Sự phát triển kinh tế - xã hội có tác động đến nguồn thu NSNN. Qui mô nguồn thu sẽ quyết định đến nguồn chi NSNN, đồng thời đòi hỏi cần phải có một cơ chế, chính sách, chế độ quản lý chặt chẽ, hiệu quả trong quản lý quỹ NSNN. Nguồn thu chủ yếu của NSNN là từ thuế và khai thác nguồn tài nguyên quốc gia, đó là các khoản thu thuế từ các cơ sơ sản xuất, kinh doanh và dịch vụ...Vì vậy tốc độ phát triển kinh tế, xã hội càng cao thì các nguồn thu cho NSNN càng lớn, đồng thời cũng khai thác tốt hơn các nguồn tài nguyên thiên nhiên, đất đai thuận lợi cho việc khai thác nguồn thu. Mặt khác, khi cơ sở hạ tầng kinh tế, kỹ thuật đồng bộ và tốt hơn nên sẽ thu hút được các nhà đầu tư vào đầu tư sản xuất kinh doanh, góp phần thúc đẩy tăng trưởng và phát triển kinh tế, tăng thu cho ngân sách, đáp ứng nhu cầu chi.
Khi Luật NSNN được ban hành, thì cơ chế quản lý và kiểm soát chi NSNN qua KBNN mới được hình thành và đi vào cuộc sống. Để hướng dẫn thực hiện Luật NSNN các chế độ chính sách về quản lý và kiểm soát chi NSNN qua KBNN được ban hành, đó là nghị định của Chính phủ, các thông tư hướng dẫn của Bộ Tài chính và các Bộ, ngành chức năng, các văn bản của KBNN. Đây là hệ thống chế độ, chính sách làm cơ sở cho KBNN thực hiện cơ chế quản lý chi NSNN. Vì vậy Chế độ chính sách phải mang tính khả thi, phù hợp với pháp luật hiện hành của Nhà nước, đảm bảo quản lý chặt chẽ không có kẽ hở để tránh thất thoát tài sản Nhà nước và cán bộ làm công tác quản lý. Chế độ chính sách phải mang tính ổn định, tránh thay đổi nhiều để thuận lợi cho việc triển khai thực hiện.
Năng lực quản lý điều hành của các cấp chính quyền và các cấp quản lý NSNN ảnh hưởng nhiều đến quản lý quỹ NSNN. Theo Luật NSNN, Quốc hội quyết nghị dự toán ngân sách trung ương và trợ cấp cho ngân sách địa phương. Hội đồng nhân dân tỉnh, thành phố quyết nghị dự toán ngân sách cấp mình và trợ cấp cho ngân sách cấp dưới... Bộ Tài chính căn cứ vào quyết nghị của Quốc hội và quyết định của Thủ tướng Chính phủ ra quyết định giao dự toán thu, chi NSNN cho các bộ, ban, ngành ở trung ương và trợ cấp ngân sách cho các địa phương. Tại tỉnh, thành phố, căn cứ vào quyết nghị của HĐND, Chủ tịch UBND tỉnh ra quyết định giao dự toán thu, chi NSNN cho các sở, ban, ngành và trợ cấp cho ngân sách quận, huyện, thành phố... Nhận được quyết định giao dự toán các đơn vị dự toán cấp I phân bổ dự toán cho các đơn vị sử dụng NSNN. Như vậy các đơn vị sử dụng NSNN có quyết định giao dự toán của cơ quan chủ quản thì mới đến KBNN làm thủ tục kiểm soát chi và rút kinh phí. Do đó Năng lực quản lý điều hành của các cấp chính quyền và các cấp quản lý NSNN sẽ có ảnh hưởng rất lớn đến cơ chế quản lý quỹ NSNN. Các đơn vị sử dụng kinh phí NSNN, việc các đơn vị có tự giác chấp hành chế độ chi tiêu NSNN hay không cũng là một nhân tố rất quan trọng đối với KBNN trong thực hiện cơ chế quản lý quỹ NSNN.
Yếu tố con người, tổ chức, chính sách luôn luôn có tầm quan trọng đặc biệt. Thể hiện qua các nội dung: Năng lực đề ra sách lược trong hoạt động, đưa ra được
các kế hoạch triển khai công việc một cách hợp lý, rõ ràng; tạo nên một cơ cấu tổ chức hợp lý, có hiệu quả, có sự phân định rõ ràng trách nhiệm và quyền hạn giữa các nhân viên cũng như giữa các khâu, các bộ phận. Năng lực quản lý của người lãnh đạo có tầm quan trọng đặc biệt đối với hoạt động của KBNN nói chung và việc quản lý quỹ NSNN nói riêng. Nếu năng lực của người lãnh đạo yếu, bộ máy tổ chức không hợp lý, các sách lược không phù hợp với thực tế thì việc quản lý chi NSNN sẽ yếu, dễ gây thất thoát, lãng phí và ngược lại.
Năng lực chuyên môn của người cán bộ KBNN là yếu tố quyết định hiệu quả trong quản lý quỹ NSNN. Nếu năng lực chuyên môn cao sẽ loại trừ được sai lệch trong hồ sơ, chứng từ, thanh toán và quyết toán NSNN. Thể hiện ở năng lực phân tích, xử lý các thông tin được cung cấp, giám sát, đối chiếu với các quy định hiện hành của Nhà nước. Nếu người cán bộ KBNN không làm tốt công tác này sẽ không phát hiện ra những thất thoát, lãnh phí trong chi NSNN.
Quy trình nghiệp vụ là một trong những mắt xích quan trọng ảnh hưởng trực tiếp đến quản lý quỹ NSNN, vì vậy quy trình nghiệp vụ phải được xây dựng theo hướng cải cách thủ tục hành chính, quy định rõ thời hạn giải quyết công việc, từng động tác trình tự công việc phải làm của lãnh đạo và các bộ quản lý một cách khoa học, đồng thời phải quy định rõ mối quan hệ giữa các bộ phận gắn liền với chế độ trách nhiệm.
Trang bị cơ sở vật chất kỹ thuật, ứng dụng công nghệ hiện đại trong công việc cũng ảnh hưởng không nhỏ đến công tác quản lý quỹ NSNN, như việc ứng dụng công nghệ tin học trong công tác quản lý quỹ NSNN đã giúp tiết kiệm được thời gian xử lý công việc, đảm bảo nhanh chóng, chính xác và thống nhất về mặt số liệu tạo tiền đề cho những cải tiến quy trình nghiệp vụ một cách hiệu quả hơn. Chính vì vậy công nghệ tin học là một trong những nhân tố ảnh hưởng không nhỏ đến chất lượng và hiệu quả của công tác quản lý quỹ NSNN.
