Yên Lập nằm trong vùng khí hậu nhiệt đới, nhiệt độ trung bình năm vào khoảng 22,5°C, cao nhất 39°C và thấp nhất 4-5°C. Có hai mùa chính: Mùa đông lạnh và khô hạn, kéo dài từ tháng 11 đến tháng 2 năm sau với nhiệt độ trung bình 14,2°-18°; mùa hè nóng và mưa nhiều, kéo dài từ tháng 6 đến tháng 9 với nhiệt độ trung bình 28-30°C. Lượng mưa trung bình năm là 1.570 mm. Độ ẩm trung bình trong năm là 86-89%, cao nhất lên đến 90% vào tháng 7.8 và thấp nhất xuống đến 62% thường vào tháng 12 hàng năm.
Yên Lập mang đặc trưng khí hậu nhiệt đới gió mùa, một năm chia làm 2 mùa: Mùa mưa từ tháng 4 đến tháng 10 thường nóng, ẩm và mưa nhiều; mùa khô từ tháng 11 đến tháng 3 năm sau thường rét đậm, rét hại và xuất hiện sương muối vào các tháng cuối năm. Căn cứ vào kết quả quan trắc nhiều năm của trạm khí tượng Minh Đài cho thấy, khí hậu Yên Lập có một số chỉ tiêu cơ bản sau:
- Nhiệt độ trung bình năm 220C – 24,50C; nhiệt độ tối cao 38,50C; nhiệt độ tối thấp khoảng 6-80C vào tháng 12 hàng năm.
- Lượng mưa trung bình năm 1.870 mm, tập trung vào các tháng 7, 8, 9; tháng cao nhất là tháng 8 đạt tới trên 2.000mm.
- Gió mùa Đông Bắc xuất hiện từ tháng 10 đến tháng 3 năm sau và thường gây mưa phùn.
- Gió mùa Đông Nam thịnh hành từ tháng 4 đến tháng 9, gió thổi mạnh và mang theo nhiều hơi nước nên mưa nhiều.
Nhìn chung, khí hậu thời tiết thuận lợi với sản xuất nông lâm nghiệp. Tuy nhiên có một số yếu tố cực hại như sương muối, rét đậm, rét hại cần được quan tâm trong quá trình sản xuất kinh doanh.