Alen số 8 của locus vWA

Một phần của tài liệu (LUẬN án TIẾN sĩ) nghiên cứu đặc trưng tần suất alen hệ nhận dạng STR (AmpFlSTR® identifiler® plus kit) của một số tộc người việt nam để ứng dụng trong giám định ADN (Trang 106)

Ở locus FGA, người Kinh có các alen đặc trưng là alen 9 và alen 10 với tần suất 0,2%. Cả 2 alen này mặc dù có tần suất nhỏ, nhưng chỉ thấy ở tộc người Kinh mà không thấy ở tộc người nào khác.

3.5.2. Các alen đặc trưng của tộc người Tày

Một trong những alen đặc trưng của người Tày là alen 10.2 thuộc locus CSF1PO với tần suất 0,2% được thể hiện ở Hình 3.24. Alen này cũng khơng nằm trong thang alen chuẩn và cũng là alen ít thấy xuất hiện trên những cơng bố của các quần thể nghiên cứu khác.

Ghi chú: mũi tên → chỉ alen 10.2 của locus CSF1PO

Ở locus D2S1338, alen 13 là alen đặc trưng cho tộc nguời Tày. Alen này cũng chỉ thấy xuất hiện ở người Tày.

Đối với locus D18S51, có một số alen đặc trưng cho tộc người này. Alen 26 chỉ xuất hiện ở tộc người Tày, ngồi ra khơng thấy xuất hiện ở tộc người nào khác. Alen 13.2, 14.2 và 15.2, ngoài xuất hiện ở người Tày còn thấy xuất hiện ở người Kinh. Alen 16 thuộc locus D5S818 và alen 29.2 thuộc locus FGA chỉ xuất hiện với tộc người Tày mà khơng thấy ở các tộc người cịn lại.

3.5.3. Các alen đặc trưng của tộc người Thái

Khi nghiên cứu các alen đặc trưng cho tộc người ở locus CSF1PO, alen số 6 chỉ thấy xuất hiện ở tộc người Thái với tần suất 0,3% (Bảng 4 - Phụ lục 1).

Ở locus TPOX, một trong những locus được đánh giá là có tính đa hình thấp nhất có 2 alen có thể mang tính đặc trưng tộc người, đó là alen số 14 và alen 15, cả 2 alen này cũng chỉ thấy xuất hiện ở tộc người Thái với tần suất là 0,1%.

Hình 3.25 thể hiện 2 alen đặc trưng của tộc người Thái là các alen 14 và alen 15, cả 2 alen này cũng đều khơng có trong thang alen chuẩn của bộ kít Identifiler.

Ghi chú: mũi tên → chỉ alen 14 và 15 của locus TPOX

Với locus D18S51, khi nghiên cứu các alen đặc trưng cho tộc người ở locus này, có một số alen có tính đặc trưng tộc người được thể hiện trong Bảng 13 - Phụ lục 1. Trong đó, alen 20.2 và 21.2 là các alen đặc trưng của người Thái, ngoài ra không thấy xuất hiện ở tộc người nào khác. Alen 9.2 là alen khơng có trong thang alen chuẩn và cũng là alen đặc trưng của tộc người Thái (Hình 3.26).

Ghi chú: mũi tên → chỉ alen 9.2 của locus D18S51

Hình 3.26. Alen 9.2 của locus D18S51

Ngồi ra người Thái cịn có một số alen đặc trưng tộc người thuộc các locus khác gồm: alen 14 và 18.2 của locus FGA, alen 15.2 của locus vWA.

3.5.4. Các alen đặc trưng của tộc người Khmer

Đối với locus vWA, các alen 12 và 15.2 và alen 18.2 xuất hiện lần lượt ở các tộc người Thái, người Khmer và tộc người H‟mông với tần suất chỉ từ 0,1 đến 0,3% mà cũng không thấy xuất hiện ở tộc người khác. Do vậy, ở locus này alen đặc trưng cho người Khmer là alen 15.2.

Đối với locus D5S818 (Bảng 14 - Phụ lục 1) ta thấy, có 3 alen đạt đủ điều kiện có thể là alen có tính đặc trưng tộc người là các alen 16, 20 và alen 23. Alen 16 chỉ thấy xuất hiện ở tộc người Tày, alen 20 chỉ thấy xuất hiện ở tộc người Kinh, còn alen 23 chỉ thấy xuất hiện ở tộc người Khmer. Alen số 23, khơng có trong thang alen chuẩn và cũng mang tính đặc trưng tộc người Khmer của locus này (Hình 3.27).

Ghi chú: mũi tên → chỉ alen 23 của locus D5S818 Hình 3.27. Alen số 23 của locus D5S818

Ở locus FGA, riêng alen 20.2 có ở người Khmer cao gấp 7 lần các tộc người khác. Đây là alen thể hiện tính đặc trưng về tần suất của người Khmer nếu tính theo chênh lệch về tần suất khi so sánh giữa các tộc người nghiên cứu (Bảng 15 - Phụ lục 1).

3.5.5. Các alen đặc trưng của tộc người Hoa

Kết quả trong Bảng 1 - Phụ lục 1 cho thấy, locus D8S1179 có 2 alen thể hiện tính đặc trưng tộc người, đó là alen số 9 và alen số 19. Alen 9 chỉ xuất hiện ở người Kinh và người Hoa với tần suất lần lượt là 0,2% và 0,3%. Đặc biệt, alen 19 của locus này chỉ xuất hiện ở tộc người Hoa với tần suất 0,3% mà không xuất hiện ở các tộc người khác. Alen này cũng không thấy xuất hiện ở người Hoa tại tỉnh Nam Ninh - Trung Quốc [90]. Hình ảnh alen 19 đặc trưng cho người Hoa được thể hiện Hình 3.28.

Ghi chú: mũi tên → chỉ alen 19 của locus D8S1179

Tương tự như vậy, đối với locus D21S11 có 3 alen thể hiện tính đặc trưng đó là các alen số 19, 26 và alen số 34, ở alen 19 ta chỉ thấy xuất hiện ở tộc người Hoa (Hình 3.29), cịn 2 alen 26 và 34 chỉ xuất hiện ở tộc người Kinh (Bảng 2 - Phụ lục 1).

Ghi chú: mũi tên → chỉ alen 19 của locus D21S11 Hình 3.29. Alen số 19 của locus D21S11 3.5.6. Các alen đặc trưng của tộc người H’mông

Người H‟mông là một trong những tộc người có nhiều alen đặc trưng. Chủ yếu người H‟mơng có những alen có tần suất cao hơn nhiều lần so với các tộc người khác.

Ở locus D7S820, 2 alen có thể mang tính đặc trưng tộc người H‟mông (Bảng 3 - Phụ lục 1), trong đó alen 15 chỉ thấy xuất hiện ở tộc người H‟mông, đặc biệt alen 14 ở tộc nguời H‟mơng có tần suất cao hơn các tộc người còn lại hàng chục lần.

Một số alen chỉ thấy xuất hiện ở tộc người H‟mơng và có tần suất thấp như: alen 19 thuộc locus D21S11, alen 18.2 thuộc locus vWA, alen 12.2 và 18.2 thuộc locus D18S51, alen 10 của locus D3S1358.

Với locus D13S317, thống kê toàn bộ tần suất alen của các tộc người ở locus này, ta thấy có 2 alen là alen 15 và 16 có thể dùng để xác định tính đặc trưng tộc người. Alen 15 xuất hiện ở tộc người Kinh, alen 16 xuất hiện ở tộc người Tày, riêng với tộc người H‟mông, xuất hiện cả 2 alen. Dựa vào nghiên cứu này, có thể thấy nếu một cá thể nào có cả alen 15 và alen 16, có khả năng cá thể đó thuộc tộc người H‟mơng, điều này có giá trị trong định hướng điều tra và củng cố thêm cho những chứng cứ khác trong hoạt động điều tra tội phạm.

Alen 16 khơng có trong thang alen chuẩn của nhà sản xuất, được thể hiện trên Hình 3.30.

Ghi chú: mũi tên → chỉ alen 16 của locus D13S317

Hình 3.30. Alen 16 của locus D13S317

Ở locus D16S539, alen số 8 thấy xuất hiện ở nhiều tộc người trừ người Khmer, Hoa và người Dao, tuy nhiên alen này lại xuất hiện ở tộc người H‟mơng có tần suất cao hơn các tộc người khác từ 5 tới 10 lần (1%).

Ở locus D2S1338, alen 26 xuất hiện ở nhiều tộc người, nhưng ở tộc người H‟mông, tần suất của alen này cao hơn rất nhiều (gấp từ 3 đến 10 lần) so với các tộc người khác.

Ở locus D19S433, alen đặc trưng cho tộc người H‟mông là alen số 17, alen này xuất hiện ở một số tộc người, tuy nhiên chỉ duy nhất người H‟mông, alen này chiếm tới 2,3% tổng số alen của locus, trong khi đó các tộc người khác, alen này chỉ chiếm 0,1% đến 0,3%.

Hình ảnh ví dụ minh họa của alen 17 đặc trưng cho người H‟mơng được thể hiện trong Hình 3.31 dưới đây. Alen này cũng khơng có trong thang alen chuẩn.

Ghi chú: mũi tên → chỉ alen 17 của locus D19S433

3.5.7. Các alen đặc trưng của tộc người Dao

Ở người Dao, alen 9.2 thuộc locus D7S820 chiếm 0,9%, cao hơn các tộc người khác từ 5 tới 9 lần, có thể là alen đặc trưng tộc người (Bảng 3 - Phụ lục 1).

Locus D3S1358 có 2 alen đặc trưng cho 2 tộc người là alen số 7 đặc trưng cho tộc người Dao và alen số 10 đặc trưng cho tộc người H‟mơng, 2 alen này có tần suất rất thấp, và cũng chỉ thấy ở 2 tộc người kể trên. Alen số 7 đặc trưng cho tộc người Dao được thể hiện ở Hình 3.32.

Ghi chú: mũi tên → chỉ alen 7 của locus D3S1358

Hình 3.32. Alen số 7 của locus D3S1358

Hai tộc người còn lại gồm người Mường và người Nùng, mặc dù số lượng mẫu cá thể thu được đủ lớn, lần lượt là 155 mẫu và 405 mẫu, tuy nhiên nghiên cứu khơng phát hiện thấy locus có tính đặc trưng tộc người.

Như vậy, các alen đặc trưng tộc người được phát hiện trong 9 tộc người nghiên cứu thường là các alen có tần suất thấp hoặc chỉ gặp ở tộc người này mà khơng gặp ở tộc người khác, hoặc có tần suất cao hơn các tộc người khác nhiều lần. Kết quả được thống kê trong Bảng 3.9.

Bảng 3.9. Thống kê các alen đặc trưng của các tộc người

Tộc ngƣời Locus

Kinh Tày Thái Mường Khmer Hoa Nùng H’mông Dao D8S1179 8 8, 19 D21S11 26, 34 19 D7S820 4, 23, 24 14, 15 9.2 CSF1PO 10.2 6 D3S1358 10 7 TH01 12 8 D13S317 15 16 15, 16 D16S539 19 18 D2S1338 13.2, 14.2 13 26 D19S433 17 vWA 8, 29 15.2 12 18.2 TPOX 14, 15 D18S51 5, 13.2 15.2, 26 9.2, 13.2 18.2 D5S818 20 16 23 FGA 9, 10 29.2 14, 18.2 20.2 28.2 Tổng 17 8 8 0 3 3 0 12 2

Trong 54 alen có tần suất thấp mang đặc trưng tộc người được tìm thấy ở 9 tộc người có dân số đơng nhất tại Việt Nam, một số alen cũng đã gặp trong các quần thể khác như người Hàn Quốc [56, 58], người Nhật Bản [41] và người Philippin [56]. Người Hàn Quốc trùng 5/24 các alen có tần suất thấp, người Nhật Bản trùng 4/27 và người Philippin trùng 2/23 các alen có tần suất thấp (Bảng 3.10).

Bảng 3.10. So sánh các alen có tần suất thấp nhất của nghiên cứu và một số quần thể khác ở châu Á [56] Tộc ngƣời Locus 13.396 mẫu thuộc 9 tộc ngƣời Việt Nam 1805 mẫu ngƣời Hàn Quốc 650 ngƣời Nhật Bản 106 ngƣời Philippin D8S1179 8, 19 18 8 12, 17 D21S11 19, 26, 34 9, 9.2, 19 24 26,30.2, 34.2, 36.2 D7S820 4, 9.2, 14, 15, 23, 24 5, 10.3 7 13 CSF1PO 6, 10.2 7, 15 6 7, 8, 14 D3S1358 7, 10 9, 20 13, 20 19 TH01 8,12 5 4 5 D13S317 15, 16 16,17 15 14 D16S539 18, 19 8 15 7 D2S1338 13, 13.2, 14.2, 26 19 15 26 D19S433 17 17, 18.2 9, 11.2, 17.2, 19.2 10 vWA 8, 12, 15.2, 18.2, 29 12 12, 13, 21, 22 13 TPOX 14,15 14 13 10 D18S51 5, 9.2, 13.2, 15.2, 18.2, 26 25 14.2, 25 21, 24 D5S818 16, 20, 23 6, 10.1 7 14 FGA 9, 10, 14, 18.2, 20.2, 28.2, 29.2 12, 19 21.2, 23.2, 26.2, 28, 29 23.2, 27

3.6. Các chỉ số đánh giá trong giám định ADN hình sự

Nếu một mẫu ADN thu được ở hiện trường cho kết quả kiểm tra giống với mẫu ADN của đối tượng khả nghi thì câu hỏi đặt ra là liệu hai mẫu đó có phải từ cùng một người không? Việc khẳng định xác suất chính xác là bao nhiêu, phụ thuộc vào độ tin cậy của phương pháp và khả năng phân biệt của từng locus nghiên cứu, phân tích. Việc xác định khả năng phân biệt của từng locus giúp tính tốn được độ chính xác của phương pháp trong từng trường hợp cụ thể, hạn chế tối đa định hướng điều tra sai. Trong trường hợp địi hỏi phải có độ chính xác cao hơn thì cần nghiên cứu bổ sung thêm các locus STR khác hoặc kết hợp với các nguồn chứng cứ điều tra khác để cho kết quả cao nhất.

Các chỉ số thống kê cho quần thể cũng được tính tốn trong nghiên cứu bao gồm chỉ số 2, tỷ lệ dị hợp tử (h), khả năng phân biệt (PD), khả năng loại trừ (PE) của locus trong quần thể. Kết quả kiểm tra chỉ số 2 cho thấy tần suất phân bố của

15 locus STR từ kết quả khảo sát thực nghiệm của chúng tôi là phù hợp với phân bố lý thuyết theo định luật cân bằng Hardy–Weinberg với độ tin cậy 95%. (Phụ lục 2)

Bảng 3.11 là tổng hợp chỉ số khả năng phân biệt (PD) của 15 locus trong nghiên cứu 9 tộc người người tại Việt Nam.

Bảng 3.11. Chỉ số khả năng phân biệt (PD) của 15 locus của các tộc người nghiên cứu

Tộc ngƣời Locus KB KT KN TY TI MG KM HA NG HM DO Trung bình D8S1179 0,96 0,965 0,964 0,957 0,958 0,96 0,954 0,96 0,972 0,931 0,961 0,958 D21S11 0,948 0,945 0,948 0,946 0,944 0,957 0,935 0,938 0,956 0,951 0,938 0,946 D7S820 0,911 0,907 0,921 0,905 0,914 0,918 0,92 0,915 0,933 0,862 0,858 0,906 CSF1PO 0,88 0,89 0,885 0,881 0,874 0,879 0,856 0,873 0,863 0,781 0,868 0,866 D3S1358 0,885 0,867 0,873 0,874 0,881 0,861 0,872 0,879 0,909 0,853 0,874 0,875 TH01 0,878 0,89 0,909 0,865 0,839 0,9 0,901 0,877 0,914 0,843 0,851 0,879 D13S317 0,923 0,923 0,931 0,921 0,912 0,916 0,922 0,913 0,926 0,829 0,914 0,912 D16S539 0,918 0,913 0,92 0,905 0,912 0,901 0,916 0,917 0,908 0,88 0,897 0,908 D2S1338 0,969 0,972 0,964 0,966 0,971 0,969 0,961 0,966 0,977 0,934 0,964 0,965 D19S433 0,948 0,948 0,944 0,942 0,956 0,95 0,953 0,933 0,96 0,94 0,943 0,947 vWA 0,918 0,928 0,926 0,917 0,931 0,921 0,934 0,928 0,942 0,892 0,916 0,923 TPOX 0,77 0,8 0,779 0,758 0,748 0,735 0,767 0,806 0,853 0,773 0,77 0,778 D18S51 0,959 0,967 0,965 0,967 0,963 0,958 0,96 0,964 0,973 0,946 0,964 0,962 D5S818 0,911 0,926 0,928 0,921 0,914 0,922 0,901 0,919 0,949 0,901 0,917 0,919 FGA 0,966 0,975 0,971 0,971 0,965 0,971 0,969 0,971 0,976 0,957 0,966 0,969

Ghi chú: KB: Kinh miền Bắc; KT: Kinh miền Trung, KN: Kinh miền Nam; TY: Tày; TI: Thái;

MG: Mường; KM: Khmer; HM: H’mông; HA: Hoa; MG: Mường; NG: Nùng và DO: Dao

Đánh giá theo khả năng phân biệt từ cao đến thấp của các locus trong quần thể nghiên cứu, chúng tơi thấy locus FGA có khả năng phân biệt cao nhất (0,97), locus TPOX có khả năng phân biệt thấp nhất (0,77). Sắp xếp theo thứ tự khả năng phân biệt từ cao đến thấp của tất cả các locus nghiên cứu lần lượt là: FGA, D18S51, D2S1338, D8S1179, D19S433, D21S11, vWA, D16S539, D5S818, D13S317, D7S820, TH01, D3S1358, CSF1PO, TPOX. Mỗi một locus có khả năng phân biệt khác nhau, vì vậy, có vai trị quan trọng khác nhau trong việc tính tốn độ tin cậy của phương pháp nghiên cứu. Locus nào có khả năng phân biệt càng cao thì càng có ý nghĩa trong giám định [40]. Vì vậy, khi xây dựng những bộ kít xét nghiệm riêng cho từng nhóm người cụ thể cần lưu ý nhiều hơn đến các locus này.

Khả năng loại trừ (PE) cũng là chỉ số để đánh giá độ tin cậy trong giám định. Bảng 3.12 là tổng hợp các khả năng loại trừ của 15 locus trong nghiên cứu 9 tộc người Việt Nam.

Bảng 3.12. Chỉ số khả năng loại trừ (PE) của 15 locus trong nghiên cứu các tộc người

Tộc ngƣời Locus KB KT KN TY TI MG KM HA NG HM DO Trung bình D8S1179 0,72 0,731 0,72 0,705 0,712 0,706 0,688 0,702 0,704 0,598 0,703 0,70 D21S11 0,649 0,644 0,637 0,67 0,592 0,689 0,619 0,636 0,63 0,692 0,621 0,64 D7S820 0,548 0,537 0,565 0,537 0,551 0,57 0,575 0,572 0,526 0,46 0,478 0,54 CSF1PO 0,5 0,485 0,5 0,477 0,468 0,48 0,436 0,466 0,457 0,347 0,451 0,46 D3S1358 0,471 0,449 0,466 0,478 0,507 0,448 0,468 0,464 0,472 0,441 0,463 0,47 TH01 0,511 0,504 0,483 0,503 0,43 0,525 0,526 0,407 0,465 0,393 0,43 0,47 D13S317 0,57 0,587 0,569 0,57 0,572 0,562 0,586 0,589 0,567 0,311 0,574 0,55 D16S539 0,59 0,564 0,572 0,554 0,578 0,53 0,571 0,566 0,533 0,499 0,555 0,56 D2S1338 0,733 0,747 0,708 0,735 0,755 0,74 0,709 0,717 0,733 0,664 0,734 0,73 D19S433 0,658 0,667 0,659 0,631 0,7 0,664 0,676 0,63 0,634 0,596 0,641 0,65 vWA 0,596 0,606 0,613 0,576 0,601 0,583 0,619 0,614 0,604 0,523 0,578 0,59 TPOX 0,289 0,308 0,294 0,273 0,288 0,238 0,277 0,283 0,328 0,309 0,282 0,29 D18S51 0,709 0,73 0,72 0,694 0,724 0,694 0,703 0,733 0,715 0,631 0,724 0,71 D5S818 0,599 0,592 0,588 0,566 0,519 0,586 0,535 0,608 0,583 0,523 0,589 0,57 FGA 0,732 0,765 0,773 0,755 0,724 0,75 0,741 0,742 0,755 0,717 0,75 0,75

Ghi chú: KB: Kinh miền Bắc; KT: Kinh miền Trung, KN: Kinh miền Nam; TY: Tày; TI: Thái;

MG: Mường; KM: Khmer; HM: H’mông; HA: Hoa; MG: Mường; NG: Nùng và DO: Dao

Đánh giá theo khả năng loại trừ (PE) từ cao đến thấp của các locus trong quần thể nghiên cứu, locus FGA có khả năng loại trừ cao nhất (0,75), locus TPOX có khả năng loại trừ thấp nhất (0,29). Sắp xếp theo thứ tự khả năng loại trừ từ cao đến thấp của tất cả các locus nghiên cứu lần lượt là: FGA, D2S1338, D18S51,

Một phần của tài liệu (LUẬN án TIẾN sĩ) nghiên cứu đặc trưng tần suất alen hệ nhận dạng STR (AmpFlSTR® identifiler® plus kit) của một số tộc người việt nam để ứng dụng trong giám định ADN (Trang 106)

Tải bản đầy đủ (PDF)

(191 trang)