Việc thực hiện chính sách miễn giảm thuỷ lợi phí chính thức, toàn diện đến nay đã được 3 năm, với 2 Nghị định của Chính phủ đã được ban hành và rất nhiều văn bản hướng dẫn của Bộ Tài chính, Bộ Nông nghiệp và Phát triển nông thôn và các Bộ ngành liên quan. Mặc dù chính sách đã đạt được nhiều mặt tích cực như đã được đánh ở chương 3, nhưng quá trình thực hiện đã cho thấy nếu Chính phủ không có những điều chỉnh, bổ sung phù hợp sẽ gây rất nhiều khó khăn cho các địa phương trong quá trình thực hiện, đồng thời làm giảm hiệu quả sử dụng kinh phí từ nguồn miễn giảm thuỷ lợi phí, không nâng cao hiệu quả quản lý, khai thác công trình thuỷ lợi.
Một số vấn đề bất cập lẽ ra phải được sửa đổi, bổ sung ngay như mức thuỷ lợi
phí, đối tượng, phạm vi được miễn, giảm thuỷ lợi phí ở một số vùng hiện nay không
phù hợp, dẫn đến kết quả không triển khai thực hiện được những quy định của Nghị định 115. Như việc, hiện nay có nhiều địa phương khi thực hiện miễn giảm, tiếp nhận nguồn kinh phí thuỷ lợi phí về địa phương nhưng không thể sử dụng hết, vì nếu áp dụng theo đúng những quy định hiện hành thì không thể giải ngân hết số
kinh phí hoặc nếu giải ngân sẽ không phù hợp với các quy định của pháp luật. Chính
vì vấn đề này mà hiện nay, việc giải ngân kinh phí thực hiện chính sách miễn thuỷ lợi phí có khác nhau ở một số địa phương.
Mục tiêu của chương này không có ý định đưa ra những nội dung của chính
sách chính sách mới sẽ được ban hành, mà chủ yếu nêu mục tiêu và định hướng
những nội dung, vấn đề cần sửa đổi và một số giải pháp chủ yếu cần phải thực hiện, nhằm tạo hệ thống cơ chế chính sách đồng bộ, hợp lý trong công tác quản lý, khai thác công trình thuỷ lợi và tăng cường hiệu lực hiệu quả của chính sách đã ban hành. Trên cơ sở nghiên cứu thực tế, luận văn đưa ra một số những gợi ý mục tiêu cũng như định hướng nên sửa đổi trong chính sách mới.