Đối với các học sinh ở bán trú, hoạt động học tập diễn ra trong điều kiện xa sự quản lý, quan tâm, giám sát của gia đình; các điều kiện ăn ở, sinh hoạt khơng thực sự đầy đủ như ở gia đình nên ảnh hưởng khơng nhỏ tới chất lượng, hiệu quả học tập (kể cả các học sinh ở trọ trong khu bán trú của nhà trường và các học sinh ở trọ ở nhà người quen hoặc trọ gần trường).
Do phải trọ học nên sau thời gian học tập chính khóa tại trường, các em còn thực hiện nhiều các hoạt động khác như tham gia hoạt động bồi dưỡng, bổ trợ kiến thức; tham gia hoạt động tự học tại khu bán trú, nơi ở trọ; tham gia các hoạt động vui chơi giải trí rèn luyện sức khỏe; tham gia hoạt động lao động vệ sinh, tăng gia cải thiện bữa ăn; tham gia các hoạt động rèn luyện, nâng cao kỹ năng sống...
Các yếu tố môi trường (phong tục, tập quán, điều kiện kinh tế gia dình học sinh, sự quan tâm lãnh đạo, chỉ đạo của cấp trên, phong trào giáo dục của địa phương, các điều kiện, phương tiện dạy học…) có ảnh hưởng tới việc quản lý hoạt động học tập của nhà trường. Việc quản lý hoạt động học tập của nhà trường sẽ mang lại hiệu quả thiết thực khi được sự quan tâm lãnh đạo của cấp trên với những chính sách và đường lối đúng đắn nhằm khuyến khích, động viên hoạt động dạy học trong nhà trường.
Các học sinh đến trọ học tại khu bán trú nhà trường và ở trọ nhà dân chủ yếu là học sinh dân tộc thiểu số, các học sinh có điều kiện kinh tế gia đình khó khăn. Mỗi dân tộc thiểu số lại có những phong tục, tập quán riêng; mỗi học sinh có một hồn cảnh gia đình riêng. Vì vậy để quản lý tốt học sinh địi hỏi người cán bộ quản lý và các thầy cô giáo phải đi sâu tìm hiểu phong tục tập qn của từng dân tộc, hồn cảnh gia đình của từng học sinh, để từ đó có những cách ứng xử và giải quyết phù hợp, học sinh sẽ cảm thấy được tôn trọng và nỗ lực hơn trong học tập và rèn luyện, khi thấy các thầy cô hiểu cả những phong tục tập quán của dân tộc mình, hồn cảnh gia đình mình.
Yếu tố mơi trường xã hội có ảnh hưởng khơng nhỏ đến việc quản lý hoạt động học tập của học sinh bán trú. Ở các vùng miền núi, vùng kinh tế đặc biệt khó khăn, nhận thức về vai trị và tầm quan trọng của việc học của đồng bào chưa cao, gia đình và bản thân học sinh chưa nhân thức rõ được động cơ và mục đích học tập đúng đắn; sự quan tâm, đầu tư về thời gian và vật chất cho việc học của con em chưa được các bậc cha mẹ chú trọng... Bên cạnh đó do nhận được nhiều chính sách hỗ trợ, ưu tiên của nhà nước, nên ít nhiều đã sinh ra tâm lý trơng chờ, ỉ lại vào các chính sách hỗ trợ... Tất cả những điều này đã ảnh hưởng rất lớn đến chất lượng học tập của học sinh, công tác quản lý hoạt động học tập của học sinh nói chung và học sinh bán trú nói riêng.
Điều kiện CSVC trường lớp, phương tiện dạy học phục vụ công tác giảng dạy và học tập, các điều kiện CSVC phục vụ sinh hoạt và học tập của học sinh trên khu bán trú, nơi ở trọ cũng là những yếu tố rất quan trọng ảnh hưởng tới chất lượng học tập của học sinh bán trú. Việc quản lý hoạt động học tập của Hiệu trưởng sẽ mang có hiệu quả cao nếu trường lớp được xây dựng khang trang, đúng quy định, điều kiện, phương tiện dạy học hiện đại được trang bị đầy đủ và đồng bộ, đáp ứng cơ bản nhu cầu giảng dạy và học tập; khu bán trú của nhà trường đáp ứng đầy đủ nhu cầu ăn, ở, sinh hoạt và học tập của tất cả các học sinh có nhu cầu ở bán trú
Ngồi ra cịn có nhiều yếu tố khác có ảnh hưởng trực tiếp hay gián tiếp, ít hay nhiều đến quản lý hoạt động học tập của học sinh bán trú trong nhà trường.