Nội dung của Đề tài nghiên cứu thuộc thể loại quản lý kinh tế, do đó trong quá trình nghiên cứu Đề tài thực hiện theo phương pháp luận cơ bản và phổ biến là phương pháp duy vật biện chứng và duy vật lịch sử của chủ nghĩa Mác – Lê nin. Ngoài ra còn sử dụng tổng hợp các phương pháp nghiên cứu khác, cụ thể: phương pháp tổng hợp, phương pháp điều tra, khảo sát, thống kê, phân tích, so sánh, tổng hợp, quan sát, đối chiếu, duy vật biện chứng…
Các phương pháp tiếp cận cụ thể ở từng chương:
Chương 2: phương pháp tổng hợp lý luận, thống kê các loại kiểm soát trong quản lý kinh tế, chi NSNN, phân loại chi NSNN, quy trình quản lý chi NSNN; kinh nghiệm kiểm soát chi NSNN của một số nước trên thế giới.
Chương 3: Trên cơ sở nghiên cứu tại KBNN Tỉnh Nam Định, để thu thập được những tài liệu thực tế trước hết Tác giả sử dụng phương pháp khảo cứu tài liệu lưu trữ của đơn vị. Sau đó Tác giả tiếp cận với Phòng Kế toán và Phòng Kế hoạch để điều tra, khảo sát, tìm hiểu nguyên tắc, phương thức kiểm soát các loại chi NSNN, quan sát quy trình, thủ tục kiểm soát chi NSNN cấp tỉnh qua KBNN. Sau đó thống kê các số liệu chi NSNN cấp tỉnh qua các năm theo báo cáo của KBNN tỉnh, từ đó phân tích, đối chiếu và so sánh kiểm soát chi có đảm bảo hiệu quả, đúng chế độ và
theo những định hướng của cơ quan Nhà nước có thẩm quyền về phát triển kinh tế - xã hội, phân tích để thấy tăng, giảm chi NSNN qua các năm, tìm hiểu nguyên nhân tăng, giảm để tiếp tục duy trì những mặt tích cực và hạn chế những mặt tiêu cực.
Chương 4: Sau khi nhìn nhận toàn diện vấn đề nghiên cứu, Tác giả sử dụng phương pháp phân tích, đánh giá từ đó có căn cứ đề ra phương hướng, giải pháp nhằm hoàn thiện kiểm soát chi NSNN cấp tỉnh tại đơn vị nghiên cứu.