BIỆT
Trong nghiên cứu này, chúng tôi đã nhận dạng đƣợc 41 spot protein tƣơng ứng với 29 protein đã đƣợc định danh và 12 protein giả thiết. Để tìm hiểu mối liên quan của các protein này với ung thƣ, chúng tôi tiến hành tìm kiếm cơ sở dữ liệu về các protein [56]. Các protein đƣợc tìm hiểu về chức năng và phân theo nhóm chức năng nhƣ trong bảng 7.
Bảng 7. Tóm tắt chức năng chính của các protein đã đƣợc định danh biểu hiện khác biệt giữa mô ung thƣ đại trực tràng so với mô đại trực tràng bình thƣờng
Protein Chức năng chính Biểu hiện
Protein liên quan đến chu trình tế bào, tăng sinh tế bào và apoptosis: 4 protein
Protein tyrosine phosphatase, receptor type, S
Protein thuộc họ tyrosine phosphatase. Họ protein này đƣợc biết đến nhƣ là phân tử tín hiệu giúp điều hòa nhiều quá trình nội bào nhƣ sinh trƣởng, biệt hóa, phân bào và chuyển dạng ung thƣ
↑
Proteasome
endopeptidase complex
Tham gia trong quá trình phản ứng lại nhiễm virus, tổn hại DNA, quá trình stress oxi hóa, quá trình apoptosis
↓
Suppressor of
tumorigenicity 20 protein
Hoạt động nhƣ yếu tố ức chế khối u, thúc đẩy quá trình apoptosis trong các tế bào ung thƣ
-
ZFYVE26 protein Hoạt động nhƣ yếu tố điều hòa quá trình nguyên phân
-
Protein liên quan đến miễn dịch và bảo vệ cơ thể: 6 protein
Immunoglobulin heavy chain (IgH)
Tham gia cấu tạo nên phân tử Ig ↑
GARS protein (Glycyl – tRNA synthetase)
Enzyme thuộc họ tRNA synthetase, có vai trò xúc tác cho việc gắn glycine vào tARN.
↑
53
Protein Chức năng chính Biểu hiện
chain variable region
MHC class I antigen Trình diện kháng nguyên nội sinh ↓ Heat shock protein 27
(HSP27)
Đáp ứng lại stress, nhiễm virus, kích thích sản xuất interleukin-1
↓
Chain A, Crystal Structure Of The Nfkb
Nfkb có vai trò điều hòa quá trình sao mã của rất nhiều loại tế bào khác nhau trong đáp ứng với các kích thích nhƣ viêm và miễn dịch
-
Protein tham gia cấu trúc tế bào: 4 protein
Actin, cardiac muscle Protein có tính bảo thủ cao, liên quan đến việc cấu trúc các tế bào vận động và thƣờng đƣợc biểu hiện ở tế bào nhân chuẩn
↑
Actin, gamma-enteric smooth muscle isoform 1 precursor
Protein có tính bảo thủ cao, liên quan đến việc cấu trúc các tế bào vận động và thƣờng đƣợc biểu hiện ở tế bào nhân chuẩn
↓
Profilin – 4 Liên kết với actin và ảnh hƣởng đến cấu trúc bộ khung tế bào
↓
Keratin, type II cytoskeletal 1
Điều hòa hoạt động của kinase bằng cách liên kết với integrin beta-1 (ITB1) và thụ thể của activated protein kinase C (RACK1/GNB2L1)
↑
Protein tham gia quá trình trao đổi chất: 10 protein
Malate dehydrogenase Tham gia trong quá trình trao đổi NADH, quá trình trao đổi carbohydrate nội bào, quá trình trao đổi malate, axaloacetate, thao gia vào chu trình tricarboxylic acid
↓
Tyrosine hydroxylase Tham gia trong quá trình trao đổi amino acid mạch vòng. Xúc tác trong quá trình sinh tổng hợp catecholamine
54
Protein Chức năng chính Biểu hiện
Acyl-coenzyme A synthetase ACSM2B
Tham gia quá trình trao đổi acid béo ↓
Mutated CMP-sialic acid transporter A1
Tham gia trong quá trình vận chuyển carbohydrate
↑
Carbonic anhydrase 1 Chuyển đổi carbon dioxide và bicarbonate để duy trì cân bằng acid – base trong máu và các mô khác
↑
Creatine kinase chain B Xúc tác thuận nghịch trong quá trình chuyển đổi gốc phosphate giữa ATP và nhiều hợp chất phosphogen nhƣ Creatine phosphate
↓
Chain A, Crystal Structure Of Diras2 In Complex With Gdp And Inorganic Phosphate
Thể hiện hoạt động của GTPase yếu, tồn tại chủ yếu trong các liên kết GTP
-
Plexin D1 Đóng vai trò quan trọng trong việc truyền tín hiệu giữa các tế bào
↓
Glutamate/aspartate transporter II
Vận chuyển glutamate/aspartate, có tác dụng loại bỏ glutamate ngoại bào
↓
Tyrosine hydroxylase Enzyme chịu trách nhiệm trong việc xúc tác cho phản ứng chuyển L-tyrosine thành L-3,4-
dihydroxyphenylalanine (L-DOPA), có tác dụng dẫn truyền xung thần kinh
Protein tham gia vào quá trình phiên mã, dịch mã và cải biến sau phiên mã, dịch mã: 5 protein
TAF2 RNA polymerase II
Điều hòa hoạt động của RNA polymerase II, giúp khởi đầu phiên mã một cách chính xác
55
Protein Chức năng chính Biểu hiện
Zinc finger protein 658 Gắn với ADN tại vị trí liên kết với yếu tố phiên mã
↑
Transcription factor IIIA (Fragment)
Gắn với vùng điều khiển nội sinh chứa khoảng 50 base của gen 5S ARN. Có vai trò đảm bảo phiên mã đúng nhờ RNA polymerase II
↓
Myc- binding factor Max, short form
Yếu tố điều hòa phiên mã ↓
Translational activator GCN1
Hoạt động nhƣ yếu tố hoạt hóa dịch mã, gián tiếp điều khiển quá trình dịch mã và thực hiện chức năng liên quan đến EF3 trong ribosome bằng việc điều hòa hoạt động của protein GCN2 kinase (EIF2AK1-4)
-
Căn cứ vào chức năng của protein cũng nhƣ các quá trình sinh học mà các protein tham gia, chúng tôi chia các protein có biểu hiện khác biệt giữa mô ung thƣ và mô đại trực tràng bình thƣờng thành 5 nhóm khác nhau. Tỷ lệ các protein thuộc 5 nhóm này không đồng đều với nhau, trong đó các protein tham gia vào quá trình trao đổi chất chiếm tỷ lệ lớn nhất (34%), tiếp theo là các protein tham gia vào quá trình miễn dịch và bảo vệ cơ thể (21%) và các protein tham gia vào quá trình phiên mã, dịch mã và cải biến sau phiên mã, dịch mã (19%), thấp nhất là các protein tham gia cấu trúc tế bào (13%) và protein liên quan đến chu trình tế bào, tăng sinh tế bào, apoptosis (13%) (hình 10). Từ kết quả này chúng tôi giả thiết rằng quá trình phát sinh, phát triển ung thƣ đã gây ảnh hƣởng nhiều tới hoạt động trao đổi chất, tổng hợp năng lƣợng của tế bào và làm thay đổi biểu hiện của các protein tham gia vào các quá trình trao đổi chất, tổng hợp năng lƣợng trong các tế bào ung thƣ.
56
Hình 10. Các nhóm protein theo chức năng
Các protein biểu hiện khác biệt giữa mô ung thƣ và mô đại trực tràng bình thƣờng rất có thể là những chỉ thị sinh học đặc trƣng cho ung thƣ đại trực tràng. Chúng tôi đã tiến hành tìm hiểu kỹ hơn về chức năng của các loại protein biểu hiện khác biệt và mối liên hệ của các protein này với quá trình phát sinh, hình thành ung thƣ đại trực tràng.