BỘ GIÁO DỤC VÀ ĐÀO TẠO BỘ Y TẾ ĐẠI HỌC Y DƯỢC THÀNH PHỐ HỒ CHÍ MINH - NGUYỄN THỊ THU SƯƠNG ĐẶC ĐIỂM VIÊM PHỔI CỘNG ĐỒNG NẶNG CÓ NHIỄM RSV, ADENOVIRUS Ở TRẺ TỪ THÁNG ĐẾN 24 THÁNG TẠI KHOA HÔ HẤP BỆNH VIỆN NHI ĐỒNG LUẬN VĂN CHUYÊN KHOA CẤP II THÀNH PHỐ HỒ CHÍ MINH, NĂM 2022 BỘ GIÁO DỤC VÀ ĐÀO TẠO BỘ Y TẾ ĐẠI HỌC Y DƯỢC THÀNH PHỐ HỒ CHÍ MINH - NGUYỄN THỊ THU SƯƠNG ĐẶC ĐIỂM VIÊM PHỔI CỘNG ĐỒNG NẶNG CÓ NHIỄM RSV, ADENOVIRUS Ở TRẺ TỪ THÁNG ĐẾN 24 THÁNG TẠI KHOA HÔ HẤP BỆNH VIỆN NHI ĐỒNG CHUYÊN NGÀNH: NHI – HÔ HẤP MÃ SỐ: CK 62 72 16 10 LUẬN VĂN BÁC SĨ CHUYÊN KHOA CẤP II NGƯỜI HƯỚNG DẪN KHOA HỌC: PGS.TS PHAN HỮU NGUYỆT DIỄM TS.BS TRẦN ANH TUẤN THÀNH PHỐ HỒ CHÍ MINH, NĂM 2022 i LỜI CAM ĐOAN Tơi xin cam đoan cơng trình nghiên cứu riêng Các số liệu nêu luận án trung thực chưa công bố cơng trình khác Ký tên Nguyễn Thị Thu Sương ii MỤC LỤC TRANG PHỤ BÌA LỜI CAM ĐOAN i MỤC LỤC ii DANH MỤC CÁC CHỮ VIẾT TẮT iv DANH MỤC CÁC BẢNG v DANH MỤC CÁC HÌNH vii DANH MỤC CÁC BIỂU ĐỒ viii ĐẶT VẤN ĐỀ MỤC TIÊU NGHIÊN CỨU CHƯƠNG TỔNG QUAN TÀI LIỆU 1.1 Tổng quan viêm phổi cộng đồng 1.2 Đại cương Adenovirus 20 1.3 Đại cương RSV 27 1.4 Cách lấy bệnh phẩm 33 1.5 Các phương pháp phát vi rút 34 1.6 Tổng quan nghiên cứu nước 37 CHƯƠNG ĐỐI TƯỢNG VÀ PHƯƠNG PHÁP NGHIÊN CỨU 40 2.1 Thiết kế nghiên cứu 40 2.2 Đối tượng nghiên cứu 40 2.3 Kỹ thuật chọn mẫu 42 2.4 Cỡ mẫu 42 2.5 Công cụ thu thập số liệu 42 2.6 Liệt kê định nghĩa biến số 42 2.7 Thu thập số liệu 50 2.8 Xử lý phân tích số liệu 57 2.9 Các biện pháp kiểm soát sai lệch 57 2.10 Y đức 57 CHƯƠNG KẾT QUẢ 58 iii 3.1 Một số đặc điểm dân số chung 58 3.2 Đặc điểm vi sinh 62 3 Đặc điểm viêm phổi có nhiễm AdV 69 3.4 Đặc điểm viêm phổi có nhiễm RSV 76 3.5 Đặc điểm viêm phổi nhóm nhiễm vi rút khác (Parainfluenza 3, Influenza A, Rihinovirus, Bocavirus, CMV, EBV) 83 3.6 Phân tích số đặc điểm lâm sàng, cận lâm sàng nhóm VP nhiễm RSV, AdV nhiễm VR khác 91 CHƯƠNG BÀN LUẬN 94 4.1 Một số đặc điểm chung 94 4.2 Đặc điểm tiền 98 4.3 Đặc điểm lâm sàng 101 4.4 Đặc điểm cận lâm sàng 104 4.5 Đặc điểm vi sinh 106 4.6 Đặc điểm điều trị 119 4.7 Hạn chế đề tài 121 KẾT LUẬN 122 KIẾN NGHỊ 124 TÀI LIỆU THAM KHẢO PHỤ LỤC iv DANH MỤC CÁC CHỮ VIẾT TẮT CHỮ VIẾT TẮT TIẾNG ANH TIẾNG VIỆT ARDS Acute Respiratory Distress Hội chứng nguy kịch Symdrom hô hấp cấp Adenovirus Vi rút Adeno AdV Biến chứng nhiễm BCNT trùng BMI Body Mass Index Chỉ số khối thể BPS Bacterial Pneumonia Score Thang điểm viêm phổi vi khuẩn CMV Virus cytomegalo CRP C - Reative Protein EBV Epstein-Barr Virus ESBL Extended-spectrum beta-lactamase HIV Human Immuno Deficiency Virus miễn Protein phản ứng C Vi rút gây suy giảm dịch người MRSA Methicillin-resistant Tụ cầu kháng methicillin Staphylococcus aureus MSSA Methicillin-susceptible Tụ cầu nhạy Methicillin Staphylococcus aureus NK Nam khoa NPA Naso pharyngeal aspiration Hút dịch mũi hầu NTA Naso tracheal aspiration Hút dịch khí quản PCR Polymerase Chain Reaction Phản ứng khuếch đại chuỗi polymerase RSV Respiratory syncytial virus Vi rút hợp bào hô hấp SIRS Systemic inflammatory Hội chứng đáp ứng response syndrome viêm toàn thân Standard deviation Độ lệch chuẩn SD v DANH MỤC CÁC BẢNG STT Tên bảng Trang Bảng 1.1 Các tác nhân gây bệnh viêm phổi trẻ em theo nhóm tuổi Bảng 1.2 Thang điểm Barlett 10 Bảng 1.3 Chẩn đoán phân độ nặng viêm phổi theo Bộ Y Tế 2014 12 Bảng 1.4 Phân độ nặng viêm phổi cộng đồng trẻ em theo up to date 2021 13 Bảng 1.5 Bảng phân nhóm Adenovirus 22 Bảng 2.1 Phân độ nặng viêm phổi cộng đồng trẻ em theo up to date 2021 41 Bảng 2.2 Liệt kê biến số 42 Bảng 2.3 Xác định thiếu máu theo Tổ chức Y tế Thế giới năm 2001 49 Bảng 2.4 Thang điểm BPScore38 49 Bảng 3.1 Một số đặc điểm chung tiền 60 Bảng 3.2 Kết test nhanh RSV-AdV 62 Bảng 3.3 Tỷ lệ phát tác nhân mẫu cấy máu, NTA BV NK 62 Bảng 3.4 Tỷ lệ tác nhân vi khuẩn phân lập dựa cấy NTA, cấy máu 63 Bảng 3.5 Phân bố tác nhân VK theo kết PCR 65 Bảng 3.6 Phân bố tác nhân VR 66 Bảng 3.7 Tỷ lệ lý nhập viện 70 Bảng 3.8 Tỷ lệ số đặc điểm tiền bệnh nhi nhiễm AdV 71 Bảng 3.9 Tỷ lệ triệu chứng lâm sàng nhiễm AdV 72 Bảng 3.10 Tỷ lệ triệu cân chứng lâm sàng nhiễm AdV 73 Bảng 3.11 Tỷ lệ tác nhân VR, VK đồng nhiễm 74 Bảng 3.12 Tỷ lệ kết điều trị 75 Bảng 3.13 Tỷ lệ lý nhập viện 77 Bảng 3.14 Tỷ lệ số đặc điểm tiền bệnh nhi nhiễm RSV 78 Bảng 3.15 Tỷ lệ số đặc điểm lâm sàng bệnh nhi nhiễm RSV 79 Bảng 3.16 Tỷ lệ số đặc điểm cận lâm sàng bệnh nhi nhiễm RSV 80 Bảng 3.17 Tỷ lệ tác nhân VR, VK đồng nhiễm 81 vi Bảng 3.18 Tỷ lệ kết điều trị 82 Bảng 3.19 Tỷ lệ lý nhập viện 84 Bảng 3.20 Tỷ lệ số đặc điểm tiền bệnh nhi VP có hiễm VR khác 85 Bảng 3.21 Tỷ lệ đặc điểm lâm sàng trẻ VP có nhiễm VR khác 86 Bảng 3.22 Tỷ lệ đặc điểm cận lâm sàng trẻ VP có nhiễm VR khác 87 Bảng 3.23 Tỷ lệ nhiễm tác nhân nhóm VR khác 88 Bảng 3.24 Tỷ lệ đồng nhiễm VK nhóm VP nhiễm VR khác 89 Bảng 3.25 Tỷ lệ kết điều trị trẻ VP có nhiễm VR khác 90 Bảng 3.26 Tỷ lệ số đặc điểm lâm sàng nhóm trẻ VP nhiễm RSV, AdV, VR khác 91 Bảng 3.27 Tỷ lệ đặc điểm cân lâm sàng nhóm trẻ VP nhiễm RSV, AdV, VR khác 92 Bảng 3.28 Tỷ lệ đặc điểm cân lâm sàng nhóm trẻ VP nhiễm RSV, AdV, VR khác 93 Bảng 4.1 Tỉ lệ tác nhân vi sinh qua nghiên cứu 108 Bảng 4.2 Tỉ lệ đồng nhiễm số nghiên cứu 113 Bảng 4.3 Tỷ lệ đề kháng S pneumoniae (CDC 2021) 117 vii DANH MỤC CÁC HÌNH STT Tên hình Trang Hình 1.1 Cơ chế công Streptococcus pneumoniae vào đường hô hấp qua trung gian RSV 14 Hình 1.2 Hình sơ đồ phân nhóm chụp Adenovirus từ kính hiển vi điện tử 21 Hình 1.3 Cấu trúc Adenovirus 22 Hình 1.4 Sinh lý bệnh viêm nhiễm Adenovirus 24 Hình 1.5 Cấu trúc RSV 28 Hình 1.6 Số trường hợp viêm tiểu phế quản số lượng phân lập RSV từ trẻ nhỏ tuổi xác định chương trình giám sát cộng đồng Monroe, Mỹ 31 viii DANH MỤC CÁC BIỂU ĐỒ STT Tên biểu đồ Trang Biểu đồ 3.1 Phân bố theo giới tính 58 Biểu đồ 3.2 Phân bố theo nhóm tuổi 59 Biểu đồ 3.3 Phân bố theo nơi cư trú 59 Biểu đồ 3.4 Tỷ lệ nhập viện theo tháng năm 59 Biểu đồ 3.5 Tỷ lệ bệnh lý dân số nghiên cứu 61 Biểu đồ 3.6 Tỷ lệ kháng KS S pneumoniae 67 Biểu đồ 3.7 Tỷ lệ kháng KS S aureus 67 Biểu đồ 3.8 Tỷ lệ kháng KS E coli 68 Biểu đồ 3.9 Tỷ lệ kháng KS Klebsiella 68 Biểu đồ 3.10 Tỷ lệ kháng KS Acinetobacter 69 Biểu đồ 3.11 Phân bố theo nhóm tuổi 69 Biểu đồ 3.12 Phân bố tỷ lệ nhập viện theo tháng 70 Biểu đồ 3.13 Phân bố số ngày bệnh trước nhập viện 70 Biểu đồ 3.16 Phân bố số ngày bệnh trước nhập viện 77 Biểu đồ 3.17 Phân bố theo giới 83 Biểu đồ 3.18 Phân bố tỷ lệ nhập viện theo tháng 83 Biểu đồ 3.19 Phân bố tỷ lệ số ngày bệnh trước nhập viện 84 Biểu đồ 4.1 Tỷ lệ kháng kháng sinh S.aureus theo Trần Thị Thanh Thư 118 Bản quyền tài liệu thuộc Thư viện Đại học Y Dược TP.Hồ Chí Minh 47 Le Roux, D.M., et al (2021), “Factors associated with serious outcomes of pneumonia among children in a birth cohort in South Africa”, PLoS One, 16(8): p e0255790 48 Li L., Woo Y Y., de Bruyne J A., et al (2018), "Epidemiology, clinical presentation and respiratory sequelae of adenovirus pneumonia in children in Kuala Lumpur, Malaysia", PLoS One, 13(10), pp e0205795 49 Martin, O.O., et al (2018), “Invasive pneumococcal disease in children with sickle cell disease in the pneumococcal conjugate vaccine era”, Pediatr Blood Cancer, 65(1) 50 Madhusha Gonapaladeniya, Thushari Dissanayake (2021), “Burden of Respiratory Syncytial Virus Associated Severe Pneumonia in Hospitalized Children”, International Journal of Pediatrics Musher, D.M (2022), “Resistance of Streptococcus pneumoniae to beta-lactam antibiotics”, www.uptodate.com © 2022 UpToDate, This topic last updated: May 31, 2022 51 Musher, D.M (2022), “Resistance of Streptococcus pneumoniae to the fluoroquinolones, doxycycline, and trimethoprimsulfamethoxazole”, www.uptodate.com © 2022 UpToDate, This topic last updated: Jul 11, 2022 52 Musher, D.M (2022), “Resistance of Streptococcus pneumoniae to the macrolides, azalides, lincosamides, and ketolides”, www.uptodate.com © 2022 UpToDate, This topic last updated: Jun 02, 2022 53 Nicolaou, E.V and A.H Bartlett (2017), “Necrotizing Pneumonia”, Pediatr Ann, 46(2): p e65-e68 54 Olarte, L., et al (2017), “Pneumococcal Pneumonia Requiring Hospitalization in US Children in the 13-Valent Pneumococcal Conjugate Vaccine Era”, Clin Infect Dis, 64(12): p 1699-1704 55 Pacheco, G.A., et al (2021), “Bacterial and Viral Coinfections with the Human Respiratory Syncytial Virus”, Microorganisms, 9(6) Tuân thủ Luật sở hữu trí tuệ Quy định truy cập tài liệu điện tử Ghi rõ nguồn tài liệu trích dẫn Bản quyền tài liệu thuộc Thư viện Đại học Y Dược TP.Hồ Chí Minh 56 Paitan, Y (2018), “Current Trends in Antimicrobial Resistance of Escherichia coli” Curr Top Microbiol Immunol, 416: p 181-211 57 Rodríguez-Martínez, C.E., D.A Rodríguez, and G Nino (2015), “Respiratory syncytial virus, adenoviruses, and mixed acute lower respiratory infections in children in a developing country”, J Med Virol, 2015 87(5): p 774-81 58 Ruiz-Rodriguez J.C., Caballero J., et al (2012), “Usefulness of procalcitonin clearance as a prognostic biomarker in septic shock A prospective pilot study”, Med Intensiva, 36(7), pp.475–480 59 Salvatore Barberi, Mario Barreto (2012), “Respiratory syncytial virus and adenovirus in acute lower respiratory infections in hospitalized infants and children”, Open Journal of Pediatrics, (2), pp.31-37 60 S Kouni, P Karakitsos (2013), “Evaluation of viral co-infections in hospitalized and non-hospitalized children with respiratory infections using microarrays”, Clin Microbiol Infect, (19), pp.772–777 61 Stadler, J.A.M., S Andronikou, and H.J Zar (2017), “Lung ultrasound for the diagnosis of community-acquired pneumonia in children”, Pediatr Radiol, 47(11): p 1412-1419 62 Sonego M., Pellegrin M.C., Becker G et al (2015), “Risk factors for mortality from acute lower respiratory infections (ALRI) in children under five years of age in low and middle-income countries: a systematic review and meta-analysis of observational studies”, PloS one, 10(1), pp.116-380 63 Tsuguto Fujimoto, Nozomu Hanaoka (2019), “Evaluation of a silver‐ amplified immunochromatography kit for adenoviral conjunctivitis”, Wiley Periodicals, Inc, J Med Virol, (91), pp.1030-1035 64 UNICEF (2020), “Save the Children, and Every Breath Counts Every child’s right to survive: a 2020 agenda to end pneumonia deaths”, UNICEF Available at https://www.unicef.org/reports/every-childs-right-survive- pneumonia Tuân thủ Luật sở hữu trí tuệ Quy định truy cập tài liệu điện tử Ghi rõ nguồn tài liệu trích dẫn Bản quyền tài liệu thuộc Thư viện Đại học Y Dược TP.Hồ Chí Minh 65 Vogler, K and L.S Schmidt (2018) “Clinical manifestations of Epstein-Barr virus infection in children and adolescents’, Ugeskr Laeger, 180 (20) 66 William J Barson, M (2022), “Community-acquired pneumonia in children: Clinical features and diagnosis” www.uptodate.com UpToDate 67 Waghmare A, Englund JA, Boeckh M (2016), “How I treat respiratory viral infections in the setting of intensive chemotherapy or hematopoietic cell transplantation”, Blood, 127(22), pp.2682-2692 68 Wurzel DF, et al (2014), “Adenovirus species C is associated with chronic suppurative lung diseases in children”, Clin Infect Dis, 59(1), pp.34-40 69 Zampoli M and Mukuddem-Sablay Z (2017), "Adenovirus-associated pneumonia in South African children: Presentation, clinical course and outcome", S Afr Med J, 107(2), pp 123-26 70 Zabawa, T.P., et al (2016), “Treatment of Gram-negative bacterial infections by potentiation of antibiotics”, Curr Opin Microbiol, 33: p 7-12 71 Zhu, X and X Li (2021), “Pneumococcal vaccine effect on hospitalisation rates of pneumonia in children: A meta-analysis”, Int J Clin Pract, 75(11): p e14739 72 ZMulcahy, M.E and R.M McLoughlin (2016), “Staphylococcus aureus and Influenza A Virus: Partners in Coinfection”, mBio, 7(6) 73 ZClegg, J., et al (2021), “Staphylococcus aureus Vaccine Research and Development: The Past, Present and Future, Including Novel Therapeutic Strategies”, Front Immunol, 12: p 705360 74 Zhang L and Silva F (2000), "Bronchiolitis obliterans in children", Jornal de Pediatria, 76(3), pp 185-92 75 Zhong L., Lin J and Dai J (2020), "Risk factors for the development of bronchiolitis obliterans in children with severe adenovirus pneumonia: A retrospective study with dose-response analysis", J Med Virol Tuân thủ Luật sở hữu trí tuệ Quy định truy cập tài liệu điện tử Ghi rõ nguồn tài liệu trích dẫn Bản quyền tài liệu thuộc Thư viện Đại học Y Dược TP.Hồ Chí Minh PHỤ LỤC BỆNH ÁN MẪU I HÀNH CHÍNH: Họ tên:…………………………………………………… SHS:……………………… Ngày sinh:……………………………………… Giới tính: Nam , Nữ Địa chỉ:…………………………………………………………………………………… Họ tên cha/mẹ:………………………………………………………………………… CHA: Năm sinh:……… Nghề nghiệp:………………… Trình độ học vấn:………… MẸ: Năm sinh:…………… Nghề nghiệp:………………… Trình độ học vấn:………… Ngày nhập viện:…… /………./……… Ngày xuất viện:… ./………./……… II LÝ DO NHẬP VIỆN:…… …………………………………………………… III BỆNH SỬ: Thời gian bệnh trước nhập viện: ………………… ngày Điều trị trước nhập viện: Khơng Có Nơi điều trị: Bác sĩ tư Bệnh viện/y tế địa phương Tự mua thuốc Sổ mũi Ho Khị khè Khó thở Cơn tím tái Nơn ói Tiêu chảy Triệu chứng: Sốt Bỏ bú/bú Tuân thủ Luật sở hữu trí tuệ Quy định truy cập tài liệu điện tử Ghi rõ nguồn tài liệu trích dẫn Bản quyền tài liệu thuộc Thư viện Đại học Y Dược TP.Hồ Chí Minh IV TIỀN CĂN Bản thân: Tuổi thai điều chỉnh: …………………………tuần Sinh non: Có Khơng Cân nặng lúc sanh: