Ở đõy ngoài việc phõn loại 2 chủng LT2 và LT8 bằng phƣơng phỏp truyền thống dựa trờn cỏc đặc điểm hỡnh thỏi, nuụi cấy, đặc điểm sinh lý, cả hai chủng LT2 và LT8 này đều thuộc chi Microcystis. Để xỏc định rừ 2 chủng thuộc loài nào của chi Microcystis chỳng tụi tiến hành phõn loại theo phƣơng phỏp sinh học phõn tử dựa trờn phõn tớch giải trỡnh tự rADN 16S. Đõy khụng phải là một cụng việc đơn giản và mỏy tớnh sẽ giỳp ta hoàn toàn cỏc tớnh toỏn cần thiết để tối thiểu hoỏ số khoảng trống và cỏc lỗi bắt cặp sai của cỏc trật tự đƣợc so sỏnh. Sự phõn loại dựa vào quỏ trỡnh phõn tớch mối quan hệ dựa trờn ADN trong tiến hoỏ của phõn loại
chủng loại phỏt sinh hoặc dựa vào những đặc điểm tƣơng tự nhau trong phõn loại hỡnh thỏi đều đƣợc thể hiện ở những sơ đồ dạng cõy gọi là cõy phả hệ. Cõy phả hệ cho phộp nhận biết mối quan hệ di truyền giữa cỏc loài và giữa cỏc chủng cựng loài. Sử dụng Cluxtal 18.1 và chƣơng trỡnh điện toỏn MEGA 2.1 cựng cỏc thụng số tiến hoỏ cần thiết cho thấy mối quan hệ đó đƣợc thiết lập trờn cơ sở phõn tớch phõn đoạn, so sỏnh giữa cỏc vựng bảo toàn của những đoạn gen rADN 16S.
Hỡnh 3.21. Cõy phả hệ dựa trờn phõn tớch giải trỡnh tự rADN 16S của 2 chủng LT2,
LT8 và cỏc loài cú quan hệ họ hàng gần
Cõy phả hệ (hỡnh 3.21) cho thấy mối quan hệ gần giữa chủng LT2 (đoạn gen 456bp) và LT8 (đoạn gen 457bp) với 13 trật tự nucleotit của cỏc chủng thuộc Cyanobacteria trong ngõn hàng dữ liệu gen. Chỳng nằm trờn cựng một nhỏnh và cựng nhúm với loài Microcystis aeruginosa EU078503 với độ tƣơng đồng là 100% (chủng LT2) và 99% (chủng LT8).
Cõy phả hệ vẽ theo phƣơng phỏp neighbour joining thƣớc đo = 0,05 Knor trong trỡnh tự nucleotid. Cỏc giỏ trị hiển thị tại cỏc nhỏnh cõy là kết quả phõn tớch boostrap với độ lập lại 1000 (với những giỏ trị >50% mới đƣợc thể hiển trờn cõy).
Sự khỏc biệt giữa 2 chủng là khụng đỏng kể và nằm trong phạm vi khỏc biệt cựng loài (conspecific variation). Dựa vào cỏc kết quả phõn tớch đặc điểm sinh lý,
Lyngbya majusculaAF510964
Lyngbya majusculaAF510965
Anabaena circinalisEU780160
Anabaena circinalis EU780161
Anabaena circinalisEU078518
88
100 100
Microcystis aeruginosaAB023261
96
Microcystis ichthyoblabeAB012338
Microcystis viridisAY121357
Microcystis viridisAY065976
100
Microcystis wesenbergiiAB038538
100
LT8 LT2
Microcystis aeruginosaEU078503
100
Microcystis aeruginosa EU078504
100
100 87
73
0.005
hoỏ và cõy phả hệ cho thấy chỳng cú nhiều đặc điểm chung vỡ vậy 2 chủng LT2 và LT8 đều thuộc loài Microcystis aeruginosa. (adsbygoogle = window.adsbygoogle || []).push({});