Khảo sát tình hình đề kháng kháng sinh do trực khuẩn Gram âm gây nhiễm trùng hô hấp được phân lập tại Bệnh viện Nhân dân 115

B GIÁO DCăVẨăẨOăTO TRNGăI HC M THÀNH PH H CHÍ MINH KHOA CÔNG NGH SINH HC  BÁO CÁO KHÓA LUN TT NGHIP  tài tt nghip: KHOăSỄTăTỊNHăHỊNHă KHÁNG KHÁNG SINH DO TRC KHUN GRAM ÂM GÂY NHIM TRÙNG HÔ HPăC PHÂN LP TI BNH VIN NHÂN DÂN 115. ( T THỄNGă11/2013ăN THÁNG 05/2014) CHUYÊN NGÀNH: VI SINH ậ SINH HC PHÂN T GVHD : BS CKI NguynăPhngăDung SVTH : Trn Th M Nhung MSSV : 1053010549 KHÓA : 2010- 2014 TP.H CHÍ MINH THÁNG 06 NM 2014 Khóa lun tt nghip GVHD: Bs CKI Nguyn Phng Dung SVTH: Trn Th M Nhung LIăCỄMăN Li cám n đu tiên em xin gi đn ba m em đư to điu kin cho em n hc đn ngày hôm nay. Gia đình luôn là ngun đng viên khuyn khích,c v em hc tp, giúp em vt qua mi khó khn trong sut thi gian hc tp và cho đn khi ra trng. Em xin chân thành cám n ging viên hng dn ca em là Bác s chuyên khoa I trng đn v vi sinh Nguyn Phng Dung đư tn tình ch dy và giúp đ em vt qua khó khn trong nhng bc đu thc báo cáo thc tp tt nghip này. Em rt cm n trng i hc M TP.HCM, khoa Công ngh sinh hc đư to điu kin thun li cho em có đc ni thc tp tt đ em hoàn thành tt bài báo cáo này. Em tht s rt cám n các thy cô ca khoa Công ngh sinh hoc trng i hc M TP.HCM đư cho em nhng kin thc rt hay, rt b ích, giúp em không cm thy b ng trong nhng ngày đu thc tp.Em rt cm n thy cô đư rt tn tình hng dn và giúp đ em rt nhiu trong quá trình hc tp ti trng i hc M TP.HCM. Em cng xin gi li cám n đn Ban Giám c Bnh Vin Nhân Dân 115 đư nhn em vào thc tp. Xin gi li cm n ca em đn ch Dung, ch Qunh, ch Phng, ch Thy, ch Tâm, ch Phi và anh Cng cùng tt c các cô chú anh ch k thut viên ti khoa xét nghim Bnh Vin Nhân Dân 115 đư tn tình hng dn và giúp đ em trong sut thi gian thc tp. Cui cùng là xin gi li cám n đn các bn đư luôn luôn bên tôi, ng h và giúp đ tôi rt nhiu đ tôi có th hoàn thành tt bài báo cáo này. Khóa lun tt nghip GVHD: Bs CKI Nguyn Phng Dung SVTH: Trn Th M Nhung DANH MC CÁC BNG Bng II.1 Tiêu chun đánh giá vi th ca mt mu đàm 34 Bng II.2 Thang đim Barlett đ đánh giá mu đàm 34 Bng II.3 Các vi khun có th có trong mu đàm khi kho sát vi th 34 Bng II.4 Màu ca b test sinh hóa Api 10S 41 Bng III.1 T l v gii tính ca bnh nhân có mu cy đàm 51 Bng III.2 T l v đ tui bnh nhân 52 Bng III.3 T l vi sinh sau khi cy đàm 52 Bng III.4 T l các vi khun gây nhim trùng hô hp phân lp đc ti Bnh Vin Nhân Dân 115 53 Bng III.5 T l các vi khun gây nhim trùng đng hô hp đc xp theo nhóm . 55 Bng III.6 T l nhim trc khun Gram âm theo gii tính 56 Bng III.7 T l nhim trc khun Gram âm theo đ tui 57 Bng III.8 T l nhim trùng hô hp do trc khun Gram âm theo khoa 58 Bng III.9 Kt qu kho sát tình hình đ kháng kháng sinh chung ca trc khun Gram âm  Bnh Vin Nhân Dân 115 59 Bng III.10 Kt qu đ kháng kháng sinh ca 195 chng Acinetobacter baumannii,124 chng Pseudomonas aeruginosa, 105 chng Escherichia coli và 137chng trc khun Gram âm khác 61 Bng III.11 Kt qu kho sát kh nng sinh men beta- lactamase ph rng (ESBL) ca trc khun Gram âm đc kho sát  Bnh Vin Nhân Dân 115 62 Khóa lun tt nghip GVHD: Bs CKI Nguyn Phng Dung SVTH: Trn Th M Nhung DANH MC HÌNH NH Hình I.1 H hô hp  ngi 5 Hình I.2 Cu to mi  ngi 6 Hình I.3 Cu to hu  ngi 6 Hình I.4 Thanh qun  ngi 7 Hình I.5 Khí qun ca ngi 8 Hình I.6 Ph qun ca ngi 9 Hình I.7 Hình thái cu to ngoài ca phi 10 Hình I.8 Khun lc Acinetobacter baumanii trên môi trng BA và MC 16 Hình I.9 Pseudomonas aeruginosa 18 Hình I.10 Escherichia coli 20 Hình II.1 L ly mu vô trùng 32 Hình II.2 Serynge hút đàm 33 Hình II.3 B ly đàm qua mi 33 Hình II.4 Phng pháp cy 3 chiu 38 Hình II.5 Màu sc phn ng âm tính và dng tính ca Api 10S 42 Hình II.6 Kt qu đnh danh bng h thng Apiwep ca Pseudomonas aeruginosa. 43 Hình II.7 Kt qu đnh danh bng h thng Apiwep ca Acinetobacter baumannii . 43 Hình II.8 Các đa kháng sinh dùng làm kháng sinh đ 47 Hình II.9 Kt qu sau khi đt kháng sinh đ 47 Khóa lun tt nghip GVHD: Bs CKI Nguyn Phng Dung SVTH: Trn Th M Nhung DANH MCăSă/ BIUă S đ II.1 Quy trình cy đàm 35 Biu đ III.1 T l v gii tính bnh nhân có mu cy đàm 51 Biu đ III.2 T l v đ tui bnh nhân 52 Biu đ III.3 T l vi sinh sau khi cy đàm 53 Biu đ III.4 T l các vi khun gây nhim trùng hô hp phân lp đc ti Bnh Vin Nhân Dân 115 54 Biu đ III.5 T l các vi khun gây nhim trùng đng hô hp đc xp theo nhóm 56 Biu đ III.6 T l nhim trc khun Gram âm theo gii tính 57 Biu đ III.7 T l nhim trc khun Gram âm theo đ tui 57 Biu đ III.8 T l nhim trùng hô hp do trc khun Gram âm theo khoa 58 Biu đ III.9 Kt qu kho sát tình hình đ kháng kháng sinh chung ca trc khun Gram âm  Bnh Vin Nhân Dân 115 60 Biu đ III.10 Kt qu đ kháng kháng sinh ca 195 chng Acinetobacter baumannii,124 chng Pseudomonas aeruginosa, 105 chng Escherichia coli và 137 trc khun Gram âm khác 61 Biu đ III.11 Kt qu kho sát kh nng sinh men beta- lactamase ph rng (ESBLs) ca trc khun Gram âm đc kho sát  Bnh Vin Nhân Dân 115 63 Khóa lun tt nghip GVHD: Bs CKI Nguyn Phng Dung SVTH: Trn Th M Nhung DANH MC T VIT TT CFU: Colony Forming Unit ( đn v to khúm đi vi vi khun sng). NCCLS: Nationnal Committee for Clinical Laboratory Standards (y Ban Quc Gia v tiêu chun ca các phòng thí nghim ti M). SMART: Study for Monitoring Antimicrobial Resistance Trends ( Nghiên cu giám sát khuynh hng đ kháng kháng sinh). R: Resistant ( đ kháng). S: Susceptible (nhy cm). I: Intermediate ( trung gian). N: S lng. ESBLs: Extended Spectrum Beta – Lactamase MC: Môi trng Mac Conkey Agar. BA: Môi trng Blood Agar. MHA: Môi trng Mueller Hinton Agar. EPEC: Enteropathogenic E. coli (E. coli gây bnh lý  rut). ETEC: Enterotoxicgenic E. coli ( E. coli tit đc t). EIEC: Enteroinvasive E. coli (E. coli xâm ln niêm mc rut). EAEC: Enteroaggregative E. coli (E.coli kt dính  niêm mc rut). EHEC: Enterohaemorrhagic E. coli (E. coli gây xut huyt niêm mc rut). MR: Methyl Red. VP: Voges Proskauer. EMB: Eosine methyl blue. SS: Samonella Shigela Agar. HUS: Hemolytic Uremie Syndrome. Khóa lun tt nghip GVHD: Bs CKI Nguyn Phng Dung SVTH: Trn Th M Nhung Khoa HSTC: Hi sc tích cc. B4m: Phòng m. A3B: Bnh lý mch máu não. A2D: Hi sc tim mch. Kháng sinh AMC: Amoxcilline + Clavulanate acid. CTX: Cefotaxime. CTX + C: Cefotaxime + Clavulanate acid. CRO: Ceftriaxone. FEP: Cefepime. SCF: Cefoperazone + Sulbactam. IMP: Imipeneme. MEM: Memropenem. ETP: Ertapenem. AN: Amikacine. MFX: Moxifloxacine CIP: Ciprofloxacine CS: Colistine CFP: Cefoperazone CXM: Cefuroxime CAZ: Ceftazidime. CAL: Ceftazidime + Clavulanate acid. Khóa lun tt nghip GVHD: Bs CKI Nguyn Phng Dung SVTH: Trn Th M Nhung MC LC T VNă 1 CHNG I: TNG QUAN 4 I. H HÔ HP 5 1. Khoang mi 5 2. Hu 6 3. Thanh qun 7 4. Khí qun 8 5. Ph qun 9 6. Phi 9 II. NHIM TRÙNG HÔ HP 10 1. nh ngha nhim trùng hô hp 10 2. Nguyên nhân và các yu t thun li gây bnh 10 3. Du hiu nhn bit nhim trùng hô hp 11 4. Tác hi và bin chng ca bnh nhim trùng hô hp 11 5. Cách x trí các trng hp nhim trùng hô hp (cp) 11 6. Cách phòng nga 12 III. CÁC BNH NHIM TRÙNG HÔ HP THNG GP 12 1. Nhim trùng hô hp trên 12 1.1 Viêm hu hng 12 1.2 Viêm xoang 12 2. Nhim trùng hô hp di 12 2.1 Viêm ph qun cp 12 2.2 Viêm phi 12 Khóa lun tt nghip GVHD: Bs CKI Nguyn Phng Dung SVTH: Trn Th M Nhung IV. TÌNH HÌNH NHIM TRÙNG HÔ HP HIN NAY VÀ S  KHÁNG SINH 13 V. CÁC VI KHUN GÂY NHIM TRÙNG HÔ HP CÓ TH TÌM THY TRONG BNH PHM ẨM 14 VI. Să LC V TRC KHUN GRAM ÂM GÂY NHIM TRÙNG NG HÔ HP 15 1. Acinetobacter baumannii 15 1.1 Tính cht vi sinh 15 1.2 Ni c trú và tính gây bnh 16 1.3 Tính cht sinh hóa 17 2. Pseudomonas aeruginosa 17 2.1 Tính cht vi sinh 17 2.2 Ni c trú và tính gây bnh 18 2.3 Tính cht sinh hóa 19 2.4 Kháng nguyên 19 3. Escherichia coli ( E.coli) 20 3.1 Tính cht vi sinh 20 3.2 Ni c trú và tính gây bnh 21 3.3 Tính cht sinh hoá 22 3.4 Kháng nguyên và đc t 22 4. Dch t hc 23 5. Bin pháp phòng nga 23 VII. KH NNGă SINHă MENă BETA- LACTAMASE PH RNG CA CÁC TRC KHUN GRAM ÂM GÂY NHIM TRÙNG HÔ HP (ESBL - ExpandedăSpectrumă.lactamase) 23 1. nh ngha ESBLs 23 Khóa lun tt nghip GVHD: Bs CKI Nguyn Phng Dung SVTH: Trn Th M Nhung 2. Tình hình đ kháng kháng sinh do trc khun gram âm tit ESBLs 24 2.1 Trên th gii 24 2.2 Ti Vit Nam 25 VIII. SăLC V KHÁNG SINH 25 1. Khái nim 25 2. Phân loi 25 3. Các h kháng sinh 26 4. Các nhóm kháng sinh thng dùng hin nay trên lâm sàng 26 4.1 Nhóm ß –lactamase 26 4.2 Aminoglycosides (Streptomycine, Gentamycine, Amikacine, Kanamycine) 27 4.3 Macrolides (Erythromycin, Azithromycin, Clarithromycin, Spiramycin …) 27 4.4 Nhóm glycopeptides 27 4.5 Nhóm Quinolones (Ofloxaxin, Norfloxacin, Ciprofloxacin và Pefloxacin) 27 4.6 Nhóm Phenicol (Chloramphenicol, Thiamphenicol) 27 4.7 Nhóm Cyclins (Tetracycline, Doxycyline, Metacycline) 27 4.8 Nhóm Nitromidazol (Metronidazole, Tinidazole, Secnidazole…) 27 5. C ch tác đng ca kháng sinh 27 6. S kháng thuc 28 6.1 C ch đ kháng 28 6.2 Ngun gc ca vic kháng thuc 28 6.3 S kháng chéo 29 6.4 Gii hn kháng thuc 29 7. Bin pháp ngn nga hin tng kháng thuc 29 8. Tính cht dc lý ca kháng sinh 29 8.1 S hp th  ng tiêu hóa 29 8.2 S khuch tán vào các mô và t bào 30 [...]... hi kháng kháng sinh do tr c khu n Gram âm gây nhi m trùng hô h c phân l p t i B nh Vi n Nhân Dân 115 (t tháng 11/ 2013 n tháng 05 tài v m t khoa h c: tài nh m cung c t s thông tin v tr c khu n Gram âm gây nhi m trùng hô h p phân l ct m k t qu , tình kháng kháng sinh c a các tr c khu n này Vì tính ch t gây b nh nguy hi m cho i mà ta c n nghiên c u tr t t nh t, gi m kh kháng kháng sinh hi u qu nh t hô. .. các nghiên c u v vi sinh v t gây nhi m khu o v s c kh e cho c ng ng M c tiêu nghiên c u M c tiêu t ng quát: Kh o sát t kháng kháng sinh do tr c khu n Gram âm gây nhi m trùng hô h c phân l p t i B nh Vi n Nhân Dân 115 th i gian t 01/11/2013 n 01/05/2014 M c tiêu chuyên bi t: Kh o sát t l tr c khu n Gram âm gây nhi m trùng hô h p phân l c t m i Khoa Xét Nghi m B nh Vi n Nhân Dân 115 t 01/11/2013 n 01/05/2014... 3 Kh o sát tình hình nhi m khu ng hô h p 53 4 K t qu kh o sát tr c khu n Gram âm gây nhi m khu ng hô h p 56 II TH O LU N 63 1 Th o lu n v m m u 63 2 Th o lu n v kh o sát vi u 63 3 Th o lu n v k t qu kh o sát tr c khu n Gram âm gây nhi m trùng hô h p phân l p t i B nh Vi n Nhân Dân 115 64 4 Th o lu n v k t qu kháng kháng sinh c a tr c khu n Gram âm B nh... không khí ô nhi m, nhi u khói b i nên các b nh lý ng g p nh t v n là các b ng hô h nh lý này có th là do virus ho c vi khu n, và b nh hô h ng g p nh t là nhi m khu ng hô h p do tr c khu n Gram âm n hình nh t là các tr c khu Nhi m khu n do tr c trùng Gram âm kháng thu c, ng do Acinetobacter baumannii là m t trong nh u gây t vong do nhi m trùng trên toàn th gi i c i Vi t Nam T l tr c trùng Gram âm gây. .. Bi n ch ng: nhi m trùng máu, suy hô h p Trang 12 X lý: h s t, gi Ngoài ra, nhi m trùng hô h qu kháng sinh u ng hay tiêm 14 ngày i còn có các b nh : Viêm thanh qu n, viêm khí IV.TÌNH HÌNH NHI M TRÙNG HÔ H P HI N NAY VÀ S KHÁNG SINH [21] Theo T ch c Y t Th gi ng hô h nh có chi u ng b nh ngày càng có chuy n bi n ph c t p mà nguyên nhân chính là do s kháng kháng sinh c a các tác nhân gây b nh Ph n l n... hô h p là tình tr ng m t ho c m t s b ph n thu c b máy hô h p b viêm nhi m do vi khu n ho c siêu vi gây ra.[17] V n lâm sàng, nhi m trùng hô h p g m hai lo i: Nhi m trùng hô h p trên là tình tr ng nhi m trùng c p tính ng hô h p trên do ng c a các vi sinh v t gây b nh B ng x y ra vào th m giao mùa (kho n tháng 3), lúc tr i tr l m trong không khí gi m th p Viêm nhi m hô h ng do vi khu ng h p do siêu vi... hình nh t là tr c khu kháng thu Acinetobacter baumannii, Pseudomonas aeruginosa, Escherichia coil gây ra, ng n s c kh e c ng nghiêm tr c bi t là s kháng kháng sinh c a nó nên chúng tôi mu u v tr c khu n Gram âm và tình tr ng kháng kháng sinh hi n nay c c s cho phép c a Khoa Công ngh sinh h i h c M TP.HCM cùng v i s ng d n c Nguy Vi Sinh Khoa xét nghi m B nh Vi n Nhân Dân 115 và s t n tình c a các cô chú,... âm d m ng có t l t vong cao không ch sinh b nh khá ph c t p c a vi khu n Gram âm mà ngày nay còn do khó ch c kháng sinh thích h p ngay t u vì kh kháng khá cao v i các kháng sinh m nh và ph r ng c bi i v i các nhi m khu n do Acinetobacter baumanii, Pseudomonas aeruginosa thì v u tr l n này kháng v i h u h t các kháng sinh Hi n nay, s xu t hi n các ch ng tr c khu n Gram âm sinh -lactamase ph r tv c p... Pseudomonas aeruginosa, [4] Acinetobacter baumannii Tr c khu n Gram âm c chú ý nhi u trong các nghiên c ug n su t ngày càng cao và tính ch t gây b nh n ng c a chúng Tr c khu n Gram âm c ghi nh n là các tác nhân vi khu n Gram âm hàng u gây các nhi m khu n bao g m các b i th máy, nhi m trùng huy t, nhi m trùng ti u, nhi m trùng sau ph u thu t vùng b ng Nhi m khu n n ng gây ra do tr c khu n Gram âm d... Kh o sát t l kháng kháng sinh c a tr c khu n Gram âm gây nhi m khu n hô h p phân l ct m i Khoa Xét Nghi m B nh Vi n Nhân Dân 115 th i gian t 01/11 n 01/05/2014 Trang 3 Trang 4 I H HÔ H P.[1] H hô h p bao g cl Hình I.1 H hô h p ng d n khí t n các ph nang c a ph i và u, thanh qu n, khí qu n, ph qu n và ph i i ( Tr n Tu n Anh, 2013) 1 Khoang m i [1] C ut oc m nh th ng c thành Thành c m có 4 thành do cá . đư tin hành thc hin đ tài: “ Kho sát tình hình đ kháng kháng sinh do trc khun Gram âm gây nhim trùng hô hp đc phân lp ti Bnh Vin Nhân Dân 115 (t tháng 11/ 2013 đn tháng 05/. lâm sàng mt s thông tin v trc khun Gram âm gây nhim trùng hô hp phân lp đc t mu đàm và kt qu kháng sinh đ, tình hình đ kháng kháng sinh ca các trc khun này. Vì tính cht gây. nghiên cu. Mc tiêu tng quát: Kho sát tình hình đ kháng kháng sinh do trc khun Gram âm gây nhim trùng hô hp đc phân lp ti Bnh Vin Nhân Dân 115 thi gian t 01/11/2013 đn 01/05/2014.