Phối hợp tổ chức các hội nghị, hội thảo, khóa học chuyên đề quốc tế là một trong những hình thức phát huy tiềm lực trí tuệ, giao lưu văn hóa và tìm kiếm cơ hội hợp tác quốc tế hiệu quả. Trong những năm qua, đồng thời với việc tham gia các dự án nghiên cứu, Trường Đại học GTVT cũng kết hợp với các trường, viện nghiên cứu trong và ngoài nước, các doanh nghiệp nước ngoài tiến hành nhiều hội thảo quốc tế và khóa học chuyên đề với sự tham gia của hàng trăm nhà khoa học đầu ngành trong và ngoài nước. Tính đến nay, Nhà trường đã đồng tổ chức hơn 70 hội thảo quốc tế lớn nhỏ và hàng chục khóa học chuyên đề. Các khóa học, hội thảo này đã thu hút được nhiều sinh viên, giảng viên và các cán bộ kỹ thuật, chuyên gia đến từ nhiều cơ quan nghiên cứu, các tổng công ty hoạt động trong ngành. Đến nay, các khóa học này đã cấp chứng chỉ cho gần một nghìn học viên tham dự.
Nhiều hội nghị, hội thảo, báo cáo chuyên đề quốc tế đã được tổ chức thành công, điển hình như: Hội thảo “Phát triển mạng lưới giao thông nông thôn Việt Nam” phối hợp với Viện Công nghệ châu Á (AIT) và Tổ chức Lao động Thế giới (ILO) (1998); “Hội thảo khoa học Việt Nam-Nhật Bản lần thứ hai về tài chính dự án và quản lý hạ tầng giao thông” phối hợp với các doanh nghiệp Nhật Bản (2005); Hội thảo quốc tế “Qui hoạch và quản lý giao thông đô thị: kinh nghiệm quốc tế và khả năng ứng dụng tại Việt Nam, 12-2008” phối hợp với Trường ĐH Darmstadt bằng
nguồn tài trợ của Cơ quan trao đổi hàn lâm Đức DAAD (2008); Hội thảo quốc tế “Thiết kế kết cấu cọc ván thép và công nghệ thi công mới áp dụng ở Việt Nam”, hợp