Cỏc nghiờn cứu so sỏnh và thực nghiệm về sự biến đổi của cỏc gen PB2, PB1 và PA, liờn quan đến gia tăng độc lực và lõy truyền của virus từ gia cầm sang động vật cú vỳ và người cho thấy, cú nhiều vị trớ thay đổi amino acid trong cỏc protein PB2, PB1 và PA của virus cỳm A/H5N1, làm tăng khả năng nhõn lờn của virus ở tế bào nuụi cấy cú nguồn gốc của người và chuột (Bảng 1.5) [51], [91].
Bờn cạnh đú, cỏc kết quả nghiờn cứu phõn tớch và so sỏnh đặc tớnh di truyền cỏc gen PB2, PB1 và PA trong hệ gen giữa cỏc chủng virus cỳm A/H5N1, phõn lập từ người, chim hoang dó và gia cầm bệnh từ năm 1996 đến nay, cho thấy:
- Cỏc gen PB2, PB1 và PA của virus cỳm A/H5N1, bờn cạnh sự thu nhận cựng với cỏc gen NP, M và NS từ nguồn gen nhiều virus cỳm A khỏc nhau, qua tỏi tổ hợp hỡnh thành genotype, cũng xuất hiện cỏc đột biến liờn quan biểu hiện độc lực cao của virus lưu hành gõy bệnh dịch ở cỏc loài vật chủ (Bảng 1.5) [12], [60], [88], [92].
Bảng 1.5. Cỏc vị trớ thay đổi amino acid ở 3 protein PB2, PB1 và PA, liờn quan đến
Protein Vị trớ Virus độc lựcthấp Virus độc lực
cao Tài liệu tham khảo
158 E G [60] PB2 199 A S [93] 318 R K [93] 355 R/Q K [97], [93] 504 I V [57] 508 Q R [93] 627 E K [66], [93], [98] 675 I L [93] 683 A T [93] 701 D N [13], [58], [99], [21] 714 S R [13] PB1 13 L P [13] 171 V M [97], [93] 198 R K [93] 317 M/V I [97], [93] 678 S N [13] 436 H Y [28] PB1-F2 66 N S [30] 127 V I [100] PA 224 P S [101] 383 D N [101] 336 L M [100] 515 S T [28] 550 I L [57] 552 T S [42] 615 N K [13]
Ghi chỳ: Cỏc chữ cỏi biểu thị kớ hiệu quốc tế tờn của cỏc amino acid. A: Alanin; L: Leucin; D: Aspartic acid;
E: Glutamic acid; K: Lysin; N: Asparagin; S: Serin; T: Threonin; V: Valin; M: Methionin; R: Arginin; I:Isoleucin; Y: Tyrosin; H: Histidin; Q: Glutamin. Isoleucin; Y: Tyrosin; H: Histidin; Q: Glutamin.
- Hệ gen của virus cỳm A/H5N1 lưu hành gõy bệnh dịch hiện nay, cú sự bảo tồn cỏc amino acid: alanin tại vị trớ 199 (A199) trong protein PB2, methionin tại vị trớ 317 (M317) trong protein PB1, serin tại vị trớ 66 (S66) trong protein PB1-F2 và threonin vị trớ 552 (T552) trong protein PA, liờn quan đến biểu hiện độc lực thấp và thớch nghi lõy truyền của virus ở gia cầm (Bảng 1.5) [30], [42], [91], [93].
- Hầu hết cỏc chủng virus cỳm A/H5N1 phõn lập trờn gia cầm và người bệnh từ năm 2003 - 2008, đều cú chứa gen PB2 biểu hiện protein PB2 bảo tồn glutamic acid (E) tại vị trớ 627 (E627) cựng với aspartic acid (D) tại vị trớ 701 (D701), liờn quan đến biểu hiện thớch nghi lõy truyền của virus ở gia cầm [21], [91], [94], [95], [96]. Cỏc biến chủng virus A/H5N1 clade 2.3.2.1, được phỏt hiện gõy bệnh ở chim hoang dó tại
Thanh Hải năm 2009 và xõm nhiễm gõy tử vong ở người tại Hồ Bắc (Trung Quốc) năm 2010, vẫn cú sự bảo tồn glutamic acid E627 trong protein PB2 [58], [70].
- Đặc biệt, hệ gen của cỏc chủng virus cỳm A/H5N1 phõn lập trờn người bệnh từ năm 2003 đến nay, đều chứa 3 gen PB2, PB1 và PA cú sự tương đồng cao với cỏc gen tương ứng, của cỏc chủng virus phõn lập trờn chim hoang dó và gia cầm bệnh cựng thời gian [12], [60], [76], [92]. Ngoài ra, đột biến thay đổi E627K trong protein PB2, một yếu tố quan trọng liờn quan đến khả năng thớch ứng nhõn lờn của virus cỳm A/H5N1 ở động vật cú vỳ và người, đó được phỏt hiện ngay ở chủng A/HK/156/97(H5N1) – chủng virus đầu tiờn xõm nhiễm gõy bệnh trờn người năm 1997 [98]. Đột biến này cũng được phỏt hiện ở một số chủng virus cỳm A/H5N1 clade 1 và 2.1 thuộc genotype Z phõn lập trờn người bệnh cỏc năm 2003 – 2005, cựng với cỏc chủng virus clade 2.2 phõn lập ở chim hoang dó năm 2005 [22], [66], [76], [82], [94], [95], [96].
Như vậy, cỏc gen PB2, PB1 và PA tồn tại trong 3 genotype tỏi tổ hợp Z, V và G của hệ gen virus cỳm A/H5N1, lưu hành gõy bệnh dịch phổ biến ở gia cầm và xõm nhiễm gõy bệnh trờn người hiện nay, đang bảo tồn cỏc đặc tớnh giỳp virus thớch nghi lõy truyền ổn định ở gia cầm. Đồng thời, cỏc gen kể trờn của cỏc chủng virus cỳm A/H5N1 phõn lập trờn người bệnh cú sự tương đồng cao và cú nguồn gốc từ cỏc chủng virus ở gia cầm xõm nhập trực tiếp sang người. Sự xuất hiện đột biến E627K trong protein PB2 của một số chủng virus phõn lập trờn người bệnh, cho thấy virus cỳm A/H5N1 đang cú sự biến đổi theo xu hướng thớch ứng chuyển nhiễm sang người trong tương lai.