Cỏc kết quả nghiờn cứu theo dừi giỏm sỏt dịch tễ học cho thấy, hệ gen của cỏc chủng virus cỳm A/H5N1 phõn lập từ gia cầm và người bệnh tại Việt Nam, khụng cú biến đổi lớn về biểu hiện clade hoặc hỡnh thành clade khỏng nguyờn H5 mới, chủ yếu thuộc 3 genotype Z, V và G, so với virus cỳm A/H5N1 cú nguồn gốc hỡnh thành và lưu hành tại Trung Quốc trước đú [69], [70], [75], [76], [77], [80], [102].
Cỏc gen PB2, PB1 và PA của virus cỳm A/H5N1 phõn lập tại Việt Nam từ năm 2003 đến nay, mặc dự cú sự tỏi tổ hợp trong cỏc genotype từ nguồn gen nhiều
virus khỏc nhau, nhưng vẫn bảo tồn đặc tớnh di truyền so với virus cỳm A/H5N1 ban đầu hỡnh thành ở Trung Quốc [76], [77], [78], [80], [83].
- Độ dài phõn tử của 03 gen PB2, PB1 và PA và cỏc protein tương ứng được mó húa của virus cỳm A/H5N1 phõn lập từ người và gia cầm bệnh tại Việt Nam giai đoạn 2003 - 2008, khụng thay đổi so với virus cỳm A/H5N1 lưu hành ở Trung Quốc và cỏc quốc gia trờn thế giới. Trong đú: Gen PB2 mó húa tổng hợp protein PB2 bảo tồn cỏc amino acid E627 và D701 ở hầu hết cỏc chủng virus cỳm A/H5N1 được phõn lập ở người và gia cầm bệnh. Gen PB1 chứa khung đọc mở PB1-F2, mó húa tổng hợp protein PB1-F2 gồm đầy đủ 90 amino acid và khụng cú đột biến N66S. Một số biến chủng virus cỳm A/H5N1 thuộc clade 1 cú protein PB1-F2 bị cắt cụt chỉ chứa 24 hoặc 25 amino acid. Gen PA mó húa tổng hợp protein PA bảo tồn amino acid T552 và đặc tớnh thớch nghi ở gia cầm [76], [78], [103].
- Đặc biệt, một số chủng virus cỳm A/H5N1 clade 2.3.4.3 thuộc genotype V, phõn lập trờn người bệnh tại Việt Nam cỏc năm 2007 – 2008, cũng được phỏt hiện cú đột biến E627K trong protein PB2, tương tự một số chủng virus clade 1 thuộc genotype Z phõn lập trờn người bệnh giai đoạn 2003 – 2005 [70], [80], [104].
Cỏc kết quả nghiờn cứu ở trờn cho thấy, cỏc gen PB2, PB1 và PA trong hệ gen virus cỳm A/H5N1 lưu hành tại Việt Nam từ 2003 – 2008, đó cú biến đổi riờng biệt bờn cạnh sự bảo tồn đặc tớnh ban đầu từ cỏc gen nguồn gốc tương ứng của virus cỳm A/H5N1, hỡnh thành ở Trung Quốc và lưu hành tại nhiều quốc gia trờn thế giới. Sự biến đổi đặc tớnh di truyền của cỏc gen PB2, PB1 và PA, giỳp virus thớch nghi nhõn lờn trong tế bào cảm thụ và gia tăng độc lực ở cơ thể người, là một trong cỏc vấn đề được quan tõm nghiờn cứu giỏm sỏt, ở virus cỳm A/H5N1 gõy bệnh dịch ở gia cầm và người hiện nay [12], [68], [92]. Chớnh vỡ vậy, nghiờn cứu biến đổi đặc tớnh di truyền hệ gen virus, liờn quan đến thay đổi độc lực và khả năng xõm nhiễm, lõy truyền gõy bệnh của virus cỳm A/H5N1, là thực sự cần thiết cung cấp cỏc dữ liệu giỏm sỏt và dự bỏo dịch tễ, xõy dựng kỹ thuật chẩn đoỏn sớm, sản xuất và sử dụng vaccine hiệu quả cho người và gia cầm. Đặc biệt, trong bối cảnh diễn biến dịch tễ phức tạp hiện nay và Việt Nam là một trong cỏc quốc gia được xỏc định là trung tõm biến đổi dịch tễ, về khả năng thớch nghi lõy truyền từ gia cầm sang người của virus cỳm A/H5N1. Dữ liệu di truyền học của cỏc gen PB2, PB1 và PA gúp
phần lượng giỏ sự biến đổi độc lực, khả năng thớch nghi của virus cỳm A/H5N1 giữa cơ thể gia cầm và người, một trong cỏc yếu tố quan trọng dự bỏo xu hướng dịch tễ học lõy truyền của virus. Bờn cạnh đú, dữ liệu di truyền của cỏc gen trờn cũn là cơ sở khoa học phục vụ điều chế, thay đổi cỏc vựng gen hoặc bộ ba mó húa (codon) cỏc vị trớ amino acid, liờn quan đến biểu hiện độc lực cao và thớch nghi lõy truyền của virus, trong sản xuất cỏc vaccine tỏi tổ hợp chứa đầy đủ hệ gen virus, đảm bảo phũng chống hiệu quả bệnh cỳm A/H5N1 cho người và gia cầm.