Về kết quả xỏc định phả hệ nguồn gốc gen PA

Một phần của tài liệu Nghiên cứu sự biến đổi di truyền các gen PB2, PB1 và PA polymerase của virus cúm AH5N1 đương nhiễm tại việt nam (Trang 118 - 120)

Chương 4 BÀN LUẬN

4.3.3. Về kết quả xỏc định phả hệ nguồn gốc gen PA

+ Tương tự cỏc gen PB2 và PB1, gen PA của 6 biến chủng virus cỳm A/H5N1 nghiờn cứu và cỏc chủng trong 3 nhúm virus clade 1.1, 2.3.2.1, 2.3.4.3, cũng như nhúm virus clade 1, lần lượt cú nguồn gốc từ nguồn gen tương ứng của virus cỳm A/H5N1 thuộc 2 genotype Z và V.

- Gen PA của nhúm virus clade 2.3.2.1 gồm 2 biến chủng virus nghiờn cứu DkQT801-2011 và DkQT802-2011, phõn lập tại Việt Nam và Trung Quốc cỏc năm 2009 – 2012, cú quan hệ nguồn gốc gần gũi với gen này của 2 nhúm virus clade 2.3.4.3, 2.3.4, phõn lập từ người và gia cầm bệnh tại Việt Nam cỏc năm 2007 – 2008. Đặc biệt, gen PA của 2 biến chủng virus nghiờn cứu DkQT801-2011 và DkQT802-2011, cựng với 3 chủng virus clade 2.3.2.1 phõn lập từ gia cầm bệnh tại Việt Nam, cũng cú quan hệ nguồn gốc gần gũi hơn với gen tương ứng của chủng A/Hubei/1/2010 phõn lập tại Trung Quốc, so với cỏc chủng phõn lập từ chim hoang dó trong nhúm virus clade 2.3.2.1. Kết quả này cho thấy, gen PA của cỏc chủng virus gõy bệnh ở gia cầm trong nhúm virus clade 2.3.2.1, cũng đó cú nhiều biến đổi so với cỏc chủng virus gõy bệnh ở chim hoang dó.

- Bờn cạnh đú, gen PA của 2 nhúm virus clade 2.3.4.3 và 2.3.4 phõn lập tại Việt Nam cỏc năm 2007 – 2008 bao gồm 02 biến chủng virus DkNA72-2007 và DkNA114-2007, cú nguồn gốc từ nguồn gen tương ứng của nhúm virus clade 2.3.4 thuộc genotype V, hỡnh thành và lưu hành tại Trung Quốc cỏc năm 2005 – 2006.

- Tương tự, gen PA của nhúm virus clade 1.1 gồm 2 biến chủng virus nghiờn cứu CkDT382-2008 và DkTG926-2009, phõn lập trờn gia cầm tại Việt Nam cỏc năm 2009 – 2011, cú quan hệ nguồn gốc từ nguồn gen của nhúm virus clade 1.1 thuộc genotype Z, phõn lập từ người bệnh tại Campuchia cỏc năm 2007 – 2011. Gen PA của nhúm virus clade 1.1 cú quan hệ gần gũi với gen tương ứng của nhúm virus clade 1 thuộc genotype Z, hỡnh thành tại Trung Quốc giai đoạn trước đú và lưu hành gõy bệnh dịch tại Việt Nam, Thỏi Lan giai đoạn 2003 – 2005.

Như vậy, cũng giống như gen PB2 và PB1, gen PA của của cỏc chủng virus phõn lập tại Việt Nam từ 2003 đến nay bao gồm cả 6 biến chủng virus cỳm A/H5N1 nghiờn cứu, biến đổi phõn chia thành 4 dưới phõn nhỏnh trong 2 phõn nhỏnh tiến húa, cú nguồn gốc từ nguồn gen tương ứng của virus cỳm A/H5N1 thuộc genotype Z và V. Trong đú, gen PA của cỏc chủng virus clade 2.3.2.1 và 2.3.4.3 cú nguồn

gốc từ virus cỳm A/H5N1 thuộc genotype V, gen PA của cỏc chủng virus clade 1 và 1.1 cú nguồn gốc từ virus cỳm A/H5N1 thuộc genotype Z. Kết quả phõn tớch phả hệ dựa trờn trỡnh tự gen PA ở trờn phự hợp với kết quả phõn tớch biến đổi di truyền ở tiểu mục 3.2.3 cho thấy, gen PA cũng cú sự biến đổi tiến húa tương quan với gen H5 ở virus cỳm A/H5N1, trong 4 nhúm virus clade 1, 1.1, 2.3.4.3 và 2.3.2.1, lưu hành gõy bệnh dịch phổ biến ở Việt Nam. Kết quả trờn cũng phự hợp với cỏc kết quả nghiờn cứu xỏc định phả hệ nguồn gốc virus cỳm A/H5N1, trong 4 nhúm virus núi trờn lưu hành tại Việt Nam, Trung Quốc và cỏc quốc gia lõn cận từ năm 2003 đến nay [75], [76], [77], [78], [80], [86].

+ Bờn cạnh đú, tương tự cỏc gen PB2 và PB1, kết quả phõn tớch nguồn gốc phả hệ gen PA của một số chủng virus clade 2.2, 2.3.2, 2.3.4 và 2.1.3.2, thuộc genotype Z, V và G phõn lập trong cỏc năm 2004 – 2007, tại Trung Quốc, Ấn Độ và Indonesia, cũng cho thấy cú sự tỏi tổ hợp gen H5 và gen PA trong hệ gen của cỏc chủng virus kể trờn, từ nguồn gen genotype virus khỏc nhau hỡnh thành trước đú.

+ Cũng như gen PB2 và PB1, gen PA của chủng virus A/VN/UT30850/2005 clade 1 phõn lập tại Việt Nam năm 2005, cú chung nguồn gốc với cỏc chủng virus clade 2.3.4 thuộc genotype V. Kết quả này chứng tỏ, gen PA của virus cỳm A/H5N1 thuộc genotype V, cũng đó được tỏi tổ hợp trong cỏc chủng virus cỳm A/H5N1 clade 1 lưu hành tại Việt Nam từ năm 2005.

+ Ngoài ra, kết quả phõn tớch cũng cho thấy, gen PB1 của cỏc chủng virus cỳm A/H5N1 lưu hành gõy bệnh dịch ở gia cầm từ 2003 đến nay, cũng cú nguồn gốc chung từ nguồn gen tương ứng của nhúm virus clade 0 thuộc genotype GD.

Cỏc kết quả phõn tớch ở trờn cho thấy, tương tự gen PB2 và PB1, gen PA trong hệ gen virus cỳm A/H5N1 cũng cú sự biến đổi tiến húa mạnh mẽ kể từ khi hỡnh thành cỏc chủng virus đầu tiờn từ 1996 đến nay.

Một phần của tài liệu Nghiên cứu sự biến đổi di truyền các gen PB2, PB1 và PA polymerase của virus cúm AH5N1 đương nhiễm tại việt nam (Trang 118 - 120)

Tải bản đầy đủ (DOC)

(146 trang)
w