Với trình tự CYP11B1 từ phòng nghiên cứu của Giáo sư Rita Bernhardt tại CHLB Đức [10], mô hình cấu trúc không gian của CYP11B1 được thể hiện bằng phần mềm ViewerLite.
Hình 3.13: Mô hình cấu trúc không gian của CYP11B1
Protein gồm 6 đoạn xoắn α-helix kí hiệu D, E, I, L, J và K, dạng gấp nếp β-sheet (phần màu góc dưới bên phải). Nhân Heme nằm giữa α-helix L và α-helix I. Vị trí của 4 đột biến điểm (màu xanh) được phát hiện ở mẫu bệnh nhân người Việt Nam. Tại đây, hình ảnh của các vùng cấu trúc được thể hiện một cách tổng quát trong không gian. Mô hình cũng thể hiện rõ vị trí của các đột biến quan tâm. Vị trí xảy ra đột biến cũng là một yếu tố quan trọng trong việc xác định ảnh hưởng đột biến đến hoạt tính của protein. Đột biến sẽ có ảnh hưởng lớn khi xảy ra tại các vùng cấu trúc quan trọng.
Cấu trúc bậc ba là dạng không gian của cấu trúc bậc hai, làm cho phân tử protein có hình dạng gọn hơn trong không gian, tạo nên trung tâm hoạt động của phần
Số hóa bởi Trung tâm Học liệu http://www.lrc-tnu.edu.vn/
lớn các loại enzyme. Sự thay đổi cấu trúc bậc ba dẫn đến sự thay đổi hướng xúc tác của enzyme hoặc mất khả năng xúc tác hoàn toàn. Cấu trúc bậc III được giữ vững nhờ các cầu disulfua, tương tác VanderWaals, liên kết hidro, lực ion. Vì vậy khi phá vỡ các liên kết này phân tử duỗi ra đồng thời làm thay đổi một số tính chất của nó, đặc biệt là tính tan và hoạt tính xúc tác của nó. Trong nghiên cứu này, chúng tôi tập trung đánh giá mức độ thay đổi của acid amin khi bị đột biến ở mức độ thay đổi liên kết hydro với các acid amin bên cạnh. Bên cạnh đó, việc thay đổi acid amin này thành acid amin có thể làm thay đổi tính chất của các acid amin làm ảnh hưởng đến mối tương tác giữa các acid amin.