Giai đoạn thứ ba chợnh thức được khởi động bằng Hiến phóp năm 2003 (sửa đổi) vă Luật Tổ chức Viện kiểm sót nhđn dđn năm 2003 (sửa đổi), với những yợu cầu đặt ra lă phải sắp xếp lại một cóch hợp lý cóc cơ quan VKSND, đẩy mạnh, nđng cao hơn nữa chất lượng, hiệu quả hoạt động cừng tố vă kiểm sót việc tuđn theo phóp luật rộng rởi hơn vă đở đổi tợn từ Tổng VKSND thănh VKSNDTC.
Theo Hiến phóp năm 2003 (sửa đổi), VKSND cụ chức năng thực hănh quyền cừng tố vă kiểm sót việc tuđn theo phóp luật của cóc Bộ vă tương đương, cơ quan thuộc Chợnh phủ, Mặt trận Lăo xđy dựng Tổ quốc, tổ chức quần chỷng, tổ chức chợnh trị - xở hội, cơ quan chợnh quyền địa phương, cóc doanh nghiệp, cón bộ cừng chức vă cừng dđn. Về tổ chức, VKSND được thănh lập củng cố vă hoăn thiện từ Trung ương đến địa
phương như: VKSNDTC, VKSND phỷc thẩm, VKSND tỉnh, thănh phố, VKSND huyện vă VKSQS.
Những năm 2003 - 2009 VKSND đở hoăn thănh việc củng cố tổ chức như sau:
- Thănh lập VKSND phỷc thẩm ở 3 miền của cả nước (Bắc, Trung, Nam). - Thănh lập vă củng cố VKSND ở cóc huyện trợn cả nước (141 huyện). - Củng cố tổ chức nội bộ VKSNDTC để tăng cường cơ chế quản lý, lởnh đạo, chỉ đạo để thực hiện vai trú, chức năng VKSND cụ hiệu quả cao.
Theo Nghị quyết 118/BCT của Bộ Chợnh trị Trung ương Đảng ngăy 15/12/2003; Sắc lệnh 13/TTg của Thủ tướng Chợnh phủ, ngăy 26/11/2007 vă Sắc lệnh 05/TTg của của Thủ tướng Chợnh phủ, ngăy 9/3/2009, về việc tiếp tục củng cố hoăn thiện cóc cơ quan hănh chợnh cấp huyện, tiếp đụ lă Nghị quyết 117/UBTV-QH của Uỷ Ban Thường vụ Quốc hội ngăy 28/5/2009, về việc Túa ón nhđn dđn vă VKSND cóc huyện hợp thănh Túa ón nhđn dđn khu vực vă VKSND Khu vực (từ 141 huyện thănh 39 khu vực), nhưng nếu khu vực năo cụ nền kinh tế - xở hội phót triển cao cụ thể thănh lập thợm tỳy theo điều kiện cần thiết của địa phương.
Riợng đối với VKSND Khu vực phải bổ nhiệm 1-2 cón bộ về đảm nhiệm cừng tóc ở cóc huyện trong phạm vi khu vực. Đối với Túa ón nhđn dđn khu vực cụ thẩm quyền xĩt xử sơ thẩm những vụ ón dđn sự cụ gió trị từ 300.000.000 kợp trở xuống, vụ ón hớnh sự cụ mức phạt từ 3 năm tỳ trở xuống.
Ngăy 05 thóng 10 năm 2009 Uỷ ban Thường vụ Quốc hội cụ Quyết định 179/UBTV-QH về quyền lực vă đổi tợn từ Túa ón nhđn dđn phỷc thẩm, VKSND phỷc thẩm thănh Túa ón nhđn dđn khu vă VKSND khu. Túa ón nhđn dđn khu cụ quyền xĩt xử vụ ón vă quan sót, tố tụng như: lă cấp phỷc thẩm đối với vụ ón đở xĩt xử sơ thẩm tại Túa ón tỉnh, thănh phố do hai bợn đương sự xin phỷc thẩm hoặc bị khóng nghị bởi VKSND. Lă cấp tói thẩm đối với vụ ón đở xĩt xử sơ thẩm ở Túa ón nhđn dđn khu vực vă Túa ón nhđn dđn tỉnh, thănh
phố đở xĩt xử phỷc thẩm vă đở được xụa bỏ bởi hai bợn đương sự hoặc bị khóng nghị bởi VKSND. Sau đụ, ngăy 26/11/2009, Quốc hội đở ban hănh luật về Tổ chức VKSND trong đụ quy định về nguyợn tắc, quy chế vă phạm vi về việc tổ chức hoạt động, kiểm tra, gióm sót của VKSND để đảm bảo việc thực hiện nhiệm vụ của VKS cụ hiệu quả cao, bảo vệ lợi ợch của Nhă nước, xở hội, quyền vă lợi ợch hợp phóp của nhđn dđn nhằm đảm bảo ổn định, trật tự an toăn xở hội, tăng cường việc từn trọng vă thực hiện đỷng phóp luật, từng bước xđy dựng nhă nước phóp quyền, gụp phần bảo vệ, xđy dựng, phót triển đất nước (Điều 1).
Tụm lại, từ việc nghiợn cứu một cóch khói quót quó trớnh hớnh thănh vă
phót triển của cơ quan cừng tố, với thực hiện quyền gióm sót trước khi xuất hiện VKSND cho thấy cơ quan cừng tố ở CHDCND Lăo đở trải qua 35 năm hớnh thănh vă phót triển, từ chỗ chỉ lă một bộ phận trong bộ móy cơ quan tư phóp được Nhă nước giao nhiệm vụ, chức năng buộc tội trước túa đến việc thực hiện chức năng kiểm sót việc tuđn theo phóp luật, điều đụ thể hiện sự hớnh thănh dần dần một hệ thống cơ quan VKS độc lập trong bộ móy nhă nước. Từ đụ, tổ chức vă hoạt động của VKSND ngăy căng được củng cố vă tăng cường. Sự hớnh thănh vă phót triển của VKSND gắn liền với sự hớnh thănh vă phót triển của Nhă nước CHDCND Lăo.