1. Trang chủ
  2. » Y Tế - Sức Khỏe

4 định trình tự chuỗi

41 1 0

Đang tải... (xem toàn văn)

Tài liệu hạn chế xem trước, để xem đầy đủ mời bạn chọn Tải xuống

THÔNG TIN TÀI LIỆU

Thông tin cơ bản

Định dạng
Số trang 41
Dung lượng 1,76 MB

Nội dung

ĐỊNH TRÌNH TỰ CHUỖI (DNA SEQUENCING) ThS Nguyễn Kim Thạch BM Hóa Sinh – Sinh Học Phân Tử Trường ĐH Y Khoa Phạm Ngọc Thạch E-mail: nguyenkimthach@pnt.edu.vn Định trình tự chuỗi DNA trình (kỹ thuật) xác định cụ thể trình tự nucleotide đoạn DNA quan tâm SEQ CĨ VAI TRỊ QUAN TRỌNG Nghiên cứu gen & gen GENOMICS HUMAN GENOME PROJECT 2003 > 30.000 GENES GENETICS SEQ CĨ VAI TRỊ QUAN TRỌNG Hỗ trợ kỹ thuật liên quan đến gen & protein RECOMBINANT DNA THUỐC VACCINE MONOCLONAL ANTIBODY SEQ CÓ VAI TRỊ QUAN TRỌNG Tham gia chẩn đốn biến đổi gen SNP ĐỘT BIẾN LIÊN QUAN ĐẾN MỘT / VÀI NUCLEOTIDE POLYMORPHISM INDIVIDUAL MEDICINE Các dạng đa hình gen Genome khảo cổ học • Sự phân hủy mẫu thu thập  mitDNA sequencing • Bộ genome nhân mẫu cổ vật: cave bear, mammoth, Neanderthal (106 bp ) XÁC ĐỊNH KIỂU GEN CỦA HPV HPV HPV TYPE 6, 11,… TYPE 16, 18,… CTC bình thường Ung thư CTC XÁC ĐỊNH ĐỘT BIẾN TRÊN BCR-ABL/CML XÁC ĐỊNH ĐỘT BIẾN TRÊN BCR-ABL/CML Natural History of HCV Infection Exposure (100) (Acute phase) 85% (85) Chronic 15% (15) Resolved 20% (12) Cirrhosis 80% (68) Stable 75% (9) Slowly progressive 25% (3) HCC Transplant Death Anti HCV (+) with liver function 120U/ml Võ Trọng Hải 2004 Genotype of HCV Molecular Testing for HCV RNA in Monitoring Therapy: PEG-IFN + R Testing Algorithm for Naïve Patients (2002 NIH Consensus Conference) Baseline Quantitative Test and Genotyping Test Week 12 Quantitative Test 2 log10 drop or undetectable HCV RNA (Qual Test) Genotype - 48 weeks of Therapy Genotype non-1 24 weeks of Therapy End-of-Treatment Qualitative Test Months follow up Qualitative Test HCV RNA (+) Non-Responder HCV RNA (+) Relapser HCV RNA (-) Sustained Responder The clean up PCR product (0.5) DTCS quick start mix (4l) + HCV sequencing primer (2pm) Sequencing PCR Ethanol precipitation CEQ 8000 sequencer Analysis Submit to HCV genotype blast Bio-edit Local blast HCV genotype Ethanol precipitation Các câu hỏi trắc nghiệm lượng giá Câu 1: Trong kỹ thuật giải trình tự DNA, dideoxynucleotide sử dụng nucleotide này: a Có thể phát quang b Có khả tham gia phản ứng kéo dài chuỗi hiệu c Cho phép rút ngắn thời gian thực kỹ thuật định trình tự chuỗi DNA d Tất e Tất sai Câu 2: Ý sau nói lên chất kỹ thuật định trình tự chuỗi DNA có sử dụng dideoxynucleotide: a Có hình thành đoạn DNA dựa khuôn mẫu đoạn DNA cần định trình tự b Các đoạn DNA tạo thành có kích thước khơng đồng c Đoạn mồi bắt cặp đặc hiệu nhờ diện dideoxynucleotide d Không cần thực trình điện di e Các đoạn DNA khuếch đại phát dễ dàng nhờ phát quang dideoxynucleotide Câu 3: Phương pháp giải trình tự DNA có ưu điểm chẩn đốn: a Đột biến điểm biết trước b Đột biến điểm trước c Đột biến đoạn biết trước d Đột biến trao đổi đoạn biết trước e Tất câu sai Câu 4: So với kỹ thuật PCR cổ điển, kỹ thuật định trình tự chuỗi dựa dideoxynucleotide khác biệt khía cạnh: a Khơng dùng DNA polymerase b Có thể trực tiếp làm việc mRNA c Chu trình nhiệt gồm chu kỳ d Chỉ dùng đoạn mồi e Tất sai Câu 5: Các đặc điểm kỹ thuật định trình tự chuỗi, trừ: a Thời gian thực nhanh b Tiêu chuẩn vàng chẩn đoán shpt c Định xác đột biến d Chi phí cao e Khơng dùng DNA polymerase

Ngày đăng: 13/04/2023, 12:53

TÀI LIỆU CÙNG NGƯỜI DÙNG

TÀI LIỆU LIÊN QUAN

w