Đặc điểm viêm phổi nặng có kết quả pcr đàm dương tính với adenovirus ở trẻ từ 2 tháng đến 5 tuổi tại bệnh viện nhi đồng i

BỘ GIÁO DỤC VÀ ĐÀO TẠO BỘ Y TẾ ĐẠI HỌC Y DƢỢC THÀNH PHỐ HỒ CHÍ MINH - - TRẦN THANH THỨC ĐẶC ĐIỂM VIÊM PHỔI NẶNG CĨ KẾT QUẢ PCR ĐÀM DƢƠNG TÍNH VỚI ADENOVIRUS Ở TRẺ TỪ THÁNG ĐẾN TUỔI TẠI BỆNH VIỆN NHI ĐỒNG LUẬN VĂN THẠC SĨ Y HỌC THÀNH PHỐ HỒ CHÍ MINH - NĂM 2021 BỘ GIÁO DỤC VÀ ĐÀO TẠO BỘ Y TẾ ĐẠI HỌC Y DƢỢC THÀNH PHỐ HỒ CHÍ MINH - - TRẦN THANH THỨC ĐẶC ĐIỂM VIÊM PHỔI NẶNG CĨ KẾT QUẢ PCR ĐÀM DƢƠNG TÍNH VỚI ADENOVIRUS Ở TRẺ TỪ THÁNG ĐẾN TUỔI TẠI BỆNH VIỆN NHI ĐỒNG NGÀNH: NHI KHOA MÃ SỐ: 8720106 LUẬN VĂN THẠC SĨ Y HỌC NGƢỜI HƢỚNG DẪN KHOA HỌC: PGS.TS.BS PHÙNG NGUYỄN THẾ NGUYÊN TS.BS TRẦN ANH TUẤN THÀNH PHỐ HỒ CHÍ MINH - NĂM 2021 LỜI CAM ĐOAN Tôi xin cam đoan luận án cơng trình nghiên cứu nghiêm túc trung thực Tất số liệu kết luận án chƣa đƣợc công bố cơng trình khác Học viên BS Trần Thanh Thức MỤC LỤC Trang phụ bìa Lời cam đoan Mục lục Danh mục từ viết tắt Danh mục bảng Danh mục hình Danh mục sơ đồ Danh mục biểu đồ ĐẶT VẤN ĐỀ CÂU HỎI NGHIÊN CỨU MỤC TIÊU NGHIÊN CỨU CHƢƠNG 1: TỔNG QUAN TÀI LIỆU 1.1 Định nghĩa phân loại viêm phổi 1.2 Dịch tễ học viêm phổi 1.3 Tác nhân gây viêm phổi 1.4 Giới thiệu adenovirus ngƣời 10 1.5 Dịch tễ học adenovirus 14 1.6 Sinh bệnh học adenovirus 17 1.7 Biểu lâm sàng viêm phổi adenovirus 19 1.8 Đặc điểm cận lâm sàng viêm phổi adenovirus 21 1.9 Điều trị viêm phổi adenovirus 28 1.10 Biến chứng lâu dài viêm phổi adenovirus 30 1.11 Tóm lƣợc nghiên cứu liên quan đến viêm phổi adenovirus 31 CHƢƠNG 2: ĐỐI TƢỢNG VÀ PHƢƠNG PHÁP NGHIÊN CỨU 36 2.1 Thiết kế nghiên cứu 36 2.2 Đối tƣợng nghiên cứu 36 2.3 Các bƣớc tiến hành 37 2.4 Sơ đồ nghiên cứu 39 2.5 Liệt kê định nghĩa biến số 39 2.6 Thu thập xử lí số liệu 49 2.7 Y đức 50 CHƢƠNG 3: KẾT QUẢ NGHIÊN CỨU 51 3.1 Đặc điểm dịch tễ học 52 3.2 Đặc điểm lâm sàng 53 3.3 Đặc điểm cận lâm sàng 57 3.4 Đặc điểm biện pháp điều trị kết điều trị 64 3.5 So sánh nhóm suy hơ hấp có thở máy khơng thở máy 69 CHƢƠNG 4: BÀN LUẬN 76 4.1 Đặc điểm dịch tễ học 76 4.2 Đặc điểm lâm sàng 78 4.3 Đặc điểm cận lâm sàng 83 4.4 Đặc điểm biện pháp điều trị kết điều trị 90 4.5 So sánh nhóm suy hơ hấp có thở máy khơng thở máy 97 4.6 Hạn chế đề tài 102 KẾT LUẬN 103 KIẾN NGHỊ 104 TÀI LIỆU THAM KHẢO PHỤ LỤC i DANH MỤC TỪ VIẾT TẮT Từ viết tắt Tiếng Anh ALT Alanine transaminase AST Aspartate transaminase BV Tiếng Việt Bệnh viện BAL Bronchoalveolar lavage VPCĐ Dịch rửa phế quản phế nang Viêm phổi mắc phải cộng đồng Protein C phản ứng CRP C-reactive protein DNA Deoxyribonucleic acid ELISA Enzym linked immuno sorbent assay Phản ứng miễn dịch gắn men ETA Endotracheal tube aspiration Hút dịch khí quản qua ống nội khí quản FiO2 Fraction of inspired oxygen Phân suất oxy khí hít vào FluV Influenza virus Vi rút cúm HAdV Human adenovirus Vi rút adeno ngƣời VPBV Viêm phổi bệnh viện Hgb Hemoglobin HSTC Nồng độ hemoglobin máu Hồi sức tích cực IFA Indirect immuno fluorescent assay Phản ứng miễn dịch huỳnh quang trực tiếp Lym Lymphocytes Tế bào bạch cầu Lympho ii MERS Middle east respiratory syndrome Hội chứng hô hấp Trung Đông MRSA Methicillin-resistant Staphylococcus aureus Tụ cầu vàng kháng methicillin NCPAP Nasal continuous positive airway pressure Thở áp lực dƣơng liên tục qua mũi Neu Neutrophils Tế bào bạch cầu đa nhân trung tính NTA Nasotracheal aspiration Hút dịch khí quản qua đƣờng mũi PaCO2 Partial pressure of carbon dioxide Áp suất riêng phần CO2 máu động mạch PaO2 Partial pressure of oxygen Áp suất riêng phần oxy máu động mạch PCR Polymerase chain reaction Phản ứng chuỗi polymerase PIV Parainfluenza virus Vi rút cúm RSV Respiratory syncytial virus Vi rút hợp bào hô hấp RV Rhinovirus Vi rút rhino SARS Severe acute respiratory syndrome Hội chứng hơ hấp cấp tính nặng SpO2 Pulse oximeter oxygen saturation Độ bão hòa oxy máu đo qua xung mạch TPHCM Thành phố Hồ Chí Minh VK Vi khuẩn VP Viêm phổi WHO World Health Organization Tổ chức Y tế Thế giới iii DANH MỤC BẢNG STT Tên bảng Bảng 1.1 Phân loại VP trẻ từ 2-59 tháng tuổi theo WHO Bảng 1.2 Các tác nhân gây viêm phổi cộng đồng thƣờng gặp theo tuổi Bảng 1.3 Phân loại adenovirus 13 Bảng 2.1 Liệt kê biến số 38 Bảng 2.2 Giá trị mạch bình thƣờng theo tuổi theo PALS 2020 45 Bảng 2.3 Phân độ suy hô hấp 46 Bảng 2.4 Giá trị số bạch cầu máu bình thƣờng theo tuổi 47 Bảng 3.1 Đặc điểm giới tính, tuổi, nơi cƣ trú khoa điều trị 51 Bảng 3.2 Lí nhập viện 52 Bảng 3.3 Triệu chứng lúc chẩn đốn 53 Bảng 3.4 Tiền bệnh lí 53 Bảng 3.5 Triệu chứng thực thể thời điểm chẩn đoán 54 Bảng 3.6 Đặc điểm tổng phân tích tế bào máu sinh hóa máu 56 Bảng 3.7 Đặc điểm khí máu động mạch 58 Bảng 3.8 Đặc điểm tổn thƣơng Xquang ngực thẳng 59 Bảng 3.9 Đặc điểm kết PCR đàm dƣơng tính với adenovirus 61 Bảng 3.10 Tác nhân đồng nhiễm kết PCR đàm 62 Bảng 3.11 Đặc điểm biện pháp điều trị 64 Bảng 3.12 Đặc điểm kết điều trị 66 Bảng 3.13 So sánh số yếu tố liên quan nhóm sống nhóm tử vong 67 Bảng 3.14 Đặc điểm dịch tễ tiền nhóm có khơng thở 68 Trang iv máy Bảng 3.15 Đặc điểm lâm sàng nhóm có không thở máy 69 Bảng 3.16 Đặc điểm cận lâm sàng nhóm có khơng thở máy 70 Bảng 3.17 So sánh kết PCR đàm nhóm có không thở máy 71 Bảng 3.18 So sánh đặc điểm điều trị kết điều trị nhóm có khơng thở máy 73 Bảng 4.1 So sánh đặc điểm triệu chứng sốt qua nghiên cứu 79 Bảng 4.2 So sánh tỉ lệ đồng nhiễm qua nghiên cứu 88 Bảng 4.3 So sánh đặc điểm hỗ trợ hô hấp qua nghiên cứu 90 DANH MỤC HÌNH STT Tên hình Hình 1.1 Hình ảnh adenovirus kính hiển vi điện tử 12 Hình 1.2 Mơ cấu trúc capsid adenovirus 12 Trang v DANH MỤC SƠ ĐỒ STT Tên sơ đồ Sơ đồ 2.1 Sơ đồ nghiên cứu 38 Sơ đồ 3.1 Sơ đồ tiến hành nghiên cứu 50 Trang DANH MỤC BIỂU ĐỒ STT Tên biểu đồ Biểu đồ 3.1 Phân bố ca bệnh theo tháng năm 52 Biểu đồ 3.2 Mức độ suy hô hấp lúc nhập viện lúc chẩn đoán 56 Biểu đồ 3.3 Đặc điểm đồng nhiễm kết PCR đàm 62 Biểu đồ 3.4 Đặc điểm biện pháp hỗ trợ hô hấp 63 Biểu đồ 3.5 Đặc điểm hỗ trợ hô hấp theo nhóm tuổi 64 Biểu đồ 3.6 Các kháng sinh sử dụng điều trị 65 Biểu đồ 3.7 Tỉ lệ đặc điểm kết điều trị 66 Biểu đồ 3.8 Đặc điểm đồng nhiễm kết PCR đàm nhóm 72 Biểu đồ 3.9 Đƣờng cong ROC thể dƣơng tính thật dƣơng tính giả xét nghiệm số copies adenovirus tiên đoán khả thở máy bệnh nhân viêm phổi nặng có kết PCR đàm dƣơng tính với adenovirus 73 Trang Bản quyền tài liệu thuộc Thư viện Đại học Y Dược TP.Hồ Chí Minh 104 kéo dài, gan to, sốc, giảm bạch cầu, tăng men gan số copies adenovirus cao, đặc biệt 72500 x103 copies - 80% trƣờng hợp sử dụng từ loại kháng sinh trở lên kháng sinh phổ rộng - 16,4% trƣờng hợp tử vong Một số yếu tố liên quan nhƣ: tỉ lệ gan to, giảm bạch cầu, thiếu máu, tăng AST > 100 U/L, thở máy, nhiễm trùng huyết, sốc nhóm tử vong cao nhóm sống, khác biệt có ý nghĩa thống kê KIẾN NGHỊ Qua kết nghiên cứu, có số kiến nghị sau: Cần thêm nhiều nghiên cứu đặc điểm lâm sàng, cận lâm sàng viêm phổi nặng nhiễm adenovirus để từ chẩn đốn sớm có biện pháp điều trị phù hợp Cần nghiên cứu biện pháp điều trị tối ƣu nhƣ ECMO, lọc máu liên tục, thuốc kháng vi rút bệnh nhân viêm phổi nặng vi rút nói chung có nhiễm adenovirus nói riêng Cần có nghiên cứu theo dõi tình trạng khị khè diễn tiến lâm sàng sau xuất viện trƣờng hợp viêm phổi nặng nhiễm adenovirus Tuân thủ Luật sở hữu trí tuệ Quy định truy cập tài liệu điện tử Ghi rõ nguồn tài liệu trích dẫn Bản quyền tài liệu thuộc Thư viện Đại học Y Dược TP.Hồ Chí Minh TÀI LIỆU THAM KHẢO TIẾNG VIỆT Hồ Sỹ Công, Đào Minh Tuấn (2019), Nghiên cứu đặc điểm dịch tễ học lâm sàng, số yếu tố tiên lượng nặng viêm phổi nhiễm adenovirus bệnh viện nhi TƯ, Đại Học Y Hà Nội Phan Hữu Nguyệt Diễm (2004), "Viêm phổi trẻ em", Thực hành lâm sàng chuyên khoa Nhi, Nhà xuất y học Thành phố Hồ Chí Minh Đồn Thị Ngọc Diệp (2011), "Phân loại xử trí cấp cứu trẻ bệnh phịng khám theo chiến lƣợc xử trí lồng ghép bệnh trẻ em", Thực hành Lâm sàng Chuyên khoa Nhi, Nhà xuất y học Thành phố Hồ Chí Minh, tr 49-58 Lâm Thị Mỹ (2011), "Hội chứng thiếu máu", Thực hành lâm sàng chuyên khoa Nhi, Nhà xuất y học Thành phố Hồ Chí Minh, tr 210-14 Phùng Nguyễn Thế Nguyên (2011), "Chẩn đoán xử trí suy hơ hấp", Thực hành Lâm sàng Chun khoa Nhi, Nhà xuất y học Thành phố Hồ Chí Minh, tr 59-73 Phùng Nguyễn Thế Nguyên, Trần Diệp Tuấn (2020), "Chấn đoán điều trị sốc trẻ em", Nhi khoa tập 2, Nhà xuất Đại học Quốc gia TPHCM, tr 390-418 Trần Quỵ, Nguyễn Tiến Dũng (1989), "Các yếu tố nguy viêm phổi nặng trẻ em", Kỷ yếu cơng trình NCKH, tr 194 Nguyễn Thị Mai Thùy, Tạ Anh Tuấn, Đậu Việt Hùng (2018), "Đặc điểm dịch tễ lâm sàng cận lâm sàng viêm phổi nặng nhiễm adenovirus khoa điều trị tích cực bệnh viện Nhi TƢ", Tạp chí Y học Việt Nam, 497(2), tr 170-73 Phùng Thị Bích Thủy (2018), "Xác định Tỉ lệ nhiễm adenovirus kỹ thuật Realtime PCR số đặc điểm dịch tễ trẻ em điều trị bệnh viện Nhi Trung Ƣơng", Tạp chí nghiên cứu y học, 115(6), tr 7379 10 Trần Thị Thủy, Đào Minh Tuấn, Phạm Thu Hiền (2018), "Đặc điểm lâm sàng, cận lâm sàng viêm phổi có nhiễm adenovirus trẻ từ tháng đến tuổi điều trị Bệnh viện Nhi Trung ƣơng năm 2017-2018", Tạp chí Y học Việt Nam, 471(1), tr 125-29 Tuân thủ Luật sở hữu trí tuệ Quy định truy cập tài liệu điện tử Ghi rõ nguồn tài liệu trích dẫn Bản quyền tài liệu thuộc Thư viện Đại học Y Dược TP.Hồ Chí Minh 11 Trần Anh Tuấn (2020), "Viêm phổi cộng đồng trẻ em", Phác đồ điều trị Nhi khoa BV Nhi Đồng 1, Nhà xuất y học Thành phố Hồ Chí Minh, tr 682-88 12 Phạm Hùng Vân (2009), PCR real-time PCR – vấn đề áp dụng thường gặp, Nhà xuất y học thành phố Hồ Chí Minh 13 Bùi Quang Vinh (2011), "Tiếp cận sốt trẻ em", Thực hành Lâm sàng Chuyên khoa Nhi, Nhà xuất y học Thành phố Hồ Chí Minh, tr 109-21 14 Bùi Quang Vinh (2020), "Suy dinh dƣỡng", Nhi khoa tập 1, Nhà xuất Đại học Quốc gia TPHCM, tr 294-306 TIẾNG ANH 15 Albuquerque MC, Pena GP, Varella RB, et al (2009), "Novel respiratory virus infections in children", Emerg Infect Dis Brazil, 15(5), pp 806-8 16 Binder AM, Biggs HM, Haynes AK, et al (2017), "Human adenovirus surveillance-United States, 2003–2016", MMWR Morb Mortal Wkly Rep, 66, pp 1039–42 17 Bradley JS, Byington CL, Shah SS, et al (2011), "The management of community-acquired pneumonia in infants and children older than months of age: clinical practice guidelines by the Pediatric Infectious Diseases Society and the Infectious Diseases Society of America", Clin Infect Dis, 53(7), pp e25-e76 18 Calvo C, Garcia-Garcia ML, Sanchez-Dehesa R, et al (2015), "Eight year prospective study of adenoviruses infections in hospitalized children comparison with other respiratory viruses", PLoS ONE, 10(7), pp e0132162 19 Castro-Rodriguez J A., Daszenies C., Garcia M., et al (2006), "Adenovirus pneumonia in infants and factors for developing bronchiolitis obliterans: a 5-year follow-up", Pediatr Pulmonol, 41(10), pp 947-53 20 Cooper RJ, Hallett R, Tullo AB, et al (2000), "The epidemiology of adenovirus infections in greater Manchester, UK, 1982-96", Epidemiol Infect, 125, pp 333–45 21 Echavarria M, Sanchez JL, Kolavic-Gray SA, et al (2003), "Rapid detection of adenovirus in throat swab specimens by PCR during respiratory disease outbreaks among military recruits", J Clin Microbiol, 41, pp 810-12 Tuân thủ Luật sở hữu trí tuệ Quy định truy cập tài liệu điện tử Ghi rõ nguồn tài liệu trích dẫn Bản quyền tài liệu thuộc Thư viện Đại học Y Dược TP.Hồ Chí Minh 22 Esposito S, Bosis S and Cavagna R et al (2002), "Characteristics of Streptococcus pneumoniae and atypical bacterial infections in children 2–5 years of age with community-acquired pneumonia.", Clin Infect Dis, 35(11), pp 1345-52 23 Ferrer A, Calico I, Manresa JM, et al (2000), "Microorganisms isolated in cases of pertussis-like syndrome", Enferm Infecc Microbiol Clin, 18, pp 433–38 24 Fox JP, Brandt CD, Wassermann FE, et al (1969), "The virus watch program: a continuing surveillance of viral infections in metropolitan New York families, VI Observations of adenovirus infections: virus excretion patterns, antibody response, efficiency of surveillance, patterns of infections, and relation to illness.", Am J Epidemiol, 89, pp 25-50 25 Frabasile S, Vitureira N, Perez G, et al (2005), "Genotyping of Uruguayan human adenovirus isolates collected between 1994 and 1998", Acta Virol, 49, pp 129-32 26 Global Burden of Disease Child, Adolescent Health Collaboration, Kassebaum N., et al (2020), "Global Burden of Diseases, Injuries, and Risk Factors 2019 Study", JAMA Pediatr, 171(6), pp 573-92 27 Hageman JC, Uyeki TM and al Francis JS et (2006), "Severe community-acquired pneumonia due to Staphylococcus aureus, 200304 influenza season", Emerg Infect Dis, 12(6), pp 894 28 Hakansson A, Kidd A, Wadell G, et al (1994), "Adenovirus infection enhances in vitro adherence of Streptococcus pneumoniae", Infect Immun, 62(7), pp 2707-14 29 Harris M, Clark J and Coote N (2011), "British Thoracic Society guidelines for the management of community acquired pneumonia in children", Thorax 2011, 66:ii1 30 Hilleman MR and JH Werner (1954), "Recovery of new agent from patients with acute respiratory illness", Proc Soc Exp Biol Med, 85, pp 183–88 31 Huang M., Luo R and Fu Z (2017), "[Risk factors for poor prognosis in children with severe adenovirus pneumonia]", Zhongguo Dang Dai Er Ke Za Zhi, 19(2), pp 159-62 32 Jadavji T, Law B, Lebel MH, et al (1997), "A practical guide for the diagnosis and treatment of pediatric pneumonia", CMAJ, 156(5), pp S703–S11 Tuân thủ Luật sở hữu trí tuệ Quy định truy cập tài liệu điện tử Ghi rõ nguồn tài liệu trích dẫn Bản quyền tài liệu thuộc Thư viện Đại học Y Dược TP.Hồ Chí Minh 33 Jain S, Williams DJ, Arnold SR, et al (2015), "Community-acquired pneumonia requiring hospitalization among U.S children", N Engl J Med, 372(9), pp 835 34 James D Cherry, William J Steinbach, Gail J Harrison, et al (2019), "Adenoviruses", Feigin and Cherry's textbook of pediatric infectious diseases, pp 2079-99 35 Jawetz E, Kimura S, Nicholas AN, et al (1955), "New type of APC virus from epidemic keratoconjunctivitis", Science, 122, pp 1190-91 36 John E Bennett, Raphael Dolin and Blaser Martin J (2019), "Adenoviridae", Mandell, Douglas, and Bennett’s Principles and Practice of Infectious Diseases, Springer, pp 1908-15 37 Kalil AC, Metersky ML, Klompas M, et al (2016), "Management of Adults With Hospital-acquired and Ventilator-associated Pneumonia: Clinical Practice Guidelines by the Infectious Diseases Society of America and the American Thoracic Society", Clin Infect Dis, 63(5), pp e61 38 Knight V and JA Kasel (1973), "Adenoviruses In: Knight V, ed Viral and Mycoplasmal Infections of the Respiratory Tract", Philadelphia: Lea & Febiger, pp 65-86 39 Kwon H J., Rhie Y J., Seo W H., et al (2013), "Clinical manifestations of respiratory adenoviral infection among hospitalized children in Korea", Pediatr Int, 55(4), pp 450-4 40 Le Roux DM, Myer L and Nicol MP et al (2015), "Incidence and severity of childhood pneumonia in the first year of life in a South African birth cohort: the Drakenstein Child Health Study", Lancet Glob Health, 3(2), pp e95-e103 41 Li L., Woo Y Y., de Bruyne J A., et al (2018), "Epidemiology, clinical presentation and respiratory sequelae of adenovirus pneumonia in children in Kuala Lumpur, Malaysia", PLoS One, 13(10), pp e0205795 42 Liu C., Xiao Y., Zhang J., et al (2015), "Adenovirus infection in children with acute lower respiratory tract infections in Beijing, China, 2007 to 2012", BMC Infect Dis, 15, pp 408 43 Liu L., Oza S., Hogan D., et al (2016), "Global, regional, and national causes of under-5 mortality in 2000-15: an updated systematic analysis with implications for the Sustainable Development Goals", Lancet, 388(10063), pp 3027-35 Tuân thủ Luật sở hữu trí tuệ Quy định truy cập tài liệu điện tử Ghi rõ nguồn tài liệu trích dẫn Bản quyền tài liệu thuộc Thư viện Đại học Y Dược TP.Hồ Chí Minh 44 Louie JK, Kajon AE, Holodniy M, et al (2008), "Severe pneumonia due to adenovirus serotype 14: a new respiratory threat? ", Clin Infect Dis, 46, pp 421–25 45 Macek V, Sorli J, Kopriva S, et al (1994), "Persistent adenoviral infection and chronic airway obstruction in children", Am J Respir Crit Care Med, 150(1), pp 7-10 46 Marinheiro JC, Sanalios RB, Santos DC, et al (2009), "Duplex-PCR assay for the detection of adenovirus and respiratory syncytial virus in nasopharyngeal samples", Mem Inst Oswaldo Cruz, 140(1), pp 11820 47 McAllister DA, Liu L, Shi T, et al (2019), "Global, regional, and national estimates of pneumonia morbidity and mortality in children younger than years between 2000 and 2015: a systematic analysis.", Lancet Glob Health, 7(1), pp e47-e57 48 Nolan VG, Arnold SR, Bramley AM, et al (2018), "Etiology and Impact of Coinfections in Children Hospitalized With Community-Acquired Pneumonia", J Infect Dis, 218(2), pp 179 49 Otto W R., Behrens E M., Teachey D T., et al (2020), "Human Adenovirus 7-Associated Hemophagocytic Lymphohistiocytosis-Like Illness: Clinical and Virological Characteristics in a Cluster of Five Pediatric Cases", Clin Infect Dis 50 Rhedin S, Lindstrand A and A Hjelmgren (2015), "Respiratory viruses associated with community-acquired pneumonia in children: matched case-control study", Thorax, 70(9), pp 847-53 51 Robert M Kliegman MD, Bonita F Stanton MD and MD Joseph St Geme (2016), Nelson Textbook of Pediatrics 20th (20th ed.), Elsevier 52 Rowe WP, Huebner RJ, Gilmore LK, et al (1953), "Isolation of a cytopathogenic agent from human adenoids undergoing spontaneous degeneration in tissue culture", Proc Soc Exp Biol Med, 84, pp 570– 73 53 Self WH, Williams DJ, Zhu Y, et al (2016), "Respiratory Viral Detection in Children and Adults: Comparing Asymptomatic Controls and Patients With Community-Acquired Pneumonia", J Infect Dis, 213(4), pp 584 54 Seto D, Chodosh J, Brister JR, et al (2011), "Using the whole-genome sequence to characterize and name human adenoviruses", J Virol, 85, pp 5701–02 Tuân thủ Luật sở hữu trí tuệ Quy định truy cập tài liệu điện tử Ghi rõ nguồn tài liệu trích dẫn Bản quyền tài liệu thuộc Thư viện Đại học Y Dược TP.Hồ Chí Minh 55 Shi J., Zhou Y., Wang F., et al (2020), "A case series of children with adenovirus pneumonia: three-year experiences in a tertiary PICU", BMC Pediatr, 20(1), pp 375 56 Shike H, Shimizu C, Kanegaye J, et al (2005), "Quantitation of adenovirus genome during acute infection in normal children", Pediatr Infect Dis J, 24(1), pp 29-33 57 Song E, Wang H, Kajon AE, et al (2016), "Diagnosis of pediatric acute adenovirus infections: is a positive PCR sufficient?", Pediatr Infect Dis J, 35(8), pp 827-34 58 United Medical Education (2020), "Pediatric Advanced Life Support Algorithms", from: https://www.acls-pals-bls.com/algorithms/pals/ 59 Walker C L F., Rudan I., Liu L., et al (2013), "Global burden of childhood pneumonia and diarrhoea", Lancet, 381(9875), pp 1405-16 60 William J Barson (2020), "Pneumonia in children: Epidemiology, pathogenesis, and etiology", from: Uptodate 61 Wilmott Robert W, Bush Andrew, Deterding Robin R, et al (2018), "Adenovirus", Kendig's Disorders of the Respiratory Tract in Children, Elsevier Health Sciences, pp 1770-81 62 Wilmott Robert W, Bush Andrew, Deterding Robin R, et al (2018), "Pneumonia in Children", Kendig's Disorders of the Respiratory Tract in Children, Elsevier Health Sciences, pp 1597-617 63 World Health Organization (2014), "Integrated Management of Childhood Illness (IMCI) (revised)", Geneva 64 World Health Organization (2019), "Pneumonia", https://www.who.int/news-room/fact-sheets/detail/pneumonia from: 65 Wu P Q., Li X., Jiang W H., et al (2016), "Hypoxemia is an independent predictor of bronchiolitis obliterans following respiratory adenoviral infection in children", Springerplus, 5(1), pp 1622 66 Wu P Q., Zeng S Q., Yin G Q., et al (2020), "Clinical manifestations and risk factors of adenovirus respiratory infection in hospitalized children in Guangzhou, China during the 2011-2014 period", Medicine (Baltimore), 99(4), pp e18584 67 Wubbel L, Muniz L, Ahmed A, et al (1999), "Etiology and treatment of community-acquired pneumonia in ambulatory children", Pediatr Infect Dis J, 18(2), pp 98-104 Tuân thủ Luật sở hữu trí tuệ Quy định truy cập tài liệu điện tử Ghi rõ nguồn tài liệu trích dẫn Bản quyền tài liệu thuộc Thư viện Đại học Y Dược TP.Hồ Chí Minh 68 Xie L., Zhang B., Zhou J., et al (2018), "Human adenovirus load in respiratory tract secretions are predictors for disease severity in children with human adenovirus pneumonia", Virol J, 15(1), pp 123 69 Yao L H., Wang C., Wei T L., et al (2019), "Human adenovirus among hospitalized children with respiratory tract infections in Beijing, China, 2017-2018", Virol J, 16(1), pp 78 70 Zampoli M and Mukuddem-Sablay Z (2017), "Adenovirus-associated pneumonia in South African children: Presentation, clinical course and outcome", S Afr Med J, 107(2), pp 123-26 71 Zhang L and Silva F (2000), "Bronchiolitis obliterans in children", Jornal de Pediatria, 76(3), pp 185-92 72 Zhong L., Lin J and Dai J (2020), "Risk factors for the development of bronchiolitis obliterans in children with severe adenovirus pneumonia: A retrospective study with dose-response analysis", J Med Virol Tuân thủ Luật sở hữu trí tuệ Quy định truy cập tài liệu điện tử Ghi rõ nguồn tài liệu trích dẫn Bản quyền tài liệu thuộc Thư viện Đại học Y Dược TP.Hồ Chí Minh PHỤ LỤC PHỤ LỤC 1: PHIẾU THU THẬP SỐ LIỆU I Phần hành chánh: Mã hồ sơ (ghi số): Giới tính: 1= nam 2= nữ Họ tên bệnh nhân (ghi cụ thể): Nơi cƣ ngụ (ghi chữ): Ngày tháng năm sinh (ngày/tháng/năm): / ./ => Tuổi: … tháng Ngày nhập viện (ngày/tháng/năm): / ./ Ngày viện (ngày/tháng/năm): / ./ => Số ngày nằm viện: ngày II Bệnh sử - tiền căn: Lý vào viện (ghi cụ thể): Sốt 1= Có - Nhiệt độ cao .oC 2= Không - Thời gian sốt trƣớc nhập viện Viêm long đƣờng hô hấp 1= Có 2= Khơng 10 Triệu chứng tiêu hóa (ói, tiêu chảy) 1= Có 2= Khơng 11 Chảy ghèn mắt 1= Có 2= Khơng 12 Phát ban da 1= Có 2= Khơng 13 Triệu chứng khác 1= Có (ghi rõ) 2= Khơng 14 Bệnh kèm theo: 1= Có (ghi rõ ) 2= Không 15 Bệnh nền: 1= Có (ghi rõ ) 2= Không 16 Tiền viêm tiểu phế quản: 1= Có 2= Khơng 17 Tiền viêm phổi 1= Có 2= Khơng 18 Sanh non: (… tuần) 1= Có 2= Khơng 19 Cân nặng lúc sanh: (ghi rõ ) Tuân thủ Luật sở hữu trí tuệ Quy định truy cập tài liệu điện tử Ghi rõ nguồn tài liệu trích dẫn Bản quyền tài liệu thuộc Thư viện Đại học Y Dược TP.Hồ Chí Minh III Triệu chứng lâm sàng: 20 Tri giác: 1= Tỉnh 3= Kích thích 21 Mơi: 2= Li bì khó đánh thức 4= Co giật 1= Hồng 5= Hơn mê 2= Tím/tái 22 Mạch:…… (lần/phút) Huyết áp:…… (mmHg) 23 Nhiệt độ:…… (oC) Nhịp thở:……… (lần/phút) 24 SpO2/FiO2: 25 Suy hơ hấp: 1= Có 2= Khơng 26 Mức đô suy hô hấp: - Lúc nhập viện: 1= Độ 2= Độ 3= Độ - Lúc chẩn đoán: 1= Độ 2= Độ 3= Độ 27 Khị khè: 2= Khơng 1= Có 28 Ran phổi (ghi rõ) 29 Triệu chứng khác có liên quan: ………………… 30 Cân nặng (ghi số): kg 31 Mức độ suy dinh dƣỡng: 32 Sốc (trong suốt trình điều trị): Chiều cao (ghi số): cm 1= Khơng 1= Có 2= Vừa 3= Nặng 2= Khơng (Nếu có: thời điểm?) 33 Dấu nƣớc: 1= Có 2= Khơng IV Cận lâm sàng: 34 Bạch cầu máu: WBC /mm3, N K/mL %, L .K/mL % 35 Hemoglobin: g/dL 36 Tiểu cẩu: ./mm3 37 CRP máu: mg/L 38 Proccalcitonin máu: …… (nếu có) 39 Ure máu: … mmol/L 40 Creatinin máu: .umol/L Tuân thủ Luật sở hữu trí tuệ Quy định truy cập tài liệu điện tử Ghi rõ nguồn tài liệu trích dẫn Bản quyền tài liệu thuộc Thư viện Đại học Y Dược TP.Hồ Chí Minh 41 AST: .U/L 42 ALT: .U/L 43 PaO2/KMĐM: .mmHg 44 PaO2/FiO2: 45 PaCO2/KMĐM: .mmHg 46 Hình ảnh + vị trí tổn thƣơng X quang phổi thời điểm làm PCR đàm (ghi rõ) 47 Kết CT scan ngực (nếu có): 48 Cấy đàm: 1= Âm tính 2= Dƣơng tính 49 Nếu dƣơng tính: (ghi rõ ngày) Tên tác nhân Nhạy Trung gian 50 Cấy máu: 1= Có 2=Khơng 51 Kết cấy máu: 1= Âm tính 2= Dƣơng tính Kháng 52 Nếu dƣơng tính: (ghi rõ ngày) Tên tác nhân 53 PCR đàm: Nhạy 1= đơn nhiễm Trung gian mẫu)…………… 54 Số copies Adenovirus: 55 Tên tác nhân đồng nhiễm: ……………………………… ……………………………… V Điều trị 56 Tên kháng sinh ban đầu (ghi rõ): 57 Số lần đổi kháng sinh: …… lần Tuân thủ Luật sở hữu trí tuệ Quy định truy cập tài liệu điện tử Ghi rõ nguồn tài liệu trích dẫn = đồng nhiễm Kháng (ghi rõ ngày lấy Bản quyền tài liệu thuộc Thư viện Đại học Y Dược TP.Hồ Chí Minh 58 Số loại kháng sinh sử dụng suốt thời gian điều trị (ghi rõ): 59 Tổng số ngày sốt: …… ngày 60 Hỗ trợ hơ hấp: 1= Có 2= Khơng 61 Thời điểm bắt đầu thở oxy tính từ lúc nhập viện: (Ghi rõ số giờ)  1= Không thở oxy 2= Lúc nhập viện  3= ≤ 48 sau nhập viện 4= Sau 48 sau nhập viện (ghi rõ ngày) 62 Số ngày thở oxy: ngày 63 Thở NCPAP: 1= Có 2= Khơng 64 Số ngày thở NCPAP: ngày 65 Thở máy: 1= Có 2= Khơng 66 Số ngày thở máy: ngày 67 Biến chứng khác ngồi suy hơ hấp: (ghi rõ .) VI Kết điều trị 68 Kết điều trị: 1= Xuất viện 2= Chuyển viện - chuyển khoa 3= Tử vong 69 Tình trạng lúc xuất viện: 1= Hồi phục hoàn toàn 2= Đỡ, giảm 3= Nặng 4= Di chứng 5= Tử vong 70 Chẩn đoán xuất viện chính: (ghi rõ ) 71 Chẩn đoán xuất viện phụ: (ghi rõ ) 72 Nhập viện sau khị khè kéo dài/tái phát: 1= Có Ghi chú: Tuân thủ Luật sở hữu trí tuệ Quy định truy cập tài liệu điện tử Ghi rõ nguồn tài liệu trích dẫn 2= Khơng Bản quyền tài liệu thuộc Thư viện Đại học Y Dược TP.Hồ Chí Minh PHỤ LỤC 2: DANH SÁCH BỆNH NHÂN Nghiên cứu: “Đặc điểm viêm phổi nặng có kết PCR đàm dƣơng tính với adenovirus trẻ từ tháng đến tuổi Bệnh viện Nhi Đồng 1” Nghiên cứu viên chính: BS TRẦN THANH THỨC Đơn vị chủ trì: Bộ mơn Nhi – Đại học Y Dƣợc TP Hồ Chí Minh STT Họ tên Giới Năm sinh Số hồ sơ BÙI ĐĂNG K Nam 2019 121394/19 BÙI MINH K Nam 2019 62529/19 ĐẶNG ĐỨC D Nam 2017 521858/17 ĐẶNG MINH K Nam 2019 539319/19 ĐINH HOÀNG S Nam 2015 343127/15 ĐINH MINH L Nam 2019 146571/19 ĐOÀN THANH X Nữ 2018 188776/19 HOÀNG MINH Đ Nam 2017 499571/18 HOÀNG QUỐC T Nam 2018 505667/18 10 HUỲNH ĐỨC T Nam 2018 357019/19 11 HUỲNH THÀNH N Nam 2018 457339/18 12 HUỲNH THANH NHÃ U Nữ 2018 342200/19 13 LÊ HẢI PHÚC A Nam 2019 415730/19 14 LÊ MINH Đ Nam 2017 463940/17 15 LÊ MINH Q Nam 2018 360640/18 Tuân thủ Luật sở hữu trí tuệ Quy định truy cập tài liệu điện tử Ghi rõ nguồn tài liệu trích dẫn Bản quyền tài liệu thuộc Thư viện Đại học Y Dược TP.Hồ Chí Minh 16 LÊ PHÚC H Nam 2015 23175/20 17 LÊ THẠCH A Nam 2017 358807/18 18 LƢ LÝ TRƢỜNG T Nam 2017 485102/19 19 LÝ GIA H Nam 2019 451320/19 20 MÃ K Nữ 2019 589532/19 21 NGUYỄN ANH K Nam 2018 294361/19 22 NGUYỄN ĐỨC ANH K Nam 2018 173469/19 23 NGUYỄN ĐỨC P Nam 2019 11452/20 24 NGUYỄN HOÀNG K Nam 2019 149792/19 25 NGUYỄN HOẰNG L Nam 2019 340357/19 26 NGUYỄN HỮU T Nam 2019 169698/19 27 NGUYỄN MINH K Nam 2018 450285/18 28 NGUYỄN MINH Q Nam 2018 16220/19 29 NGUYỄN MINH T Nam 2018 452954/19 30 NGUYỄN MINH V Nam 2019 629783/19 31 NGUYỄN NGỌC KHẢ H Nữ 2018 292661/19 32 NGUYỄN NGỌC PHƢƠNG V Nữ 2019 488601/19 33 NGUYỄN PHẠM HOÀI TRỌNG N Nam 2018 127234/18 34 NGUYỄN PHẠM MINH K Nam 2019 522488/19 35 NGUYỄN PHƢỚC L Nam 2018 504160/18 36 NGUYỄN THÀNH L Nam 2019 583244/19 37 NGUYỄN THANH N Nữ 2019 75299/19 38 NGUYỄN THẮNG L Nam 2018 552329/18 39 NGUYỄN THỊ NGỌC H Nữ 2016 77527/19 40 NGUYỄN THIÊN A Nam 2019 472865/19 Tuân thủ Luật sở hữu trí tuệ Quy định truy cập tài liệu điện tử Ghi rõ nguồn tài liệu trích dẫn Bản quyền tài liệu thuộc Thư viện Đại học Y Dược TP.Hồ Chí Minh 41 NGUYỄN THIỆN M Nam 2017 627161/17 42 NGUYỄN TUẤN H Nam 2019 341798/19 43 NGUYỄN XUÂN P Nam 2019 592078/19 44 PHẠM ÁI P Nữ 2017 625803/19 45 PHẠM AN N Nam 2018 576892/19 46 SCHUSTER KIM C Nữ 2017 140724/19 47 TÔN THẤT THÁI B Nam 2019 490263/19 48 TRẦN LÊ K Nam 2018 338988/19 49 TRẦN MẠNH T Nam 2019 532243/19 50 TRẦN NGUYỄN TƢỜNG V Nữ 2018 89454/19 51 TRẦN PHÚC K Nam 2017 349326/19 52 TRẦN TÚ U Nữ 2018 26354/20 53 TRỊNH MINH Q Nam 2019 379181/19 54 VÕ KHÁNH M Nữ 2017 582608/17 55 VÕ THIÊN D Nữ 2018 445833/19 XÁC NHẬN CỦA BỆNH VIỆN Tuân thủ Luật sở hữu trí tuệ Quy định truy cập tài liệu điện tử Ghi rõ nguồn tài liệu trích dẫn