ĐẠI HOC NGUYỄN TẤT THÀNH NGUYEN TAT THANH THỤC HỌC - THỤC HÀNH - THỤC DANH - THỤC NGHIỆP KHOA CƠNG NGHỆ SINH HỌC KHĨA LUẬN TĨT NGHIỆP GIẢI TRÌNH Tự VÃ PHÂN TÍCH GẦN ĐÀY ĐỦ GENOME PARVOVIRUS GÂY BỆNH TIÊU CHẢY CẤP TÍNH TRÊN CHĨ Sinh viên thực : Võ Thị Tài Hậu MSSV : 1711548166 GVHD : TS Thân Văn Thái TP HCM, 2020 MỤC LỤC LỜI CẢM ƠN i MỤC LỤC ii TÓM TẮT V SUMMARY vi DANH MỤC CÁC HÌNH ẢNH vi DANH MỤC BẢNG BIẾU viii DANH MỤC CHŨ VIẾT TẮT ix ĐẶT VẤN ĐỀ xi CHƯƠNG TÓNG QUAN TÀI LIỆU 1.1 Tổng quan Canine parvovirus 1.1.1 Lịch sử phát 1.1.2 Phân loại 1.1.3 Genome 1.1.4 Phương thức lây nhiễm 1.1.5 Tổng quan bệnh nhiềm Canine parvovirus 1.1.6 Cách phòng bệnh điều trị 1.1.7 Dịch tễ học 12 1.1.8 Các phương pháp chấn đoán bệnh CPV 13 1.2 Tổng quan giải trình tự genome Canine parvovirus 16 1.2.1 Phương pháp giải trình tự 16 1.2.2 Lắp ráp trình tự 18 1.2.3 Phân tích, giải genome 18 1.2.5 Xây dựng phát sinh loài 19 1.3 Các nghiên cứu nước 20 ii 1.3.1 Nghiên cứu nước 20 1.3.2 Nghiên cứu giới 21 CHƯƠNG NỘI DUNG VÀ PHƯƠNG PHÁP NGHIÊN củu 23 2.1 Địa điểm thực 23 2.2 Nội dung nghiên cứu 23 2.3 Đối tượng nghiên cứu 23 2.4 Vật liệu nghiên cứu 23 2.4.1 Thiết bị, dụng cụ 23 2.4.2 Hóa chất thuốc thử 24 2.3 Phương pháp nghiên cứu 24 2.3.1 Thu nhận mầu xử lý mầu 24 2.3.2 Tách chiết DNA 25 2.3.3 PCR phát 26 2.3.4 PCR gần đầy đủ genome 27 2.3.5 Phương pháp điện di 28 2.3.6 Chuẩn bị gel agarose nồng độ 1,2 % .28 2.3.7 Bơm mẫu vào giếng chạy điện di 28 2.3.8 Giải trình tự gen xây dựng phát sinh loài 29 CHƯƠNG KẾT QUẢ VÀ THẢO LUẬN 30 3.1 Thu nhận mầu 30 3.2 Tách chiết DNA 30 3.3 Kết PCR phát 31 3.4 Ket PCR gần đầy đủ genome 31 3.5 Phân tích kết giải trình tự 33 3.6 Ket so sánh mức độ tương đồng 47 3.7 Ket xây dựng phát sinh loài 49 iii 3.7.1 Cây phả hệ gen VP2 49 3.7.2 Cây phả hệ gen NS1 52 KẾT LUẬN VÀ ĐỀ NGHỊ 55 TÀI LIỆU THAM KHẢO 56 PHỤ LỤC 59 IV TÓM TẤT Canine parvovirus (CPV) gây bệnh nặng cho động vật liên tục tạo chủng biến the tái to hợp chó Do đó, cần phải điều tra chùng CPV gây dịch để nâng cao hiểu biết cùa lây truyền CPV lưu hành virus Tuy nhiên, hầu hết nghiên cứu tập trung vào phân tích VP2, đó, thơng tin mối quan hệ chủng hạn chế Trong nghiên cứu chúng tơi tiến hành giải trình tự phân tích trình tự 02 chủng CPV phân lập mầu phân chó tiêu chảy Tp Ho Chí Minh năm 2020 Chủng nghiên cứu thuộc genotype 2c với so biến đổi trình tự nucleotide tìm thấy Phân tích phát sinh lồi gene VP2 NS1 cho thấy chủng nghiên cứu thuộc nhóm với chúng CPV phân lập số nước Châu Á Đe tài: “Giải trình tự phân tích gần đầy đủ genome parvovirus gây bệnh tiêu chảy cấp tính chó” thực từ tháng 06-09/2020 Phịng thí nghiệm Vi sinh, trường Đại học Nguyền Tất Thành Với mục tiêu dùng kĩ thuật tách chiết DNA, phản ứng PCR, giải trình tự phân tích gần đầy đủ trình tự genome Canine parvovirus phần mem tin sinh học Đe tài có nội dung: Chan đoán phát CPV mầu bệnh phẩm phương pháp PCR Thực phản ứng PCR khuếch đại genome CPV Giải trình tự genome CPV Phân tích trình tự genome CPV phần mềm tin - sinh học Những kết đạt sau tháng nghiên cứu: - Chấn đoán phát 10 chùng CPVs mẫu phân chó tiêu chảy cấp tính phương pháp PCR - Đã thực phản ứng PCR khuếch đại gene 05 chủng CPVs phân lập - Giải trình tự genome CPV 1, đặt lại tên Par-21 Par-24 - Phân tích trình tự gene thu từ kết giải trình tự 02 genomes chủng CPVs dựa vùng trình tự gene VP2 NS V DANH MỤC CÁC HÌNH ẢNH Hình 1.1 Genome hồn chỉnh Canine parvovirus Hình 1.2 Ket dương tính xét nghiệm phương pháp ELISA 14 Hình 3.1 Mầu phân chó thu thập từ sở thú y thành phố Hồ Chí Minh 30 Hình 3.2 Kết sau chạy PCR phát 31 Hình 3.3 PCR genome với cặp mồi NS-Fext - Parvo-Rl 32 Hình 3.4 PCR genome với cặp moi Parvo-F2 - Parvo-R2 32 Hình 3.5 PCR genome với cặp moi Parvo-F3 - Parvo-R3 33 Hình 3.6 PCR genome với cặp mồi Parvo-F4 - 4823R 33 Hình 3.7 Kết giải trình tự khơng tốt 34 Hình 3.8 Kết giải trình tự tốt 34 Hình 3.9 Hiệu chỉnh trình tự SeqMan 35 Hình 3.10 Kết sau BLAST NCBI 36 Hình 3.11 Kết sau BLAST NCBI 36 Hình 3.12 Phần trăm tỷ lệ base genome Par-21 Par-24 37 Hình 3.13 Ket phân tích genome Par-21 Par-24 chương trình Python 38 Hình 3.14 Đoi chiếu vị trí mở đầu đoạn gen NS1 NS2 Par-24 EditSeq 39 Hình 3.15 Sai khác base vị trí T462C đoạn gen NSI 42 Hình 3.16 Cây phát sinh loài Canine parvovirus đoạn gen VP2 51 Hình 3.17 Cây phát sinh loài Canine parvovirus đoạn gen NS1 53 vii DANH MỤC BANG BIÊU Bảng 2.1 Danh mục thiết bị sử dụng nghiên cứu 23 Bảng 2.2 Danh mục dụng cụ sử dụng nghiên cứu 24 Bảng 2.3 Danh mục hóa chất thuốc thử 24 Bảng 2.4 Các thành phần phản ứng PCR phát 26 Bảng 2.5 Chu kì nhiệt phản ứng PCR phát 26 Bảng 2.6 Các thành phần phản ứng PCR genome 27 Bảng 2.7 Các cặp moi sử dụng cho PCR genome 27 Bảng 2.8 Chu kì nhiệt phản ứng PCR genome với cặp mồi NS-Fext - Parvo-Rl, Parvo-F4 - 4823 R có nhiệt độ bắt cặp 54 °C cặp moi Parvo-F - Parvo-Rl, Parvo-F3 - Parvo-R3 có nhiệt độ bắt cặp 58 °C 28 Bảng 3.1 Mô tả thông so cặp mồi sử dụng PCR gần đầy đủ genome.32 Bảng 3.2 Vị trí đoạn gen genome Par-21 Par-24 38 Bảng 3.3 Bảng thống kê số lượng amino acid vùng gen dịch mã trình tự Par-21 Par-24 40 Bảng 3.4 Bảngthống kê base đoạngen 2trìnhtự Par-21 Par-24 41 Bảng 3.5 VỊ trí thayđối amino acid đoạngen VP2giữa chủng phân lậpvà chúng tham chiếu 44 Bảng 3.6 VỊ trí thay đổi amino acid đoạn gen NSỉ chủng phân lập chùng tham chiếu 46 Bảng 3.7 Mức độ tưong đồng nucleotide (amino acid) (%) phân đoạn gen VP2 NS1 chủng Par-21, Par-24 chủng tham chiếu 47 viii DANH MỤC CHỮ VIÉT TẮT CPV Canine parvovirus FPV virus panleukopenia PCR Polymerase Chain Reaction NS1 Non-structural protein NS2 Non-structural protein ORF open reading frame ssDNA single-stranded DNA dsDNA double-stranded DNA VLP virus-like particle Ori origin of replication RCR rolling-circle replication PIF Parvovirus initiation factor SF3 superfamily ATP Adenosine triphosphat DNA Deoxyribonucleic acid TÍR Transferrin receptor HI Hemagglutination Inhibition PLA2 Phospholipase A2 TCID50 Median Tissue Culture Infectious Dose ddNTP dideoxynucleotide CL cell lysis PBS Phosphate-buffered saline WB1 washing buffer WB2 washing buffer EB elution buffer TAE Tris-acetate-EDTA IƯPAC International Union of Pure and Applied Chemistry IX Arg Arginine His Histidine Lys Lysine Asn Asparagine Cys Cysteine Glu Axit glutamic Gin Glutamine Gly Glycine He Isoleucine Leu Leucine Met Methionine Phe Phenylalanin Pro Proline Ser Serine Thr Threonine Trp Tryptophan Tyr Tyrosine Vai Valine X ĐẶT VẤN ĐÈ Tại Việt Nam nhu cầu ni chó làm thú cưng ni chó nghiệp vụ ngày tăng Song song đó, vấn đề sức khỏe chúng chủ nuôi đặt mối quan tâm Trên thực tế, chó thường hay mac bệnh như: bệnh dại, bệnh care, bệnh viêm gan truyền nhiễm gây nguy hại đến tính mạng Trong so bệnh chó, bệnh tiêu chảy cấp tính Canine parvovirus (CPV) gây nên bệnh đặc biệt nguy hiểm cần phải lưu ý CPV loại virus truyền nhiễm chủ yếu ảnh hưởng đến chó CPV dễ lây lan cá the chó với tiếp xúc trực tiếp gián tiếp với phân chó bị mắc bệnh Chó dễ mắc bệnh CVP gây chó trưởng thành Khi bị mắc bệnh, chó có triệu chứng lờ đờ, mệt mỏi, kèm theo tiêu máu Tình trạng bệnh lý thường diễn biến nhanh chóng, kèm theo tỷ lệ tử vong cao chó chó chưa tiêm chùng vaccine nên việc phòng chống bệnh CPV gây điều quan trọng nuôi chó Theo nghiên cứu giới, có the thấy CPV thường xuyên xuất loại biến chủng với tần số biến đối di truyền khác giừa quốc gia Hiện Việt Nam, nghiên cứu phần lớn mang tính cập nhật tỷ lệ nhiễm CPV qua năm khác cập nhật số đặc điểm di truyền virus Việc giải trình tự đầy đủ genome CPV phân tích thay đổi đặc điểm di truyền chủng CPV sè đóng góp vào việc xác định đồng nhiễm tái to hợp, làm sáng tỏ chủng CPV phát chủng virus Việt Nam; từ truy nguồn gốc tiến hóa cung cấp thơng tin để chế tạo nên vaccine đặc hiệu với chủng thuộc địa Xuất phát từ tính cấp thiết trên, chúng tơi đề xuất đề tài “Giải trình tự phân tích gần đầy đủ genome parvovirus gây bệnh tiêu chảy cấp tính chó” Mục tiêu nghiên cứu: - Chẩn đốn phát CPV mẫu bệnh phẩm phương pháp PCR - Khuếch đại genome CPV phương pháp PCR - Xác định đặc điểm di truyền học phân tử Canine parvovirus thơng qua kết giải trình tự thu XI 14 Wilson GM, Jindal HK, Yeung DE, Chen w, Astell CR Expression of minute virus of mice major nonstructural protein in insect cells: purification and identification of ATPase and helicase activities Virology 1991; 185( ):90-98 15 Christensen J, Cotmore SF, Tattersall p A novel cellular site-specific DNAbinding protein cooperates with the viral NS1 polypeptide to initiate parvovirus DNA replication J Virol 1997;71(2): 1405-1416 16 Cotmore SF, Tattersall p High-mobility group 1/2 proteins are essential for initiating rolling-circle-type DNA replication at a parvovirus hairpin origin J Virol 1998;72(ll):8477-8484 17 Niskanen EA, Kalliolinna o, Ihalainen TO, Hakkinen M, Vihinen-Ranta M Mutations in DNA binding and transactivation domains affect the dynamics of parvovirus NS1 protein J Virol 2013;87(21):11762-11774 18 Callaway HM, Feng KH, Lee DW, et al Parvovirus Capsid Structures Required for Infection: Mutations Controlling Receptor Recognition and Protease Cleavages J Virol 2017;91 (2):e01871 -01816 19 Nandi s, Kumar M Canine parvovirus: current perspective Indian J Virol 2010;21(l):31-44 20 Decaro N, Desario c, Addie DD, et al The study molecular epidemiology of canine parvovirus, Europe Emerg Infect Dis 2007; 13(8): 1222-1224 21 Nakamura M, Tohya Y, Miyazawa T, et al A novel antigenic variant of Canine parvovirus from a Vietnamese dog Archives of virology 2004; 149(11):22612269 22 Ju c, Cheng Y, Ji Y, Wang Y, Sun L, Huang J Genome sequence of canine parvovirus strain SC02/2011, isolated from a puppy with severe diarrhea in south China J Virol 2012;86(24): 13805-13805 23 Li c, Tang J, Chen z, et al Genetic characterization of the complete genome of a mutant canine parvovirus isolated in China Archives of virology 2018; 163(2):521-525 24 Mira F, Purpari G, Di Bella s, et al spreading of canine parvovirus type 2c mutants of Asian origin in southern Italy Transboundary and emerging diseases 2019;66(6):2297-2304 25 Ogbu KI, Mira F, Purpari G, et al Nearly full-length genome characterization of canine parvovirus strains circulating in Nigeria Transboundary and emerging diseases 2020;67(2):635-647 26 Zhou p, Zeng w, Zhang X, Li s The genetic evolution of canine parvovirus - A new perspective PLoS One 2017; 12(3):e0175035-e0175035 27 Li G, Ji s, Zhai X, et al Evolutionary and genetic analysis of the VP2 gene of canine parvovirus BMC Genomics 2017; 18( ):534 28 Guo L, Yang S-l, Chen S-j, et al Identification of canine parvovirus with the Q370R point mutation in the VP2 gene from a giant panda (Ailuropoda melanoleuca) Virology journal 2013;10:163-163 57 29 Li c, Tang J, Chen z, Niu G, Liu G A divergent canine parvovirus type 2c (CPV2c) isolate circulating in China Infection, genetics and evolution : journal of molecular epidemiology’ and evolutionary genetics in infectious diseases 2019;73:242-247 30 Charoenkul K, Tangwangvivat R, Janetanakit T, et al Emergence of canine parvovirus type 2c in domestic dogs and cats from Thailand Transboundary and emerging diseases 2019;66(4): 1518-1528 31 Moon B-Y, Jang J, Kim S-H, et al Genetic characterization of canine parvovirus type 2c from domestic dogs in Korea Transboundary and emerging diseases 2020;67(4): 1645-1653 32 VÕ VH, Nguyễn TY, Đào LA, et al Một so đặc tính phân từ parvovirus type chó phân lập thành phô Hà Nội Tạp Khoa học Nông nghiệp Việt Nam 2019 2019; 17(2): 100-107 58 PHỤ LỤC Phụ lục Trình tự Par-21 Genome CGCTTCTTGTCTTTGACAGAGTGAACCTCTCTTACTTTGACTAACCATGTCTGGCAACCAGTATACTGAGGAAGTTATGGAGG GAGTAAATTGGTTGAAGAAACATGCAGAAAATGAAGCATTTTCGTTTGTTTTTAAATGTGACAACGTCCAACTAAATGGAAA GGATGTTCGCTGGAACAACTATACCAAACCAATTCAAAATGAAGAACTAACATCTTTAATTAGAGGAGCACAAACAGCAATG GATCAAACCGAAGAAGAAGAAATGGACTGGGAATCGGAAGTTGATAGTCTCGCCAAAAAGCAAGTACAAACTTTTGATGCA TTAATTAAAAAATGTCTTTTTGAAGTCTTTGTTTCTAAAAATATAGAACCAAATGAATGTGTTTGGTTTATTCAACATGAATGG GGAAAAGATCAAGGCTGGCATTGTCATGTTTTACTTCATAGTAAAAACTTACAACAAGCAACTGGTAAATGGCTACGCAGAC AAATGAATATGTATTGGAGTAGATGGTTGGTGACTCTTTGTTCGGTAAACTTAACACCAACTGAAAAGATTAAGCTCAGAGA AATTGCAGAAGATAGTGAATGGGTGACTATATTAACATACAGACATAAGCAAACAAAAAAAGACTATGTTAAAATGGTTCAT TTTGGAAATATGATAGCATATTACTTTTTAACAAAGAAAAAAATTGTCCACATGACAAAAGAAAGTGGCTATTTTTTAAGTAC TGATTCTGGTTGGAAATTTAACTTTATGAAATATCAAGACAGACAAATTGTCAGCACACTTTACACTGAACAAATGAAACCAG AAACCGTTGAAACCACAGTGACGACAGCACAGGAAACAAAGCGCGGGAGAATTCAAACTAAAAAGGAAGTGTCAATCAAAT GTACTTTGCGGGACTTGGTTAGTAAAAGAGTAACATCACCTGAAGACTGGATGATGTTACAACCAGATAGTTATATTGAAAT GATGGCACAACCAGGAGGTGAAAATCTTTTAAAAAATACACTTGAAATTTGTACTTTGACTTTAGCAAGAACAAAAACAGCA TTTGAATTAATACTTGAAAAAGCAGATAATACTAAGCTAACTAACTTTGATCTTGCAAATTCTAGAACATGTCAAATTTTTAG AATGCACGGATGGAATTGGATTAAAGTTTGTCACGCTATAGCATGTGTTTTAAATAGACAAGGTGGTAAAAGAAATACAGTT CTTTTTCATGGACCAGCAAGTACAGGAAAATCTATCATTGCTCAAGCCATAGCACAAGCTGTGGGTAATGTTGGTTGTTATAA TGCAGCAAATGTAAATTTTCCATTTAATGACTGTACCAATAAAAATTTAATTTGGATTGAAGAAGCTGGTAACTTTGGTCAAC AAGTTAATCAATTTAAAGCAATCTGTTCTGGACAAACAATTAGAATTGATCAAAAAGGTAAAGGAAGTAAGCAAATTGAACC AACTCCAGTAATTATGACAACTAATGAAAATATAACAATTGTGAGAATTGGATGTGAAGAAAGACCTGAACATACACAACCA ATAAGAGACAGAATGTTGAACATTAAGTTAGTATGTAAGCTTCCAGGAGACTTTGGTTTGGTTGATAAAGAAGAATGGCCTTT AATATGTGCATGGTTAGTTAAGCATGGTTTTGTATCAACCATGGCTAACTATACACATCACTGGGGAAAAGTACCAGAATGG GATGAAAACTGGGCGGAGCCTAAAATACAAGAAGGTATAAATTCACCAGGTTGCAAAGACTTAGAGACACAAGCGGCAAGC AATCCTCAGAGTCAAGACCAAGTTCTAACTCCTCTGACTCCGGACGTAGTGGACCTTGCACTGGAACCGTGGAGTACTCCAGA TACGCCTATTGCAGAAACTGCAAATCAACAATCAAACCAACCTGGCGTTACTCACAAAGACGTGCAAGCGAGTCCAACGTGG TCCGAAATAGAGGCAGACCTGAGAGCCATCTTTACTTCTGAACAATTGGAAGAAGATTTTCGAGACGACTTGGATTAAGGTA CGATGGCACCTCCGGCAAAGAGAGCCAGGAAAAGTAAGGGTGTGTTAGTGAAAGGGGGGGAAGGGAAAGATTTAATAACTT AACTAAGTATGTATTTTTTTGTAGGACTTGTGCCTCCAGGTTATAAATATCTTGGGCCTGGGAACAGTCTTGACCAAGGAGAA CCAACTAACCCTTCTGACGCCGCTGCAAAGAACACGACGAAGCTTACGCTGCTTATCTTCGCTCTGGTAAAAACCCATACTTA TATTTCTCGCCAGCAGATCAACGCTTTATAGATCAAACTAAGGACGCTAAAGATTGGGGGGGGAAAATAGGACATTATTTTTT TAGAGCTAAAAAGGCAATTGCTCCAGTATTAACTGATACACCAGATCATCCATCAACATCAAGACCAACAAAGCCAACTAAA AGAAGTAAACCACCACCTCATATTTTCATCAATCTTGCAAAAAAAAAAAAACCCGGTGCAGGACAAGTAAAAAGAGACAAT CTTGCACCAATGAGTGATGGAGGATTTCACCCAAACGGGGGTCACCCTGCTGTCAAAAATGAAAAACCTACAGGATCGGGAA ACGGGTCGGGAGGCGGGGGGGGGGGGGGTTCGGGGGGTGGGGGGATTTCTACGGGTACTTTTAATAATCAAACGGAATTTA ATTTTTTGAAAAACGGATGGGGGGAAATCACACCAAACTCAAGCAAACTTGTGCATTTAAATATGCCAAAAAGTGAAAATTA TAGAAAAGTGGTTGTAAATAATTTGGATAAAACTGCATTT.AACGGAAACATGGCTTTAAATGATACTCATGCACAAATTGTA ACACCTTGGTCATTGGTTGATGCAAATGCTTGGGGAGTTTGGTTTAATCCAGGAGATTGGCAACTAATTGTTAATACTATGAG TGAGTTGCATTTAGTTAGTTTTGAACAAGAAATTTTTAATGTTGTTTTAAAGACTGTTTCAGAATCTGCTACTCAGCCACCAAC TAAAGTTTATAATAATGATTTAACTGCATCATTGATGGTTGCATTAGATAGTAATAATACTATGCCATTTACTCCAGCAGCTAT GAGATCTGAGACATTGGGTTTTTATCCATGGAAACCAACCATACCAACTCCATGGAGATATTATTTTCAATGGGATAGAACAT TAATACCATCTCATACTGGAACTAGTGGCACACCAACAAATATATACCATGGTACAGATCCAGATGATGTTCAATTTTATACT ATTGAAAATTCTGTGCCAGTACACTTACTAAGAACAGGTGATGAATTTGCTACAGGAACATTTTATTTTGATTGTAAACCATG TAGACTAACACATACATGGCAAACAAATAGAGCATTGGGCTTACCACCATTTCTAAATTCTTTGCCTCAAGCTGAAGGAGGTA CTAACTTTGGTTATATAGGAGTTCAACAAGATAAAAGACGTGGTGTAACTCAAATGGGAAACACAAACATTATTACTGAAGC TACTATTATCGAGACCAGCTGAGGTTGGTTATAGTGCACCATATTATTCTTTTGAGGCGTCTACACAAGGGCCATTTAAAACA CCTATTGCAGCAGGACGGGGGGGAGCGCAAACAGATGAAAATCGAGCAGCAGATGGTGACCCAAGATATGCATTTGGTAGA 59 CAACATGGTCAAAAAACTACCACAACAGGAGAAACACCTGAGAGATTTACATATATAGCACATCAAGATACAGGAAGATAT CCAGAAGGAGATTGGATTCAAAATATTAACTTTAACCTTCCTGTAACAGAAGATAATGTATTGCTACCAACAGATCCAATTGG AGGTAAAACAGGAATTAACTATACTAATATGTTTAATACTTATGGTCCTTTAACTGCATTAAATAATGTACCACCAGTTTATC CAAATGGTCAAATTTGGGATAAAGAATTTGATACTGACTTAAAACCAAGACTTCATGTAAATGCACCATTTGTTTGTCAAAAT AATTGTCCTGGTCAATTATTTGTAAAAGTTGCACCTAATTTAACAAATGAATATGATCCTGATGCATCTGCTAATATGTCAAG AATTGTAACTTACTCAGATTTTTGGTGGAAAGGTAAATTAGTATTTAAAGCTAAACTAAGAGCCTCTCATACTTGGAATCCAA TTCAACAAATGAGTATCAATGTAGATAACCAATTTAACTATGTACCAAGTAATATTGGAGGTATGAAAATTGTATATGAAAA ATCTCAACTAGCACCTAGAAAATTATATTAACATACTTACTATGTTTTTATGTTTATTACATATTATTTTAAGATTAATTAAATT ACAGCATAGAAATATTGTACTTGTACTTGATATAGGATTTAGAAGGTTTGTTATATGGTATACAATAACTGTAAGAAATAGAA GAACATTTAGATCATAGTTAGTAGTTTGTTTATAAAATGTATTGTAAACCATTAATGTATGTTGTATGTGTGGGGTGGTGGT Gen NS1 ATGTCTGGCAACCAGTATACTGAGGAAGTTATGGAGGGAGTAAATTGGTTGAAGAAACATGCAGAAAATGAAGCATTTTCGT TTGTTTTTAAATGTGACAACGTCCAACTAAATGGAAAGGATGTTCGCTGGAACAACTATACCAAACCAATTCAAAATGAAGA ACTAACATCTTTAATTAGAGGAGCACAAACAGCAATGGATCAAACCGAAGAAGAAGAAATGGACTGGGAATCGGAAGTTGA TAGTCTCGCCAAAAAGCAAGTACAAACTTTTGATGCATTAATTAAAAAATGTCTTTTTGAAGTCTTTGTTTCTAAAAATATAG AACCAAATGAATGTGTTTGGTTTATTCAACATGAATGGGGAAAAGATCAAGGCTGGCATTGTCATGTTTTACTTCATAGTAAA AACTTACAACAAGCAACTGGTAAATGGCTACGCAGACAAATGAATATGTATTGGAGTAGATGGTTGGTGACTCTTTGTTCGGT AAACTTAACACCAACTGAAAAGATTAAGCTCAGAGAAATTGCAGAAGATAGTGAATGGGTGACTATATTAACATACAGACAT AAGCAAACAAAAAAAGACTATGTTAAAATGGTTCATTTTGGAAATATGATAGCATATTACTTTTTAACAAAGAAAAAAATTG TCCACATGACAAAAGAAAGTGGCTATTTTTTAAGTACTGATTCTGGTTGGAAATTTAACTTTATGAAATATCAAGACAGACAA ATTGTCAGCACACTTTACACTGAACAAATGAAACCAGAAACCGTTGAAACCACAGTGACGACAGCACAGGAAACAAAGCGC GGGAGAATTCAAACTAAAAAGGAAGTGTCAATCAAATGTACTTTGCGGGACTTGGTTAGTAAAAGAGTAACATCACCTGAAG ACTGGATGATGTTACAACCAGATAGTTATATTGAAATGATGGCACAACCAGGAGGTGAAAATCTTTTAAAAAATACACTTGA AATTTGTACTTTGACTTTAGCAAGAACAAAAACAGCATTTGAATTAATACTTGAAAAAGCAGATAATACTAAGCTAACTAACT TTGATCTTGCAAATTCTAGAACATGTCAAATTTTTAGAATGCACGGATGGAATTGGATT.AAAGTTTGTCACGCTATAGCATGT GTTTTAAATAGACAAGGTGGTAAAAGAAATACAGTTCTTTTTCATGGACCAGCAAGTACAGGAAAATCTATCATTGCTCAAG CCATAGCACAAGCTGTGGGTAATGTTGGTTGTTATAATGCAGCAAATGTAAATTTTCCATTTAATGACTGTACCAATAAAAAT TTAATTTGGATT(iAAGAAGCTGGTAACTTTGGTCAACAAGTTAATCAATTTAAAGCAATCT(iITCTGGACAAACAATTAGAAT TGATCAAAAAGGTAAAGGAAGTAAGCAAATTGAACCAACTCCAGTAATTATGACAACTAATGAAAATATAACAATTGTGAG AATTGGATGTGAAGAAAGACCTGAACATACACAACCAATAAGAGACAGAATGTTGAACATTAAGTTAGTATGTAAGCTTCCA GGAGACTTTGGTTTGGTTGATAAAGAAGAATGGCCTTTAATATGTGCATGGTTAGTTAAGCATGGTTTTGTATCAACCATGGC TAACTATACACATCACTGGGGAAAAGTACCAGAATGGGATGAAAACTGGGCGGAGCCTAAAATACAAGAAGGTATAAATTC ACCAGGTTGCAAAGACTTAGAGACACAAGCGGCAAGCAATCCTCAGAGTCAAGACCAAGTTCTAACTCCTCTGACTCCGGAC GTAGTGGACCTTGCACTGGAACCGTGGAGTACTCCAGATACGCCTATTGCAGAAACTGCAAATCAACAATCAAACCAACCTG GCGTTACTCACAAAGACGTGCAAGCGAGTCCAACGTGGTCCGAAATAGAGGCAGACCTGAGAGCCATCTTTACTTCTGAACA ATTGGAAGAAGATTTTCGAGACGACTTGGATTAA Gen NS2 ATGTCTGGCAACCAGTATACTGAGGAAGTTATGGAGGGAGTAAATTGGTTGAAGAAACATGCAGAAAATGAAGCATTTTCGT TTGTTTTTAAATGTGACAACGTCCAACTAAATGGAAAGGATGTTCGCTGGAACAACTATACCAAACCAATTCAAAATGAAGA ACTAACATCTTTAATTAGAGGAGCACAAACAGCAATGGATCAAACCGAAGAAGAAGAAATGGACTGGGAATCGGAAGTTGA TAGTCTCGCCAAAAAGCAAGTACAAACTTTTGATGCATTAATTAAAAAATGTCTTTTTGAAGTCTTTGTTTCTAAAAATATAG AACCAAATGAATGTGTTTGGTTTATTCAACATGAATGGGGAAAAGATCAAGGCTGGCATTGTCATGTTTTACTTCATAGTAAA AACTTACAACAAGCAACTGGTAAATGGCTACGCAGACAAATGAATATGTATTGGAGTAGATGGTTGGTGACTCTTTGTTCGGT AAACTTAACACCAACTGAAAAGATTAAGCTCAGAGAAATTGCAGAAGATAGTGAATGGGTGACTATATTAACATACAGACAT AAGCAAACAAAAAAAGACTATGTTAAAATGGTTCATTTTGGAAATATGATAGCATATTACTTTTTAACAAAGAAAAAAATTG TCCACATGACAAAAGAAAGTGGCTATTTTTTAAGTACTGATTCTGGTTGGAAATTTAACTTTATGAAATATCAAGACAGACAA ATTGTCAGCACACTTTACACTGAACAAATGAAACCAGAAACCGTTGAAACCACAGTGACGACAGCACAGGAAACAAAGCGC GGGAGAATTCAAACTAAAAAGGAAGTGTCAATCAAATGTACTTTGCGGGACTTGGTTAGTAAAAGAGTAACATCACCTGAAG 60 ACTGGATGATGTTACAACCAGATAGTTATATTGAAATGATGGCACAACCAGGAGGTGAAAATCTTTTAAAAAATACACTTGA AATTTGTACTTTGACTTTAGCAAGAACAAAAACAGCATTTGAATTAATACTTGAAAAAGCAGATAATACTAAGCTAACTAACT TTGATCTTGCAAATTCTAGAACATGTCAAATTTTTAGAATGCACGGATGGAATTGGATTAAAGTTTGTCACGCTATAGCATGT GTTTTAAATAGACAAGGTGGTAAAAGAAATACAGTTCTTTTTCATGGACCAGCAAGTACAGGAAAATCTATCATTGCTCAAG CCATAGCACAAGCTGTGGGTAATGTTGGTTGTTATAATGCAGCAAATGTAAATTTTCCATTTAATGACTGTACCAATAAAAAT TTAATTTGGATTGAAGAAGCTGGTAACTTTGGTCAACAAGTTAATCAATTTAAAGCAATCTGTTCTGGACAAACAATTAGAAT TGATCAAAAAGGTAAAGGAAGTAAGCAAATTGAACCAACTCCAGTAATTATGACAACTAATGAAAATATAACAATTGTGAG AATTGGATGTGAAGAAAGACCTGAACATACACAACCAATAAGAGACAGAATGTTGAACATTAAGTTAGTATGTAAGCTTCCA GGAGACTTTGGTTTGGTTGATAAAGAAGAATGGCCTTTAATATGTGCATGGTTAGTTAAGCATGGTTTTGTATCAACCATGGC TAACTATACACATCACTGGGGAAAAGTACCAGAATGGGATGAAAACTGGGCGGAGCCTAAAATACAAGAAGGTATAAATTC ACCAGGTTGCAAAGACTTAGAGACACAAGCGGCAAGCAATCCTCAGAGTCAAGACCAAGTTCTAACTCCTCTGACTCCGGAC GTAGTGGACCTTGCACTGGAACCGTGGAGTACTCCAGATACGCCTATTGCAGAAACTGCAAATCAACAATCAAACCAACCTG GCGTTACTCACAAAGACGTGCAAGCGAGTCCAACGTGGTCCGAAATAGAGGCAGACCTGAGAGCCATCTTTACTTCTGA Gen VP1 ATGGCACCTCCGGCAAAGAGAGCCAGGAAAAGTAAGGGTGTGTTAGTGAAAGGGGGGGAAGGGAAAGATTTAATAACTTAA CTAAGTATGTATTTTTTTGTAGGACTTGTGCCTCCAGGTTATAAATATCTTGGGCCTGGGAACAGTCTTGACCAAGGAGAACC AACTAACCCTTCTGACGCCGCTGCAAAGAACACGACGAAGCTTACGCTGCTTATCTTCGCTCTGGTAAAAACCCATACTTATA TTTCTCGCCAGCAGATCAACGCTTTATAGATCAAACTAAGGACGCTAAAGATTGGGGGGGGAAAATAGGACATTATTTTTTTA GAGCTAAAAAGGCAATTGCTCCAGTATTAACTGATACACCAGATCATCCATCAACATCAAGACCAACAAAGCCAACTAAAAG AAGTAAACCACCACCTCATATTTTCATCAATCTTGCAAAAAAAAAAAAACCCGGTGCAGGACAAGTAAAAAGAGACAATCTT GCACCAATGAGTGATGGAGGATTTCACCCAAACGGGGGTCACCCTGCTGTCAAAAATGAAAAACCTACAGGATCGGGAAAC GGGTCGGGAGGCGGGGGGGGGGGGGGTTCGGGGGGTGGGGGGATTTCTACGGGTACTTTTAATAATCAAACGGAATTTAATT TTTTGAAAAACGGATGGGGGGAAATCACACCAAACTCAAGCAAACTTGTGCATTTAAATATGCCAAAAAGTGAAAATTATAG AAAAGTGGTTGTAAATAATTTGGATAAAACTGCATTTAACGGAAACATGGCTTTAAATGATACTCATGCACAAATTGTAACA CCTTGGTCATTGGTTGATGCAAATGCTTGGGGAGTTTGGTTTAATCCAGGAGATTGGCAACTAATTGTTAATACTATGAGTGA GTTGCATTTAGTTAGTTTTGAACAAGAAATTTTTAATGTTGTTTTAAAGACTGTTTCAGAATCTGCTACTCAGCCACCAACTAA AGTTTATAATAATGATTTAACTGCATCATTGATGGTTGCATTAGATAGTA.ẰTAATACTATGCCATTTACTCCAGCAGCTATGA GATCTGAGACATTGGGTTTTTATCCATGGAAACCAACCATACCAACTCCATGGAGATATTATTTTCAATGGGATAGAACATTA ATACCATCTCATACTGGAACTAGTGGCACACCAACAAATATATACCATGGTACAGATCCAGATGATGTTCAATTTTATACTAT TGAAAATTCTGTGCCAGTACACTTACTAAGAACAGGTGATGAATTTGCTACAGGAACATTTTATTTTGATTGTAAACCATGTA GACTAACACATACATGGCAAACAAATAGAGCATTGGGCTTACCACCATTTCTAAATTCTTTGCCTCAAGCTGAAGGAGGTACT A.'KCTTTGGTTATATAGGAGTTCAACAAGATAAAAGACGTGGTGTAACTCAAATGGGAAACACAAACATTATTACTGAAGCTA CTATTATCGAGACCAGCTGAGGTTGGTTATAGTGCACCATATTATTCTTTTGAGGCGTCTACACAAGGGCCATTTAAAACACC TATTGCAGCAGGACGGGGGGGAGCGCAAACAGATGAAAATCGAGCAGCAGATGGTGACCCAAGATATGCATTTGGTAGACA ACATGGTCAAAAAACTACCACAACAGGAGAAACACCTGAGAGATTTACATATATAGCACATCAAGATACAGGAAGATATCC AGAAGGAGATTGGATTCAAAATATTAACTTTAACCTTCCTGTAACAGAAGATAATGTATTGCTACCAACAGATCCAATTGGA GGTAAAACAGGAATTAACTATACTAATATGTTTAATACTTATGGTCCTTTAACTGCATTAAATAATGTACCACCAGTTTATCC AAATGGTCAA,ATTTGGGATAAAGAATTTGATACTGACTTAAAACCAAGACTTCATGTAAATGCACCATTTGTTTGTCAAAATA ATTGTCCTGGTCAATTATTTGTAAAAGTTGCACCTAATTTA.ACAAATGAATATGATCCTGATGCATCTGCTAATATGTCAAGA ATTGT.AACTTACTCAGATTTTTGGTGGAAAGGTAAATTAGTATTTAAAGCTAAACTAAGAGCCTCTCATACTTGGAATCCAAT TCAACAAATGAGTATCAATGTAGATAACCAATTTAACTATGTACCAAGTAATATTGGAGGTATGAAAATTGTATATGAAAAA TCTCAACTAGCACCTAGAAAATTATATTAA Gen VP2 ATGAGTGATGGAGGAGTTCAACCAGACGGTGGTCAACCTGCTGTCAGAAATGAAAGAGCTACAGGATCTGGGAACGGGTCT GGAGGCGGGGGTGGTGGTGGTTCTGGGGGTGTGGGGATTTCTACGGGTACTTTTAATAATCAGACGGAATTTAAATTTTTGGA AAACGGATGGGTGGA,AATCACAGCAAACTCAAGCAGACTTGTGCATTTAAATATGCCAGAAAGTGAAAATTATAGAAGAGT GGTTGTAAATAATTTGGATAAAACTGCAGTTAACGGAAACATGGCTTTAGATGATACTCATGCACAAATTGTAACACCTTGGT CATTGGTTGATGCAAATGCTTGGGGAGTTTGGTTTAATCCAGGAGATTGGCAACTAATTGTTAATACTATGAGTGAGTTGCAT 61 TTAGTTAGTTTTGAACAAGAAATTTTTAATGTTGTTTTAAAGACTGTTTCAGAATCTGCTACTCAGCCACCAACTAAAGTTTAT AATAATGATTTAACTGCGTCATTGATGGTTGCATTAGATAGTAATAATACTATGCCATTTACTCCAGCAGCTATGAGATCTGA GACATTGGGTTTTTATCCATGGAAACCAACCATACCAACTCCATGGAGATATTACTTTCAATGGGATAGAACATTAATACCAT CTCATACTGGAACTAGTGGCACACCAACAAATATATACCATGGTACAGATCCAGATGATGTTCAATTTTACACTATTGAAAAT TCTGTGCCAGTACACTTACTAAGAACAGGTGATGAATTTGCTACAGGAACATTTTATTTTGATTGTAAACCATGTAGACTAAC ACATACATGGCAAACAAATAGAGCATTGGGCTTACCACCATTTCTAAATTCTTTGCCTCAAGCTGAAGGAGGTACTAACTTTG GTTATATAGGAGTCCAACAAGATAAAAGACGTGGTGTAACTCAAATGGGAAACACAAACATTATTACTGAAGCTACTATTAT GAGACCAGCTGAGGTTGGTTATAGTGCACCATATTATTCTTTTGAGGCGTCTACACAAGGGCCATTTAAAACACCTATTGCAG CAGGACGGGGGGGAGCGCAAACAGATGAAAATCGAGCAGCAGATGGTGATCCAAGATATGCATTTGGTAGACAACATGGTC AAAAAACTACCACAACAGGAGAAACACCTGAGAGATTTACATATATAGCACATCAAGATACAGGAAGATATCCAGAAGGAG ATTGGATTCAAAATATTAACTTTAACCTTCCTGTAACAGAAGATAATGTATTGCTACCAACAGATCCAATTGGAGGTAAAACA GGAATTAACTATACTAATATGTTTAATACTTATGGTCCTTTAACTGCATTAAATAATGTACCACCAGTTTATCCAAATGGTCAA ATTTGGGATAAAGAATTTGATACTGACTTAAAACCAAGACĨTCATGTAAATGCACCATTTGTTTGTCAAAATAATTGTCCTGG TCAATTATTTGTAAAAGTTGCACCTAATTTAACAAATGAATATGATCCTGATGCATCTGCTAATATGTCAAGAATTGTAACTT ACTCAGATTTTTGGTGGAAAGGTAAATTAGTATTTAAAGCTAAACTAAGAGCCTCTCATACTTGGAATCCAATTCAACAAATG AGTATCAATGTAGATAACCAATTTAACTATGTACCAAGTAATATTGGAGGTATGAAAATTGTATATGAAAAATCTCAACTAGC ACCTAGAAAATTATATTAA Phụ lục Trình tự Par-24 Genome GACCGTTACTGACATTCGCTTCTTGTCTTTGACAGAGTGAACCTCTCTTACTTTGACTAACCATGTCTGGCAACCAGTATACTG AGGAAGTTATGGAGGGAGTAAATTGGTTGAAGAAACATGCAGAAAATGAAGCATTTTCGTTTGTTTTTAAATGTGACAACGT CCAACTAAATGGAAAGGATGTTCGCTGGAACAACTATACCAAACCAATTCAAAATGAAGAGCTAACATCTTTAGTTAGAGGA GCACAAACAGCAATGGATCAAACCGAAGAAGAAGAAATGGACTGGGAATCGGAAGTTGATAGTCTCGCCAAAAAGCAAGTA CAAACTTTTGATGCATTAATTAAAAAATGTCTTTTTGAAGTCTTTGTTTCTAAAAATATAGAACCAAATGAATGTGTTTGGTTT ATTCAACATGAATGGGGAAAAGATCAAGGCTGGCATTGTCATGTTTTACTTCATAGTAAAAACTTACAACAAGCAACTGGTA AATGGCTACGCAGACAAATGAATATGTATTGGAGTAGATGGTTGGTGACTCTTTGTTCGGTAAACTTAACACCAACTGAAAA GATTAAGCTCAGAGAAATTGCAGAAGATAGTGAATGGGTGACTATATTAACATACAGACATAAGCAAACAAAAAAAGACTA TGTTAAAATGGTTCATTTTGGAAATATGATAGCATATTACTTTTTAACAAAGAAAAAAATTGTCCACATGACAAAAGAAAGTG GCTATTTTTTAAGTACTGATTCTGGTTGGAAATTTAACTTTATGAAATATCAAGACAGACAAATTGTCAGCACACTTTACACTG AACAAATGAAACCAGAAACCGTTGAAACCACAGTGACGACAGCACAGGAAACAAAGCGCGGGAGAATTCAAACTAAAAAG GAAGTGTCAATCAAATGTACTrTGCGGGACTTGGTTAGTAAAAGAGTAACATCACCTGAAGACTGGATGATGTTACAACCAG ATAGTTATATTGAAATGATGGCACAACCAGGAGGTGAAAATCTTTTAAAAAATACACTTGAAATTTGTACTTTGACTTTAGCA AGAACAAAAACAGCATTTGAATTAATACTTGAAAAAGCAGATAATACTAAGCTAACTAACTTTGATCTTGCAAATTCTAGAA CATGTCAAATTTTTAGAATGCACGGATGGAATTGGATTAAAGTTTGTCACGCTATAGCGTGTGTTTTAAATAGACAAGGTGGT AAAAGAAATACAGTTCTTTTTCATGGACCAGCAAGTACAGGAAAATCTATCATTGCTCAAGCCATAGCACAAGCTGTGGGTA ATGTTGGTTGTTATAATGCAGCAAATGTAAATTTTCCATTTAATGACTGTACCAATAAAAATTTAATTTGGATTGAAGAAGCT GGTAACTTTGGTCAACAAGTTAATCAATTTAAAGCAATCTGTTCTGGACAAACAATTAGAATTGATCAAAAAGGTAAAGGAA GTAAGCAAATTGAACCAACTCCAGTAATTATGACAACTAATGAA.'XATATAACAATTGTGAGAATTGGATGTGAAGAAAGACC TGAACATACACAACCAATAAGAGACAGAATGTTGAACATTAAGCTAGTATGTAAGCTTCCAGGAGACTTTGGTTTGGTTGAT AAAGAAGAATGGCCTTTAATATGTGCATGGTTAGTTAAGCATGGTTTTGTATCAACCATGGCTAACTATACACATCACTGGGG AAAAGTACCAGAATGGGATGAAAACTGGGCGGAGCCTAAAATACAAGAAGGTATAAATTCACCAGGTTGCAAAGACTTAGA GACACAAGCGGCAAGCAATCCTCAGAGTCAAGACCAAGTTCTAACTCCTCTGACTCCGGACGTAGTGGACCTTGCACTGGAA CCGTGGAGTACTCCAGATACGCCTATTGCAGAAACTGCAAATCAACAATCAAACCAACCTGGCGTTACTCACAAAGACGTGC AAGCGAGTCCAACGTGGTCCGAAATAGAGGCAGACCTGAGAGCCATCTTTACTTCTGAACAATTGGAAGAAGATTTTCGAGA CGACTTGGATTAAGGTACGATGGCACCTCCGGCAAAGAGAGCCAGGAGAGGTAAGGGTGTGTTAGTGAAGTGGGGGGAGGG GAAAGATTTAATAACTT.AACTAAGTATGTATTTTTTTGTAGGACTTGTGCCTCCAGGTTATAAATATCTTGGGCCTGGGAACA GTCTTGACCAAGGAGAACCAACTAACCCTTCTGACGCCGCTGCAAAAGAACACGACGAAGCTTACGCTGCTTATCTTCGCTCT GGTAAAAACCCATACTTATATTTCTCGCCAGCAGATCAACGCTTTATAGATCAAACTAAGGACGCTAAAGATTGGGGGGGGA 62 AAATAGGACATTATTTTTTTAGAGCTAAAAAGGCAATTGCTCCAGTATTAACTGATACACCAGATCATCCATCAACATCAAGA CCAACAAAACCAACTAAAAGAAGTAAACCACCACCTCATATTTTCATCAATCTTGCAAAAAAAAAAAAAGCCGGTGCAGGAC AAGTAAAAAGAGACAATCTTGCACCAATGAGTGATGGAGGAGTTCAACCAGACGGTGGTCAACCTGCTGTCAGAAATGAAA GAGCTACAGGATCTGGGAACGGGTCTGGAGGCGGGGGTGGTGGTGGTTCTGGGGGTGTGGGGATTTCTACGGGTACTTTTAA TAATCAGACGGAATTTAAATTTTTGGAAAACGGATGGGTGGAAATCACAGCAAACTCAAGCAGACTTGTGCATTTAAATATG CCAGAAAGTGAAAATTATAGAAGAGTGGTTGTAAATAATTTGGATAAAACTGCAGTTAACGGAAACATGGCTTTAGATGATA CTCATGCACAAATTGTAACACCTTGGTCATTGGTTGATGCAAATGCTTGGGGAGTTTGGTTTAATCCAGGAGATTGGCAACTA ATTGTTAATACTATGAGTGAGTTGCATTTAGTTAGTTTTGAACAAGAAATTTTTAATGTTGTTTTAAAGACTGTTTCAGAATCT GCTACTCAGCCACCAACTAAAGTTTATAATAATGATTTAACTGCGTCATTGATGGTTGCATTAGATAGTAATAATACTATGCC ATTTACTCCAGCAGCTATGAGATCTGAGACATTGGGTTTTTATCCATGGAAACCAACCATACCAACTCCATGGAGATATTACT TTCAATGGGATAGAACATTAATACCATCTCATACTGGAACTAGTGGCACACCAACAAATATATACCATGGTACAGATCCAGA TGATGTTCAATTTTACACTATTGAAAATTCTGTGCCAGTACACTTACTAAGAACAGGTGATGAATTTGCTACAGGAACATTTT ATTTTGATTGTAAACCATGTAGACTAACACATACATGGCAAACAAACAGAGCATTGGGCTTACCACCATTTCTAAATTCTTCG CCTCAAGCTGAAGGAGGTACTAACTTTGGTTATATAGGAGTCCAACAAGATAAAAGACGTGGTGTAACTCAAATGGGAAACA CAAACATTATCACTGAAGCTACTATTATGAGACCAGCTGAGGTTGGTTATAGTGCACCATATTATTCTTTTGAGGCGTCTACA CAAGGGCCATTTAAAACACCTATTGCAGCAGGACGGGGGGGAGCGCAAACAGATGAAAATCGAGCAGCAGATGGTGATCCA AGATATGCATTTGGTAGACAACATGGTCAAAAAACTACCACAACAGGAGAAACACCTGAGAGATTTACATATATAGCACATC AAGATACAGGAAGATATCCAGAAGGAGATTGGATTCAAAATATTAACTTTAACCTTCCTGTAACAGAAGATAATGTATTGCT ACCAACAGATCCAATTGGAGGTAAAACAGGAATTAACTATACTAATATGTTTAATACTTATGGTCCTTTAACTGCATTAAATA ATGTACCACCAGTTTATCCAAATGGTCAAATTTGGGATAAAGAATTTGATACTGACTTAAAACCAAGACTTCATGTAAATGCA CCATTTGTTTGTCAAAATAATTGTCCTGGTCAATTATTTGTAAAAGTTGCACCTAATTTAACAAATGAATATGATCCTGATGCA TCTGCTAATATGTCAAGAATTGTAACTTACTCAGATTTTTGGTGGAAAGGTAAATTAGTATTTAAAGCTAAACTAAGAGCCTC TCATACTTGGAATCCAATTCAACAAATGAGTATCAATGTAGATAACCAATTTAACTATGTACCAAGTAATATTGGAGGTATGA AAATTGTATATGAAAAATCTCAACTAGCACCTAGAAAATTATATTAACATACTTACTATGTTTTTATGCTTATTACATATTATT TTAAGATTAATTAAATTACAGCATAGAAATATTGTACTTGTACTTGATATAGGATTTAGAAGGTTTGTTATATGGTATACAAT AACTGTAAGAAATAGAAGAACATTTAGATCATAGTTAGTAGTTTGTTTTATAAAATGTATTGTAAACCATTAATGTATGTTGT TATGGTGTGGGTGGTTGGT Gen NS1 ATGTCTGGCAACCAGTATACTGAGGAAGTTATGGAGGGAGTAAATTGGTTGAAGAAACATGCAGAAAATGAAGCATTTTCGT TTGTTTTTAAATGTGACAACGTCCAACTAAATGGAAAGGATGTTCGCTGGAACAACTATACCAAACCAATTCAAAATGAAGA GCTAACATCTTTAGTTAGAGGAGCACAAACAGCAATGGATCAAACCGAAGAAGAAGAAATGGACTGGGAATCGGAAGTTGA TAGTCTCGCCAAAAAGCAAGTACAAACTTTTGATGCATTAATTAAAAAATGTCTTTTTGAAGTCTTTGTTTCTAAAAATATAG AACCAAATGAATGTGTTTGGTTTATTCAACATGAATGGGGAAAAGATCAAGGCTGGCATTGTCATGTTTTACTTCATAGTAAA AACTTACAACAAGCAACTGGTAAATGGCTACGCAGACAAATGAATATGTATTGGAGTAGATGGTTGGTGACTCTTTGTTCGGT AAACTTAACACCAACTGAAAAGATTAAGCTCAGAGAAATTGCAGAAGATAGTGAATGGGTGACTATATTAACATACAGACAT AAGCAAACAAAAAAAGACTATGTTAAAATGGTTCATTTTGGAAATATGATAGCATATTACTTTTTAACAAAGAAAAAAATTG TCCACATGACAAAAGAAAGTGGCTATTTTTTAAGTACTGATTCTGGTTGGAAATTTAACTTTATGAAATATCAAGACAGACAA ATTGTCAGCACACTTTACACTGAACAAATGAAACCAGAAACCGTTGAAACCACAGTGACGACAGCACAGGAAACAAAGCGC GGGAGAATTCAAACTAAAAAGGAAGTGTCAATCAAATGTACTTTGCGGGACTTGGTTAGTAAAAGAGTAACATCACCTGAAG ACTGGATGATGTTACAACCAGATAGTTATATTGAAATGATGGCACAACCAGGAGGTGAAAATCTTTTAAAAAATACACTTGA AATTTGTACTTTGACTTTAGCAAGAACAAAAACAGCATTTGAATTAATACTTGAAAAAGCAGATAATACTAAGCTAACTAACT TTGATCTTGCAAATTCTAGAACATGTCAAATTTTTAGAATGCACGGATGGAATTGGATT.AAAGTTTGTCACGCTATAGCGTGT GTTTTAAATAGACAAGGTGGTAAAAGAAATACAGTTCTTTTTCATGGACCAGCAAGTACAGGAAAATCTATCATTGCTCAAG CCATAGCACAAGCTGTGGGTAATGTTGGTTGTTATAATGCAGCAAATGTAAATTTTCCATTTAATGACTGTACCAAT.AAAAAT TTAATTTGGATT(iAAGAAGCTGGTAACTTTGGTCAACAAGTTAATCAATTTAAAGCAATCT(iTTCTGGACAAACAATTAGAAT TGATCAAAAAGGTAAAGGAAGTAAGCAAATTGAACCAACTCCAGTAATTATGACAACTAATGAAAATATAACAATTGTGAG AATTGGATGTGAAGAAAGACCTGAACATACACAACCAATAAGAGACAGAATGTTGAACATTAAGCTAGTATGTAAGCTTCCA GGAGACTTTGGTTTGGTTGATAAAGAAGAATGGCCTTTAATATGTGCATGGTTAGTTAAGCATGGTTTTGTATCAACCATGGC TAACTATACACATCACTGGGGAAAAGTACCAGAATGGGATGAAAACTGGGCGGAGCCTAAAATACAAGAAGGTATAAATTC 63 ACCAGGTTGCAAAGACTTAGAGACACAAGCGGCAAGCAATCCTCAGAGTCAAGACCAAGTTCTAACTCCTCTGACTCCGGAC GTAGTGGACCTTGCACTGGAACCGTGGAGTACTCCAGATACGCCTATTGCAGAAACTGCAAATCAACAATCAAACCAACCTG GCGTTACTCACAAAGACGTGCAAGCGAGTCCAACGTGGTCCGAAATAGAGGCAGACCTGAGAGCCATCTTTACTTCTGAACA ATTGGAAGAAGATTTTCGAGACGACTTGGATTAA Gen NS2 ATGTCTGGCAACCAGTATACTGAGGAAGTTATGGAGGGAGTAAATTGGTTGAAGAAACATGCAGAAAATGAAGCATTTTCGT TTGTTTTTAAATGTGACAACGTCCAACTAAATGGAAAGGATGTTCGCTGGAACAACTATACCAAACCAATTCAAAATGAAGA GCTAACATCTTTAGTTAGAGGAGCACAAACAGCAATGGATCAAACCGAAGAAGAAGAAATGGACTGGGAATCGGAAGTTGA TAGTCTCGCCAAAAAGCAAGTACAAACTTTTGATGCATTAATTAAAAAATGTCTTTTTGAAGTCTTTGTTTCTAAAAATATAG AACCAAATGAATGTGTTTGGTTTATTCAACATGAATGGGGAAAAGATCAAGGCTGGCATTGTCATGTTTTACTTCATAGTAAA AACTTACAACAAGCAACTGGTAAATGGCTACGCAGACAAATGAATATGTATTGGAGTAGATGGTTGGTGACTCTTTGTTCGGT AAACTTAACACCAACTGAAAAGATTAAGCTCAGAGAAATTGCAGAAGATAGTGAATGGGTGACTATATTAACATACAGACAT AAGCAAACAAAAAAAGACTATGTTAAAATGGTTCATTTTGGAAATATGATAGCATATTACTTTTTAACAAAGAAAAAAATTG TCCACATGACAAAAGAAAGTGGCTATTTTTTAAGTACTGATTCTGGTTGGAAATTTAACTTTATGAAATATCAAGACAGACAA ATTGTCAGCACACTTTACACTGAACAAATGAAACCAGAAACCGTTGAAACCACAGTGACGACAGCACAGGAAACAAAGCGC GGGAGAATTCAAACTAAAAAGGAAGTGTCAATCAAATGTACTTTGCGGGACTTGGTTAGTAAAAGAGTAACATCACCTGAAG ACTGGATGATGTTACAACCAGATAGTTATATTGAAATGATGGCACAACCAGGAGGTGAAAATCTTTTAAAAAATACACTTGA AATTTGTACTTTGACTTTAGCAAGAACAAAAACAGCATTTGAATTAATACTTGAAAAAGCAGATAATACTAAGCTAACTAACT TTGATCTTGCAAATTCTAGAACATGTCAAATTTTTAGAATGCACGGATGGAATTGGATTAAAGTTTGTCACGCTATAGCGTGT GTTTTAAATAGACAAGGTGGTAAAAGAAATACAGTTCTTTTTCATGGACCAGCAAGTACAGGAAAATCTATCATTGCTCAAG CCATAGCACAAGCTGTGGGTAATGTTGGTTGTTATAATGCAGCAAATGTAAATTTTCCATTTAATGACTGTACCAATAAAAAT TTAATTTGGATTGAAGAAGCTGGTAACTTTGGTCAACAAGTTAATCAATTTAAAGCAATCTGTTCTGGACAAACAATTAGAAT TGATCAAAAAGGTAAAGGAAGTAAGCAAATTGAACCAACTCCAGTAATTATGACAACTAATGAAAATATAACAATTGTfjAG AATTGGATGTGAAGAAAGACCTGAACATACACAACCAATAAGAGACAGAATGTTGAACATTAAGCTAGTATGTAAGCTTCCA GGAGACTTTGGTTTGGTTGATAAAGAAGAATGGCCTTTAATATGTGCATGGTTAGTTAAGCATGGTTTTGTATCAACCATGGC TAACTATACACATCACTGGGGAAAAGTACCAGAATGGGATGAAAACTGGGCGGAGCCTAAAATACAAGAAGGTATAAATTC ACCAGGTTGCAAAGACTTAGAGACACAAGCGGCAAGCAATCCTCAGAGTCAAGACCAAGTTCTAACTCCTCTGACTCCGGAC GTAGTGGACCTTGCACTGGAACCGTGGAGTACTCCAGATACGCCTATTGCAGAAACTGCAAATCAACAATCAAACCAACCTG GCGTTACTCACAAAGACGTGCAAGCGAGTCCAACGTGGTCCGAAATAGAGGCAGACCTGAGAGCCATCTTTACTTCTGA Gen VP1 ATGGCACCTCCGGCAAAGAGAGCCAGGAGAGGTAAGGGTGTGTTAGTGAAGTGGGGGGAGGGGAAAGATTTAATAACTTAA CTAAGTATGTATTTTTTTGTAGGACTTGTGCCTCCAGGTTATAAATATCTTGGGCCTGGGAACAGTCTTGACCAAGGAGAACC AACTAACCCTTCTGACGCCGCTGCAAAAGAACACGACGAAGCTTACGCTGCTTATCTTCGCTCTGGTAAAAACCCATACTTAT ATTTCTCGCCAGCAGATCAACGCTTTATAGATCAAACTAAGGACGCTAAAGATTGGGGGGGGAAAATAGGACATTATTTTTTT AGAGCTAAAAAGGCAATTGCTCCAGTATTAACTGATACACCAGATCATCCATCAACATCAAGACCAACAAAACCAACTAAAA GAAGTAAACCACCACCTCATATTTTCATCAATCTTGCAAAAAAAAAAAAAGCCGGTGCAGGACAAGTAAAAAGAGACAATCT TGCACCAATGAGTGATGGAGGAGTTCAACCAGACGGTGGTCAACCTGCTGTCAGAAATGAAAGAGCTACAGGATCTGGGAA CGGGTCTGGAGGCGGGGGTGGTGGTGGTTCTGGGGGTGTGGGGATTTCTACGGGTACTTTTAATAATCAGACGGAATTTAAA TTTTTGGAAAACGGATGGGTGGAAATCACAGCAAACTCAAGCAGACTTGTGCATTTAAATATGCCAGAAAGTGAAAATTATA GAAGAGTGGTTGTAAATAATTTGGATAAAACTGCAGTTAACGGAAACATGGCTTTAGATGATACTCATGCACAAATTGTAAC ACCTTGGTCATTGGTTGATGCAAATGCTTGGGGAGTTTGGTTT.AATCCAGGAGATTGGCAACTAATTGTTAATACTATGAGTG AGTTGCATTTAGTTAGTTTTGAACAAGAAATTTTTAATGTTGTTTTAAAGACTGTTTCAGAATCTGCTACTCAGCCACCAACTA AAGTTTATAATAATGATTTAACTGCGTCATTGATGGTTGCATTAGATAGTAATAATACTATGCCATTTACTCCAGCAGCTATG AGATCTGAGACATTGGGTTTTTATCCATGGAAACCAACCATACCAACTCCATGGAGATATTACTTTCAATGGGATAGAACATT AATACCATCTCATACTGGAACTAGTGGCACACCAACAAATATATACCATGGTACAGATCCAGATGATGTTCAATTTTACACTA TTGAAAATTCTGTGCCAGTACACTTACTAAGAACAGGTGATGAATTTGCTACAGGAACATTTTATTTTGATTGTAAACCATGT AGACTAACACATACATGGCAAACAAACAGAGCATTGGGCTTACCACCATTTCTAAATTCTTCGCCTCAAGCTGAAGGAGGTA CTAACTTTGGTTATATAGGAGTCCAACAAGATAAAAGACGTGGTGTAACTCAAATGGGAAACACAAACATTATCACTGAAGC 64 TACTATTATGAGACCAGCTGAGGTTGGTTATAGTGCACCATATTATTCTTTTGAGGCGTCTACACAAGGGCCATTTAAAACAC CTATTGCAGCAGGACGGGGGGGAGCGCAAACAGATGAAAATCGAGCAGCAGATGGTGATCCAAGATATGCATTTGGTAGAC AACATGGTCAAAAAACTACCACAACAGGAGAAACACCTGAGAGATTTACATATATAGCACATCAAGATACAGGAAGATATC CAGAAGGAGATTGGATTCAAAATATTAACTTTAACCTTCCTGTAACAGAAGATAATGTATTGCTACCAACAGATCCAATTGGA GGTAAAACAGGAATTAACTATACTAATATGTTTAATACTTATGGTCCTTTAACTGCATTAAATAATGTACCACCAGTTTATCC AAATGGTCAAATTTGGGATAAAGAATTTGATACTGACTTAAAACCAAGACTTCATGTAAATGCACCATTTGTTTGTCAAAATA ATTGTCCTGGTCAATTATTTGTAAAAGTTGCACCTAATTTAACAAATGAATATGATCCTGATGCATCTGCTAATATGTCAAGA ATTGTAACTTACTCAGATTTTTGGTGGAAAGGTAAATTAGTATTTAAAGCTAAACTAAGAGCCTCTCATACTTGGAATCCAAT TCAACAAATGAGTATCAATGTAGATAACCAATTTAACTATGTACCAAGTAATATTGGAGGTATGAAAATTGTATATGAAAAA TCTCAACTAGCACCTAGAAAATTATATTAA Gen VP2 ATGAGTGATGGAGGAGTTCAACCAGACGGTGGTCAACCTGCTGTCAGAAATGAAAGAGCTACAGGATCTGGGAACGGGTCT GGAGGCGGGGGTGGTGGTGGTTCTGGGGGTGTGGGGATTTCTACGGGTACTTTTAATAATCAGACGGAATTTAAATTTTTGGA AAACGGATGGGTGGAAATCACAGCAAACTCAAGCAGACTTGTGCATTTAAATATGCCAGAAAGTGAAAATTATAGAAGAGT GGTTGTAAATAATTTGGATAAAACTGCAGTTAACGGAAACATGGCTTTAGATGATACTCATGCACAAATTGTAACACCTTGGT CATTGGTTGATGCAAATGCTTGGGGAGTTTGGTTTAATCCAGGAGATTGGCAACTAATTGTTAATACTATGAGTGAGTTGCAT TTAGTTAGTTTTGAACAAGAAATTTTTAATGTTGTTTTAAAGACTGTTTCAGAATCTGCTACTCAGCCACCAACTAAAGTTTAT AATAATGATTTAACTGCGTCATTGATGGTTGCATTAGATAGTAATAATACTATGCCATTTACTCCAGCAGCTATGAGATCTGA GACATTGGGTTTTTATCCATGGAAACCAACCATACCAACTCCATGGAGATATTACTTTCAATGGGATAGAACATTAATACCAT CTCATACTGGAACTAGTGGCACACCAACAAATATATACCATGGTACAGATCCAGATGATGTTCAATTTTACACTATTGAAAAT TCTGTGCCAGTACACTTACTAAGAACAGGTGATGAATTTGCTACAGGAACATTTTATTTTGATTGTAAACCATGTAGACTAAC ACATACATGGCAAACAAACAGAGCATTGGGCTTACCACCATTTCTAAATTCTTTGCCTCAAGCTGAAGGAGGTACTAACTTTG GTTATATAGGAGTCCAACAAGATAAAAGACGTGGTGTAACTCAAATGGGAAACACAAACATTATCACTGAAGCTACTATTAT GAGACCAGCTGAGGTTGGTTATAGTGCACCATATTATTCTTTTGAGGCGTCTACACAAGGGCCATTTAAAACACCTATTGCAG CAGGACGGGGGGGAGCGCAAACAGATGAAAATCGAGCAGCAGATGGTGATCCAAGATATGCATTTGGTAGACAACATGGTC AAAAAACTACCACAACAGGAGAAACACCTGAGAGATTTACATATATAGCACATCAAGATACAGGAAGATATCCAGAAGGAG ATTGGATTCAAAATATTAACTTTAACCTTCCTGTAACAGAAGATAATGTATTGCTACCAACAGATCCAATTGGAGGTAAAACA GGAATTAACTATACT.AATATGTTTAATACTTATGGTCCTTTAACTGCATTAAATAATGTACCACCAGTTTATCCAAATGGTCAA ATTTGGGATAAAGAATTTGATACTGACTTAAAACCAAGACTTCATGTAAATGCACCATTTGTTTGTCAAAATAATTGTCCTGG TCAATTATTTGTAAAAGTTGCACCTAATTTAACAAATGAATATGATCCTGATGCATCTGCTAATATGTCAAGAATTGTAACTT ACTCAGATTTTTGGTGGAAAGGTAAATTAGTATTTAAAGCTAAACTAAGAGCCTCTCATACTTGGAATCCAATTCAACAAATG AGTATCAATGTAGATAACCAATTTAACTATGTACCAAGTAATATTGGAGGTATGAAAATTGTATATGAAAAATCTCAACTAGC ACCTAGAAAATTATATTAA 65 Phụ lục Các chủng tham chiếu gen NS1 STT Mã số Chung Quốc gia Năm EU659120 CPV-2b USA 1998 EU659119 CPV-2b USA 2000 MF177239 CPV-2c Italy 2001 MF177238 CPV-2c Italy 2005 MF177227 CPV-2c France 2009 KM457142 CPV-2c Uruguay 2011 KM457140 CPV-2a Uruguay 2011 KM457138 CPV-2a Uruguay 2011 MF177269 CPV-2a Ecuador 2011 10 MF177268 CPV-2a Ecuador 2011 11 LC214969 CPV-2c VNM 2013 12 KR002800 CPV-2c China 2014 13 KU508692 CPV-2c Australia 2015 14 KU508693 CPV-2c Australia 2015 15 MF510158 CPV-2c Italy 2016 16 MH711902 CPV-2c Thailand 2016 17 MH476592 CPV-2c China 2017 18 MH476583 CPV-2c China 2017 19 MG013488 CPV-2a China 2017 20 MG434741 CPV-2a Italy 2017 21 MG434743 CPV-2a Italy 2017 22 MN832850 CPV-2c Taiwan 2018 23 MK895486 CPV-2c Nigeria: Makurdi 2018 24 MK895490 CPV-2c Nigeria: Jos 2018 25 MH545963 CPV-2a India 2018 26 MH165482 FPV China 2014 66 Phụ lục Các chủng tham chiếu gen VP2 STT Mã số Chủng Quốc gia Năm FJ005202 CPV-2c Germany 1997 FJ222821 CPV-2c Italy 2000 AB120727 CPV-2c VNM 2003 AY742953 CPV-2a USA 2003 DỌ025985 CPV-2c France 2005 DỌ025962 CPV-2a France 2005 AB128923 CPV-2Ồ Japan 2005 DỌ025992 CPV-2Ồ France 2005 FJ005233 CPV-2c Italy 2007 10 JN867607 CPV-2c USA 2008 11 GỌ379043 CPV-2a Thailand 2008 12 GỌ379048 CPV-2a Thailand 2009 13 JF414818 CPV-2c Argentina 2010 14 KM083037 CPV-2a China 2010 15 KM083036 CPV-2a China 2010 16 KJ813883 CPV-2c USA 2012 17 KJ813879 CPV-2b USA 2012 18 KF149969 CPV-2c Ecuador 2013 19 KJ438804 CPV-2a China 2013 20 KF149972 CPV-2b Ecuador 2013 21 KJ813892 CPV-2b USA 2013 22 KY922910 CPV-2c China 2016 23 KY922907 CPV-2c China 2016 24 MK357721 CPV-2c VNM 2016 25 MF001438 CPV-2a China 2016 26 KY937656 CPV-2b China 2016 27 MK357725 CPV-2c VNM 2017 28 MH476587 CPV-2c China 2017 29 MH660525 CPV-2c China 2018 30 MK357735 CPV-2c VNM 2018 31 MH660524 CPV-2b China 2018 32 MN119593 CPV-2b China 2019 33 MH165482 FPV China 2014 67 Phụ lục Bảng thống kê tỷ lệ mẫu dưong tính với phương pháp PCR STT Ngày xử lý mẫu Ngày PCR PCR mẫu 555 F-R 01 17/6/2020 20/6/2020 + 02 17/6/2020 20/6/2020 + 03 17/6/2020 20/6/2020 + 04 17/6/2020 20/6/2020 + 05 17/6/2020 20/6/2020 + 06 17/6/2020 20/6/2020 + 07 20/6/2020 22/6/2020 + 08 20/6/2020 22/6/2020 + 09 20/6/2020 22/6/2020 + 10 23/6/2020 23/6/2020 + 11 23/6/2020 23/6/2020 - 12 23/6/2020 23/6/2020 - 13 4/7/2020 5/6/2020 — 68 Phụ lục Thang HyperLadder™ Ikb SIZE (bp) ng/BAND - 10037 8000 - 6000 - 5000 4000 - 3000 - 2500 100 80 60 50 40 30 25 2000 20 -1500/1517 15/15 - 1000 100 - 800 80 - 600 60 - 400 40 - 200 20 - 69 Phụ lục Bảng so sánh mức độ tương đông gen VP2 CPV-2c/canlD 0,9% 0,9% 0,993 0,9% 0,9% 0,993 0,9% 0,9® 0.9® 0.9® 0.9® 09® 0,588 0.988 0,588 0,9® 0,9® 0,9® 0.988 0,989 0,986 0.9® 0,9® 0.987 0,587 0,986 0,5® 0,966 0.987 0,987 0,983 0,983 0,977 0,9% 0,993 0,®6 0,9% 0,993 0,991 0,9% 0.9® 0.989 0.9® 0.9® 0,9® 0,989 0.989 0,568 0,9® 0.9® 0,9® 0,9® 0,99 0987 0.9® 0,587 0.9® 0,9® 0,986 0,987 0,566 0.9® 0,®8 0,985 0,984 977 0,993 0,9% 0,9% 0.994 0,991 0,9% 0,9® 0.9® 0.9® 0.9® 0,9® 0,988 0.988 0,588 09® 0.9® 0,9® 0.988 0,989 0,986 0.9® 0,586 0.987 0,587 0,986 0,5® 0,566 0,987 0,987 0,983 (X983 0,977 0,9% 0,9% 0,993 0,991 0,995 0,9® 0,989 0,9® 0,9® 09® 0,988 0,988 0,568 0,9® 0.9® 0,9® 0,9® 0,989 0.986 0.9® 0,5® 0.9® 0,9® 0.®6 0,®7 0,986 0,9® 0,987 0,9® o.®3 0,977 0,958 0,995 0,997 0,998 0,99 0,991 0,99 0.992 099 0,99 0.992 0,9® 0,992 0.9® 0,992 0.9® 0,993 0.® 0,992 0,99 0,991 0,991 0,® 0,99 0,99 0,991 0991 0,987 0,987 0,961 0,997 0,998 0,999 0,992 0,992 0.992 0,993 0992 0,992 Q®2 0,9® 0992 0.992 0,992 0,992 0,993 0,99 0,992 0,99 0.991 0,991 0,® 0,99 0,99 0,991 0991 0,987 0.987 0,561 0,997 0,997 0,99 0,99 099 0991 0991 0,99 0,® 0,99 0,99 0.® 0,99 0,99 0,992 0,9® 0,99 0,989 0,9® 0,989 a®8 0,989 0,9® 0.9® 0.9® 0,985 0,®5 0,979 0,998 0,991 0,992 0,991 0992 0,992 0,991 0.992 0,991 0,991 0.992 0,991 0,991 0,993 0.99 0,991 0,99 a® 0,99 0,989 0,99 0,989 a® a® 0,9® 0,986 0,58 0,992 0993 0,992 0993 0.9® 0,992 0993 0,992 0992 0,993 0,992 0,992 0,9% 0,991 0,992 0,991 0.992 0,992 0,® 0991 0,99 0.992 0,992 0,9® 0,988 0,981 0,998 0998 09® 0,9% 0,992 0,9® 0,992 0.992 0,992 0,9® 0,993 0,989 0,993 0,993 0,993 0,993 0,992 0,993 0,993 0.993 0,992 0,989 0.9® 0,9® 0999 09® 09® 0,997 0,®3 0.9® 0,992 o.®3 0,992 0,992 0,9% Q99 0,9® 0,993 0.9% 0,994 0.®3 0,993 0,9% 0.9% 0,993 0,® 0® 0,584 09® 0,997 0,9% 0992 0,992 0,992 0,992 0,992 0,9® 0,993 0.989 0,993 0,993 0,993 0,993 0.992 0,993 0,993 0,993 0,992 0,989 0.9® 0,5® 0.9® 0,9% 0,993 0.9® 0,993 0.993 0,993 0.993 0,9% Q® 0.9% 0,9% 0.9% 0,9% 0993 0,9% 0,993 0,993 0993 0,989 0.9® 0,5® 0,9% 0992 0,992 0,992 0.992 0,992 0,9® 0,993 0,989 0,993 0,993 0,993 0,993 0.992 0,993 0,992 0,992 0,992 0,9® 0,988 0,582 0,®l 0.99 0,99 0.991 0,99 0,99 0,992 0,989 0,992 0,992 0,991 0,991 0,® 0,99 0,991 0,993 0.991 0,9® 0,9® 0,582 0,9® 0,998 0.9® 0,958 0,9® 0,958 0,994 0,997 0,5% 0.9% 0,9% Q995 0,9% 0,995 0,9% 0.9% 0,®2 0,992 0,9® 997 0.9® 0,997 0,9® 0,998 0.994 0.9% 0,995 0.9% 0,9% 0,9% 0,9% 0,9% 0.9% 0.9% 0992 0,992 0,565 0.9® 0,997 0,997 0,958 0,994 0.9% 0,995 0.995 0,9% 09% 0,9% 0,9% 0,9% 0.9% 0992 0,992 0,9® 0,998 0,9® 0,998 0,994 0,997 0,9% 0.9% 0,9% 0.®5 0,9% 0,995 0.9% 0.9% 0,992 0.992 0,566 0.9® 0,998 0,994 0.9% 0,995 0,995 0,9% 0,994 0,9% 0,9% 0.9% 0.9% 992 0,992 0,5® 0,998 0,994 0.9% 0,995 0.9% 0,9% 0994 0,9% 0,9% 0.9% 0.9% 992 0992 0,5® 0,9% 0.9® 0,997 0.997 0,997 0,996 0,9% 0,9% 0,997 0997 993 0,993 0,587 0,9% 0,994 o.®3 0,993 0,992 0,992 0,992 0,993 o.®3 0,989 0.9® 0,5® 0,9% 0.9% 0,9% 09% 0,995 0,9% 0.9% 0.9% 0,992 0992 0,9® 0.9% 0,9% 0,9% 0,995 0,9% 0.9% 0,996 0,992 0,992 0,9® 1.000 09® 0,9% 0,9% 0997 0.9% 0,992 0992 0,9® 09® 0,9% 0,9% 0.9® 0.9% 0,992 0.992 0,5® 0,9% 0,995 0.9% 0,995 0,991 0991 0,9® 0,9% 0.9% 0,994 0,® 0.® 0,984 0.9% 0,995 0,992 0,992 0,9® 0.9% 0,993 a®3 0,987 0993 0,993 0,987 0,998 0,9® MK35772V 0,9% ID MK357K/ 0,995 0,9% ID MKỉsras/ 0,993 0,993 0,993 ID CPV-2c/can 0,9% 0,9% 0,9% 0,9% ID MH476587/ 0,9% 0,9% 0,9% 0,9% 0,99810 Wffilit 0,993 0,993 0,991 0,993 0.9% 0,997 ID raw 0,994 0,994 0,991 0,994 0,997 0,958 0,997 ID MH660525/ 0,9% 0,9% 0,9% 0,995 0,998 0,999 0,997 0,998 KJ4388M/C Q9S8 0,988 0,988 0,968 0,99 0,992 0,99 0,991 0,992 ID GQ3W 0,9® 0,989 0,988 0,9® 0,991 0,992 0,99 0,992 0,993 0,999 ID GQ3J9W 0,988 0,988 0,988 0,5® 0,99 0,992 0,99 0,991 0,992 0,998 0.999 ID MN115593/ 0,9® 0,989 0,989 0,989 0,992 0,993 0,991 0,992 0,993 0,998 0.999 0.9® ID tnw 0,988 0,988 0,988 0,5® 0,99 0,992 0,991 0,992 0,992 0,997 0.998 0,997 09® MHB1W 0,968 0,989 0,988 0,9® 0,99 0,992 0,99 0,991 0,992 0,9% 0,997 0995 09% 0,995 ID FJOOS233/C 0,988 0,989 0,988 0,9® 0,992 0,992 0,® 0,992 0,993 0992 0,993 0,992 0.993 0,9® KJ813883/C 0,968 0,988 0,988 0,9® 0,992 0,992 0,99 0,991 0,992 0,992 0,992 0992 0993 09® 0,99 0,998 ID JHM81SC 0,988 0,988 0,988 0,9® 0,992 0,992 U99 0,991 0,992 0992 0,992 0992 0.993 0,9® 0,99 0,998 0,997 ID FJC06202/C 0,968 0,989 0,588 0,5® 0,992 0,992 0,99 0,992 0,993 0,992 0,993 0992 0993 09® 0,991 0,998 0,9® 0.998ID MOW 0,988 0,988 0,988 0,5® 0,992 0,992 0,® 0,991 0,992 0,992 0,992 0,992 0993 0.9® 0,99 0,998 0,997 0,997 0.9® ID KHAW 0,968 0,988 0,588 0,5® 0,992 0,992 0,99 0,991 0,992 0,992 0,992 0.992 0993 09® 0,99 0,998 0,9® 0997 0.9® 0,99710 FJ22282VC 0,989 0,99 0,589 0,989 0,993 0,993 0,992 0,993 0994 0,993 0.994 0993 0.994 09® 0,992 0998 0,998 0,998 0.9® 0,958 0.9® ID AB120727/C 0,9® 0,987 0,586 0,9® 0,99 0,99 0,989 a® 0,991 0,989 099 0989 0® 09® 0,5® 0,994 0,594 0,994 0,9% 0,9% 0,9% 0,9% ID Jfi867ẼO7/C 0,988 0,988 0,588 0,9® 0,992 0,992 0.99 0,991 0,992 0993 0,993 0993 0994 0,993 0,992 0997 0,9% 0,9% 0.9® 0,9% 0.9% 0,998 0,994 ID MH66CS24/ 0,988 0,987 0,586 0,9® 0,99 0,99 0,989 0,99 0,991 0,993 0,993 0,993 0.994 0.9® 0,992 0,996 0,5% 0,9% 0.9% 0,9% 0,9% 0,997 0.994 0.9% ID KF1499WC 0,987 988 0,587 0,9® 0,991 0,991 0,989 0,99 0,992 0993 0.994 0,993 0994 0,993 0,991 996 0,9% 0,9% 0.9% 0,9% 0.9% 0,997 0,993 0.9% 0,9% ID K181W 0,987 0,988 0,987 0,5® 0,991 0,991 0,989 0,99 0,992 0,993 0.994 0993 0994 09® 0,991 o.®6 0,9% 0,9% 0.9% 0,9% 0.9% 0,997 0,993 0.9% 0,9% LOGO ID KJ813892/C 0,968 0,986 0,5® 0,5® 0,99 0,99 0.9® 0,589 0,99 0,992 0.993 0992 0.9® 0,992 0,99 0,995 0.9% 0,994 0.995 0,9% 0.9% 0,9% 0,992 0.9% 0,9% 0.9® 0,958 ID AB12S92W 0,988 0,987 0,5® 0,587 0,99 0,59 0.989 0,99 0,991 0,993 0,993 0993 0.994 09® 0,99 0994 0,9% 0,994 0.9% 0,9% 0.9% 0,9% 0,992 0.995 0,995 0.9% 0,9% 09% ID MOW 0,986 0,986 0,5® 0,5® 0,99 0,99 0.9® 0,589 0.99 0993 0,994 0993 09® 0,992 0,991 0,995 0.9% 0,994 0.995 0,9% 0.9% 0,9% 0,992 0.9% 0,9% 0.9% 0,9% 0,995 0,9% ID AWA25S3/C 0987 0,988 0,587 0,587 0,991 0,991 0,989 0,99 0,992 0,993 0,994 0993 09® 0992 0,993 0,9% 0,9% 0,9% 0.9% 0,9% 0.9% 0,997 0,993 0.9% 0,5% o.®7 0,9® 09% 0,9% 0,9% ID tXMW 0,987 0,988 0,987 0,987 0,991 0,991 0,989 0,99 0,992 0,992 0,993 0992 0.993 0,992 0,991 0.9% 0,9% 0,9% 0.9% 0,9% 0.9% 0,997 0,993 0.9% 0,9% 0.9% 0,9% 0,995 0,9% 0,995 0.9% ID M3O37;1 0,983 0,985 0,583 0,5® 0,987 0,987 0.985 0,985 0,9® 0,989 0.99 0,9® 0.9® 09® 0,988 0,992 0,9® 0992 0,992 0,992 0,9® 0,993 0.5® 0,992 0,992 0.992 0,992 0991 0,99 0,9® 0,993 0,993 ID M3Ữ3&' 0,983 0,984 0,583 0,9® 0,987 0,987 0.935 0,9® 0.5® 0,989 099 0.9® 0.9® 0.9® 0,988 0992 0,9® 0992 0,992 0,992 0,992 0,993 0.9® 0,992 0,592 0,992 0,992 0991 0,99 0,992 0,993 Q®3 0,998ID FPV-B105/C 0,977 0,977 0,977 0,977 0,981 0,981 0,979 0,® 0,581 0,983 0.984 09® 0,983 0982 0,982 0,986 0,985 0,985 0,9® 0,585 0,985 0,987 0,983 0,985 0,9® 0,986 0,966 0,®5 0,584 0,566 0,987 o.®7 0,989 ID 0,999 ID 0,99110 70 0,9® 0.9® ID Phụ lục Bảng so sánh mức độ tương đông gen NS1 EU65912O, EU659119, KM4571C KM457138 MF177238 MF177239 KU5O8692 KU5O8693 KM457142 MF177227 MF510158 LC214969/ MN83285Í Par-24/CP Par-21/CP MK89549C MH476582 MG013488 KR002800, MH476592 MH711902 MK895486 MH54596; MG434741MG43474; MF177269 MF 177268 FPV-BJ05/ EU65912O/ ID 1.000 0,994 0,995 0,997 0,997 0,992 0,992 0,995 0,996 0,996 0,992 0,991 0,992 0,992 0,992 0,992 0,992 0,992 0,992 0,992 0,991 0,99 0,994 0,994 0,995 0,995 0,993 0,994 0,995 0,997 0,997 0,992 0,992 0,995 0,996 0,M6 0,992 0,991 0,992 0,992 0,992 0,992 0,992 0,992 0,992 0,992 0,991 0,99 0,994 0,994 0,995 0,995 0,993 0,999 0,994 0,994 0,99 0,99 0,993 0,994 0,993 0,99 0,989 0,99 0,99 0,99 0,99 0,99 0,99 0,99 0,989 0,989 0,988 0,992 0,992 0,993 0,992 0,99 0,995 0,995 0,991 0,991 0,994 0,995 0,994 0,991 0,99 0,991 0,991 0,991 0,991 0,991 0,991 0,991 0,99 0,99 0,989 0,993 0,993 0,994 0,993 0,991 1.000 0,995 0,995 0,998 0,999 0,999 0,992 0,991 0,992 0,992 0,992 0,992 0,992 0,992 0,992 0,992 0,992 0,99 0,994 0,994 0,995 0,995 0,992 0,995 0,995 0,998 0,999 0,999 0,992 0,991 0,992 0,992 0,992 0,992 0,992 0,992 0,992 0,992 0,992 0,99 0,994 0,994 0,995 0,995 0,992 1.000 0,997 0,995 0,994 0,988 0,987 0,988 0,988 0,988 0,988 0,988 0,988 0,988 0,987 0,988 0,985 0,99 0,99 0,991 0,99 0,989 0,997 0,995 0,994 0,988 0,987 0,988 0,988 0,988 0,988 0,988 0,988 0,988 0,987 0,988 0,985 0,99 0,99 0,991 0,99 0,989 0,998 0,997 0,991 0,99 0,991 0,991 0,991 0,991 0,991 0,991 0,991 0,99 0,991 0,988 0,993 0,993 0,994 0,993 0,992 0,M8 0,992 0,991 0,992 0,992 0,992 0,992 0,992 0,992 0,992 0,991 0,992 0,99 0,994 0,994 0,995 0,994 0,992 0,992 0,991 0,992 0,992 0,992 0,992 0,992 0,992 0,992 0,992 0,992 0,989 0,993 0,993 0,994 0,994 0,991 0,998 0,998 0,998 0,998 0,998 0,998 0,998 0,998 0,997 0,997 0,988 0,992 0,992 0,992 0,991 0,989 0,999 0,999 0,999 0,999 0,999 0,999 0,999 0,998 0,998 0,989 0,992 0,992 0,992 0,991 0,988 1.000 1.000 1.000 1.000 1.000 1.000 0,999 0,999 0,99 0,993 0,993 0,993 0,992 0,989 1.000 1.000 1.000 1.000 1.000 0,999 0,999 0,99 0,993 0,993 0,993 0,992 0,989 1.000 1.000 1.000 1.000 0,999 0,999 0,99 0,993 0,993 0,993 0,992 0,989 1.000 1.000 1.000 0,999 0,999 0,99 0,993 0,993 0,993 0,992 0,989 1.000 1.000 0,999 0,999 0,99 0,993 0,993 0,993 0,992 0,989 1.000 0,999 0,999 0,99 0,993 0,993 0,993 0,992 0,989 0,999 0,999 0,99 0,993 0,993 0,993 0,992 0,989 0,998 0,99 0,992 0,992 0,992 0,992 0,988 0,989 0,992 0,992 0,992 0,991 0,988 EU659119/ 1.000 ID KM457140/ 0,994 0,994 ID KM457138/ 0,995 0,995 0,999 ID MF177238/ 0,997 0,997 0,994 0,995 ID MF177239/ 0997 0,997 0,994 0,995 1.000 ID KU5O8692/ 0,992 0,992 0,99 0,991 0,995 0,995 ID KU5O8693/ 0,992 0,992 0,99 0,991 0,995 0,995 1.000 KM457142/ 0,995 0,995 0,993 0,994 0,998 0,998 0,997 0,997 ID MF177227/ 0,996 0,996 0,994 0,995 0,999 0,999 0,995 0,995 0,998 ID MF510158/ 0,996 0,996 0,993 0,994 0,999 0,999 0,994 0,994 0,997 0,998 ID LC214969/C 0,992 0,992 0,99 0,991 0,992 0,992 0,988 0,988 0,991 0,992 0,992 ID MN83285Q 0,991 0,991 0,989 0,99 0,991 0,991 0,987 0,987 0,99 0,991 0,991 0,998 ID Par-24/CP\ 0,992 0,992 0,99 0,991 0,992 0,992 0,988 0,988 0,991 0,992 0,992 0,998 0,999 ID Par-21/CP\ 0,992 0,992 0,99 0,991 0,992 0,992 0,988 0,988 0,991 0,992 0,992 0,998 0,999 1.000 ID MK895490/ 0,992 0,992 0,99 0,991 0,992 0,992 0,988 0,988 0,991 0,992 0,992 0,998 0,999 1.000 1.000 ID MH476583, 0,992 0,992 0,99 0,991 0,992 0,992 0,988 0,988 0,991 0,992 0,992 0,998 0,999 1.000 1.000 1.000 ID MG013488, 0,992 0,992 0,99 0,991 0,992 0,992 0,988 0,988 0,991 0,992 0,M2 0,998 0,999 1.000 1.000 1.000 1.000 ID KR002800/ 0,992 0,992 0,99 0,991 0,992 0,992 0,988 0,988 0,991 0,992 0,992 0,998 0,999 1.000 1.000 1.000 1.000 1.000 ID MH476592, 0,992 0,992 0,99 0,991 0,992 0,992 0,988 0,988 0,991 0,992 0,992 0,998 0,999 1.000 1.000 1.000 1.000 1.000 1.000 ID MH711902, 0,992 0,992 0,989 0,99 0,992 0,992 0,987 0,987 0,99 0,991 0,992 0,997 0,998 0,999 0,999 0,999 0,999 0,999 0,999 0,999 ID MK895486/ 0,991 0,991 0,989 0,99 0,992 0,992 0,988 0,988 0,991 0,992 0,992 0,997 0,998 0,999 0,999 0,999 0,999 0,999 0,999 0,999 ID 0,998 ID MH545963, 0,99 0,99 0,988 0,989 0,99 0,99 0,985 0,985 0,988 0,99 0,989 0,988 0,989 0,99 0,99 0,99 0,99 0,99 0,99 0,99 0,99 MG43474V 0,994 0,994 0,992 0,993 0,994 0,994 0,99 0,99 0,993 0,994 0,993 0,992 0,992 0,993 0,993 0,993 0,993 0,993 0,993 0,993 0,992 0,992 0,99 ID MG434743/ 0,994 0,994 0,992 0,993 0,994 0,994 0,99 0,99 0,993 0,994 0,993 0,992 0,992 0,993 0,993 0,993 0,993 0,993 0,993 0,993 0,992 0,992 0,99 1.000 ID MF177269/ 0,995 0,995 0,993 0,994 0,995 0,995 0,991 0,991 0,994 0,995 0,K4 0,992 0,992 0,993 0,993 0,993 0,993 0,993 0,993 0,993 0,992 0,992 0,99 0,995 0,995 ID MF177268/ 0,995 0,995 0,992 0,993 0,995 0,995 0,99 0,99 0,993 0,994 0,994 0,991 0,991 0,992 0,992 0,992 0,992 0,992 0,992 0,992 0,992 0,991 0,99 0,994 0,994 0,999 ID FPV-8JO5A 0,993 0,993 0,99 0,991 0,992 0,992 0,989 0,989 0,992 0,992 0,991 0,989 0,988 0,989 0,989 0,989 0,989 0,989 0,989 0,989 0,988 0,988 0,986 0,991 0,991 0,991 71 0,989 ID 0,99 0,99 0,99 0,99 0,986 1.000 0,995 0,994 0,991 0,995 0,994 0,991 0,999 0,991 0,99 0,99 ID ... chủng nghiên cứu thuộc nhóm với chúng CPV phân lập số nước Châu Á Đe tài: ? ?Giải trình tự phân tích gần đầy đủ genome parvovirus gây bệnh tiêu chảy cấp tính chó? ?? thực từ tháng 06-09/2020 Phịng thí... cung cấp thơng tin để chế tạo nên vaccine đặc hiệu với chủng thuộc địa Xuất phát từ tính cấp thiết trên, chúng tơi đề xuất đề tài ? ?Giải trình tự phân tích gần đầy đủ genome parvovirus gây bệnh tiêu. .. đại genome CPV Giải trình tự genome CPV Phân tích trình tự genome CPV phần mềm tin - sinh học Những kết đạt sau tháng nghiên cứu: - Chấn đoán phát 10 chùng CPVs mẫu phân chó tiêu chảy cấp tính