Thực hiện chính sách quy hoạch nuôi trồng thủy sản 1999-2010, nhưng cho tới hiện nay, nuôi trồng thủy sản của nước ta vẫn còn thiếu quy hoạch một cách nghiêm trọng, việc nuôi trồng phát triển tự phát, không gắn với thị trường, khiến cho tình trạng nay thiếu mai thừa nguyên liệu thường xuyên sảy ra ở vùng trọng điểm về kinh tế thủy sản là đồng bằng Sông Cửu Long (ĐBSCL).
Thách thức lớn nhất đối với lĩnh vực nuôi trồng thủy sản là xây dựng quy hoạch và thực hiện quy hoạch. Biểu hiện cụ thể tại 2 đối tượng nuôi đang được cho là thế mạnh của thủy sản nước nhà là cá tra và tôm sú.
Cho đến nay, quy hoạch sản xuất và tiêu thụ cá tra, ba sa vùng ĐBSCL vẫn chưa được phê duyệt do đang trong quá trình hoàn chỉnh báo cáo đánh giá môi trường chiến lược. Tại địa phương, quy hoạch phát triển cá tra cũng mới dừng ở mức xem xét phê duyệt dẫn tới, chưa có cơ sở để quy hoạch. Thế nhưng, một số tỉnh đã có quy hoạch thì việc quản lý, thực hiện quy hoạch cũng vô cùng khó khăn do thiếu các chế tài để khống chế phát triển tràn lan ở những vùng ngoài quy hoạch.
Thiếu quy hoạch khiến cơ sở hạ tầng thủy lợi cho sản xuất cá tra không được quan tâm đầu tư. Hiện chưa có hệ thống cấp nước chủ động cho các vùng nuôi cá tra tập trung. Các hộ dân nhỏ lẻ trên diện tích ven các con sông
tự đầu tư đường dẫn nước vào ao hầm của mình, dẫn đến tình trạng lôn xộn, gây hại lẫn nhau. Ngoài ra, việc quản lý môi trường nuôi cũng gặp khó khăn. Trong thực tế sản xuất, người nuôi chỉ thực hiện hút vét bùn đáy mà không thực hiện quy định phải dành diện tích làm ao lắng nước cấp, ao xử lý nước thải. Mật độ giống cá thả nuôi quá dày (nhiều khi tới 60- 70 con/m2), cộng với việc thiếu nguồn nước thay thường xuyên đã làm giảm chất lượng môi trường nuôi, ảnh hưởng tới chất lượng cá nguyên liệu.
Sản lượng khai thác thủy sản hiện đã đến ngưỡng. Do vậy, tăng trương của ngành thủy sản phụ thuộc vào nuôi trồng. Tuy nhiên, sự quan tâm của trung ương cũng như chính quyền các địa phương chưa tương xứng. Dẫn đến việc chúng ta vẫn thiếu những chính sách khuyến khích phát triển, thiếu đầu tư. Dẫn tới hậu quả người nông dân hiện nay đang phải “tự bơi” là chính.
Việc kiểm dịch con giống chưa được thực hiện ở nhiều địa phương. Các tiêu chuẩn chất lượng thịt cá tra cũng chưa được xây dựng. Do đó, thiếu căn cứ để định giá cá tra một cách rõ ràng, minh bạch. Hậu quả là việc tiêu thụ khó khăn, nảy sinh gian lận thương mại. Doanh nghiệp cạnh tranh không lành mạnh.
Nguồn: Phunu.info ngày 18/09/2010
Đối với con tôm sú, mặc dù là đối tượng nuôi chủ lực ở vùng nước lợ cung cấp nguồn nguyên liệu chính cho xuất khẩu, với giá trị kim ngạch lớn nhất trong các nhóm đối tượng thủy sản nuôi trồng. Nhưng cho đến nay quy hoạch phát triển cũng chỉ mới được xây dựng và đang trong quá trình thẩm định. Tôm chân trắng đã được nuôi một ở miền Bắc và miền Trung, và mới đây được phép phát triển nuôi tại ĐBSCL nhưng cũng chưa được quy hoạch.