Khảo sát các hoạt chất từ cây lan kim tuyến (anoectochilus sp ) có tiềm năng kháng viêm

Bộ GIÁO DỤC VÀ ĐÀO TẠO TRƯỜNG ĐẠI HỌC NGUYÊN TẤT THÀNH VIỆN KỸ THUẬT CÔNG NGHỆ CAO NTT NGÀNH CƠNG NGHỆ SINH HỌC NGUYEN TAT THANH KHĨA LUẬN TƠT NGHIỆP ĐẺ TÀI: KHẢO SÁT CÁC HOẠT CHẤT TỪ CÂY LAN KIM TUYẾN (Anoectochilus sp.) CÓ TIỀM NĂNG KHÁNG VIÊM CAO GVHD : TS VŨ THỊ HUYỀN TRANG SVTH : LUƠNG THÁI VĂN MSSV : 1800001428 LỚP : 18DSH1A TP HCM, tháng 05 năm 2022 Bộ GIÁO DỤC VÀ ĐÀO TẠO TRƯỜNG ĐẠI HỌC NGUYÊN TẤT THÀNH VIỆN KỸ THUẬT CÔNG NGHỆ CAO NTT NGÀNH CÔNG NGHỆ SINH HỌC NGUYEN TAT THANH KHĨA LUẬN TƠT NGHIỆP ĐẺ TÀI: KHẢO SÁT CÁC HOẠT CHẤT TỪ CÂY LAN KIM TUYẾN (Anoectochilus sp.) CÓ TIỀM NĂNG KHÁNG VIÊM CAO GVHD : TS VŨ THỊ HUYỀN TRANG SVTH : LUƠNG THÁI VĂN MSSV : 1800001428 LỚP : 18DSH1A TP HCM, tháng 05 năm 2022 LỜI CẢM ƠN Tôi xin chân thành cảm ơn Ngành Công nghệ Sinh học Viện Công nghệ Kỳ thuật cao Nguyễn Tất Thành thầy cô tạo điều kiện cho tốt cho tơi hồn thành khóa luận tốt nghiệp Tôi xin chân thành cảm ơn TS Vũ Thị Huyền Trang tận tâm dạy truyền đạt kiến thức suốt thời gian thực đề tài để tơi hồn thành tốt khóa luận Tơi xin chân thành cảm ơn Anh Nguyễn Thanh Điềm giúp đỡ thời gian qua Sinh viên (ký ghi rõ họ tên) NHẬN XÉT CỦA GIẢNG VIÊN HƯỚNG DẢN 1/ Trình độ lý luận: 2/ Kỳ nghề nghiệp: 3/ Nội dung báo cáo: 4/ Hình thức báo cáo: Điểm: TP HCM, ngày tháng năm 2021 (Ký ghi rõ họ tên) ii NHẬN XÉT CỦA GIẢNG VIÊN PHẢN BIỆN 1/ Trình độ lý luận: 2/ Kỳ nghề nghiệp: 3/ Nội dung báo cáo: 4/ Hình thức báo cáo: Điểm: TP HCM, ngày tháng năm 2021 (Ký ghi rõ họ tên) iii MỤC LỤC LỜI CẢM ƠN i MỤC LỤC iv DANH MỤC CÁC BẢNG BIẾU vi DANH MỤC CÁC HÌNH ẢNH, sơ ĐỊ, BIẾU ĐÒ vii KÝ HIỆU CÁC CỤM TÙ VIẾT TÁT vui LỜI MỞ ĐẦU ix CHƯƠNG TÓNG QUAN TÀI LIỆU 1.1 Tổng quan Viêm 1.1.1 Khái niệm 1.1.2 Một so protein liên quan đen viêm 1.2 Tổng quan Lan Kim tuyến 1.2.1 Giới thiệu Lan Kim tuyến 1.2.2 Đặc điếm hình thái 1.2.3 Đặc điếm sinh thái 1.2.4 Giá trị 1.3 Mô gắn kết phân tử (Molecular Docking) 1.4 Tình hình nghiên cứu 1.4.1 Nghiên cứu nước 1.4.2 Nghiên cứu nước CHƯƠNG NỘI DUNG VÀ PHƯƠNG PHÁP NGHIÊN cứu 10 2.1 Noi thực 10 2.2 Nội dung nghiên cứu .10 2.3 Phuơng pháp nghiên cứu 10 IV 2.3.1 Các phần mềm, chương trình máy tính 10 2.3.2 Thu thập xử lí dừ liệu hợp chất phối tử 11 2.3.3 Thu thập xử lí liệu phân từ protein (receptor) liên quan đến kháng viêm 12 2.3.4 Thực gắn kết cứng (Rigid Docking) 13 2.3.5 Phân tích phamarcophore 13 2.3.6 Thực mô gắn kết linh động (Flexible docking) 15 CHƯƠNG KÉT QUÀ VÀ THẢO LUẬN 18 3.1 KẾT QUẢ 18 3.1.1 Thu thập xử lí dừ liệu cấu trúc phân tử ligand 18 3.1.2 Thu thập xử lí liệu cấu trúc phân tử receptor (protein) 19 3.1.3 Kết lực tương tác (Affinity) mô gẳn kết cứng (Rigid Docking) 20 3.1.4 Phân tích pharmacophore cho phức hệ rigid docking 24 3.1.5 Ket lực tương tác (Affinity) sau thực liên kết linh động (Flexible Docking) 26 3.1.6 Phân tích pharmacophore cho phức hệ Flexible Docking so với Rigid Docking .29 3.2 Thảo luận 30 KÉT LUẬN VÀ ĐỀ NGHỊ 32 PHỤ LỤC 33 TÀI LIỆU THAM KHẢO 39 V DANH MỤC CÁC BẢNG BIỂU Bảng 3.1 Các hợp chất thu từ lan Kim tuyến thông tin liên quan 18 Bảng 3.2 Một số thông tin cấu trúc 3D protein khảo sát 19 Bảng 3.3 Hình cấu trúc 3D protein khảo sát 20 Bảng 3.4 Ái lực gắn kết linh động protein với acid amin linh động tương ứng với phối tử 28 Bảng 3.5 Phân tích Phamarcophore phức hợp có kết lực tốt .29 Bảng 3.6 Tương tác phân tử phức họp từ Rigid Flexible Docking 30 vi DANH MỤC CÁC HÌNH ẢNH, sơ ĐỒ, BIỂU ĐỒ Hình 1.1 Lan Kim tuyến Hình 2.1 Giao diện chương trình Notepad thực gắn kết cứng 13 Hình 2.2 Sao chép kết Model 14 Hình 2.3 Hiến thị Pharmacorphore 3D phức hợp protein - ligand hiến thị BIOVIA Discovery Studio Visualizer 15 Hình 2.4 Giao diện chương trình Notepad thực gắn kết linh động 16 Hình 2.5 Chuyến đoi thư mục chương trình cmd 17 Hình 2.6 Ket sau chạy chương trình cmd 17 Hình 3.1 Bieu the lực phối tử với protein Interleukin-1 p (6Y8I) 21 Hình 3.2 Biểu đồ thể lực phối tử với protein TNF-a (7KP9) 22 Hình 3.3 Bieu đồ lực cùa phối tử với protein MCP-1 (2ML0) 22 Hình 3.4 Biểu đồ thể lực phối tử với protein Interleukin (5FUC) 23 Hình 3.5 Ket hiến thị pharmacophore phức hệ Cirrhopetalanthrin- TNF-a 24 Hình 3.6 Ket hiến thị pharmacophore Rutin với IL-1 (3 25 Hình 3.7 Ket hiến thị pharmacophore Narcissin với IL-6 26 vii KÝ HIỆU CÁC CỤM TỪ VIẾT TẤT Cmd Command Prompt PDB Protein Data Bank 2D Two-Dimension 3D Three-Dimension GC Gas Chromatography MS Mass Spectrometry viii TRP C219 Interactions 2] van der Waals ■ Unfavorable Acceptor-Acceptor ■ Conventional Hydrogen Bond ■ Pl-Sigma Hình 3.7 Ket hiến thị pharmacophore cùa Narcissin với IL-6 IL-6 protein có chuồi có kết lực cao (< -7,0 kcal/mol) với bốn phối tử 2, 6-Dimethoxy-1, 4-benzoquinone, Inulin, Narcissin, Rutin Trong kết lực tuơng tác IL-6 Narcissin tốt (-8,3 kcal/mol) Hầu hết mối quan hệ giũa phối tử với IL-6 liên kết van der waals liên kết yếu Điều có liên quan chặt chẽ đến cấu trúc thành phần phối tủ Tuy nhiên acid amin có vai trị liên kết với nhóm hydroxyl điều lý giải cho phức hợp protein - phối tử IL-6 Narcissin cần lượng liên kết tự thấp (8.3kcal/mol) 3.1.5 Ket lực tương tác (Affinity) sau thực liên kết linh động (Flexible Docking) Hau het phương pháp gắn kết protein-phoi tử cho rang protein phân tử không the lay chuyến Tuy nhiên, thực tế hầu hết protein phân tử linh hoạt liên tục chuyển từ cấu tạo ổn định sang dạng khác Gắn kết linh động thực AutoDockVina, với thông số hộp lưới phối tử gắn kết cứng, ngoại trừ yêu cầu gắn thêm axit amin linh động với protein Vì bước này, số axit amin linh hoạt từ mồi protein có tương tác với ligand rigid docking chọn để làm amino acid linh động phép 26 mô flexible docking Kết cụ thể trình bày Bảng 3.4 Trong protein, tơi khảo sát thêm mô gắn kết linh động (flexible docking) cho phức hệ protein 5FUC với Narcissin protein 7KP9 với Cirrhopetalanthrin đề xem thử thay đổi mức lượng gắn kết so với rigid docking 27 Bảng 3.4 Ái lực gắn két linh động protein với acid amin linh động tương ứng với phối từ Ái lực Protein Phối tử Ket gắn kết linh động acid amin với protein tương ứng gắn kết cứng Cirrhopetalant ilel55 leu57 tyr59 tyrl 19 tyr!51 vall3 -9.1 -9.1 -9.1 -9.2 -9.1 -9.1 -9.1 arg231 asn226 asp221 gln220 his256 ser227 ser228 trp225 -8.3 -8.0 -9.2 -8.9 -8.2 -8.2 -8.5 -8.1 -9.1 7KP9 hrin 5FUC his 15 Narcissin -8.2 28 Kết gắn kết linh động tạo liên kết mạnh dao động khoảng (0.1-1.0 kcal/mol) so với gắn kết cứng, flexible docking 7KP9 cao 0.1 kcal/mol so với Rigid Docking, 5FUC 1.0 kcal/mol (tại vị trí arg231) 3.1.6 Phân tích pharmacophore cho phức hệ Flexible Docking so vói Rigid Docking Bảng 3.5 Phân tích Phamarcophore phức hợp có ket lực tốt Sau thực gắn kết linh động, cho thấy hợp chất cho kết gắn kết cao hợp chất có chứa vịng phenol Các họp chat polyphenol có khả thay đối cấu trúc sơ cấp thứ cấp trình methyl, glycosyl hydroxyl hóa giúp dễ dàng tạo liên kết với acid amin tăng khả gắn kết ligand với protein 29 Bảng 3.6 Tương tác phân tữ cùa phức hợp từ Rigid Flexible Docking Complex 5FUCNarcissin 7KP9Cirrhopetala nthrin Docking type van der waals Conventional Hydrogen Bond Vnfavorble AcceptorAcceptor Pi-Sigma t’nfavorble Bump Pi-Pi stacked Alkyl Pi-Alkyl Rigid 1 0 0 Flexible 0 0 Rigid 0 Flexible 0 2 Kết cho thấy số acid amin linh động từ mồi protein gắn kết với ligand nhằm đạt kết gần với thực tế Các liên kết Pi quan trọng nhiều protein Các liên kết Pi tham gia vào q trình chuyển điện tích giúp vận chuyến thuốc thụ the liên quan Các tương tác kỵ nước nhóm liên ket Alkyl báo cáo làm tăng tính ưa béo cùa thuốc tạo điều kiện thuận lợi cho thuốc thấm qua màng tế bào Nhóm Carbonyl đóng vai trị quan trọng tương tác phối tử-đích liên kết hydro Tương tác nhóm OH’ khơng tạo gắn chặt làm tăng lực liên kết trình gắn kết linh hoạt Liên kết hydro tương tác phân tử biến họp chất sinh học đóng góp vào tính đặc hiệu cùa nhận biết phối tử 3.2 Thảo luận Các kết rigid docking cho thấy sử dụng hợp chat Acid Helvolic, Cirrhopetalanthrin, Inulin, Narcissin, Rutin, Triterpenoid đề phát triển thuốc ức chế protein IL-lp; hợp chất 2, 6-Dimethoxy-l, 4-benzoquinone, Cirrhopetalanthrin, Narcissin, Rutin đe ức chế protein TNF-a; hợp chất Cirrhopetalanthrin, Inulin, Rutin đe ức chế protein MCP-1; hợp chất chất 2, 6-Dimethoxy-l, 4-benzoquinone, Inulin, Narcissin, Rutin đế ức chế protein IL-6 điều trị viêm Trong đó, Inulin, Rutin hai hợp chất có tiềm ức chế nhiều loại protein viêm khác Tuy nhiên, việc phát triển loại thuốc từ hợp chất vần cần nghiên cứu thêm độc tinh, khả hấp thụ Cùng họ lan Kim tuyến trên, nhũng chi lan khác biết đến với nhiều công dụng khác nhau, nghiên cứu rộng rãi chống ung thu Cùng họp chất có 30 lan Kim tuyến tiến hành khảo sát hợp chất có tính chống viêm cao cho kết khả quan Các hợp chat quercetin, isorhamnetin, rutinoside (Bui Bao Thinh Nguyen Thi Yen, 2021) ngồi có tác dụng chống ung thư vú chống ung thư phối hợp chất cịn có tiềm kháng viêm Trong kết phụ lục hợp chất có kết lực thấp tốn lượng đặc biệt rutin có lực thấp hon quercetin isorhamnetin nên họp chất thích họp để điều chế thuốc chống viêm hiệu Quercetin, kaempferol isorhamnetin thành phần flavonoid xác định ÍARE Chiết xuất có tác dụng gây độc tế bào tế bào ung thư khác (Wen-Chuan Lin cs, 2015) Và ba hợp chất tơi khảo sát có tiềm chống viêm trình điều trị vấn đề liên quan đến viêm Nhiều nghiên cứu tinh kháng viêm kháng ung thư họp chất tự nhiên từ thảo dược thực hiện, nhiên nghiên cứu mô chủ yếu thực chất ức chế ung thư Trong đó, việc nghiên cứu khả viêm cùa họp chất phương pháp mơ vần cịn hạn chế Vì nghiên cứu hướng mẻ Ngoài ra, việc thực mô phụ thuộc nhiều nguồn dừ liệu cấu trúc protein tìm hiếu công bố sở dừ liệu, nhiều protein có cấu trúc liệu chưa tương thích với phần mem docking Vì nghiên cứu protein khảo sát (5FUC, 7KP9, 6Y8I 2MLO) thực rigid docking, có protein (5FUC 7KP9) có the thực tiếp flexible docking protein lại để thực flexible docking cần phải điều chỉnh cấu trúc liệu gốc, nhiên làm thay đổi liệu protein so với phức hệ rigid docking, nên không thực flexible docking cho protein Tuy thực mô linh động cho protein, kết flexible thể rõ ràng kết lực tương tác tăng đáng kể so với mô gắn kết rigid docking Điều gợi ý tiềm thực tế họp chất cho việc ức chế viêm thể cao nữa, the yếu tố từ acid amin protein ligand thể linh động, dẫn đến sè có tư tương tác bền chặt hơn, lực cao 31 KẾT LUẬN VÀ ĐÈ NGHỊ Ket luận Sau mô gắn kết cứng Docking protein với ligand cho thấy hợp chất Cirrhopetalanthrin, Narcissin, Rutin cho lực tương tác tốt (< -7,0 kcal/mol) với protein tham gia: - Protein IL-6 có lực tương tác với họp chất Cirrhopetalanthrin (-7,8 kcal/mol), Narcissin (-7,3 kcal/mol), Rutin (-7,5 kcal/mol) - Protein IL-lp có lực tương tác với hợp chất Cirrhopetalanthrin (-7,0 kcal/mol), Narcissin (-8,8 kcal/mol), Rutin (-9,2 kcal/mol) - Protein TNF-a có lực tương tác với họp chất Cirrhopetalanthrin (-7,3 kcal/mol), Narcissin (-7,1 kcal/mol), Rutin (-7,5 kcal/mol) - Protein MCP-1 có lực tương tác với hợp chất Cirrhopetalanthrin (-7,3 kcal/mol), Narcissin (-7,6 kcal/mol), Rutin (-7,6 kcal/mol) Giải thích hình thái hoạt tính dược (Pharmacophore) mô gắn kết cứng dựa tương tác protein-phối tử chương trình BIOVIA Discovery Studio Visualizer xác định so acid amin linh hoạt đe làm Docking cho protein Đe nghị - Nuôi trồng lan Kim tuyến chiết xuất họp chất Cirrhopetalanthrin, Narcissin, Rutin làm thuốc điều trị viêm - Thử nghiệm tính hiệu điều trị lâm sàng họp chất có lan Kim tuyến - Thực nghiệm nhiều họp chất có tiềm kháng viêm cao có lan Kim tuyến 32 PHỤ LỤC Phụ lục Các hợp chất tham khảo từ cơng bố có sẵn Bài báo Tên hợp chất Hàm lượng Trinh Ngoc Bon, Trieu Thai Hung, Phung Dinh Trung, Tran Cao Nguyen, Dang Thi Hai Ha, Nguyen Thi Hoai (E-E)-farnesol Anh, Hoang Thanh Son, Tran Hai Long, Pham Quang Tuyen, Ninh Viet Khuong (2020), “Medicinal Plant, Anoectochilus: Distribution, Ecology, Commercial Value and Use in North Vietnam’’, J Pharm Res Int, 32(11): 84-92 Gutierrez, Rosa Martha Pérez (2010), “Orchids: A review of uses in traditional medicine, its phytochemistry S2, 6-Dimethoxy-l, 4-benzoquinone and pharmacology”, Journal of medicinal plants research, 4(8): 592-638 Chae, LD Thinh BB Huong, HTT Kiel, NT Huan, LQ (2019), “Quantification of quercetin, isorhamnetin and acid aristolochic ferulic acid from Vietnamin dry extract of Anoectochilus setaceus Blume”, International Journal of Botany Studies, 4(5): 14-18 Xiao-Ming Du, Toyokichi Yoshizawa, Yukihiro Shoyama (1998), “Butanoic acid glucoside composition of acid ferulic whole body and in vitro plantlets of Anoectochilus formosanus”, Phytochemistry, 49(7): 1925-1928 Trinh Ngoc Bon, Trieu Thai Hung, Phung Dinh Trung, Tran Cao Nguyen, Dang Thi Hai Ha, Nguyen Thi Hoai acid helvolic Anh, Hoang Thanh Son, Tran Hai Long, Pham Quang Tuyen, Ninh Viet Khuong (2020), “Medicinal Plant, Anoectochilus: Distribution, Ecology, Commercial Value and Use in North Vietnam”, J Pharm Res Int, 32(11): 84-92 Gutierrez, Rosa Martha Pérez (2010), “Orchids: A review of uses in traditional medicine, its phytochemistry calanthoside and pharmacology”, Journal of medicinal plants research, 4(8): 592-638 33 5L9pg/g Xiao-Ming Du, Ning-Yi Sun, Nobuto Irino, Yukihiro Shoyama (2000), “Glycosidic constituents from in vitro caryophyllene oxide Anoectochilus fortnosanus”, Chemical and pharmaceutical bulletin, 48(11): 1803-1804 Gutierrez, Rosa Martha Pérez (2010), “Orchids: A review of uses in traditional medicine, its phytochemistry cirrhopetalanthrin and pharmacology”, Journal of medicinal plants research, 4(8): 592-638 Yang, Li-Chan Wu, Jin-Bin Lu, Ting-Jang Lin, Wen-Chuan (2013), “The prebiotic effect of Anoectochilus daucosterol formosanus and its consequences on bone health”, British journal of nutrition, 109(10): 1779-1788 Gutierrez, Rosa Martha Pérez (2010), “Orchids: A review of uses in traditional medicine, its phytochemistry dihydromel i lotoside and pharmacology”, Journal of medicinal plants research, 4(8): 592-638 Thang, Tran Ding, Ogunwande, Isiaka (2018), “Chemical constituents of essential oils from some Vietnamese gastrodin plants”, Facta Universitatis, Series Physics, Chemistry and Technology, 16(1): 79 25,25-4074,80 pg/g Gutierrez, Rosa Martha Pérez (2010), “Orchids: A review of uses in traditional medicine, its phytochemistry gastrol and pharmacology”, Journal of medicinal plants research, 4(8): 592-638 Thang, Tran Ding, Ogunwande, Isiaka (2018), “Chemical constituents of essential oils from some Vietnamese goodyeroside A plants”, Facta Universitatis, Series Physics, Chemistry and Technology, 16(1): 79 79,26-150,61 mg/g Zeng, Biyu Su, Minghua Chen, Qingxi Chang, Qiang Wang, Wei Li, Huihua (2017), “Protective effect of a inulin polysaccharide from Anoectochilus roxburghii against carbon tetrachloride-induced acute liver injury in mice”, Journal of ethnopharmacology, 200: 124-135 34 400 mg/kg Xiao-Ming Du, Toyokichi Yoshizawa, Yukihiro Shoyama (1998), “Butanoic acid glucoside composition of isohamnetin whole body and in vitro plantlets of Anoectochilus formosanus”, Phytochemistry, 49(7): 1925-1928 187,2pg/g DD Giap, TD Thai, DD Thang, NTH Trang, TT Tuan, NT Xuyen, DD Hieu (2018), “Effects of several organic kaempferol extracts on the growth, yield and quality of Anoectochilus formosanus biomass’’, International Journal of Agricultural Technology, 14(2): 171-182 Thang, Tran Ding, Ogunwande, Isiaka (2018), “Chemical constituents of essential oils from some Vietnamese kinsenoside plants”, Facta Universitatis, Series Physics, Chemistry and Technology, 16(1): 79 3,38-229,17 mg/g Thang, Tran Ding, Ogunwande, Isiaka (2018), “Chemical constituents of essential oils from some Vietnamese narcissin plants”, Facta Universitatis, Series Physics, Chemistry and Technology, 16(1): 79 10,07-17,37 pg/g Gutierrez, Rosa Martha Pérez (2010), “Orchids: A review of uses in traditional medicine, its phytochemistry octacosanol and pharmacology”, Journal of medicinal plants research, 4(8): 592-638 Thang, Tran Ding, Ogunwande, Isiaka (2018), “Chemical constituents of essential oils from some Vietnamese quercitrin plants”, Facta Universitatis, Series Physics, Chemistry and Technology, 16(1): 79 6,10-395,65 pg/g Xiao-Ming Du, Toyokichi Yoshizawa, Yukihiro Shoyama (1998), “Butanoic acid glucoside composition of quercetin whole body and in vitro plantlets of Anoectochilus formosanus”, Phytochemistry, 49(7): 1925-1928 Thang, Tran Ding, Ogunwande, Isiaka (2018), “Chemical constituents of essential oils from some Vietnamese rutin plants”, Facta Universitatis, Series Physics, Chemistry and Technology, 16(1): 79 35 4,80-6,67 pg/g Gutierrez, Rosa Martha Pérez (2010), “Orchids: A review of uses in traditional medicine, its phytochemistry scopoletin scoparone and pharmacology”, Journal of medicinal plants research, 4(8): 592-638 Do Thi, Gam Ha, Viet Hai Chu, Hoang Ha Pham, Bich Ngoc (2017), “Investigation of some chemical triterpenoid characteristics and antioxidant effects of Flavonoid compounds extracted from the species of Anoectochilus in Vietnam”, VNU Journal of Science: Natural Sciences and Technology, 33(1 S) Trinh Ngoc Bon, Trieu Thai Hung, Phung Dinh Trung, Tran Cao Nguyen, Dang Thi Hai Ha, Nguyen Thi Hoai a-cardinol Anh, Hoang Thanh Son, Tran Hai Long, Pham Quang Tuyen, Ninh Viet Khuong (2020), “Medicinal Plant, Anoectochilus: Distribution, Ecology, Commercial Value and Use in North Vietnam”, J Pharm Res Int, 32(11): 84-92 Xiao-Ming Du, Ning-Yi Sun, Nobuto Irino, Yukihiro Shoyama (2000), “Glycosidic constituents from in vitro p-caryophuyllene Anoectochilus formosanus”, Chemical and pharmaceutical bulletin, 48(11): 1803-1804 Xiao-Ming Du, Ning-Yi Sun, Nobuto Irino, Yukihiro Shoyama (2000), “Glycosidic constituents from in vitro p-elemene Anoectochilus formosanus”, Chemical and pharmaceutical bulletin, 48(11): 1803-1804 Chae, LD, Thinh BB Huong, HTT Kiet, NT Huan, LQ (2019), “Quantification of quercetin, isorhamnetin and p-sitosterol ferulic acid from Vietnamin dry extract of Anoectochilus setaceus Blume”, International Journal of Botany Studies, 4(5): 14-18 36 6Y8I NJ ơ —2 W g s O o S© Ui ■u bo O C 9s O' 4^ bo ■'O 4— NJ u 9s U* 4^ ẹn Os ‘o k> -J 9s 4^ 9s O' NJ ■'© acid aristolochic b 4^ acid ferulic O' acid helvolic U1 O\ 9s O 9s k) L> bo O' O' u< VI u» ps 9s Cirrhopctalanthrin ■'O daucosterol O' dihydromelilotoside o gas trod in Ui u O' 4^ O' NJ 00 OO k) ■'O Q0 '■c bo y O' 9s O' Ur NJ oo O' L> Ị*J oo bo u> bo Kinsenoside 00 O' ‘o 9s O' O O' O' O bo O' Ui Ui *o k) 4^ £ NJ octacosanol o quercitrin O' quercetin k> rutin w O' u! 4^ Scopoletin scoparone O' O' triterpenoid O' a-cardinol o p-caryophuyllene O' oo O' OJ Ui ?• 4^ bo Ui u bo bo Ui bo O' ‘o bo NJ 4^ 4^ y* 9s narcissin bo O' ĩo kí oo NJ w ps O' k> isohamnetin kaempferol CM ■'O inulin k> O' bs Gastrol goodyeroside A io ps 9s k> U caryophyllene oxide k> O O' 4^ £ NJ O Calanthoside ;yi k> u> O' !e u> Ễ 2, 6-Dimethoxy-l 4-benzoquinone 4^ 4^ CM (E-E)-farnesol 4^ NJ [}-elemene P-sitostcrol Phụ lục Ket Rigid Docking —2 7KP9 og Phụ lục Grid box tạo dựa protein nghiên cứu Grid box center 2mlo 6y8i Center X Center y Center z Size Grid 6.417 -8.611 -9.611 30x30x30 Grid 6.039 24.907 7.102 30x30x30 Grid 31.056 3.889 14.5 30x30x30 Grid -12.75 22.389 46.889 30x30x30 Grid -13.694 3.25 44.528 30x30x30 Grid -14.275 -1.984 18.711 30x30x30 5fuc 7kp9 38 TÀI LIỆU THAM KHẢO Tiếng Việt Văn Minh Thân (2011), Nghiên cứu điều hòa đáp ứng viêm Wedelolacton từ nhọ nồi điểu trị bệnh nhiêm trùng nặng choảng nhiễm trùng thông qua thụ thê Pectin-1 Tiếng Anh Rebekka Bent Moll (2018), Interleukin-1 beta—a friend or foe in malignancies?, International journal of molecular sciences, 19(8): 2155 Trinh Ngoc Bon, Trieu Thai Hung, Phung Dinh Trung, Tran Cao Nguyen, Dang Thi Hai Ha, Nguyen Thi Hoai Anh, Hoang Thanh Son, Tran Hai Long, Pham Quang Tuyen, Ninh Viet Khuong (2020), Medicinal Plant, Anoectochilus: Distribution, Ecology, Commercial Value and Use in North Vietnam, J Pharm Res Int, 32(11): 84-92 Salvatore Cuzzocrea, Rosanna Di Paola, Emanuela Mazzon, Nimesh SA Patel, Tiziana Genovese, Carmelo Muià, Concetta Crisafulli, Achille p Caputi, Christoph Thiemermann (2006), Erythropoietin reduces the development of nonseptic shock induced by zymosan in mice, Critical care medicine, 34(4): 1168-1177 Satish L Deshmane, Sergey Kremlev, Shohreh Amini, Bassel E Sawaya (2009), Monocyte chemoattractant protein-1 (MCP-1): an overview, Journal of interferon & cytokine research, 29(6): 313-326 Xiao-Ming Du, Nobuto Irino, Norihiro Furusho, Jun Hayashi, Yukihiro Shoyama (2008), Pharmacologically active compounds in the Anoectochilus and Goodyera species, Journal of natural medicines, 62(2): 132-148 Xiao-Ming Du, Ning-Yi Sun, Nobuto Irino, Yukihiro Shoyama (2000), Glycosidic constituents from in vitro Anoectochilus formosanus, Chemical and pharmaceutical bulletin, 48(11): 1803-1804 Xiao-Ming Du, Toyokichi Yoshizawa, Yukihiro Shoyama (1998), Butanoic acid glucoside composition of whole body and in vitro plantlets ofAnoectochilus formosanus, Phytochemistry, 49(7): 1925-1928 DD Giap, TD Thai, DD Thang, NTH Trang, TT Tuan, NT Xuyen, DD Hieu (2018), Effects ofseveral organic extracts on the growth, yield and quality of Anoectochilus formosanus biomass, International Journal of Agricultural Technology, 14(2): 171-182 10 BG Gimenez, MS Santos, M Ferrarini, JPS Fernandes (2010), Evaluation of blockbuster drugs under the rule-of-five, Die Pharmazie-An International Journal of Pharmaceutical Sciences, 65(2): 148-152 39 11 Tran M Hoi, Do N Dai, Chu TT Ha, Ha V Anh, Isiaka A Ogunwande (2019), Essential oil constituents from the leaves ofAnoectochilus setacues, Codonopsis javanica and Aristiochia kwangsiensis from Vietnam, Rec Nat Prod, 13(3): 281286 12 Tanaka, Toshio, Narazaki, Masashi, Kishimoto, Tadamitsu (2014), IL-6 in inflammation, immunity, and disease, Cold spring Harbor perspectives in biology, 6(10): a016295 13 T Liu, RK Clark, PC McDonnell, PR Young, RF White, FC Barone, GZ Feuerstein (1994), Tumor necrosis factor-alpha expression in ischemic neurons, Stroke, 25(7): 1481-1488 14 Gloria Lopez-Castejon David Brough (2011), Understanding the mechanism ofIL-If secretion, Cytokine & growth factor reviews, 22(4): 189-195 15 Raimund Mannhold, Hugo Kubinyi, Gerd Folkers (2008), Antitargets: prediction and prevention of drug side effects, John Wiley & Sons 16 Tamanna Narsinghani, Mukesh c Sharma, Sakshi Bhargav (2013), Synthesis, docking studies and antioxidant activity of some chaicone and aurone derivatives, Medicinal Chemistry Research, 22(9): 4059-4068 17 Noel M O'Boyle, Michael Banck, Craig A James, Chris Morley, Tim Vandermeersch, Geoffrey R Hutchison (2011), Open Babel: An open chemical toolbox, Journal of cheminformatics, 3(1): 1-14 18 Matthias Rarey, Bernd Kramer, Thomas Lengauer, Gerhard Klebe (1996), A fast flexible docking method using an incremental construction algorithm, Journal of molecular biology, 261(3): 470-489 19 Sergio Filipe Sousa, Pedro Alexandrine Fernandes, Maria Joao Ramos (2006), Protein-ligand docking: current status andfuture challenges, Proteins: Structure, Function, and Bioinformatics, 65(1): 15-26 20 Bui Bao Thinh Nguyen Thi Yen (2021), Anti-cancer activity of dry extract of Anoectochilus setaceus Blume against BT474 breast cancer cell line and A549 lung cancer cell line, Research Journal of Pharmacy and Technology, 14(2): 730-734 21 Oleg Trott Arthur J Olson (2010), AutoDock Vina: improving the speed and accuracy of docking with a new scoring function, efficient optimization, and multithreading, Journal of computational chemistry, 31(2): 455-461 22 Xiaoling Yu, Lingyi Huang, Chen You, Liying Huang (2021), Hepatoprotective Effects of Polysaccharide from Anoectochilus roxburghii (Wall.) Lindl on Rat Liver Injury Induced by CC14, Drug Design, Development and Therapy, 15: 2885 40