (b) Tách chiết nucleic acids (c) Cho mẫu vào master mix chia theo tube ↓ Phòng khuếch đại phát sản phẩm (a) Chạy PCR (real-time PCR) máy luân nhiệt (b) Phát sản phẩm i Điện di gel (PCR thường) ii Quan sát & phân tích kết máy (real-time PCR) Thiết bị phòng thí nghiệm PCR: Để đảm bảo cho bước trước PCR sau chạy PCR tách biệt, phòng cần có thiết bị, hóa chất, dụng cụ… riêng sử dụng vật dụng phòng Máy PCR/real-time PCR: Dùng riêng cho phòng khuếch đại Máy ly tâm (centrifuge): Sử dụng máy ly tâm riêng cho chuẩn bị mẫu (tách chiết acid nucleids…) phòng chuẩn bị hóa chất (optional) Máy ly tâm kéo mẫu (spindown): Sử dụng riêng máy spindown cho phòng chuẩn bị hóa chất, phòng chuẩn bị mẫu, phòng khuếch đại phát sản phẩm Máy trộn mẫu (vortex mixer): Sử dụng riêng máy vortex cho phòng chuẩn bị hóa chất, phòng chuẩn bị mẫu, phòng khuếch đại phát sản phẩm Bộ điện di DNA (DNA gel electrophoresis): Dùng để phát sản phẩm sau chạy PCR, multiples PCR, RT-PCR… Pipettes: Sử dụng riêng pipette cho phòng chuẩn bị hóa chất, phòng chuẩn bị mẫu, phòng khuếch đại phát sản phẩm Tủ thao tác / tủ an toàn sinh học (Biological safety cabinets): Nên sử dụng tủ thao tác phù hợp với nhu cầu phòng thí nghiệm (theo thiết kế nhà sản xuất) Loại tủ Đèn UV Hệ thống khí Mục đích sử dụng PCR cabinet (Type C) Chỉ dùng cho bước chuẩn bị Tủ mát có ngăn đơng (Refrigerator): Dùng cho phòng khuếch đại phát sản phẩm để giữ hóa chất cho điện di, dung dịch sử dụng (working solution), sản phẩm PCR sau khuếch đại Tủ âm (freezer) (-20oC): - Dùng riêng cho phòng chuẩn bị hóa chất để giữ hóa chất PCR sạch, buffer, dNTPS, primers… - Dùng riêng cho phòng chuẩn bị mẫu để giữ mẫu gốc, nucleic acids sau tách chiết - Bảo quản thời gian dài nên sử dụng tủ đông sâu (-80 oC) (optional) 10 Cân kỹ thuật (4 số lẻ): Dùng riêng cho phòng chuẩn bị hóa chất phòng phát sản phẩm 11 Máy khuấy từ: Dùng riêng cho phòng chuẩn bị hóa chất 12 Máy đo pH: Dùng riêng cho phòng chuẩn bị hóa chất 13 Lò vi sóng: Dùng riêng cho phòng phát sản phẩm 14 Máy đọc chụp ảnh gel (hoặc bàn đèn UV): Dùng riêng cho phòng phát sản phẩm VẬT TƯ TIÊU HAO: Pipette tips: - Có thể dùng đầu tip có lọc để tránh nhiễm chéo - Tip dùng cho PCR phải vô trùng, RNase-free, DNase-free, pyrogen-free Tube đựng mẫu (1.5 mL) tube PCR (0.2 mL) - Tube dùng cho phòng thí nghiệm PCR nên polypropylene tubes, DNase-, RNase-, pyrogen-free Tube 0.2 mL dùng cho chạy máy luân nhiệt nên tube vách mỏng (thin-wall) Găng tay phòng thí nghiệm: Nên sử dụng găng tay không bụi, dùng găng tay tất thao tác phòng thí nghiệm PCR Nên thay găng tay chuyển từ khu vực phòng sang phòng khác (phòng chuẩn bị hóa chất –> chuẩn bị mẫu –> khuếch đại…) Dụng cụ thủy tinh: Nên sử dụng loại hấp khử trùng Giá để tube (rack) – nhiệt độ phòng & lạnh Phòng thí nghiệm PCR: danh mục thiết bị ST T Số lượng tối thiểu Tên thiết bị PHỊNG CHUẨN BỊ HĨA CHẤT 1 Cân kỹ thuật (4 số lẻ) Máy khuấy từ Máy đo pH Tủ thao tác / tủ an toàn sinh học 1 Tủ âm (freezer) (-200C) Máy ly tâm kéo mẫu (spindown) Máy trộn mẫu (vortex mixer) Pipettes PHÒNG CHUẨN BỊ MẪU 1 Cân kỹ thuật Tủ thao tác / tủ an toàn sinh học Tủ âm (freezer) (-20 C) Option al Tủ đông sâu (deep freezer) (-800C) Máy ly tâm (centrifuge) Máy ly tâm kéo mẫu (spindown) Máy trộn mẫu (vortex mixer) Pipettes PHÒNG KHUẾCH ĐẠI VÀ PHÁT HIỆN MẪU 1 /1 Máy PCR / real-time PCR Máy ly tâm kéo mẫu (spindown) Máy trộn mẫu (vortex mixer) Tủ mát có ngăn đông (Refrigerator) Cân kỹ thuật (tối thiểu số) Lò vi sóng Bộ điện di DNA (DNA gel electrophoresis) 1-2 Pipettes Máy đọc chụp ảnh gel ( bàn đèn UV) VẬT DỤNG TIÊU HAO x Pipette tips Tube đựng mẫu (1.5 mL) tube PCR (0.2 mL) x x Găng tay phòng thí nghiệm x Dụng cụ thủy tinh Giá để tube (rack) – nhiệt độ phòng & lạnh x ... thủy tinh: Nên sử dụng loại hấp khử trùng Giá để tube (rack) – nhiệt độ phòng & lạnh Phòng thí nghiệm PCR: danh mục thiết bị ST T Số lượng tối thiểu Tên thiết bị PHỊNG CHUẨN BỊ HĨA CHẤT 1 Cân... kết máy (real-time PCR) Thiết bị phòng thí nghiệm PCR: Để đảm bảo cho bước trước PCR sau chạy PCR tách biệt, phòng cần có thiết bị, hóa chất, dụng cụ… riêng sử dụng vật dụng phòng Máy PCR/real-time... (centrifuge): Sử dụng máy ly tâm riêng cho chuẩn bị mẫu (tách chiết acid nucleids…) phòng chuẩn bị hóa chất (optional) Máy ly tâm kéo mẫu (spindown): Sử dụng riêng máy spindown cho phòng chuẩn bị hóa chất,