Bộ Tài chính cần có những hướng dẫn cụ thể triển khai các quy định về tài chính như cấp phát và cho vay lại. Bộ tài chính cần xác định loại hình viện trợ phù hợp với đặc điểm của từng dự án, đặc biệt cần áp dụng phù hợp: dự án có khả năng thu hồi vốn và dự án không có khả năng thu hồi vốn.
Bộ Tài chính dưới sự chỉ đạo của Chính phủ xét các khoản nợ đối với các đơn vị sử dụng để có kế hoạch trả nợ ngay từ khi triển khai dự án.
Bộ Tài chính cần lập ngân sách với công tác chuẩn bị tại các dự án để đảm bảo các dự án không bị thụ động trong việc đợi kinh phí. Nguồn NSNN dành cho dự án ODA ngay từ khâu chuẩn bị thiết kế dự án tăng tính chủ động của Ban điều hành dự án.
Bộ Tài chính tăng cường quản lý các chương trình dự án sử dụng vốn ODA. Trước hết, Bộ Tài chính cần rà soát hồ sơ thủ tục ghi thu ghi chi của các chương trình, dự án và lập thông tri duyệt y dự toán để các đơn vị tổ chức hạch toán ghi thu ghi chi NSNN đối các khoản vay và viện trợ nước ngoài của Chính phủ. Ngoài việc đẩy mạnh công tác ghi thu ghi để tăng tiến độ quyết toán. Bên cạnh đó, Bộ tài chính cần có quy trình thống nhất từ phân bổ vốn, kiểm soát chi, thống nhất định mức chi, thống nhất thủ tục để quản lý đơn giản hóa, giảm cấc chi phí giao dịch trong đầu tư. Hệ thống kiểm tra, giám sát quyết toán tài chính hàng năm được cải thiện sẽ kịp thời phát hiện sai sót và có những điều chỉnh thích hợp.
Bộ Tài chính cần có những cải tiến trong quy trình giải ngân. Bộ Tài chính có thể ban hành các quy định về thủ tục giải ngân được đơn giản hơn nhằm giúp quá trình giải ngân được nhanh hơn. Thực tế, nhiều dự án thực hiện hoàn tất nhưng thủ tục giải ngân quá nhiêu khê nên phải làm đi làm lại rất nhiều lần, gây mất thời gian công sức và làm chậm tiến độ giải ngân, ảnh hưởng đến hiệu quả sử dụng vốn.
Bộ Tài chính cần kết hợp với Bộ Kế hoạch đầu tư xây dựng một quyển cẩm nang chung quy định cho từng nhà trợ hài hòa thủ tục với các nhà tài trợ, giảm chi phí thời gian tiền bạc trong xây dựng quy chế tài chính cho các dự án, tăng hiệu quả sử dụng vốn ODA.
Bộ Tài chính nên xây dựng một hệ thống kế hoạch, chi tiêu báo cáo thống nhất đối với các dự án mang tính chất hỗn hợp sự nghiệp và đầu tư. Hiện các Bộ ban ngành đang thực hiện hai chế độ kế toán và báo cáo riêng biệt, gặp khó khăn trong quản lý và tổng hợp dự án.